MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 1273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013207	CGG	2	6	42840	42845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793080
502	NC_013207	ATT	2	6	42999	43004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257793081
503	NC_013207	GC	3	6	43020	43025	0 %	0 %	50 %	50 %	257793081
504	NC_013207	GC	3	6	43029	43034	0 %	0 %	50 %	50 %	257793081
505	NC_013207	TGC	2	6	43072	43077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793081
506	NC_013207	ATC	2	6	43104	43109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793081
507	NC_013207	CTG	2	6	43113	43118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793081
508	NC_013207	TG	3	6	43190	43195	0 %	50 %	50 %	0 %	257793081
509	NC_013207	GGCT	2	8	43747	43754	0 %	25 %	50 %	25 %	257793082
510	NC_013207	ATC	2	6	43817	43822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793082
511	NC_013207	GAAA	2	8	43838	43845	75 %	0 %	25 %	0 %	257793082
512	NC_013207	TTTG	2	8	44138	44145	0 %	75 %	25 %	0 %	257793083
513	NC_013207	GC	4	8	44224	44231	0 %	0 %	50 %	50 %	257793083
514	NC_013207	CGC	2	6	44274	44279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793083
515	NC_013207	GGC	2	6	44280	44285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793083
516	NC_013207	CGG	2	6	44300	44305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793083
517	NC_013207	GTG	2	6	44311	44316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793083
518	NC_013207	GAC	2	6	44340	44345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
519	NC_013207	AG	3	6	44391	44396	50 %	0 %	50 %	0 %	257793083
520	NC_013207	CGC	2	6	44417	44422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793083
521	NC_013207	GTC	2	6	44439	44444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793083
522	NC_013207	CAA	2	6	44508	44513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793083
523	NC_013207	TGG	2	6	44549	44554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793083
524	NC_013207	GTCG	2	8	44568	44575	0 %	25 %	50 %	25 %	257793083
525	NC_013207	ATGG	2	8	44589	44596	25 %	25 %	50 %	0 %	257793083
526	NC_013207	TCA	2	6	44609	44614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793083
527	NC_013207	GACGCC	2	12	44637	44648	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257793083
528	NC_013207	TTCA	2	8	44662	44669	25 %	50 %	0 %	25 %	257793083
529	NC_013207	CGA	2	6	44702	44707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
530	NC_013207	ACG	2	6	44752	44757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
531	NC_013207	GGA	2	6	44835	44840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793083
532	NC_013207	AGC	2	6	44888	44893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793083
533	NC_013207	TCTTGC	2	12	45328	45339	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	257793084
534	NC_013207	CGATT	2	10	45340	45349	20 %	40 %	20 %	20 %	257793084
535	NC_013207	GAG	2	6	45390	45395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793084
536	NC_013207	ATGA	2	8	45408	45415	50 %	25 %	25 %	0 %	257793084
537	NC_013207	GGC	2	6	45439	45444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793084
538	NC_013207	GAT	2	6	45446	45451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793084
539	NC_013207	T	6	6	45465	45470	0 %	100 %	0 %	0 %	257793084
540	NC_013207	GCAT	2	8	45532	45539	25 %	25 %	25 %	25 %	257793084
541	NC_013207	CCGT	2	8	45603	45610	0 %	25 %	25 %	50 %	257793084
542	NC_013207	CCTT	2	8	45611	45618	0 %	50 %	0 %	50 %	257793084
543	NC_013207	CTT	2	6	45629	45634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793084
544	NC_013207	GCCT	2	8	45687	45694	0 %	25 %	25 %	50 %	257793084
545	NC_013207	AAG	2	6	45714	45719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793084
546	NC_013207	GTT	2	6	45784	45789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793085
547	NC_013207	CCG	2	6	45933	45938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793085
548	NC_013207	CGGG	2	8	45949	45956	0 %	0 %	75 %	25 %	257793085
549	NC_013207	TGT	2	6	46016	46021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793085
550	NC_013207	AG	3	6	46159	46164	50 %	0 %	50 %	0 %	257793085
551	NC_013207	ACG	2	6	46184	46189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793085
552	NC_013207	CAT	2	6	46199	46204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793085
553	NC_013207	TCA	2	6	46260	46265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793085
554	NC_013207	GATGAA	2	12	47016	47027	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	257793086
555	NC_013207	GC	3	6	47051	47056	0 %	0 %	50 %	50 %	257793086
556	NC_013207	GCGCC	2	10	47075	47084	0 %	0 %	40 %	60 %	257793086
557	NC_013207	GCG	2	6	47105	47110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793086
558	NC_013207	GAA	2	6	47142	47147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793086
559	NC_013207	GCAG	2	8	47358	47365	25 %	0 %	50 %	25 %	257793086
560	NC_013207	ACG	2	6	47425	47430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
561	NC_013207	GGT	2	6	47479	47484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793086
562	NC_013207	CAG	2	6	47498	47503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
563	NC_013207	GAGC	2	8	47522	47529	25 %	0 %	50 %	25 %	257793086
564	NC_013207	TCAATC	2	12	47537	47548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793086
565	NC_013207	ACG	3	9	47671	47679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
566	NC_013207	CGC	2	6	47705	47710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793086
567	NC_013207	CGC	2	6	47732	47737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257793086
568	NC_013207	GCA	2	6	47766	47771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
569	NC_013207	CAC	2	6	47787	47792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793086
570	NC_013207	AAC	2	6	47815	47820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793086
571	NC_013207	TCT	2	6	47849	47854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793086
572	NC_013207	GCA	2	6	47874	47879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
573	NC_013207	GTGG	2	8	47913	47920	0 %	25 %	75 %	0 %	257793086
574	NC_013207	TGG	2	6	47943	47948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793086
575	NC_013207	ATG	2	6	47951	47956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793086
576	NC_013207	AGT	2	6	47958	47963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793086
577	NC_013207	GAG	2	6	47978	47983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793086
578	NC_013207	CGA	2	6	48018	48023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793086
579	NC_013207	TCC	2	6	48108	48113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793086
580	NC_013207	AATC	2	8	48222	48229	50 %	25 %	0 %	25 %	257793086
581	NC_013207	GAA	2	6	48362	48367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793087
582	NC_013207	GGT	2	6	48383	48388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793087
583	NC_013207	GAC	2	6	48392	48397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
584	NC_013207	GGC	2	6	48449	48454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
585	NC_013207	GGA	2	6	48523	48528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257793087
586	NC_013207	ATCA	2	8	48731	48738	50 %	25 %	0 %	25 %	257793087
587	NC_013207	CCGTC	2	10	48776	48785	0 %	20 %	20 %	60 %	257793087
588	NC_013207	GCA	2	6	48843	48848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
589	NC_013207	TCT	2	6	48927	48932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793087
590	NC_013207	TCC	2	6	48936	48941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257793087
591	NC_013207	ATGT	2	8	48957	48964	25 %	50 %	25 %	0 %	257793087
592	NC_013207	GTC	2	6	48990	48995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793087
593	NC_013207	AGC	2	6	49092	49097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
594	NC_013207	CAT	3	9	49181	49189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793087
595	NC_013207	CGGCA	2	10	49190	49199	20 %	0 %	40 %	40 %	257793087
596	NC_013207	GGC	2	6	49205	49210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
597	NC_013207	GGC	2	6	49218	49223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
598	NC_013207	CGA	2	6	49249	49254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
599	NC_013207	GC	3	6	49291	49296	0 %	0 %	50 %	50 %	257793087
600	NC_013207	GTT	2	6	49400	49405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793087
601	NC_013207	GTGG	2	8	49422	49429	0 %	25 %	75 %	0 %	257793087
602	NC_013207	GGC	2	6	49511	49516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
603	NC_013207	CAA	2	6	49529	49534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793087
604	NC_013207	GTT	2	6	49556	49561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257793087
605	NC_013207	ACCA	2	8	49671	49678	50 %	0 %	0 %	50 %	257793087
606	NC_013207	GCA	2	6	49712	49717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
607	NC_013207	GGT	2	6	49719	49724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257793087
608	NC_013207	CTT	2	6	49817	49822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257793087
609	NC_013207	GCG	2	6	49834	49839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
610	NC_013207	ACG	2	6	49858	49863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
611	NC_013207	AGCC	2	8	49917	49924	25 %	0 %	25 %	50 %	257793087
612	NC_013207	CGA	2	6	49957	49962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257793087
613	NC_013207	AAC	2	6	49980	49985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793087
614	NC_013207	TGA	2	6	49988	49993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257793087
615	NC_013207	CGG	2	6	50021	50026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
616	NC_013207	ATC	2	6	50163	50168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793087
617	NC_013207	TCG	2	6	50238	50243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793087
618	NC_013207	CGT	2	6	50269	50274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257793087
619	NC_013207	CAA	2	6	50309	50314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793087
620	NC_013207	GGC	2	6	50337	50342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
621	NC_013207	GGC	2	6	50394	50399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
622	NC_013207	CGG	2	6	50420	50425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257793087
623	NC_013207	ACA	2	6	50464	50469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257793087
624	NC_013207	GAA	2	6	50567	50572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257793087
625	NC_013207	CCA	2	6	50614	50619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257793087
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627	NC_013207	ATC	2	6	50697	50702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257793087
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