MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 42276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_013385	CTT	2	6	1375180	1375185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893226
27003	NC_013385	TCACGC	2	12	1375206	1375217	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893226
27004	NC_013385	CTC	2	6	1375234	1375239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893227
27005	NC_013385	GCC	2	6	1375243	1375248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893227
27006	NC_013385	CGC	2	6	1375302	1375307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893227
27007	NC_013385	TG	3	6	1375330	1375335	0 %	50 %	50 %	0 %	260893227
27008	NC_013385	CG	3	6	1375378	1375383	0 %	0 %	50 %	50 %	260893227
27009	NC_013385	CTGC	2	8	1375453	1375460	0 %	25 %	25 %	50 %	260893227
27010	NC_013385	CGG	2	6	1375499	1375504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893227
27011	NC_013385	CGG	3	9	1375508	1375516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893227
27012	NC_013385	TCG	2	6	1375550	1375555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893227
27013	NC_013385	CCA	2	6	1375564	1375569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893227
27014	NC_013385	TCG	2	6	1375577	1375582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893227
27015	NC_013385	GTC	2	6	1375730	1375735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27016	NC_013385	CGG	2	6	1375772	1375777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893228
27017	NC_013385	GTC	2	6	1375925	1375930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27018	NC_013385	CGACCA	2	12	1376179	1376190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893228
27019	NC_013385	CTG	2	6	1376207	1376212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27020	NC_013385	AGG	2	6	1376247	1376252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893228
27021	NC_013385	GTG	2	6	1376253	1376258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893228
27022	NC_013385	CCG	2	6	1376266	1376271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893228
27023	NC_013385	CAG	2	6	1376318	1376323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27024	NC_013385	CAG	2	6	1376339	1376344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27025	NC_013385	CAGC	2	8	1376395	1376402	25 %	0 %	25 %	50 %	260893228
27026	NC_013385	CAGG	2	8	1376406	1376413	25 %	0 %	50 %	25 %	260893228
27027	NC_013385	ACT	2	6	1376439	1376444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893228
27028	NC_013385	CGC	2	6	1376456	1376461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893228
27029	NC_013385	GAA	2	6	1376492	1376497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893228
27030	NC_013385	GCC	2	6	1376519	1376524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893228
27031	NC_013385	CCG	2	6	1376536	1376541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893228
27032	NC_013385	CAG	2	6	1376555	1376560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27033	NC_013385	GTC	2	6	1376561	1376566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27034	NC_013385	TCC	2	6	1376619	1376624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893228
27035	NC_013385	ACCGCC	2	12	1376649	1376660	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893228
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27037	NC_013385	CTG	2	6	1376717	1376722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893228
27038	NC_013385	CCG	2	6	1376728	1376733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893228
27039	NC_013385	CCG	2	6	1376854	1376859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893228
27040	NC_013385	GGGC	2	8	1376872	1376879	0 %	0 %	75 %	25 %	260893228
27041	NC_013385	GGGC	2	8	1376896	1376903	0 %	0 %	75 %	25 %	260893228
27042	NC_013385	CCA	2	6	1376923	1376928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893228
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27044	NC_013385	GCC	2	6	1377027	1377032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893228
27045	NC_013385	CG	3	6	1377038	1377043	0 %	0 %	50 %	50 %	260893228
27046	NC_013385	ACCGGA	2	12	1377077	1377088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893228
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27049	NC_013385	TCC	2	6	1377441	1377446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893229
27050	NC_013385	GTA	2	6	1377453	1377458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893229
27051	NC_013385	CGT	2	6	1377490	1377495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893229
27052	NC_013385	GC	3	6	1377535	1377540	0 %	0 %	50 %	50 %	260893229
27053	NC_013385	CCA	2	6	1377604	1377609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893229
27054	NC_013385	GCCC	3	12	1377630	1377641	0 %	0 %	25 %	75 %	260893229
27055	NC_013385	CGGC	2	8	1377642	1377649	0 %	0 %	50 %	50 %	260893229
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27058	NC_013385	TGC	2	6	1377748	1377753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893229
27059	NC_013385	CAC	2	6	1377754	1377759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893229
27060	NC_013385	CCTG	2	8	1378013	1378020	0 %	25 %	25 %	50 %	260893229
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27063	NC_013385	CCG	2	6	1378111	1378116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893229
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27067	NC_013385	CGC	3	9	1378211	1378219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893229
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27069	NC_013385	GTTCC	2	10	1378331	1378340	0 %	40 %	20 %	40 %	260893229
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27083	NC_013385	CGA	2	6	1379010	1379015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893230
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27085	NC_013385	CG	3	6	1379030	1379035	0 %	0 %	50 %	50 %	260893230
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27087	NC_013385	CCGT	2	8	1379154	1379161	0 %	25 %	25 %	50 %	260893230
27088	NC_013385	CGGCG	2	10	1379166	1379175	0 %	0 %	60 %	40 %	260893230
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27096	NC_013385	TCG	2	6	1379522	1379527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893230
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27100	NC_013385	G	6	6	1379587	1379592	0 %	0 %	100 %	0 %	260893230
27101	NC_013385	AGG	2	6	1379666	1379671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893230
27102	NC_013385	TCT	2	6	1379801	1379806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893230
27103	NC_013385	GA	3	6	1379808	1379813	50 %	0 %	50 %	0 %	260893230
27104	NC_013385	CTT	2	6	1379824	1379829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893230
27105	NC_013385	TCT	2	6	1379873	1379878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893230
27106	NC_013385	GCT	2	6	1380050	1380055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893231
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27111	NC_013385	GCCC	2	8	1380309	1380316	0 %	0 %	25 %	75 %	260893231
27112	NC_013385	GCC	2	6	1380327	1380332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893231
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27114	NC_013385	CG	3	6	1380418	1380423	0 %	0 %	50 %	50 %	260893231
27115	NC_013385	GAG	2	6	1380441	1380446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893231
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27117	NC_013385	CGC	2	6	1380564	1380569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893231
27118	NC_013385	T	6	6	1380622	1380627	0 %	100 %	0 %	0 %	260893231
27119	NC_013385	CCT	2	6	1380649	1380654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893231
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27121	NC_013385	GCT	2	6	1380858	1380863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893232
27122	NC_013385	CCA	2	6	1380905	1380910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893232
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27154	NC_013385	TCT	3	9	1381994	1382002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893233
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27220	NC_013385	CA	3	6	1386119	1386124	50 %	0 %	0 %	50 %	260893237
27221	NC_013385	CCT	2	6	1386193	1386198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893237
27222	NC_013385	ACCT	2	8	1386357	1386364	25 %	25 %	0 %	50 %	260893238
27223	NC_013385	GGCCAG	2	12	1386366	1386377	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893238
27224	NC_013385	GCG	2	6	1386409	1386414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893238
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27226	NC_013385	GAG	2	6	1386431	1386436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893238
27227	NC_013385	CCT	2	6	1386455	1386460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893238
27228	NC_013385	CCA	2	6	1386506	1386511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893238
27229	NC_013385	C	6	6	1386639	1386644	0 %	0 %	0 %	100 %	260893238
27230	NC_013385	AAG	2	6	1386674	1386679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893238
27231	NC_013385	GTG	2	6	1386700	1386705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893238
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27346	NC_013385	A	7	7	1390905	1390911	100 %	0 %	0 %	0 %	260893244
27347	NC_013385	GCC	2	6	1390929	1390934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893244
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