MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_013205	CGT	2	6	1990413	1990418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511905
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39004	NC_013205	GAA	2	6	1990760	1990765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511906
39005	NC_013205	GCT	2	6	1990813	1990818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511906
39006	NC_013205	TGG	2	6	1990860	1990865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511906
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39011	NC_013205	CTG	2	6	1991084	1991089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511906
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39016	NC_013205	ACG	2	6	1991253	1991258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511906
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39089	NC_013205	CG	4	8	1994223	1994230	0 %	0 %	50 %	50 %	258511909
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39105	NC_013205	TCCACG	2	12	1994725	1994736	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258511910
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39110	NC_013205	CAT	2	6	1994886	1994891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511910
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39452	NC_013205	GAGC	2	8	2011589	2011596	25 %	0 %	50 %	25 %	258511930
39453	NC_013205	CGAGA	2	10	2011629	2011638	40 %	0 %	40 %	20 %	258511930
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39462	NC_013205	CGA	2	6	2012072	2012077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511930
39463	NC_013205	CGT	2	6	2012162	2012167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511930
39464	NC_013205	TG	3	6	2012190	2012195	0 %	50 %	50 %	0 %	258511930
39465	NC_013205	CG	3	6	2012205	2012210	0 %	0 %	50 %	50 %	258511930
39466	NC_013205	CG	4	8	2012316	2012323	0 %	0 %	50 %	50 %	258511930
39467	NC_013205	CGTGAC	2	12	2012330	2012341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258511930
39468	NC_013205	CG	3	6	2012353	2012358	0 %	0 %	50 %	50 %	258511930
39469	NC_013205	TCT	2	6	2012366	2012371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511930
39470	NC_013205	AAGC	2	8	2012375	2012382	50 %	0 %	25 %	25 %	258511930
39471	NC_013205	TCG	2	6	2012458	2012463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511931
39472	NC_013205	CCT	2	6	2012538	2012543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511931
39473	NC_013205	TCA	2	6	2012567	2012572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511931
39474	NC_013205	GGC	2	6	2012585	2012590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511931
39475	NC_013205	CTG	2	6	2012692	2012697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511931
39476	NC_013205	ACC	2	6	2012722	2012727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511931
39477	NC_013205	CTT	2	6	2012742	2012747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511931
39478	NC_013205	CTCGCC	2	12	2012770	2012781	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258511931
39479	NC_013205	TCG	2	6	2012789	2012794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511931
39480	NC_013205	GCG	2	6	2012813	2012818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511931
39481	NC_013205	TTCG	2	8	2012880	2012887	0 %	50 %	25 %	25 %	258511931
39482	NC_013205	ACC	2	6	2012966	2012971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511931
39483	NC_013205	CCTCAT	2	12	2012997	2013008	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258511931
39484	NC_013205	TAC	2	6	2013019	2013024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511931
39485	NC_013205	CCG	2	6	2013030	2013035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511931
39486	NC_013205	CGC	2	6	2013063	2013068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511931
39487	NC_013205	CGG	2	6	2013075	2013080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511931
39488	NC_013205	TGG	2	6	2013083	2013088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511931
39489	NC_013205	TCG	2	6	2013110	2013115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511931
39490	NC_013205	GGT	2	6	2013162	2013167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511931
39491	NC_013205	ATC	3	9	2013220	2013228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511931
39492	NC_013205	GTCG	2	8	2013231	2013238	0 %	25 %	50 %	25 %	258511931
39493	NC_013205	ACG	2	6	2013244	2013249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511931
39494	NC_013205	CCA	3	9	2013281	2013289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511931
39495	NC_013205	CG	3	6	2013291	2013296	0 %	0 %	50 %	50 %	258511931
39496	NC_013205	CTT	2	6	2013336	2013341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511931
39497	NC_013205	ATC	2	6	2013373	2013378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511931
39498	NC_013205	ACG	2	6	2013382	2013387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511931
39499	NC_013205	GTC	2	6	2013439	2013444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511931
39500	NC_013205	CAT	2	6	2013447	2013452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511931

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