MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 1803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013852	GGC	2	6	51548	51553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947726
1002	NC_013852	CCA	2	6	51562	51567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947726
1003	NC_013852	CG	3	6	51593	51598	0 %	0 %	50 %	50 %	288947726
1004	NC_013852	TCA	2	6	51718	51723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947726
1005	NC_013852	TGC	2	6	51733	51738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947726
1006	NC_013852	AGC	2	6	51892	51897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947726
1007	NC_013852	CCA	2	6	52183	52188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947727
1008	NC_013852	CTT	2	6	52242	52247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947727
1009	NC_013852	GAC	2	6	52288	52293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947727
1010	NC_013852	ACA	2	6	52370	52375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947727
1011	NC_013852	CGC	2	6	52412	52417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947727
1012	NC_013852	CAA	2	6	52536	52541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947727
1013	NC_013852	CCA	2	6	52628	52633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947727
1014	NC_013852	ATC	2	6	52732	52737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947727
1015	NC_013852	GGA	2	6	52746	52751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947727
1016	NC_013852	CGG	2	6	52785	52790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947727
1017	NC_013852	CTA	2	6	52818	52823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947727
1018	NC_013852	CGG	2	6	52893	52898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947727
1019	NC_013852	GGCT	2	8	52907	52914	0 %	25 %	50 %	25 %	288947727
1020	NC_013852	GGT	2	6	52957	52962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947727
1021	NC_013852	GGC	2	6	52963	52968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947727
1022	NC_013852	GGA	2	6	52974	52979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947727
1023	NC_013852	GGC	2	6	53052	53057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947727
1024	NC_013852	GATC	2	8	53085	53092	25 %	25 %	25 %	25 %	288947727
1025	NC_013852	CCG	2	6	53182	53187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947728
1026	NC_013852	CAA	2	6	53219	53224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947728
1027	NC_013852	GCGG	2	8	53265	53272	0 %	0 %	75 %	25 %	288947728
1028	NC_013852	GAA	2	6	53304	53309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947728
1029	NC_013852	CG	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	288947728
1030	NC_013852	GCC	2	6	53481	53486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947728
1031	NC_013852	CG	3	6	53514	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	288947728
1032	NC_013852	TGC	2	6	53735	53740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947729
1033	NC_013852	CGC	2	6	53746	53751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947729
1034	NC_013852	CCA	2	6	53779	53784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947729
1035	NC_013852	CAG	2	6	53824	53829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947729
1036	NC_013852	GCG	2	6	53856	53861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947729
1037	NC_013852	CGA	2	6	53922	53927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947729
1038	NC_013852	CGC	2	6	53961	53966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947729
1039	NC_013852	GCG	2	6	53976	53981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947729
1040	NC_013852	TG	3	6	54011	54016	0 %	50 %	50 %	0 %	288947729
1041	NC_013852	GCT	2	6	54090	54095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947729
1042	NC_013852	CGG	2	6	54162	54167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947729
1043	NC_013852	GCT	2	6	54270	54275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947729
1044	NC_013852	GGC	2	6	54304	54309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947729
1045	NC_013852	AGGT	2	8	54320	54327	25 %	25 %	50 %	0 %	288947729
1046	NC_013852	TGC	2	6	54457	54462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947730
1047	NC_013852	CGC	2	6	54480	54485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947730
1048	NC_013852	TCCC	2	8	54554	54561	0 %	25 %	0 %	75 %	288947730
1049	NC_013852	GGACCA	2	12	54599	54610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947730
1050	NC_013852	GTA	2	6	54615	54620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947730
1051	NC_013852	GCT	2	6	54623	54628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947730
1052	NC_013852	GC	3	6	54659	54664	0 %	0 %	50 %	50 %	288947730
1053	NC_013852	CGC	2	6	54815	54820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947731
1054	NC_013852	CGG	2	6	54869	54874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947731
1055	NC_013852	GGA	2	6	54967	54972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947731
1056	NC_013852	CGG	2	6	55205	55210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947731
1057	NC_013852	CA	3	6	55243	55248	50 %	0 %	0 %	50 %	288947731
1058	NC_013852	GGC	2	6	55249	55254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947731
1059	NC_013852	CGC	2	6	55271	55276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947731
1060	NC_013852	GCC	2	6	55324	55329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947731
1061	NC_013852	TCG	2	6	55377	55382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947732
1062	NC_013852	GCG	2	6	55501	55506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947732
1063	NC_013852	CTT	2	6	55529	55534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947732
1064	NC_013852	GAT	2	6	55535	55540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947732
1065	NC_013852	TGG	2	6	55574	55579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947732
1066	NC_013852	TCA	2	6	55611	55616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947732
1067	NC_013852	GGC	2	6	55637	55642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947732
1068	NC_013852	TTC	2	6	55646	55651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947732
1069	NC_013852	TTA	2	6	55686	55691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288947732
1070	NC_013852	CTT	2	6	55894	55899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947732
1071	NC_013852	GC	3	6	56029	56034	0 %	0 %	50 %	50 %	288947732
1072	NC_013852	GT	3	6	56212	56217	0 %	50 %	50 %	0 %	288947732
1073	NC_013852	ATG	2	6	57173	57178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947733
1074	NC_013852	GC	3	6	57259	57264	0 %	0 %	50 %	50 %	288947733
1075	NC_013852	TAT	2	6	57371	57376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288947733
1076	NC_013852	TGC	2	6	57384	57389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947733
1077	NC_013852	GTCA	2	8	57413	57420	25 %	25 %	25 %	25 %	288947733
1078	NC_013852	GCG	2	6	57483	57488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947733
1079	NC_013852	AT	3	6	57900	57905	50 %	50 %	0 %	0 %	288947734
1080	NC_013852	CTT	2	6	57913	57918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947734
1081	NC_013852	GGC	2	6	57931	57936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947734
1082	NC_013852	CTGG	2	8	57972	57979	0 %	25 %	50 %	25 %	288947734
1083	NC_013852	ATCG	2	8	58042	58049	25 %	25 %	25 %	25 %	288947734
1084	NC_013852	TCG	2	6	58151	58156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947734
1085	NC_013852	GGA	2	6	58176	58181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947734
1086	NC_013852	TGG	2	6	58196	58201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947734
1087	NC_013852	AGCC	3	12	58230	58241	25 %	0 %	25 %	50 %	288947734
1088	NC_013852	GC	5	10	58285	58294	0 %	0 %	50 %	50 %	288947734
1089	NC_013852	GC	3	6	58369	58374	0 %	0 %	50 %	50 %	288947734
1090	NC_013852	CAG	2	6	58584	58589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947735
1091	NC_013852	GCC	2	6	58595	58600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947735
1092	NC_013852	CCG	2	6	58630	58635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947735
1093	NC_013852	ATC	2	6	58645	58650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947735
1094	NC_013852	GAA	2	6	58692	58697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947735
1095	NC_013852	GATG	2	8	58769	58776	25 %	25 %	50 %	0 %	288947735
1096	NC_013852	CAA	2	6	58782	58787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947735
1097	NC_013852	TGA	2	6	58792	58797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947735
1098	NC_013852	AGG	2	6	58855	58860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947735
1099	NC_013852	GCA	2	6	58921	58926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947736
1100	NC_013852	TCC	2	6	58943	58948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947736
1101	NC_013852	GC	3	6	58970	58975	0 %	0 %	50 %	50 %	288947736
1102	NC_013852	CGG	2	6	58982	58987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947736
1103	NC_013852	GCG	2	6	59059	59064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947736
1104	NC_013852	TGC	3	9	59110	59118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947736
1105	NC_013852	AAC	2	6	59119	59124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947736
1106	NC_013852	ATTG	2	8	59164	59171	25 %	50 %	25 %	0 %	288947736
1107	NC_013852	TGA	2	6	59193	59198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947737
1108	NC_013852	GCTG	2	8	59374	59381	0 %	25 %	50 %	25 %	288947737
1109	NC_013852	CA	3	6	59389	59394	50 %	0 %	0 %	50 %	288947737
1110	NC_013852	CCGAA	2	10	59398	59407	40 %	0 %	20 %	40 %	288947737
1111	NC_013852	CGA	2	6	59548	59553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947737
1112	NC_013852	CA	3	6	59614	59619	50 %	0 %	0 %	50 %	288947737
1113	NC_013852	GCAA	2	8	59700	59707	50 %	0 %	25 %	25 %	288947737
1114	NC_013852	CAA	2	6	59770	59775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947737
1115	NC_013852	GCC	2	6	59793	59798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947737
1116	NC_013852	GACC	2	8	59870	59877	25 %	0 %	25 %	50 %	288947737
1117	NC_013852	GCC	2	6	59878	59883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947737
1118	NC_013852	TGA	2	6	59926	59931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947737
1119	NC_013852	GCC	2	6	59963	59968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947737
1120	NC_013852	CG	3	6	59982	59987	0 %	0 %	50 %	50 %	288947737
1121	NC_013852	GGTGCC	2	12	60033	60044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288947738
1122	NC_013852	GAT	2	6	60066	60071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947738
1123	NC_013852	TCT	2	6	60076	60081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947738
1124	NC_013852	CGC	2	6	60085	60090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947738
1125	NC_013852	GAT	2	6	60250	60255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947738
1126	NC_013852	GGC	2	6	60788	60793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947739
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1243	NC_013852	GCCACG	2	12	69075	69086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288947751
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1251	NC_013852	AC	3	6	69633	69638	50 %	0 %	0 %	50 %	288947752
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