MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 42276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013385	GCC	2	6	250889	250894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892174
5002	NC_013385	GCCA	2	8	250904	250911	25 %	0 %	25 %	50 %	260892174
5003	NC_013385	CCA	2	6	250915	250920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892174
5004	NC_013385	GCT	2	6	250936	250941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892174
5005	NC_013385	TCC	2	6	250970	250975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892174
5006	NC_013385	G	6	6	250994	250999	0 %	0 %	100 %	0 %	260892174
5007	NC_013385	AGC	2	6	251029	251034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892174
5008	NC_013385	CAG	2	6	251059	251064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892174
5009	NC_013385	GCG	2	6	251115	251120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892174
5010	NC_013385	GAGC	2	8	251130	251137	25 %	0 %	50 %	25 %	260892174
5011	NC_013385	CGC	2	6	251177	251182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892174
5012	NC_013385	GCTTG	2	10	251192	251201	0 %	40 %	40 %	20 %	260892174
5013	NC_013385	AGGAG	2	10	251212	251221	40 %	0 %	60 %	0 %	260892174
5014	NC_013385	CTGC	2	8	251225	251232	0 %	25 %	25 %	50 %	260892174
5015	NC_013385	GAAGAG	2	12	251246	251257	50 %	0 %	50 %	0 %	260892174
5016	NC_013385	CGA	2	6	251311	251316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892174
5017	NC_013385	TTC	2	6	251342	251347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892174
5018	NC_013385	CGC	2	6	251363	251368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892174
5019	NC_013385	GCG	2	6	251414	251419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892174
5020	NC_013385	GAG	2	6	251420	251425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892174
5021	NC_013385	ATC	2	6	251426	251431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892174
5022	NC_013385	GAG	2	6	251445	251450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892174
5023	NC_013385	GCG	2	6	251489	251494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892174
5024	NC_013385	GAG	2	6	251510	251515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892174
5025	NC_013385	GGT	2	6	251518	251523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892174
5026	NC_013385	GGA	2	6	251542	251547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892174
5027	NC_013385	GGC	2	6	251617	251622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892174
5028	NC_013385	GGT	2	6	251626	251631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892174
5029	NC_013385	CTG	2	6	251709	251714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892174
5030	NC_013385	GGA	2	6	251831	251836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892175
5031	NC_013385	CGG	2	6	251844	251849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892175
5032	NC_013385	GGA	2	6	251855	251860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892175
5033	NC_013385	CTA	2	6	251897	251902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892175
5034	NC_013385	CCAC	2	8	251929	251936	25 %	0 %	0 %	75 %	260892175
5035	NC_013385	GGT	2	6	251951	251956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892175
5036	NC_013385	GGT	2	6	251975	251980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892175
5037	NC_013385	GAT	2	6	252023	252028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892175
5038	NC_013385	GAA	2	6	252051	252056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892175
5039	NC_013385	GCA	2	6	252170	252175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5040	NC_013385	AGC	2	6	252193	252198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5041	NC_013385	AGA	2	6	252214	252219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892176
5042	NC_013385	CTAC	2	8	252274	252281	25 %	25 %	0 %	50 %	260892176
5043	NC_013385	GGC	2	6	252290	252295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892176
5044	NC_013385	CTT	2	6	252298	252303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892176
5045	NC_013385	TAACA	2	10	252359	252368	60 %	20 %	0 %	20 %	260892176
5046	NC_013385	CGG	2	6	252424	252429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892176
5047	NC_013385	ATCA	2	8	252467	252474	50 %	25 %	0 %	25 %	260892176
5048	NC_013385	GGT	2	6	252548	252553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892176
5049	NC_013385	GCA	2	6	252557	252562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5050	NC_013385	ATC	2	6	252582	252587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892176
5051	NC_013385	CCAG	2	8	252589	252596	25 %	0 %	25 %	50 %	260892176
5052	NC_013385	ACT	2	6	252597	252602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892176
5053	NC_013385	CCA	2	6	252637	252642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892176
5054	NC_013385	AGC	2	6	252753	252758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5055	NC_013385	TCG	2	6	252871	252876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5056	NC_013385	CGGC	2	8	252940	252947	0 %	0 %	50 %	50 %	260892176
5057	NC_013385	AGC	2	6	252984	252989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5058	NC_013385	ACC	2	6	253062	253067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892176
5059	NC_013385	GAT	2	6	253095	253100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892176
5060	NC_013385	CCAG	2	8	253180	253187	25 %	0 %	25 %	50 %	260892176
5061	NC_013385	ACT	2	6	253248	253253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892176
5062	NC_013385	ACT	2	6	253282	253287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892176
5063	NC_013385	TC	3	6	253288	253293	0 %	50 %	0 %	50 %	260892176
5064	NC_013385	GTA	2	6	253303	253308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892176
5065	NC_013385	GGA	2	6	253331	253336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892176
5066	NC_013385	AG	3	6	253350	253355	50 %	0 %	50 %	0 %	260892176
5067	NC_013385	GCA	2	6	253367	253372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5068	NC_013385	GAA	2	6	253386	253391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892176
5069	NC_013385	CTCAA	2	10	253399	253408	40 %	20 %	0 %	40 %	260892176
5070	NC_013385	AGC	2	6	253416	253421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892176
5071	NC_013385	TGGC	2	8	253422	253429	0 %	25 %	50 %	25 %	260892176
5072	NC_013385	AGC	2	6	253479	253484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892177
5073	NC_013385	CAA	2	6	253485	253490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260892177
5074	NC_013385	GCACC	2	10	253511	253520	20 %	0 %	20 %	60 %	260892177
5075	NC_013385	ACG	2	6	253547	253552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892177
5076	NC_013385	GGA	2	6	253635	253640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892177
5077	NC_013385	ACT	2	6	253712	253717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892177
5078	NC_013385	AGG	2	6	253769	253774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892177
5079	NC_013385	G	6	6	253826	253831	0 %	0 %	100 %	0 %	260892177
5080	NC_013385	AGAA	2	8	253925	253932	75 %	0 %	25 %	0 %	260892178
5081	NC_013385	GGCA	2	8	253942	253949	25 %	0 %	50 %	25 %	260892178
5082	NC_013385	GCC	2	6	253994	253999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892178
5083	NC_013385	AGG	2	6	254009	254014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892178
5084	NC_013385	GCTT	2	8	254015	254022	0 %	50 %	25 %	25 %	260892178
5085	NC_013385	GAA	2	6	254071	254076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892178
5086	NC_013385	GCT	2	6	254091	254096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892178
5087	NC_013385	A	6	6	254157	254162	100 %	0 %	0 %	0 %	260892178
5088	NC_013385	G	7	7	254182	254188	0 %	0 %	100 %	0 %	260892178
5089	NC_013385	TTA	2	6	254225	254230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260892179
5090	NC_013385	GGC	2	6	254381	254386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892179
5091	NC_013385	CCCG	2	8	254450	254457	0 %	0 %	25 %	75 %	260892179
5092	NC_013385	GTT	2	6	254517	254522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260892179
5093	NC_013385	CAG	2	6	254543	254548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892179
5094	NC_013385	GCCT	2	8	254569	254576	0 %	25 %	25 %	50 %	260892179
5095	NC_013385	ATC	2	6	254656	254661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892179
5096	NC_013385	CTT	2	6	254666	254671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892179
5097	NC_013385	GGA	2	6	254699	254704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892179
5098	NC_013385	TCCC	2	8	254768	254775	0 %	25 %	0 %	75 %	260892179
5099	NC_013385	GCA	2	6	254813	254818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892179
5100	NC_013385	TGA	2	6	254900	254905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892179
5101	NC_013385	ATA	3	9	254919	254927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260892179
5102	NC_013385	A	6	6	255057	255062	100 %	0 %	0 %	0 %	260892179
5103	NC_013385	CGG	2	6	255112	255117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892179
5104	NC_013385	CAA	2	6	255164	255169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260892179
5105	NC_013385	CTG	2	6	255204	255209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892179
5106	NC_013385	AAG	2	6	255277	255282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892179
5107	NC_013385	GCT	3	9	255387	255395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892179
5108	NC_013385	GCT	2	6	255423	255428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892179
5109	NC_013385	TAT	2	6	255459	255464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260892179
5110	NC_013385	AGT	2	6	255509	255514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892179
5111	NC_013385	GCCG	2	8	255558	255565	0 %	0 %	50 %	50 %	260892179
5112	NC_013385	GGC	2	6	255628	255633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892179
5113	NC_013385	CCT	2	6	255654	255659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892179
5114	NC_013385	CCA	2	6	255729	255734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892179
5115	NC_013385	CTG	2	6	255818	255823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892179
5116	NC_013385	GAC	2	6	255840	255845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892179
5117	NC_013385	AGG	2	6	255922	255927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892179
5118	NC_013385	CTT	2	6	255942	255947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892179
5119	NC_013385	TTG	2	6	256061	256066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260892179
5120	NC_013385	AGCT	2	8	256156	256163	25 %	25 %	25 %	25 %	260892179
5121	NC_013385	GTA	2	6	256182	256187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892179
5122	NC_013385	GAA	2	6	256203	256208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892179
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5125	NC_013385	CT	3	6	256406	256411	0 %	50 %	0 %	50 %	260892179
5126	NC_013385	GGT	2	6	256421	256426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892179
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5129	NC_013385	TACGG	2	10	256552	256561	20 %	20 %	40 %	20 %	260892179
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5134	NC_013385	GA	3	6	256854	256859	50 %	0 %	50 %	0 %	260892179
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5227	NC_013385	GCCGC	2	10	261221	261230	0 %	0 %	40 %	60 %	260892183
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5237	NC_013385	CTG	2	6	261795	261800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892185
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5239	NC_013385	TCTTCC	2	12	261935	261946	0 %	50 %	0 %	50 %	260892186
5240	NC_013385	TGG	2	6	262038	262043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892186
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5242	NC_013385	AC	3	6	262676	262681	50 %	0 %	0 %	50 %	260892187
5243	NC_013385	CCA	2	6	262685	262690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892187
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5245	NC_013385	CA	3	6	262787	262792	50 %	0 %	0 %	50 %	260892187
5246	NC_013385	CGC	3	9	262793	262801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892187
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5255	NC_013385	ACG	2	6	263331	263336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892187
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5365	NC_013385	TCT	2	6	273418	273423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892195
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5484	NC_013385	GGC	2	6	278957	278962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892200
5485	NC_013385	AGC	2	6	279034	279039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892200
5486	NC_013385	AAC	2	6	279042	279047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260892200
5487	NC_013385	CAC	2	6	279116	279121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892200
5488	NC_013385	TGG	2	6	279130	279135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892200
5489	NC_013385	GCG	2	6	279148	279153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892200
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5491	NC_013385	GGC	2	6	279224	279229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892200
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