MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 270788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014318	CGC	2	6	608844	608849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782526
16002	NC_014318	CGT	2	6	608871	608876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782526
16003	NC_014318	CGC	2	6	608930	608935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782526
16004	NC_014318	GCT	3	9	608946	608954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782526
16005	NC_014318	GACC	2	8	609054	609061	25 %	0 %	25 %	50 %	300782526
16006	NC_014318	ATC	2	6	609094	609099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782526
16007	NC_014318	GTC	2	6	609130	609135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782526
16008	NC_014318	CGC	2	6	609398	609403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782527
16009	NC_014318	CCAAGA	2	12	609434	609445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300782527
16010	NC_014318	CCGC	2	8	609548	609555	0 %	0 %	25 %	75 %	300782527
16011	NC_014318	GCC	2	6	609583	609588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782527
16012	NC_014318	CGA	2	6	609624	609629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782527
16013	NC_014318	TGGC	2	8	609651	609658	0 %	25 %	50 %	25 %	300782527
16014	NC_014318	CGC	2	6	609669	609674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782527
16015	NC_014318	CTTC	2	8	609866	609873	0 %	50 %	0 %	50 %	300782527
16016	NC_014318	TCC	2	6	609920	609925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300782527
16017	NC_014318	CGT	2	6	609935	609940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782527
16018	NC_014318	GAA	2	6	609960	609965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782527
16019	NC_014318	CAC	3	9	609975	609983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300782527
16020	NC_014318	GTCTGA	2	12	610048	610059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300782527
16021	NC_014318	CGT	2	6	610137	610142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782528
16022	NC_014318	CGC	2	6	610190	610195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782528
16023	NC_014318	TGC	3	9	610200	610208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782528
16024	NC_014318	CGC	2	6	610219	610224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782528
16025	NC_014318	GTC	2	6	610256	610261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782528
16026	NC_014318	CGGC	2	8	610275	610282	0 %	0 %	50 %	50 %	300782528
16027	NC_014318	ACG	2	6	610335	610340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782528
16028	NC_014318	CGA	2	6	610390	610395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782528
16029	NC_014318	ATC	2	6	610442	610447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782528
16030	NC_014318	CGG	3	9	610461	610469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782528
16031	NC_014318	GCG	2	6	610497	610502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782528
16032	NC_014318	CGG	2	6	610525	610530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782528
16033	NC_014318	GTG	2	6	610544	610549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782528
16034	NC_014318	CGG	2	6	610554	610559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782528
16035	NC_014318	GCT	2	6	610573	610578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782528
16036	NC_014318	GGA	2	6	610582	610587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782528
16037	NC_014318	GCC	2	6	610600	610605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782528
16038	NC_014318	GGCTTC	2	12	610672	610683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782528
16039	NC_014318	GCC	2	6	610757	610762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782528
16040	NC_014318	GGC	3	9	610777	610785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782528
16041	NC_014318	CGG	2	6	610830	610835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782528
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16043	NC_014318	GTCGGC	2	12	610904	610915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300782529
16044	NC_014318	CGA	2	6	610947	610952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782529
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16046	NC_014318	ACG	2	6	611073	611078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782529
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16048	NC_014318	CTG	2	6	611176	611181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782529
16049	NC_014318	CCGC	2	8	611197	611204	0 %	0 %	25 %	75 %	300782529
16050	NC_014318	CGT	2	6	611235	611240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782529
16051	NC_014318	TCG	2	6	611268	611273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782529
16052	NC_014318	TGGT	2	8	611282	611289	0 %	50 %	50 %	0 %	300782529
16053	NC_014318	CGC	2	6	611301	611306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782529
16054	NC_014318	CCT	2	6	611307	611312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300782529
16055	NC_014318	GAA	2	6	611350	611355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782529
16056	NC_014318	CTT	2	6	611419	611424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300782529
16057	NC_014318	CAGC	2	8	611428	611435	25 %	0 %	25 %	50 %	300782529
16058	NC_014318	TCGG	2	8	611462	611469	0 %	25 %	50 %	25 %	300782529
16059	NC_014318	G	6	6	611485	611490	0 %	0 %	100 %	0 %	300782529
16060	NC_014318	GCCC	2	8	611505	611512	0 %	0 %	25 %	75 %	300782529
16061	NC_014318	CTG	2	6	611584	611589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782529
16062	NC_014318	CTG	2	6	611620	611625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782529
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16070	NC_014318	GCGG	2	8	612240	612247	0 %	0 %	75 %	25 %	300782530
16071	NC_014318	TCG	2	6	612284	612289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782530
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16101	NC_014318	CCG	2	6	612996	613001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782531
16102	NC_014318	GCC	2	6	613004	613009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782531
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16104	NC_014318	C	6	6	613539	613544	0 %	0 %	0 %	100 %	300782532
16105	NC_014318	GAT	2	6	613605	613610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300782532
16106	NC_014318	GCT	2	6	613614	613619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782532
16107	NC_014318	GC	3	6	613727	613732	0 %	0 %	50 %	50 %	300782532
16108	NC_014318	GAA	2	6	613788	613793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782532
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16110	NC_014318	AAG	2	6	613861	613866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782532
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16112	NC_014318	GC	3	6	613899	613904	0 %	0 %	50 %	50 %	300782532
16113	NC_014318	ATC	2	6	613939	613944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782532
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16116	NC_014318	CGACG	2	10	614028	614037	20 %	0 %	40 %	40 %	300782532
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16118	NC_014318	TGC	2	6	614138	614143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782532
16119	NC_014318	GTC	2	6	614161	614166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782532
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16233	NC_014318	CGA	2	6	618696	618701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16234	NC_014318	CGG	2	6	618714	618719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782537
16235	NC_014318	CAC	2	6	618723	618728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300782537
16236	NC_014318	ACG	2	6	618773	618778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16237	NC_014318	TCAAGG	2	12	618851	618862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300782537
16238	NC_014318	CTGG	2	8	618867	618874	0 %	25 %	50 %	25 %	300782537
16239	NC_014318	GATCAA	2	12	618894	618905	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300782537
16240	NC_014318	CG	3	6	618980	618985	0 %	0 %	50 %	50 %	300782537
16241	NC_014318	ACG	2	6	619004	619009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16242	NC_014318	ACA	2	6	619046	619051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300782537
16243	NC_014318	AGC	2	6	619061	619066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782537
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16246	NC_014318	CG	3	6	619169	619174	0 %	0 %	50 %	50 %	300782537
16247	NC_014318	CAG	2	6	619177	619182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16248	NC_014318	CTG	2	6	619192	619197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16249	NC_014318	GCT	2	6	619254	619259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16250	NC_014318	CGA	2	6	619260	619265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16251	NC_014318	GCT	2	6	619317	619322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782537
16252	NC_014318	CGA	2	6	619365	619370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782537
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16258	NC_014318	TCG	3	9	619654	619662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782538
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16262	NC_014318	ACC	2	6	619702	619707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300782538
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16264	NC_014318	CGG	2	6	619931	619936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782538
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16335	NC_014318	CCGAA	2	10	622994	623003	40 %	0 %	20 %	40 %	300782540
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16338	NC_014318	GAG	2	6	623119	623124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782540
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16340	NC_014318	TCG	2	6	623150	623155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782540
16341	NC_014318	GCT	2	6	623190	623195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782540
16342	NC_014318	CCTGA	2	10	623199	623208	20 %	20 %	20 %	40 %	300782540
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16344	NC_014318	GCC	2	6	623299	623304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782541
16345	NC_014318	GGCACT	2	12	623341	623352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300782541
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16347	NC_014318	CGG	2	6	623367	623372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782541
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16350	NC_014318	GGC	2	6	623425	623430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782541
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16352	NC_014318	GTG	2	6	623444	623449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782541
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16471	NC_014318	GCA	2	6	627604	627609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782545
16472	NC_014318	GCG	2	6	627659	627664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782545
16473	NC_014318	CGT	2	6	627699	627704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782545
16474	NC_014318	GCC	3	9	627711	627719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782545
16475	NC_014318	GCCG	2	8	627739	627746	0 %	0 %	50 %	50 %	300782545
16476	NC_014318	ACG	2	6	627780	627785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782545
16477	NC_014318	GCT	2	6	627796	627801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782545
16478	NC_014318	CGG	2	6	627802	627807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782545
16479	NC_014318	CGGAC	2	10	627883	627892	20 %	0 %	40 %	40 %	300782545
16480	NC_014318	ATC	2	6	627920	627925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782545
16481	NC_014318	GC	3	6	628241	628246	0 %	0 %	50 %	50 %	300782546
16482	NC_014318	CGG	2	6	628299	628304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782546
16483	NC_014318	GGT	2	6	628346	628351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782546
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16490	NC_014318	ACCC	2	8	628650	628657	25 %	0 %	0 %	75 %	300782547
16491	NC_014318	CCCG	2	8	628688	628695	0 %	0 %	25 %	75 %	300782547
16492	NC_014318	GCT	2	6	628715	628720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782547
16493	NC_014318	CCG	2	6	628739	628744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782547
16494	NC_014318	CAG	2	6	628748	628753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782547
16495	NC_014318	GCC	2	6	628779	628784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782547
16496	NC_014318	TGC	2	6	628855	628860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782547
16497	NC_014318	TCG	2	6	628876	628881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782547
16498	NC_014318	ACG	2	6	628933	628938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782547
16499	NC_014318	GGCCGC	2	12	628958	628969	0 %	0 %	50 %	50 %	300782547
16500	NC_014318	TTC	2	6	628989	628994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300782547

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