MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 1803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013852	GC	3	6	85622	85627	0 %	0 %	50 %	50 %	288947772
1502	NC_013852	GCGCTT	2	12	85641	85652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947772
1503	NC_013852	CG	3	6	85660	85665	0 %	0 %	50 %	50 %	288947772
1504	NC_013852	GC	3	6	85744	85749	0 %	0 %	50 %	50 %	288947772
1505	NC_013852	TGT	2	6	85914	85919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947772
1506	NC_013852	GCTGCC	2	12	85924	85935	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288947772
1507	NC_013852	GC	3	6	85941	85946	0 %	0 %	50 %	50 %	288947772
1508	NC_013852	GCC	2	6	85979	85984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947772
1509	NC_013852	CCA	2	6	86177	86182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947773
1510	NC_013852	CGAT	2	8	86187	86194	25 %	25 %	25 %	25 %	288947773
1511	NC_013852	ACGA	2	8	86195	86202	50 %	0 %	25 %	25 %	288947773
1512	NC_013852	GCCG	2	8	86218	86225	0 %	0 %	50 %	50 %	288947773
1513	NC_013852	CG	3	6	86224	86229	0 %	0 %	50 %	50 %	288947773
1514	NC_013852	CAG	2	6	86273	86278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947773
1515	NC_013852	TGG	2	6	86323	86328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947773
1516	NC_013852	GACG	2	8	86412	86419	25 %	0 %	50 %	25 %	288947773
1517	NC_013852	AGC	2	6	86444	86449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947773
1518	NC_013852	CAC	2	6	86775	86780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947774
1519	NC_013852	ACG	2	6	86793	86798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947774
1520	NC_013852	CT	3	6	86843	86848	0 %	50 %	0 %	50 %	288947774
1521	NC_013852	GC	3	6	86854	86859	0 %	0 %	50 %	50 %	288947774
1522	NC_013852	CG	3	6	86916	86921	0 %	0 %	50 %	50 %	288947774
1523	NC_013852	GC	3	6	86973	86978	0 %	0 %	50 %	50 %	288947774
1524	NC_013852	GCG	3	9	87088	87096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947774
1525	NC_013852	GGGA	2	8	87114	87121	25 %	0 %	75 %	0 %	288947774
1526	NC_013852	TCAAC	2	10	87150	87159	40 %	20 %	0 %	40 %	288947775
1527	NC_013852	GC	3	6	87246	87251	0 %	0 %	50 %	50 %	288947775
1528	NC_013852	CG	3	6	87282	87287	0 %	0 %	50 %	50 %	288947775
1529	NC_013852	CGGG	2	8	87354	87361	0 %	0 %	75 %	25 %	288947775
1530	NC_013852	CGG	2	6	87447	87452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947775
1531	NC_013852	CAG	2	6	87481	87486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947775
1532	NC_013852	ACTTC	2	10	87566	87575	20 %	40 %	0 %	40 %	288947776
1533	NC_013852	GTT	2	6	87629	87634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947776
1534	NC_013852	AGC	2	6	87657	87662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947776
1535	NC_013852	GC	4	8	87732	87739	0 %	0 %	50 %	50 %	288947776
1536	NC_013852	TCG	2	6	87935	87940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947777
1537	NC_013852	ACTG	2	8	88035	88042	25 %	25 %	25 %	25 %	288947777
1538	NC_013852	CG	3	6	88113	88118	0 %	0 %	50 %	50 %	288947777
1539	NC_013852	CAG	2	6	88207	88212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947777
1540	NC_013852	TCGG	2	8	88310	88317	0 %	25 %	50 %	25 %	288947777
1541	NC_013852	CAT	2	6	88354	88359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947777
1542	NC_013852	GCG	2	6	88567	88572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947778
1543	NC_013852	TGGC	2	8	88578	88585	0 %	25 %	50 %	25 %	288947778
1544	NC_013852	CGT	2	6	88598	88603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947778
1545	NC_013852	CAT	2	6	88604	88609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947778
1546	NC_013852	CGA	2	6	88649	88654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947778
1547	NC_013852	TGG	2	6	88693	88698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947778
1548	NC_013852	TGG	2	6	88864	88869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947778
1549	NC_013852	CCG	2	6	88915	88920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947778
1550	NC_013852	GCT	2	6	88928	88933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947778
1551	NC_013852	GC	3	6	88943	88948	0 %	0 %	50 %	50 %	288947778
1552	NC_013852	ATC	2	6	88986	88991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947779
1553	NC_013852	TGG	2	6	89016	89021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947779
1554	NC_013852	CGG	2	6	89031	89036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947779
1555	NC_013852	TCA	2	6	89055	89060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947779
1556	NC_013852	CGAT	2	8	89103	89110	25 %	25 %	25 %	25 %	288947779
1557	NC_013852	CCG	2	6	89168	89173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947779
1558	NC_013852	CAA	2	6	89183	89188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947779
1559	NC_013852	CAG	2	6	89246	89251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947779
1560	NC_013852	GGA	2	6	89260	89265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947779
1561	NC_013852	GCC	2	6	89424	89429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947779
1562	NC_013852	GCT	2	6	89476	89481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947779
1563	NC_013852	TCG	3	9	89487	89495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947779
1564	NC_013852	GCAT	2	8	89589	89596	25 %	25 %	25 %	25 %	288947779
1565	NC_013852	CCG	2	6	89602	89607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947779
1566	NC_013852	ACG	2	6	89623	89628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947779
1567	NC_013852	TGG	2	6	89751	89756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947779
1568	NC_013852	GAT	2	6	89770	89775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947779
1569	NC_013852	CTG	2	6	89783	89788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947779
1570	NC_013852	TGAA	2	8	89820	89827	50 %	25 %	25 %	0 %	288947779
1571	NC_013852	CAT	2	6	89845	89850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947779
1572	NC_013852	G	6	6	89973	89978	0 %	0 %	100 %	0 %	288947779
1573	NC_013852	TGA	2	6	89979	89984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947779
1574	NC_013852	CAG	2	6	90115	90120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947780
1575	NC_013852	GTT	2	6	90148	90153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947780
1576	NC_013852	CAG	2	6	90292	90297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947780
1577	NC_013852	CCA	2	6	90343	90348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947780
1578	NC_013852	CG	3	6	90411	90416	0 %	0 %	50 %	50 %	288947780
1579	NC_013852	GTC	3	9	90418	90426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947780
1580	NC_013852	GGC	2	6	90469	90474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947780
1581	NC_013852	GCG	2	6	90492	90497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947780
1582	NC_013852	TGA	2	6	90549	90554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947780
1583	NC_013852	CAT	2	6	90567	90572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947780
1584	NC_013852	CGGG	2	8	90575	90582	0 %	0 %	75 %	25 %	288947780
1585	NC_013852	ATG	3	9	90692	90700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947781
1586	NC_013852	TGC	2	6	90780	90785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1587	NC_013852	GCG	2	6	90798	90803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947781
1588	NC_013852	TGA	2	6	90813	90818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947781
1589	NC_013852	TCGGC	2	10	90825	90834	0 %	20 %	40 %	40 %	288947781
1590	NC_013852	CAG	2	6	90917	90922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1591	NC_013852	TCGGG	2	10	90969	90978	0 %	20 %	60 %	20 %	288947781
1592	NC_013852	AGC	3	9	91056	91064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1593	NC_013852	CG	3	6	91148	91153	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1594	NC_013852	GCGG	2	8	91192	91199	0 %	0 %	75 %	25 %	288947781
1595	NC_013852	CCG	2	6	91296	91301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947781
1596	NC_013852	CG	3	6	91329	91334	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1597	NC_013852	GC	3	6	91345	91350	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1598	NC_013852	GCT	2	6	91441	91446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1599	NC_013852	CG	3	6	91525	91530	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1600	NC_013852	GCG	2	6	91532	91537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947781
1601	NC_013852	GC	3	6	91558	91563	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1602	NC_013852	GACC	2	8	91630	91637	25 %	0 %	25 %	50 %	288947781
1603	NC_013852	GAA	2	6	91655	91660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947781
1604	NC_013852	GC	3	6	91690	91695	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1605	NC_013852	CGG	2	6	91738	91743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947781
1606	NC_013852	GGT	2	6	91765	91770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947781
1607	NC_013852	CCT	2	6	91777	91782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947781
1608	NC_013852	CG	3	6	91835	91840	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1609	NC_013852	GC	3	6	91874	91879	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1610	NC_013852	GCT	2	6	91891	91896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1611	NC_013852	CTG	2	6	91958	91963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1612	NC_013852	TGA	2	6	91998	92003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947781
1613	NC_013852	TGC	2	6	92010	92015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1614	NC_013852	GC	3	6	92014	92019	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1615	NC_013852	TGC	2	6	92040	92045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1616	NC_013852	TCGG	2	8	92072	92079	0 %	25 %	50 %	25 %	288947781
1617	NC_013852	GGTGC	2	10	92084	92093	0 %	20 %	60 %	20 %	288947781
1618	NC_013852	GC	4	8	92297	92304	0 %	0 %	50 %	50 %	288947781
1619	NC_013852	GCG	2	6	92324	92329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947781
1620	NC_013852	CGA	2	6	92337	92342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947781
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1622	NC_013852	GGT	2	6	92479	92484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947781
1623	NC_013852	GGT	2	6	92506	92511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947781
1624	NC_013852	TGGCCT	2	12	92538	92549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947781
1625	NC_013852	CCA	2	6	92553	92558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947781
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1627	NC_013852	GCA	2	6	92614	92619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947781
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.