MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 42276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_013385	GAT	2	6	1211663	1211668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893058
24002	NC_013385	GGA	2	6	1211675	1211680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893058
24003	NC_013385	CCG	2	6	1211731	1211736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893058
24004	NC_013385	TCT	2	6	1211906	1211911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893059
24005	NC_013385	GCC	2	6	1211916	1211921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893059
24006	NC_013385	CTT	2	6	1211985	1211990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893059
24007	NC_013385	TGG	2	6	1212071	1212076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893059
24008	NC_013385	TTC	2	6	1212151	1212156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893059
24009	NC_013385	C	6	6	1212184	1212189	0 %	0 %	0 %	100 %	260893059
24010	NC_013385	TCG	2	6	1212190	1212195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893059
24011	NC_013385	ATC	2	6	1212241	1212246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893059
24012	NC_013385	TCA	2	6	1212268	1212273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893059
24013	NC_013385	GC	3	6	1212356	1212361	0 %	0 %	50 %	50 %	260893059
24014	NC_013385	CCG	2	6	1212386	1212391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893059
24015	NC_013385	GAA	2	6	1212435	1212440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893059
24016	NC_013385	TAC	2	6	1212444	1212449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893059
24017	NC_013385	ACC	3	9	1212547	1212555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893059
24018	NC_013385	CCA	2	6	1212599	1212604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893059
24019	NC_013385	TGA	2	6	1212611	1212616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893059
24020	NC_013385	TCT	2	6	1212644	1212649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893059
24021	NC_013385	TTC	3	9	1212742	1212750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893059
24022	NC_013385	CAC	2	6	1212768	1212773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893059
24023	NC_013385	CAGAC	2	10	1212796	1212805	40 %	0 %	20 %	40 %	260893059
24024	NC_013385	CTT	2	6	1212834	1212839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893059
24025	NC_013385	GGTC	2	8	1212875	1212882	0 %	25 %	50 %	25 %	260893059
24026	NC_013385	TGG	2	6	1212893	1212898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893059
24027	NC_013385	AT	3	6	1213012	1213017	50 %	50 %	0 %	0 %	260893059
24028	NC_013385	TTCC	2	8	1213160	1213167	0 %	50 %	0 %	50 %	260893060
24029	NC_013385	CGC	2	6	1213199	1213204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893060
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24031	NC_013385	TCT	3	9	1213313	1213321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893060
24032	NC_013385	TTC	2	6	1213347	1213352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893060
24033	NC_013385	CGC	2	6	1213364	1213369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893060
24034	NC_013385	CG	4	8	1213378	1213385	0 %	0 %	50 %	50 %	260893060
24035	NC_013385	TCC	2	6	1213408	1213413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893060
24036	NC_013385	CGG	2	6	1213471	1213476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893060
24037	NC_013385	CGC	2	6	1213568	1213573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893060
24038	NC_013385	CGT	2	6	1213577	1213582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893060
24039	NC_013385	CCA	2	6	1213595	1213600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893060
24040	NC_013385	TCCTCG	2	12	1213603	1213614	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893060
24041	NC_013385	T	6	6	1213617	1213622	0 %	100 %	0 %	0 %	260893060
24042	NC_013385	CCA	2	6	1213700	1213705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893060
24043	NC_013385	ATTTTT	2	12	1214196	1214207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	260893061
24044	NC_013385	AAG	2	6	1214208	1214213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893061
24045	NC_013385	TCC	2	6	1214279	1214284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893061
24046	NC_013385	CAG	2	6	1214512	1214517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893061
24047	NC_013385	C	6	6	1214544	1214549	0 %	0 %	0 %	100 %	260893061
24048	NC_013385	GAG	2	6	1214602	1214607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893061
24049	NC_013385	CCT	2	6	1214727	1214732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893061
24050	NC_013385	CAGG	2	8	1214784	1214791	25 %	0 %	50 %	25 %	260893061
24051	NC_013385	A	6	6	1214833	1214838	100 %	0 %	0 %	0 %	260893061
24052	NC_013385	CGG	2	6	1214854	1214859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893061
24053	NC_013385	CTT	2	6	1214862	1214867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893061
24054	NC_013385	TTCCA	2	10	1214883	1214892	20 %	40 %	0 %	40 %	260893061
24055	NC_013385	CTT	2	6	1214907	1214912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893061
24056	NC_013385	TGA	2	6	1214967	1214972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893061
24057	NC_013385	GCG	2	6	1214976	1214981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893061
24058	NC_013385	GAAA	2	8	1214982	1214989	75 %	0 %	25 %	0 %	260893061
24059	NC_013385	CCA	2	6	1215135	1215140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893062
24060	NC_013385	CGAT	2	8	1215177	1215184	25 %	25 %	25 %	25 %	260893062
24061	NC_013385	TCCA	2	8	1215194	1215201	25 %	25 %	0 %	50 %	260893062
24062	NC_013385	ACC	2	6	1215281	1215286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893062
24063	NC_013385	TGA	2	6	1215300	1215305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893062
24064	NC_013385	GAT	2	6	1215355	1215360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893062
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24067	NC_013385	CAC	2	6	1215478	1215483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893062
24068	NC_013385	GCC	3	9	1215542	1215550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893062
24069	NC_013385	CGA	2	6	1215582	1215587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893062
24070	NC_013385	GAG	2	6	1215598	1215603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893062
24071	NC_013385	GAA	2	6	1215604	1215609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893062
24072	NC_013385	ACC	2	6	1215627	1215632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893062
24073	NC_013385	AG	3	6	1215633	1215638	50 %	0 %	50 %	0 %	260893062
24074	NC_013385	CCA	2	6	1215657	1215662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893062
24075	NC_013385	GAA	2	6	1215742	1215747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893062
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24078	NC_013385	AGG	2	6	1215938	1215943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893062
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24081	NC_013385	TGC	2	6	1216147	1216152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893062
24082	NC_013385	GTC	2	6	1216231	1216236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893062
24083	NC_013385	CCG	2	6	1216256	1216261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893062
24084	NC_013385	AT	3	6	1216492	1216497	50 %	50 %	0 %	0 %	260893063
24085	NC_013385	CCAC	2	8	1216512	1216519	25 %	0 %	0 %	75 %	260893063
24086	NC_013385	CT	3	6	1216560	1216565	0 %	50 %	0 %	50 %	260893063
24087	NC_013385	ATG	2	6	1216683	1216688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893063
24088	NC_013385	CCA	2	6	1216915	1216920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893063
24089	NC_013385	GCG	2	6	1216957	1216962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893063
24090	NC_013385	GTC	2	6	1217006	1217011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893063
24091	NC_013385	AGA	2	6	1217085	1217090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893063
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24098	NC_013385	GGAA	2	8	1217456	1217463	50 %	0 %	50 %	0 %	260893064
24099	NC_013385	GCTC	2	8	1217498	1217505	0 %	25 %	25 %	50 %	260893064
24100	NC_013385	CTT	2	6	1217540	1217545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893064
24101	NC_013385	G	6	6	1217623	1217628	0 %	0 %	100 %	0 %	260893064
24102	NC_013385	TCCC	2	8	1217655	1217662	0 %	25 %	0 %	75 %	260893064
24103	NC_013385	GCCG	2	8	1217667	1217674	0 %	0 %	50 %	50 %	260893064
24104	NC_013385	CT	3	6	1217710	1217715	0 %	50 %	0 %	50 %	260893064
24105	NC_013385	A	6	6	1217723	1217728	100 %	0 %	0 %	0 %	260893064
24106	NC_013385	AAG	2	6	1217743	1217748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893064
24107	NC_013385	TCG	2	6	1217902	1217907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893064
24108	NC_013385	GGT	2	6	1217930	1217935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893064
24109	NC_013385	TC	3	6	1217961	1217966	0 %	50 %	0 %	50 %	260893064
24110	NC_013385	TACG	2	8	1217969	1217976	25 %	25 %	25 %	25 %	260893064
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24112	NC_013385	CTT	2	6	1218068	1218073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893064
24113	NC_013385	CTT	2	6	1218138	1218143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893064
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24115	NC_013385	CAG	2	6	1218323	1218328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893065
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24117	NC_013385	CCA	2	6	1218418	1218423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893065
24118	NC_013385	TCC	2	6	1218462	1218467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893065
24119	NC_013385	CGT	2	6	1218520	1218525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893065
24120	NC_013385	GC	3	6	1218548	1218553	0 %	0 %	50 %	50 %	260893065
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24137	NC_013385	TAG	2	6	1219156	1219161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893065
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24233	NC_013385	AGCC	2	8	1223850	1223857	25 %	0 %	25 %	50 %	260893071
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24468	NC_013385	CGG	2	6	1236209	1236214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893088
24469	NC_013385	ACC	2	6	1236290	1236295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893088
24470	NC_013385	TGA	2	6	1236306	1236311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893088
24471	NC_013385	G	6	6	1236345	1236350	0 %	0 %	100 %	0 %	260893088
24472	NC_013385	GAA	2	6	1236362	1236367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893088
24473	NC_013385	TTG	2	6	1236383	1236388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893088
24474	NC_013385	ACC	2	6	1236398	1236403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893088
24475	NC_013385	CCT	2	6	1236414	1236419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893088
24476	NC_013385	CCAGAA	2	12	1236471	1236482	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260893088
24477	NC_013385	GC	3	6	1236494	1236499	0 %	0 %	50 %	50 %	260893088
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24479	NC_013385	CCT	3	9	1236540	1236548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893088
24480	NC_013385	GCG	2	6	1236559	1236564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893088
24481	NC_013385	GAA	2	6	1236613	1236618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893088
24482	NC_013385	GGT	2	6	1236637	1236642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893088
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24484	NC_013385	TCC	2	6	1236773	1236778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893088
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24487	NC_013385	CGG	2	6	1236892	1236897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893088
24488	NC_013385	ACC	2	6	1236923	1236928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893088
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24490	NC_013385	CCG	2	6	1236949	1236954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893088
24491	NC_013385	CCA	2	6	1237005	1237010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893088
24492	NC_013385	CCA	2	6	1237092	1237097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893088
24493	NC_013385	CCA	2	6	1237110	1237115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893088
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24497	NC_013385	CAC	2	6	1237258	1237263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893088
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24499	NC_013385	CGC	2	6	1237296	1237301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893089
24500	NC_013385	CTC	2	6	1237326	1237331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893089

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