MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 44337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	A	8	8	42	49	100 %	0 %	0 %	0 %	284047387
2	NC_013740	TGG	2	6	50	55	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047387
3	NC_013740	A	6	6	98	103	100 %	0 %	0 %	0 %	284047387
4	NC_013740	GAA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
5	NC_013740	GTG	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047387
6	NC_013740	GGC	3	9	231	239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047387
7	NC_013740	CAA	2	6	252	257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047387
8	NC_013740	CTT	2	6	279	284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047387
9	NC_013740	TGA	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
10	NC_013740	GAA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
11	NC_013740	TGC	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047387
12	NC_013740	CGA	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047387
13	NC_013740	TCC	2	6	494	499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047387
14	NC_013740	GAA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
15	NC_013740	CAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047387
16	NC_013740	ATC	3	9	568	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047387
17	NC_013740	CCG	2	6	593	598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047387
18	NC_013740	GAT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
19	NC_013740	CCG	2	6	650	655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047387
20	NC_013740	TCC	2	6	692	697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047387
21	NC_013740	TTCCC	2	10	722	731	0 %	40 %	0 %	60 %	284047387
22	NC_013740	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
23	NC_013740	CTG	2	6	745	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047387
24	NC_013740	CAG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047387
25	NC_013740	C	6	6	890	895	0 %	0 %	0 %	100 %	284047387
26	NC_013740	CAG	3	9	919	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047387
27	NC_013740	CGG	2	6	982	987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047387
28	NC_013740	GAT	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
29	NC_013740	GAA	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
30	NC_013740	CAT	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047387
31	NC_013740	A	6	6	1106	1111	100 %	0 %	0 %	0 %	284047387
32	NC_013740	AGG	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047387
33	NC_013740	GAA	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
34	NC_013740	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	284047388
35	NC_013740	GAAC	2	8	1993	2000	50 %	0 %	25 %	25 %	284047388
36	NC_013740	GAACA	2	10	2102	2111	60 %	0 %	20 %	20 %	284047388
37	NC_013740	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047388
38	NC_013740	AGC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
39	NC_013740	TGC	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047388
40	NC_013740	CAG	2	6	2198	2203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
41	NC_013740	ACC	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047388
42	NC_013740	CTG	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047388
43	NC_013740	GGCCCG	2	12	2311	2322	0 %	0 %	50 %	50 %	284047388
44	NC_013740	GCC	2	6	2327	2332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047388
45	NC_013740	CAG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
46	NC_013740	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047388
47	NC_013740	CAG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
48	NC_013740	CCG	2	6	2397	2402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047388
49	NC_013740	CGG	2	6	2412	2417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047388
50	NC_013740	TGA	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047388
51	NC_013740	GCG	2	6	2474	2479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047388
52	NC_013740	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047388
53	NC_013740	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047388
54	NC_013740	ATG	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047389
55	NC_013740	GAA	2	6	2759	2764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
56	NC_013740	GCTG	2	8	2789	2796	0 %	25 %	50 %	25 %	284047389
57	NC_013740	CTGG	2	8	2834	2841	0 %	25 %	50 %	25 %	284047389
58	NC_013740	GGA	2	6	2864	2869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047389
59	NC_013740	CAT	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047389
60	NC_013740	GAA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
61	NC_013740	TGG	2	6	2995	3000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047389
62	NC_013740	AAGG	2	8	3009	3016	50 %	0 %	50 %	0 %	284047389
63	NC_013740	CCCT	2	8	3018	3025	0 %	25 %	0 %	75 %	284047389
64	NC_013740	CGG	2	6	3061	3066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047389
65	NC_013740	GCCG	2	8	3086	3093	0 %	0 %	50 %	50 %	284047389
66	NC_013740	TGA	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047389
67	NC_013740	TGC	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047389
68	NC_013740	CGA	2	6	3431	3436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047389
69	NC_013740	GAA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
70	NC_013740	TTC	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047389
71	NC_013740	ATC	3	9	3519	3527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047389
72	NC_013740	GCC	2	6	3539	3544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047389
73	NC_013740	GAA	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
74	NC_013740	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047389
75	NC_013740	TCC	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047389
76	NC_013740	CCA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047389
77	NC_013740	TGG	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047389
78	NC_013740	GGA	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047389
79	NC_013740	ACCAC	2	10	4033	4042	40 %	0 %	0 %	60 %	284047389
80	NC_013740	TCC	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047389
81	NC_013740	TGG	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047389
82	NC_013740	GAA	2	6	4130	4135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
83	NC_013740	ATG	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047389
84	NC_013740	ATG	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047390
85	NC_013740	GAG	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047390
86	NC_013740	CTG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047390
87	NC_013740	GCC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047390
88	NC_013740	GAA	2	6	4735	4740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047390
89	NC_013740	GGACC	2	10	4767	4776	20 %	0 %	40 %	40 %	284047390
90	NC_013740	GAA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047390
91	NC_013740	CCA	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047390
92	NC_013740	GCCG	2	8	4847	4854	0 %	0 %	50 %	50 %	284047390
93	NC_013740	CCCG	2	8	4984	4991	0 %	0 %	25 %	75 %	284047390
94	NC_013740	GCA	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047390
95	NC_013740	GGT	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047390
96	NC_013740	TAT	2	6	5094	5099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047390
97	NC_013740	TCC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047390
98	NC_013740	TC	3	6	5210	5215	0 %	50 %	0 %	50 %	284047390
99	NC_013740	ACA	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047390
100	NC_013740	CGGA	2	8	5261	5268	25 %	0 %	50 %	25 %	284047390
101	NC_013740	ATC	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047390
102	NC_013740	TTC	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047390
103	NC_013740	ACCA	2	8	5425	5432	50 %	0 %	0 %	50 %	284047390
104	NC_013740	CCGGC	2	10	5443	5452	0 %	0 %	40 %	60 %	284047390
105	NC_013740	GCT	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
106	NC_013740	ACATA	2	10	5579	5588	60 %	20 %	0 %	20 %	284047391
107	NC_013740	T	6	6	5593	5598	0 %	100 %	0 %	0 %	284047391
108	NC_013740	CTG	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
109	NC_013740	CGG	2	6	5647	5652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
110	NC_013740	TTCC	2	8	5663	5670	0 %	50 %	0 %	50 %	284047391
111	NC_013740	GAG	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047391
112	NC_013740	CCTT	2	8	5694	5701	0 %	50 %	0 %	50 %	284047391
113	NC_013740	GGA	2	6	5708	5713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047391
114	NC_013740	GCG	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
115	NC_013740	GCT	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
116	NC_013740	GAA	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
117	NC_013740	CTG	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
118	NC_013740	C	6	6	5830	5835	0 %	0 %	0 %	100 %	284047391
119	NC_013740	GAT	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047391
120	NC_013740	CGG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
121	NC_013740	TAT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047391
122	NC_013740	CTG	2	6	5967	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
123	NC_013740	CAG	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047391
124	NC_013740	CCGGGA	2	12	6023	6034	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284047391
125	NC_013740	GAA	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
126	NC_013740	GCT	2	6	6053	6058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
127	NC_013740	GGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
128	NC_013740	ACC	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047391
129	NC_013740	TCC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047391
130	NC_013740	GGC	2	6	6137	6142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
131	NC_013740	G	6	6	6208	6213	0 %	0 %	100 %	0 %	284047391
132	NC_013740	GAA	2	6	6219	6224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
133	NC_013740	GAC	2	6	6339	6344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047391
134	NC_013740	AGGC	2	8	6362	6369	25 %	0 %	50 %	25 %	284047391
135	NC_013740	ACGG	2	8	6401	6408	25 %	0 %	50 %	25 %	284047391
136	NC_013740	GTCC	2	8	6449	6456	0 %	25 %	25 %	50 %	284047391
137	NC_013740	GAA	2	6	6459	6464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
138	NC_013740	GAT	2	6	6483	6488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047391
139	NC_013740	CGG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
140	NC_013740	TCA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047391
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142	NC_013740	GGA	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047391
143	NC_013740	TCCTGA	2	12	6663	6674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284047392
144	NC_013740	TGA	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047392
145	NC_013740	GCA	2	6	6700	6705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047392
146	NC_013740	GGA	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047392
147	NC_013740	ATG	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047392
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149	NC_013740	CTCC	2	8	6892	6899	0 %	25 %	0 %	75 %	284047392
150	NC_013740	GGA	2	6	6903	6908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047392
151	NC_013740	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047392
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156	NC_013740	CAG	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047392
157	NC_013740	GAA	2	6	7205	7210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047392
158	NC_013740	TCCG	2	8	7287	7294	0 %	25 %	25 %	50 %	284047392
159	NC_013740	AGC	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047392
160	NC_013740	GGA	2	6	7306	7311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047392
161	NC_013740	TTA	2	6	7351	7356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047392
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164	NC_013740	T	6	6	7448	7453	0 %	100 %	0 %	0 %	284047393
165	NC_013740	TG	3	6	7518	7523	0 %	50 %	50 %	0 %	284047393
166	NC_013740	ATC	2	6	7539	7544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047393
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169	NC_013740	GCA	2	6	7720	7725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047394
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173	NC_013740	TCC	2	6	7921	7926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047394
174	NC_013740	CGG	2	6	7967	7972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047394
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242	NC_013740	CCT	2	6	11573	11578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047397
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246	NC_013740	TGA	2	6	11701	11706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047397
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250	NC_013740	GGAA	2	8	11933	11940	50 %	0 %	50 %	0 %	284047397
251	NC_013740	AC	3	6	12041	12046	50 %	0 %	0 %	50 %	284047397
252	NC_013740	ATC	2	6	12069	12074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047397
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257	NC_013740	CCA	2	6	12259	12264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047397
258	NC_013740	GCC	2	6	12297	12302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047397
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262	NC_013740	GAA	2	6	12500	12505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047397
263	NC_013740	CCG	2	6	12521	12526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047397
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265	NC_013740	GTG	2	6	12588	12593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047397
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374	NC_013740	A	6	6	17486	17491	100 %	0 %	0 %	0 %	284047401
375	NC_013740	GATCA	2	10	17606	17615	40 %	20 %	20 %	20 %	284047401
376	NC_013740	GGC	2	6	17624	17629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047401
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381	NC_013740	CCA	2	6	17748	17753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047401
382	NC_013740	GGT	2	6	17779	17784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047401
383	NC_013740	GAA	2	6	17944	17949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047401
384	NC_013740	TTC	2	6	17968	17973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047401
385	NC_013740	ACT	2	6	17979	17984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047401
386	NC_013740	GATG	2	8	17995	18002	25 %	25 %	50 %	0 %	284047401
387	NC_013740	GAA	2	6	18020	18025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047401
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389	NC_013740	CCA	2	6	18105	18110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047401
390	NC_013740	GTAC	2	8	18124	18131	25 %	25 %	25 %	25 %	284047401
391	NC_013740	CTA	2	6	18136	18141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047401
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497	NC_013740	TGC	2	6	23005	23010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047408
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500	NC_013740	CGGC	2	8	23094	23101	0 %	0 %	50 %	50 %	284047408

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