MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid S25

Total Repeats: 614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013438	AGA	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876183
2	NC_013438	TCAAA	2	10	163	172	60 %	20 %	0 %	20 %	261876183
3	NC_013438	TGA	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876183
4	NC_013438	TAC	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876184
5	NC_013438	A	8	8	450	457	100 %	0 %	0 %	0 %	261876184
6	NC_013438	T	6	6	478	483	0 %	100 %	0 %	0 %	261876184
7	NC_013438	TTA	2	6	491	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876184
8	NC_013438	T	6	6	523	528	0 %	100 %	0 %	0 %	261876184
9	NC_013438	ATTT	2	8	533	540	25 %	75 %	0 %	0 %	261876184
10	NC_013438	AC	3	6	543	548	50 %	0 %	0 %	50 %	261876184
11	NC_013438	AATT	2	8	555	562	50 %	50 %	0 %	0 %	261876184
12	NC_013438	CCG	2	6	739	744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261876185
13	NC_013438	TCA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876186
14	NC_013438	AATT	2	8	1561	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	261876187
15	NC_013438	TAAC	2	8	1666	1673	50 %	25 %	0 %	25 %	261876187
16	NC_013438	CAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876187
17	NC_013438	AAG	2	6	1681	1686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876187
18	NC_013438	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876187
19	NC_013438	TAA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876187
20	NC_013438	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876187
21	NC_013438	TAAA	2	8	1855	1862	75 %	25 %	0 %	0 %	261876187
22	NC_013438	CAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876187
23	NC_013438	ATTTA	2	10	1928	1937	40 %	60 %	0 %	0 %	261876187
24	NC_013438	TTA	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876187
25	NC_013438	TAA	3	9	2162	2170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876187
26	NC_013438	ACA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876187
27	NC_013438	T	6	6	2224	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	261876187
28	NC_013438	AGAA	2	8	2248	2255	75 %	0 %	25 %	0 %	261876187
29	NC_013438	GAA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876187
30	NC_013438	GAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876187
31	NC_013438	CAAAA	2	10	2330	2339	80 %	0 %	0 %	20 %	261876187
32	NC_013438	CAAGG	2	10	2357	2366	40 %	0 %	40 %	20 %	261876187
33	NC_013438	ATT	2	6	2419	2424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876187
34	NC_013438	CAAG	2	8	2461	2468	50 %	0 %	25 %	25 %	261876187
35	NC_013438	T	6	6	2478	2483	0 %	100 %	0 %	0 %	261876187
36	NC_013438	AGA	2	6	2764	2769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876188
37	NC_013438	T	7	7	2824	2830	0 %	100 %	0 %	0 %	261876188
38	NC_013438	AC	3	6	2843	2848	50 %	0 %	0 %	50 %	261876188
39	NC_013438	TAA	2	6	2893	2898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876188
40	NC_013438	AAG	2	6	2915	2920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876189
41	NC_013438	TTA	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876189
42	NC_013438	TAT	2	6	2940	2945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876189
43	NC_013438	AG	3	6	2979	2984	50 %	0 %	50 %	0 %	261876189
44	NC_013438	TGCTAT	2	12	3000	3011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261876189
45	NC_013438	CCAA	2	8	3036	3043	50 %	0 %	0 %	50 %	261876189
46	NC_013438	A	6	6	3062	3067	100 %	0 %	0 %	0 %	261876189
47	NC_013438	TGA	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876189
48	NC_013438	ATT	2	6	3098	3103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876189
49	NC_013438	TAA	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876189
50	NC_013438	TAA	2	6	3234	3239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876189
51	NC_013438	GTT	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876189
52	NC_013438	TTTC	2	8	3281	3288	0 %	75 %	0 %	25 %	261876189
53	NC_013438	CAA	2	6	3345	3350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876189
54	NC_013438	TTG	2	6	3371	3376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876189
55	NC_013438	A	6	6	3439	3444	100 %	0 %	0 %	0 %	261876189
56	NC_013438	TCAA	2	8	3502	3509	50 %	25 %	0 %	25 %	261876189
57	NC_013438	TCAA	2	8	3531	3538	50 %	25 %	0 %	25 %	261876189
58	NC_013438	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876189
59	NC_013438	TAA	2	6	3582	3587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876190
60	NC_013438	AAAC	2	8	3592	3599	75 %	0 %	0 %	25 %	261876190
61	NC_013438	TCAA	2	8	3637	3644	50 %	25 %	0 %	25 %	261876190
62	NC_013438	AAG	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876190
63	NC_013438	TACT	2	8	3728	3735	25 %	50 %	0 %	25 %	261876190
64	NC_013438	GTA	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876190
65	NC_013438	GTT	2	6	3772	3777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876190
66	NC_013438	GGT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261876190
67	NC_013438	GCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261876190
68	NC_013438	GTT	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876191
69	NC_013438	CTTT	2	8	4119	4126	0 %	75 %	0 %	25 %	261876191
70	NC_013438	GTAT	2	8	4139	4146	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
71	NC_013438	AT	3	6	4157	4162	50 %	50 %	0 %	0 %	261876191
72	NC_013438	TATTT	2	10	4175	4184	20 %	80 %	0 %	0 %	261876191
73	NC_013438	TCT	2	6	4185	4190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261876191
74	NC_013438	A	6	6	4233	4238	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
75	NC_013438	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
76	NC_013438	TTA	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876191
77	NC_013438	A	8	8	4357	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
78	NC_013438	A	7	7	4424	4430	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
79	NC_013438	TTC	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261876191
80	NC_013438	AGA	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
81	NC_013438	TGT	2	6	4462	4467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261876191
82	NC_013438	ATG	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
83	NC_013438	A	7	7	4762	4768	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
84	NC_013438	A	6	6	4787	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
85	NC_013438	AGA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
86	NC_013438	ACG	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261876191
87	NC_013438	ACG	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261876191
88	NC_013438	TGATA	2	10	5029	5038	40 %	40 %	20 %	0 %	261876191
89	NC_013438	ACGC	2	8	5123	5130	25 %	0 %	25 %	50 %	261876191
90	NC_013438	TTGA	2	8	5219	5226	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
91	NC_013438	AGA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
92	NC_013438	CAA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876191
93	NC_013438	TAT	2	6	5286	5291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876191
94	NC_013438	ATGT	2	8	5319	5326	25 %	50 %	25 %	0 %	261876191
95	NC_013438	ATC	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876191
96	NC_013438	AAG	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
97	NC_013438	A	6	6	5382	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
98	NC_013438	ATA	2	6	5553	5558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876191
99	NC_013438	AAAC	2	8	5613	5620	75 %	0 %	0 %	25 %	261876191
100	NC_013438	TCA	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876191
101	NC_013438	ATTT	2	8	5825	5832	25 %	75 %	0 %	0 %	261876191
102	NC_013438	CGTG	2	8	5860	5867	0 %	25 %	50 %	25 %	261876191
103	NC_013438	A	7	7	5934	5940	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
104	NC_013438	AGA	2	6	6022	6027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876191
105	NC_013438	CGTG	2	8	6040	6047	0 %	25 %	50 %	25 %	261876191
106	NC_013438	CGT	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261876191
107	NC_013438	A	6	6	6161	6166	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
108	NC_013438	AATC	2	8	6274	6281	50 %	25 %	0 %	25 %	261876191
109	NC_013438	TGA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
110	NC_013438	ATT	2	6	6593	6598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876191
111	NC_013438	GAT	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
112	NC_013438	A	6	6	6635	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	261876191
113	NC_013438	ATG	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876191
114	NC_013438	AAT	2	6	6824	6829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876191
115	NC_013438	CAA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876192
116	NC_013438	A	7	7	7099	7105	100 %	0 %	0 %	0 %	261876192
117	NC_013438	ACA	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876192
118	NC_013438	ATGA	2	8	7170	7177	50 %	25 %	25 %	0 %	261876192
119	NC_013438	TGA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261876192
120	NC_013438	CAA	2	6	7303	7308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876192
121	NC_013438	A	8	8	7339	7346	100 %	0 %	0 %	0 %	261876192
122	NC_013438	ATT	2	6	7359	7364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876192
123	NC_013438	GAA	2	6	7376	7381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876192
124	NC_013438	AAG	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261876192
125	NC_013438	AATGC	2	10	7494	7503	40 %	20 %	20 %	20 %	261876192
126	NC_013438	TTA	2	6	7518	7523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876192
127	NC_013438	CGCA	2	8	7575	7582	25 %	0 %	25 %	50 %	261876192
128	NC_013438	AAAAGC	2	12	7588	7599	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261876192
129	NC_013438	A	7	7	7662	7668	100 %	0 %	0 %	0 %	261876193
130	NC_013438	ATT	2	6	7673	7678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876193
131	NC_013438	TAT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261876193
132	NC_013438	A	8	8	7723	7730	100 %	0 %	0 %	0 %	261876193
133	NC_013438	AAC	2	6	7747	7752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876193
134	NC_013438	ACT	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876193
135	NC_013438	AAC	2	6	7804	7809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261876193
136	NC_013438	CTAAAT	2	12	7837	7848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261876193
137	NC_013438	TAA	2	6	7891	7896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876194
138	NC_013438	GT	3	6	7960	7965	0 %	50 %	50 %	0 %	261876194
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