MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40004	NC_013205	CGG	2	6	2036732	2036737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511957
40005	NC_013205	GC	3	6	2036787	2036792	0 %	0 %	50 %	50 %	258511957
40006	NC_013205	CGG	2	6	2036803	2036808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511957
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40012	NC_013205	GCCG	2	8	2037064	2037071	0 %	0 %	50 %	50 %	258511957
40013	NC_013205	CCG	2	6	2037127	2037132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511957
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40017	NC_013205	GTC	2	6	2037242	2037247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511957
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40118	NC_013205	TCG	2	6	2040555	2040560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511960
40119	NC_013205	CGA	2	6	2040598	2040603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511960
40120	NC_013205	CAC	2	6	2040641	2040646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511960
40121	NC_013205	CGC	2	6	2040665	2040670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511960
40122	NC_013205	GC	3	6	2040692	2040697	0 %	0 %	50 %	50 %	258511960
40123	NC_013205	ACC	2	6	2040735	2040740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511960
40124	NC_013205	TCT	2	6	2040811	2040816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511960
40125	NC_013205	GC	4	8	2040871	2040878	0 %	0 %	50 %	50 %	258511960
40126	NC_013205	GGC	2	6	2040944	2040949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511960
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40130	NC_013205	GCA	2	6	2041069	2041074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511960
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40133	NC_013205	ACG	2	6	2041253	2041258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511961
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40135	NC_013205	GATCGA	2	12	2041398	2041409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258511961
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40146	NC_013205	CGG	2	6	2041894	2041899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511961
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40153	NC_013205	CGT	2	6	2042278	2042283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511962
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40155	NC_013205	TCG	2	6	2042348	2042353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511962
40156	NC_013205	GCC	2	6	2042360	2042365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511962
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40187	NC_013205	CCT	2	6	2043708	2043713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
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40190	NC_013205	CGC	2	6	2043858	2043863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
40191	NC_013205	GCG	2	6	2043864	2043869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511963
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40193	NC_013205	GCA	2	6	2043939	2043944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
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40201	NC_013205	CGA	2	6	2044149	2044154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
40202	NC_013205	CCT	2	6	2044209	2044214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
40203	NC_013205	CCG	2	6	2044238	2044243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
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40205	NC_013205	TCG	2	6	2044314	2044319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
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40213	NC_013205	CTT	2	6	2044525	2044530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511963
40214	NC_013205	ATG	2	6	2044553	2044558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
40215	NC_013205	GTC	2	6	2044570	2044575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
40216	NC_013205	GCC	2	6	2044576	2044581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
40217	NC_013205	GGT	2	6	2044584	2044589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511963
40218	NC_013205	TCG	2	6	2044599	2044604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
40219	NC_013205	GCC	3	9	2044657	2044665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
40220	NC_013205	TGGTC	2	10	2044683	2044692	0 %	40 %	40 %	20 %	258511963
40221	NC_013205	TCC	2	6	2044694	2044699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511963
40222	NC_013205	TGA	2	6	2044740	2044745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
40223	NC_013205	CG	3	6	2044782	2044787	0 %	0 %	50 %	50 %	258511963
40224	NC_013205	GCTG	2	8	2044797	2044804	0 %	25 %	50 %	25 %	258511963
40225	NC_013205	TGA	2	6	2044827	2044832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
40226	NC_013205	ATC	2	6	2044892	2044897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511963
40227	NC_013205	GCG	2	6	2044911	2044916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511963
40228	NC_013205	GAT	2	6	2044975	2044980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511963
40229	NC_013205	ACG	2	6	2045057	2045062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
40230	NC_013205	CGT	2	6	2045068	2045073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511963
40231	NC_013205	GAC	2	6	2045098	2045103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511963
40232	NC_013205	CGC	2	6	2045109	2045114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511963
40233	NC_013205	TGG	2	6	2045139	2045144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511963
40234	NC_013205	GCA	2	6	2045283	2045288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511964
40235	NC_013205	GCA	2	6	2045301	2045306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511964
40236	NC_013205	CG	3	6	2045503	2045508	0 %	0 %	50 %	50 %	258511964
40237	NC_013205	GCA	2	6	2045529	2045534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511964
40238	NC_013205	AGC	2	6	2045543	2045548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511964
40239	NC_013205	CCGC	2	8	2045616	2045623	0 %	0 %	25 %	75 %	258511964
40240	NC_013205	TGC	2	6	2045636	2045641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511964
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40244	NC_013205	GA	3	6	2045726	2045731	50 %	0 %	50 %	0 %	258511964
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40247	NC_013205	TCCGCC	2	12	2045792	2045803	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258511964
40248	NC_013205	CGC	3	9	2045809	2045817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511964
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40263	NC_013205	GCC	3	9	2046481	2046489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511965
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40331	NC_013205	CCTT	2	8	2050193	2050200	0 %	50 %	0 %	50 %	258511968
40332	NC_013205	CAC	2	6	2050244	2050249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511968
40333	NC_013205	GAG	2	6	2050351	2050356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511968
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40335	NC_013205	AC	3	6	2050510	2050515	50 %	0 %	0 %	50 %	258511968
40336	NC_013205	CAGTTC	2	12	2050729	2050740	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258511968
40337	NC_013205	CGCGC	2	10	2050744	2050753	0 %	0 %	40 %	60 %	258511968
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40340	NC_013205	GC	3	6	2050902	2050907	0 %	0 %	50 %	50 %	258511969
40341	NC_013205	CGT	3	9	2051068	2051076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511969
40342	NC_013205	GCC	2	6	2051211	2051216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511969
40343	NC_013205	CG	3	6	2051219	2051224	0 %	0 %	50 %	50 %	258511969
40344	NC_013205	TGC	2	6	2051225	2051230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511969
40345	NC_013205	GTC	2	6	2051234	2051239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511969
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40465	NC_013205	GAT	2	6	2057468	2057473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511976
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40469	NC_013205	CG	3	6	2057565	2057570	0 %	0 %	50 %	50 %	258511976
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