MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 1803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013852	GAA	2	6	28881	28886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947705
502	NC_013852	GGC	2	6	28887	28892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947705
503	NC_013852	CCG	2	6	29034	29039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947705
504	NC_013852	CGC	2	6	29237	29242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947706
505	NC_013852	TCA	2	6	29262	29267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947706
506	NC_013852	GGC	2	6	29272	29277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947706
507	NC_013852	TGG	2	6	29285	29290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947706
508	NC_013852	ATCT	2	8	29381	29388	25 %	50 %	0 %	25 %	288947706
509	NC_013852	CCG	2	6	29413	29418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947706
510	NC_013852	GCT	2	6	29431	29436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947706
511	NC_013852	GAT	2	6	29443	29448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947706
512	NC_013852	TCA	2	6	29567	29572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947707
513	NC_013852	CTG	3	9	29593	29601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947707
514	NC_013852	GA	3	6	29656	29661	50 %	0 %	50 %	0 %	288947707
515	NC_013852	CGG	2	6	29694	29699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947707
516	NC_013852	TCA	2	6	29708	29713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947707
517	NC_013852	CGG	2	6	29723	29728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947707
518	NC_013852	GTG	2	6	29803	29808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947707
519	NC_013852	CG	3	6	29972	29977	0 %	0 %	50 %	50 %	288947707
520	NC_013852	CAT	2	6	30045	30050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947708
521	NC_013852	CTG	2	6	30064	30069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947708
522	NC_013852	TCG	2	6	30095	30100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947708
523	NC_013852	CGG	2	6	30117	30122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947708
524	NC_013852	ACC	2	6	30161	30166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947708
525	NC_013852	CTG	2	6	30196	30201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947708
526	NC_013852	CTG	2	6	30211	30216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947708
527	NC_013852	CGC	2	6	30219	30224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947708
528	NC_013852	CAT	2	6	30228	30233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947708
529	NC_013852	GCC	2	6	30249	30254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947708
530	NC_013852	GCG	2	6	30627	30632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947709
531	NC_013852	ATG	2	6	30637	30642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947709
532	NC_013852	GCTG	2	8	30815	30822	0 %	25 %	50 %	25 %	288947709
533	NC_013852	CG	4	8	30823	30830	0 %	0 %	50 %	50 %	288947709
534	NC_013852	CGA	2	6	30835	30840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947709
535	NC_013852	GGAG	2	8	30934	30941	25 %	0 %	75 %	0 %	288947709
536	NC_013852	TCT	2	6	30952	30957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947709
537	NC_013852	GCT	2	6	30992	30997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947709
538	NC_013852	GAA	2	6	31095	31100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947709
539	NC_013852	CA	3	6	31106	31111	50 %	0 %	0 %	50 %	288947709
540	NC_013852	GAC	2	6	31115	31120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947709
541	NC_013852	GCG	2	6	31148	31153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947709
542	NC_013852	CGG	2	6	31160	31165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947709
543	NC_013852	GATCGA	2	12	31336	31347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288947710
544	NC_013852	CCG	2	6	31363	31368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947710
545	NC_013852	CCG	2	6	31389	31394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947710
546	NC_013852	AAG	2	6	31397	31402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947710
547	NC_013852	GCC	2	6	31403	31408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947710
548	NC_013852	GC	3	6	31459	31464	0 %	0 %	50 %	50 %	288947710
549	NC_013852	CAAC	3	12	31588	31599	50 %	0 %	0 %	50 %	288947710
550	NC_013852	CAAG	2	8	31670	31677	50 %	0 %	25 %	25 %	288947711
551	NC_013852	TCA	2	6	31678	31683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947711
552	NC_013852	CGA	2	6	31715	31720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947711
553	NC_013852	CG	3	6	31735	31740	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
554	NC_013852	CGC	2	6	31787	31792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947711
555	NC_013852	CCA	2	6	31822	31827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947711
556	NC_013852	CAT	2	6	31856	31861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947711
557	NC_013852	GGC	3	9	31898	31906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947711
558	NC_013852	GC	3	6	31905	31910	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
559	NC_013852	GATCA	2	10	31962	31971	40 %	20 %	20 %	20 %	288947711
560	NC_013852	GCC	2	6	32028	32033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947711
561	NC_013852	GGC	2	6	32054	32059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947711
562	NC_013852	TGA	2	6	32168	32173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947711
563	NC_013852	GAC	2	6	32175	32180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947711
564	NC_013852	TGC	2	6	32194	32199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947711
565	NC_013852	GAT	2	6	32276	32281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947711
566	NC_013852	CGA	2	6	32333	32338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947711
567	NC_013852	GC	3	6	32373	32378	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
568	NC_013852	GAT	2	6	32393	32398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947711
569	NC_013852	CCA	2	6	32468	32473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947711
570	NC_013852	GC	3	6	32541	32546	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
571	NC_013852	GCA	2	6	32572	32577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947711
572	NC_013852	GC	4	8	32581	32588	0 %	0 %	50 %	50 %	288947711
573	NC_013852	GCG	2	6	32651	32656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947711
574	NC_013852	CGG	2	6	32692	32697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947711
575	NC_013852	GGC	2	6	32702	32707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947711
576	NC_013852	CGA	2	6	32750	32755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947711
577	NC_013852	GGT	2	6	32816	32821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947711
578	NC_013852	AGC	2	6	32833	32838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947711
579	NC_013852	GCG	3	9	32983	32991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947712
580	NC_013852	GCCG	2	8	33027	33034	0 %	0 %	50 %	50 %	288947712
581	NC_013852	TCG	2	6	33038	33043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947712
582	NC_013852	GTG	2	6	33067	33072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947712
583	NC_013852	CGC	2	6	33182	33187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947712
584	NC_013852	CGG	2	6	33272	33277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947712
585	NC_013852	TCACC	2	10	33291	33300	20 %	20 %	0 %	60 %	288947712
586	NC_013852	GTTC	2	8	33322	33329	0 %	50 %	25 %	25 %	288947712
587	NC_013852	GC	3	6	33456	33461	0 %	0 %	50 %	50 %	288947712
588	NC_013852	GAG	2	6	33533	33538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947712
589	NC_013852	GTT	2	6	33644	33649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947713
590	NC_013852	CTG	2	6	33663	33668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947713
591	NC_013852	CTGG	2	8	33683	33690	0 %	25 %	50 %	25 %	288947713
592	NC_013852	CGG	2	6	33709	33714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947713
593	NC_013852	ATC	2	6	33730	33735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947713
594	NC_013852	GGC	2	6	33741	33746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947713
595	NC_013852	TGC	2	6	33787	33792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947713
596	NC_013852	CG	3	6	33830	33835	0 %	0 %	50 %	50 %	288947713
597	NC_013852	GCGG	2	8	33866	33873	0 %	0 %	75 %	25 %	288947713
598	NC_013852	CGG	2	6	33886	33891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947713
599	NC_013852	GAA	2	6	33908	33913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947713
600	NC_013852	GCC	2	6	33947	33952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947713
601	NC_013852	CGC	2	6	34024	34029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947713
602	NC_013852	CAG	2	6	34062	34067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947713
603	NC_013852	GTTG	2	8	34090	34097	0 %	50 %	50 %	0 %	288947713
604	NC_013852	TGG	2	6	34113	34118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947713
605	NC_013852	TGG	2	6	34149	34154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947713
606	NC_013852	GCG	2	6	34163	34168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947713
607	NC_013852	GTCGA	2	10	34174	34183	20 %	20 %	40 %	20 %	288947713
608	NC_013852	GAA	2	6	34252	34257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947714
609	NC_013852	CGG	2	6	34263	34268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947714
610	NC_013852	CTG	2	6	34276	34281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947714
611	NC_013852	CCG	2	6	34296	34301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947714
612	NC_013852	GTA	2	6	34327	34332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947714
613	NC_013852	CCG	2	6	34346	34351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947714
614	NC_013852	CCG	2	6	34364	34369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947714
615	NC_013852	AGCGCG	2	12	34382	34393	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288947714
616	NC_013852	ACC	2	6	34435	34440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947714
617	NC_013852	ACC	2	6	34480	34485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947714
618	NC_013852	CAG	2	6	34537	34542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947714
619	NC_013852	CG	3	6	34545	34550	0 %	0 %	50 %	50 %	288947714
620	NC_013852	TCGGGA	2	12	34574	34585	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288947714
621	NC_013852	TCT	2	6	34710	34715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947715
622	NC_013852	CAC	3	9	34744	34752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947715
623	NC_013852	CGGCCC	2	12	34764	34775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947715
624	NC_013852	GCC	2	6	34799	34804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947715
625	NC_013852	CTT	2	6	34840	34845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288947715
626	NC_013852	CGG	2	6	34855	34860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947715
627	NC_013852	CCA	3	9	34869	34877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947715
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