MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 44337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23003	NC_013740	CAG	2	6	1204437	1204442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048414
23004	NC_013740	CGG	2	6	1204557	1204562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284048414
23005	NC_013740	CA	3	6	1204592	1204597	50 %	0 %	0 %	50 %	284048414
23006	NC_013740	CAA	2	6	1204668	1204673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284048415
23007	NC_013740	AGCCA	2	10	1204756	1204765	40 %	0 %	20 %	40 %	284048415
23008	NC_013740	GTA	2	6	1204778	1204783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048415
23009	NC_013740	GCATG	2	10	1204827	1204836	20 %	20 %	40 %	20 %	284048415
23010	NC_013740	GAT	2	6	1204879	1204884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048415
23011	NC_013740	GCA	2	6	1204974	1204979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048415
23012	NC_013740	AC	3	6	1205055	1205060	50 %	0 %	0 %	50 %	284048415
23013	NC_013740	T	6	6	1205107	1205112	0 %	100 %	0 %	0 %	284048415
23014	NC_013740	CAG	2	6	1205113	1205118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048415
23015	NC_013740	ATC	2	6	1205150	1205155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048415
23016	NC_013740	CAG	3	9	1205236	1205244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048415
23017	NC_013740	CTT	2	6	1205337	1205342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048415
23018	NC_013740	CAC	2	6	1205386	1205391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048415
23019	NC_013740	CAG	2	6	1205398	1205403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048415
23020	NC_013740	CAT	2	6	1205448	1205453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048415
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23022	NC_013740	GCA	2	6	1205577	1205582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048415
23023	NC_013740	GGAAGC	2	12	1205608	1205619	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284048415
23024	NC_013740	CCAT	2	8	1205621	1205628	25 %	25 %	0 %	50 %	284048415
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23028	NC_013740	CAT	2	6	1205730	1205735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048415
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23030	NC_013740	GCA	2	6	1205865	1205870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048415
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23032	NC_013740	ATC	2	6	1205909	1205914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048415
23033	NC_013740	CAT	2	6	1205917	1205922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048415
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23052	NC_013740	AAAT	2	8	1206766	1206773	75 %	25 %	0 %	0 %	284048416
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23093	NC_013740	TCCG	2	8	1209998	1210005	0 %	25 %	25 %	50 %	284048422
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23115	NC_013740	TCC	2	6	1211457	1211462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284048424
23116	NC_013740	CAC	2	6	1211513	1211518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048424
23117	NC_013740	CTC	2	6	1211561	1211566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284048424
23118	NC_013740	TGC	2	6	1211575	1211580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284048424
23119	NC_013740	GAA	2	6	1211602	1211607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284048424
23120	NC_013740	GTA	2	6	1211681	1211686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048424
23121	NC_013740	GGA	2	6	1211836	1211841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284048425
23122	NC_013740	GTTCCA	2	12	1211905	1211916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284048425
23123	NC_013740	CAC	2	6	1211987	1211992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048425
23124	NC_013740	GCT	2	6	1212005	1212010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284048425
23125	NC_013740	GAT	2	6	1212164	1212169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048425
23126	NC_013740	TTC	2	6	1212219	1212224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048425
23127	NC_013740	CAT	2	6	1212268	1212273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048425
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23129	NC_013740	CAT	2	6	1212334	1212339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048425
23130	NC_013740	TTC	2	6	1212357	1212362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048425
23131	NC_013740	GGA	2	6	1212441	1212446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284048425
23132	NC_013740	TTC	3	9	1212584	1212592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048425
23133	NC_013740	TTC	2	6	1212623	1212628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048425
23134	NC_013740	TCA	2	6	1212648	1212653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048425
23135	NC_013740	GCA	2	6	1212715	1212720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048425
23136	NC_013740	CCA	2	6	1212802	1212807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048425
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23138	NC_013740	TTCC	2	8	1212829	1212836	0 %	50 %	0 %	50 %	284048425
23139	NC_013740	GAT	2	6	1212869	1212874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048425
23140	NC_013740	GAT	2	6	1212890	1212895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048425
23141	NC_013740	TGA	2	6	1212904	1212909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048425
23142	NC_013740	TTG	2	6	1212939	1212944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284048425
23143	NC_013740	T	6	6	1213027	1213032	0 %	100 %	0 %	0 %	284048425
23144	NC_013740	CAC	2	6	1213133	1213138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048426
23145	NC_013740	TTC	2	6	1213379	1213384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048426
23146	NC_013740	TCT	2	6	1213446	1213451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048426
23147	NC_013740	CAG	2	6	1213526	1213531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048426
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23151	NC_013740	CTT	2	6	1213886	1213891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048427
23152	NC_013740	CCA	2	6	1213895	1213900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048427
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23155	NC_013740	TCT	2	6	1213964	1213969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048427
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23164	NC_013740	A	6	6	1214430	1214435	100 %	0 %	0 %	0 %	284048428
23165	NC_013740	ATGCA	2	10	1214499	1214508	40 %	20 %	20 %	20 %	284048428
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23172	NC_013740	TGACC	2	10	1214971	1214980	20 %	20 %	20 %	40 %	284048429
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23177	NC_013740	T	7	7	1215175	1215181	0 %	100 %	0 %	0 %	284048429
23178	NC_013740	TCC	2	6	1215230	1215235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284048430
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23180	NC_013740	TCTT	2	8	1215278	1215285	0 %	75 %	0 %	25 %	284048430
23181	NC_013740	GCC	2	6	1215369	1215374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284048430
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23183	NC_013740	TGC	2	6	1215449	1215454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284048430
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23185	NC_013740	GATG	2	8	1215672	1215679	25 %	25 %	50 %	0 %	284048430
23186	NC_013740	CAT	2	6	1215687	1215692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048430
23187	NC_013740	GCT	2	6	1215752	1215757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284048430
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23190	NC_013740	ACC	2	6	1215965	1215970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048430
23191	NC_013740	ATTCC	2	10	1215971	1215980	20 %	40 %	0 %	40 %	284048430
23192	NC_013740	ACC	2	6	1216199	1216204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048430
23193	NC_013740	CCG	2	6	1216272	1216277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284048430
23194	NC_013740	CTT	2	6	1216295	1216300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048430
23195	NC_013740	CAC	3	9	1216315	1216323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048430
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23198	NC_013740	CCA	2	6	1216401	1216406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048430
23199	NC_013740	GGT	2	6	1216462	1216467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284048430
23200	NC_013740	CCT	2	6	1216579	1216584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284048431
23201	NC_013740	CAG	2	6	1216599	1216604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048431
23202	NC_013740	CAT	2	6	1216622	1216627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048431
23203	NC_013740	GCA	2	6	1216658	1216663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048431
23204	NC_013740	GCA	2	6	1216682	1216687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048431
23205	NC_013740	TTC	2	6	1216696	1216701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048431
23206	NC_013740	TC	3	6	1216850	1216855	0 %	50 %	0 %	50 %	284048431
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23208	NC_013740	TCA	2	6	1217016	1217021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048432
23209	NC_013740	TATCCG	2	12	1217047	1217058	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284048432
23210	NC_013740	T	6	6	1217162	1217167	0 %	100 %	0 %	0 %	284048432
23211	NC_013740	TCCT	2	8	1217332	1217339	0 %	50 %	0 %	50 %	284048433
23212	NC_013740	GAA	2	6	1217386	1217391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284048433
23213	NC_013740	CAGA	2	8	1217452	1217459	50 %	0 %	25 %	25 %	284048433
23214	NC_013740	TC	3	6	1217491	1217496	0 %	50 %	0 %	50 %	284048433
23215	NC_013740	ATG	2	6	1217502	1217507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048433
23216	NC_013740	TCC	2	6	1217525	1217530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284048433
23217	NC_013740	CCAG	2	8	1217541	1217548	25 %	0 %	25 %	50 %	284048433
23218	NC_013740	TCC	2	6	1217555	1217560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284048433
23219	NC_013740	AGT	2	6	1217691	1217696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048433
23220	NC_013740	CAT	2	6	1217763	1217768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048433
23221	NC_013740	ATGGA	2	10	1217830	1217839	40 %	20 %	40 %	0 %	284048433
23222	NC_013740	CTT	2	6	1217848	1217853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048433
23223	NC_013740	CTT	2	6	1217916	1217921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048433
23224	NC_013740	ATG	2	6	1217936	1217941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048433
23225	NC_013740	CCA	2	6	1218086	1218091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284048433
23226	NC_013740	ATC	2	6	1218101	1218106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048433
23227	NC_013740	CAA	2	6	1218141	1218146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284048433
23228	NC_013740	CTG	2	6	1218148	1218153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284048433
23229	NC_013740	AGA	2	6	1218183	1218188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284048433
23230	NC_013740	GAG	2	6	1218331	1218336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284048433
23231	NC_013740	T	6	6	1218439	1218444	0 %	100 %	0 %	0 %	284048434
23232	NC_013740	CTT	2	6	1218563	1218568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048434
23233	NC_013740	TCT	2	6	1218581	1218586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048434
23234	NC_013740	TGG	2	6	1218807	1218812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284048434
23235	NC_013740	GTT	2	6	1218996	1219001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284048434
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23342	NC_013740	CCGGAG	2	12	1226088	1226099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284048441
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23347	NC_013740	TTG	2	6	1226529	1226534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284048443
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23465	NC_013740	TCC	2	6	1234415	1234420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284048450
23466	NC_013740	ATAAA	2	10	1234423	1234432	80 %	20 %	0 %	0 %	284048450
23467	NC_013740	AGATCC	2	12	1234483	1234494	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284048450
23468	NC_013740	CAT	2	6	1234509	1234514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048450
23469	NC_013740	AT	3	6	1234687	1234692	50 %	50 %	0 %	0 %	284048451
23470	NC_013740	AGA	2	6	1234919	1234924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284048451
23471	NC_013740	GAT	2	6	1234937	1234942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284048451
23472	NC_013740	T	7	7	1234972	1234978	0 %	100 %	0 %	0 %	284048451
23473	NC_013740	GCT	2	6	1235007	1235012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284048451
23474	NC_013740	TCA	2	6	1235078	1235083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048451
23475	NC_013740	TAC	2	6	1235093	1235098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048451
23476	NC_013740	T	7	7	1235102	1235108	0 %	100 %	0 %	0 %	284048451
23477	NC_013740	T	6	6	1235132	1235137	0 %	100 %	0 %	0 %	284048451
23478	NC_013740	TCTGA	2	10	1235141	1235150	20 %	40 %	20 %	20 %	284048451
23479	NC_013740	TA	3	6	1235154	1235159	50 %	50 %	0 %	0 %	284048451
23480	NC_013740	CATA	2	8	1235198	1235205	50 %	25 %	0 %	25 %	284048451
23481	NC_013740	AAGT	2	8	1235534	1235541	50 %	25 %	25 %	0 %	284048451
23482	NC_013740	AAT	2	6	1235568	1235573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284048451
23483	NC_013740	AGG	2	6	1235637	1235642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284048451
23484	NC_013740	CAT	2	6	1235660	1235665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048451
23485	NC_013740	AT	3	6	1235699	1235704	50 %	50 %	0 %	0 %	284048451
23486	NC_013740	CTG	2	6	1235800	1235805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284048451
23487	NC_013740	GC	3	6	1235809	1235814	0 %	0 %	50 %	50 %	284048451
23488	NC_013740	CAA	2	6	1235924	1235929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284048451
23489	NC_013740	CTT	2	6	1235951	1235956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048451
23490	NC_013740	GGA	2	6	1236118	1236123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284048451
23491	NC_013740	CAG	2	6	1236227	1236232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048451
23492	NC_013740	ATC	2	6	1236243	1236248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048451
23493	NC_013740	AT	4	8	1236267	1236274	50 %	50 %	0 %	0 %	284048451
23494	NC_013740	CAT	2	6	1236320	1236325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048451
23495	NC_013740	ACT	2	6	1236331	1236336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284048451
23496	NC_013740	CAATC	2	10	1236395	1236404	40 %	20 %	0 %	40 %	284048451
23497	NC_013740	CTT	2	6	1236413	1236418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284048451
23498	NC_013740	T	8	8	1236424	1236431	0 %	100 %	0 %	0 %	284048451
23499	NC_013740	AGC	2	6	1236467	1236472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284048451
23500	NC_013740	TTA	2	6	1236490	1236495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284048451

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