MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 37973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_013416	ATT	2	6	642235	642240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867411
11503	NC_013416	T	7	7	642239	642245	0 %	100 %	0 %	0 %	261867411
11504	NC_013416	ATC	2	6	642283	642288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867412
11505	NC_013416	TTC	2	6	642303	642308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867412
11506	NC_013416	T	6	6	642341	642346	0 %	100 %	0 %	0 %	261867412
11507	NC_013416	CGA	2	6	642402	642407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867412
11508	NC_013416	ATC	2	6	642409	642414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867412
11509	NC_013416	GCC	2	6	642423	642428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867412
11510	NC_013416	TCA	2	6	642499	642504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867412
11511	NC_013416	A	6	6	642504	642509	100 %	0 %	0 %	0 %	261867412
11512	NC_013416	CTG	2	6	642555	642560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867412
11513	NC_013416	T	7	7	642628	642634	0 %	100 %	0 %	0 %	261867412
11514	NC_013416	T	6	6	642654	642659	0 %	100 %	0 %	0 %	261867412
11515	NC_013416	CTGGT	2	10	642841	642850	0 %	40 %	40 %	20 %	261867412
11516	NC_013416	GAAA	2	8	642936	642943	75 %	0 %	25 %	0 %	261867412
11517	NC_013416	AT	3	6	642952	642957	50 %	50 %	0 %	0 %	261867412
11518	NC_013416	TTG	2	6	642958	642963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867412
11519	NC_013416	TTC	2	6	643059	643064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867412
11520	NC_013416	AT	3	6	643135	643140	50 %	50 %	0 %	0 %	261867412
11521	NC_013416	TCC	2	6	643147	643152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261867412
11522	NC_013416	TGA	2	6	643198	643203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867412
11523	NC_013416	AAT	2	6	643263	643268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867412
11524	NC_013416	TTG	2	6	643311	643316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867412
11525	NC_013416	TCCAGT	2	12	643360	643371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261867412
11526	NC_013416	T	6	6	643391	643396	0 %	100 %	0 %	0 %	261867412
11527	NC_013416	TGA	2	6	643498	643503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867412
11528	NC_013416	TCA	2	6	643582	643587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867412
11529	NC_013416	AAT	2	6	643605	643610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867412
11530	NC_013416	GTC	2	6	643689	643694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867412
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11532	NC_013416	AT	3	6	643724	643729	50 %	50 %	0 %	0 %	261867412
11533	NC_013416	T	6	6	643729	643734	0 %	100 %	0 %	0 %	261867412
11534	NC_013416	TTA	2	6	643935	643940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867413
11535	NC_013416	A	6	6	643940	643945	100 %	0 %	0 %	0 %	261867413
11536	NC_013416	TTGC	2	8	643965	643972	0 %	50 %	25 %	25 %	261867413
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11540	NC_013416	ATT	2	6	644106	644111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867413
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11543	NC_013416	A	6	6	644175	644180	100 %	0 %	0 %	0 %	261867413
11544	NC_013416	ATT	2	6	644190	644195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867413
11545	NC_013416	TAT	2	6	644261	644266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867413
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11549	NC_013416	AAC	2	6	644443	644448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867413
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11551	NC_013416	ACT	2	6	644547	644552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867413
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11553	NC_013416	GGCA	2	8	644646	644653	25 %	0 %	50 %	25 %	261867413
11554	NC_013416	ATG	2	6	644672	644677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867413
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11556	NC_013416	GCTATT	2	12	644755	644766	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261867414
11557	NC_013416	TAT	2	6	644812	644817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867414
11558	NC_013416	GTC	2	6	644827	644832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867414
11559	NC_013416	ATT	2	6	644931	644936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867415
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11591	NC_013416	GC	3	6	647331	647336	0 %	0 %	50 %	50 %	261867417
11592	NC_013416	TATT	2	8	647338	647345	25 %	75 %	0 %	0 %	261867417
11593	NC_013416	ATTCTG	2	12	647402	647413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261867417
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11601	NC_013416	TGG	2	6	647965	647970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867418
11602	NC_013416	TC	3	6	648042	648047	0 %	50 %	0 %	50 %	261867418
11603	NC_013416	CAC	2	6	648097	648102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867418
11604	NC_013416	CAA	2	6	648125	648130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867418
11605	NC_013416	AAT	2	6	648202	648207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867418
11606	NC_013416	TTTC	2	8	648304	648311	0 %	75 %	0 %	25 %	261867418
11607	NC_013416	CTG	2	6	648362	648367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867418
11608	NC_013416	CAGTG	2	10	648371	648380	20 %	20 %	40 %	20 %	261867418
11609	NC_013416	ATA	2	6	648425	648430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867418
11610	NC_013416	T	6	6	648451	648456	0 %	100 %	0 %	0 %	261867418
11611	NC_013416	ACGCC	2	10	648490	648499	20 %	0 %	20 %	60 %	261867418
11612	NC_013416	TTCA	2	8	648518	648525	25 %	50 %	0 %	25 %	261867418
11613	NC_013416	T	6	6	648611	648616	0 %	100 %	0 %	0 %	261867418
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11617	NC_013416	TAAT	2	8	648814	648821	50 %	50 %	0 %	0 %	261867418
11618	NC_013416	AGA	2	6	648836	648841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867418
11619	NC_013416	CCGC	2	8	648939	648946	0 %	0 %	25 %	75 %	261867418
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11982	NC_013416	GATTT	2	10	667616	667625	20 %	60 %	20 %	0 %	261867438
11983	NC_013416	ATT	2	6	667667	667672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867438
11984	NC_013416	A	6	6	667679	667684	100 %	0 %	0 %	0 %	261867438
11985	NC_013416	TGC	2	6	667725	667730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867438
11986	NC_013416	A	6	6	667791	667796	100 %	0 %	0 %	0 %	261867438
11987	NC_013416	TTG	2	6	667820	667825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867438
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11990	NC_013416	A	6	6	668004	668009	100 %	0 %	0 %	0 %	261867438
11991	NC_013416	ACC	2	6	668021	668026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867438
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11995	NC_013416	GGC	2	6	668365	668370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867439
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11998	NC_013416	TGG	2	6	668471	668476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867439
11999	NC_013416	CAA	2	6	668539	668544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867439
12000	NC_013416	TTC	2	6	668569	668574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867439

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