MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acetohalobium arabaticum DSM 5501 chromosome

Total Repeats: 53359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_014378	ATC	2	6	1848543	1848548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392509
40003	NC_014378	TAT	2	6	1848659	1848664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392509
40004	NC_014378	TCT	2	6	1848727	1848732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392509
40005	NC_014378	TAA	2	6	1848746	1848751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392509
40006	NC_014378	GTT	2	6	1848773	1848778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302392509
40007	NC_014378	T	6	6	1848865	1848870	0 %	100 %	0 %	0 %	302392509
40008	NC_014378	CAA	2	6	1848873	1848878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302392509
40009	NC_014378	T	7	7	1848935	1848941	0 %	100 %	0 %	0 %	302392509
40010	NC_014378	CTA	2	6	1848977	1848982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392509
40011	NC_014378	TTAGTT	2	12	1849018	1849029	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	302392509
40012	NC_014378	AGAAA	2	10	1849048	1849057	80 %	0 %	20 %	0 %	302392509
40013	NC_014378	TAACT	2	10	1849065	1849074	40 %	40 %	0 %	20 %	302392509
40014	NC_014378	ACCTT	2	10	1849078	1849087	20 %	40 %	0 %	40 %	302392509
40015	NC_014378	ATCT	2	8	1849176	1849183	25 %	50 %	0 %	25 %	302392509
40016	NC_014378	TCT	2	6	1849202	1849207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392509
40017	NC_014378	ATA	3	9	1849255	1849263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392509
40018	NC_014378	ATT	2	6	1849278	1849283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392509
40019	NC_014378	TGA	2	6	1849343	1849348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392510
40020	NC_014378	TAT	2	6	1849355	1849360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392510
40021	NC_014378	TGAT	2	8	1849364	1849371	25 %	50 %	25 %	0 %	302392510
40022	NC_014378	TCT	2	6	1849393	1849398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392510
40023	NC_014378	AT	3	6	1849411	1849416	50 %	50 %	0 %	0 %	302392510
40024	NC_014378	ATA	2	6	1849444	1849449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392510
40025	NC_014378	CAG	2	6	1849575	1849580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392510
40026	NC_014378	ATT	2	6	1849608	1849613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392510
40027	NC_014378	ATA	2	6	1849622	1849627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392510
40028	NC_014378	GATT	2	8	1849633	1849640	25 %	50 %	25 %	0 %	302392510
40029	NC_014378	ATA	2	6	1849799	1849804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392510
40030	NC_014378	TTA	2	6	1849861	1849866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392510
40031	NC_014378	CTAT	2	8	1849874	1849881	25 %	50 %	0 %	25 %	302392510
40032	NC_014378	CAC	2	6	1849882	1849887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302392511
40033	NC_014378	ATT	2	6	1849911	1849916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392511
40034	NC_014378	CTA	2	6	1849999	1850004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392511
40035	NC_014378	TTTA	2	8	1850006	1850013	25 %	75 %	0 %	0 %	302392511
40036	NC_014378	ATG	2	6	1850022	1850027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392511
40037	NC_014378	TTA	2	6	1850028	1850033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392511
40038	NC_014378	TTAACC	2	12	1850049	1850060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392511
40039	NC_014378	ATC	2	6	1850078	1850083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392511
40040	NC_014378	CTG	2	6	1850095	1850100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392511
40041	NC_014378	ATC	2	6	1850168	1850173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392511
40042	NC_014378	CTT	2	6	1850194	1850199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392511
40043	NC_014378	GCT	2	6	1850209	1850214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392511
40044	NC_014378	CTT	2	6	1850246	1850251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392511
40045	NC_014378	ATA	4	12	1850348	1850359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392511
40046	NC_014378	TC	3	6	1850406	1850411	0 %	50 %	0 %	50 %	302392511
40047	NC_014378	TCCAT	2	10	1850425	1850434	20 %	40 %	0 %	40 %	302392511
40048	NC_014378	TAT	2	6	1850435	1850440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392511
40049	NC_014378	AATG	2	8	1850477	1850484	50 %	25 %	25 %	0 %	302392512
40050	NC_014378	CTT	2	6	1850517	1850522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392512
40051	NC_014378	GAA	2	6	1850530	1850535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	302392512
40052	NC_014378	CAT	2	6	1850546	1850551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392512
40053	NC_014378	GTT	2	6	1850594	1850599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302392512
40054	NC_014378	ATT	2	6	1850601	1850606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392512
40055	NC_014378	TGA	2	6	1850635	1850640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392512
40056	NC_014378	ACT	2	6	1850644	1850649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392512
40057	NC_014378	TCA	2	6	1850671	1850676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392512
40058	NC_014378	CTG	2	6	1850685	1850690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392512
40059	NC_014378	CTA	2	6	1850729	1850734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392512
40060	NC_014378	CT	3	6	1850826	1850831	0 %	50 %	0 %	50 %	302392512
40061	NC_014378	ATCA	2	8	1850832	1850839	50 %	25 %	0 %	25 %	302392512
40062	NC_014378	TTAAT	2	10	1850876	1850885	40 %	60 %	0 %	0 %	302392512
40063	NC_014378	ATA	2	6	1850886	1850891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392512
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40066	NC_014378	TAA	2	6	1851055	1851060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392513
40067	NC_014378	TGT	2	6	1851121	1851126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	302392513
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40070	NC_014378	CGC	2	6	1851177	1851182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	302392513
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40072	NC_014378	TTA	2	6	1851305	1851310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392513
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40074	NC_014378	ATCTC	2	10	1851374	1851383	20 %	40 %	0 %	40 %	302392513
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40085	NC_014378	TTAA	2	8	1851959	1851966	50 %	50 %	0 %	0 %	302392513
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40089	NC_014378	AT	3	6	1852099	1852104	50 %	50 %	0 %	0 %	302392514
40090	NC_014378	TC	3	6	1852120	1852125	0 %	50 %	0 %	50 %	302392514
40091	NC_014378	ATAA	2	8	1852132	1852139	75 %	25 %	0 %	0 %	302392514
40092	NC_014378	AC	3	6	1852197	1852202	50 %	0 %	0 %	50 %	302392514
40093	NC_014378	ATTT	2	8	1852226	1852233	25 %	75 %	0 %	0 %	302392514
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40101	NC_014378	TAAATC	2	12	1852508	1852519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	302392514
40102	NC_014378	CAT	3	9	1852579	1852587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392514
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40105	NC_014378	ATT	2	6	1852649	1852654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392514
40106	NC_014378	TAA	2	6	1852681	1852686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392514
40107	NC_014378	AT	3	6	1852697	1852702	50 %	50 %	0 %	0 %	302392514
40108	NC_014378	TAG	2	6	1852738	1852743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392514
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40112	NC_014378	CTG	2	6	1852933	1852938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392514
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40115	NC_014378	AT	3	6	1852998	1853003	50 %	50 %	0 %	0 %	302392514
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40117	NC_014378	TAA	2	6	1853042	1853047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392514
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40230	NC_014378	TTC	3	9	1858614	1858622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392521
40231	NC_014378	ATC	2	6	1858634	1858639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392521
40232	NC_014378	CAT	2	6	1858673	1858678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392522
40233	NC_014378	CAT	2	6	1858694	1858699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392522
40234	NC_014378	TAC	2	6	1858711	1858716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392522
40235	NC_014378	CTA	3	9	1858717	1858725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392522
40236	NC_014378	ATC	2	6	1858860	1858865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392522
40237	NC_014378	CTA	2	6	1858963	1858968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392522
40238	NC_014378	TACT	2	8	1858987	1858994	25 %	50 %	0 %	25 %	302392522
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40240	NC_014378	AGC	3	9	1859106	1859114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392522
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40242	NC_014378	TCTG	2	8	1859139	1859146	0 %	50 %	25 %	25 %	302392522
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40245	NC_014378	ACT	2	6	1859172	1859177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392522
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40253	NC_014378	CTG	2	6	1859350	1859355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392522
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40260	NC_014378	TAG	2	6	1859644	1859649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392522
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40263	NC_014378	CTT	2	6	1859737	1859742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392522
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40267	NC_014378	CCTTA	2	10	1859843	1859852	20 %	40 %	0 %	40 %	302392522
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40270	NC_014378	TCA	2	6	1860018	1860023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392523
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40316	NC_014378	CTG	2	6	1862257	1862262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392524
40317	NC_014378	CAGT	2	8	1862300	1862307	25 %	25 %	25 %	25 %	302392524
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40321	NC_014378	ATC	2	6	1862426	1862431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392524
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40327	NC_014378	CTTT	2	8	1862819	1862826	0 %	75 %	0 %	25 %	302392525
40328	NC_014378	CTC	2	6	1862894	1862899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392525
40329	NC_014378	CAG	2	6	1862916	1862921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	302392525
40330	NC_014378	ACC	2	6	1862956	1862961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302392525
40331	NC_014378	AGT	2	6	1863030	1863035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392525
40332	NC_014378	CCA	2	6	1863038	1863043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302392525
40333	NC_014378	T	6	6	1863123	1863128	0 %	100 %	0 %	0 %	302392525
40334	NC_014378	CTT	2	6	1863153	1863158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392525
40335	NC_014378	CAC	2	6	1863230	1863235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	302392525
40336	NC_014378	CAA	2	6	1863242	1863247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	302392525
40337	NC_014378	CTT	2	6	1863278	1863283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392525
40338	NC_014378	CGTC	2	8	1863307	1863314	0 %	25 %	25 %	50 %	302392525
40339	NC_014378	TAT	2	6	1863317	1863322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392525
40340	NC_014378	CTT	2	6	1863380	1863385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392525
40341	NC_014378	CTG	2	6	1863476	1863481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392525
40342	NC_014378	TAT	2	6	1863551	1863556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	302392525
40343	NC_014378	CTC	2	6	1863615	1863620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392525
40344	NC_014378	ATTT	2	8	1864610	1864617	25 %	75 %	0 %	0 %	302392526
40345	NC_014378	CTT	3	9	1864625	1864633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392526
40346	NC_014378	TAA	2	6	1864709	1864714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	302392526
40347	NC_014378	A	6	6	1864766	1864771	100 %	0 %	0 %	0 %	302392526
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40464	NC_014378	AGT	2	6	1869444	1869449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	302392531
40465	NC_014378	TAC	2	6	1869457	1869462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392532
40466	NC_014378	CTT	2	6	1869518	1869523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	302392532
40467	NC_014378	TAGAA	2	10	1869545	1869554	60 %	20 %	20 %	0 %	302392532
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40469	NC_014378	CTA	2	6	1869622	1869627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	302392532
40470	NC_014378	TAAT	2	8	1869657	1869664	50 %	50 %	0 %	0 %	302392532
40471	NC_014378	GTCA	2	8	1869680	1869687	25 %	25 %	25 %	25 %	302392532
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40480	NC_014378	CTG	2	6	1870198	1870203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	302392533
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40490	NC_014378	TA	3	6	1870600	1870605	50 %	50 %	0 %	0 %	302392533
40491	NC_014378	AAATT	2	10	1870619	1870628	60 %	40 %	0 %	0 %	302392533
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40493	NC_014378	TC	3	6	1870703	1870708	0 %	50 %	0 %	50 %	302392533
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40500	NC_014378	CTC	2	6	1870957	1870962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	302392533

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