MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36004	NC_013205	GC	3	6	1845786	1845791	0 %	0 %	50 %	50 %	258511760
36005	NC_013205	TCG	2	6	1845822	1845827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511760
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36040	NC_013205	TCG	2	6	1847729	1847734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511764
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36042	NC_013205	CGT	2	6	1847748	1847753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511764
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36054	NC_013205	CCGGC	2	10	1848491	1848500	0 %	0 %	40 %	60 %	258511765
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36233	NC_013205	GT	3	6	1857074	1857079	0 %	50 %	50 %	0 %	258511774
36234	NC_013205	TCC	2	6	1857160	1857165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511775
36235	NC_013205	GA	3	6	1857542	1857547	50 %	0 %	50 %	0 %	258511775
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36319	NC_013205	CGT	2	6	1862163	1862168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511781
36320	NC_013205	CGA	2	6	1862307	1862312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511782
36321	NC_013205	CTCG	2	8	1862320	1862327	0 %	25 %	25 %	50 %	258511782
36322	NC_013205	CTT	2	6	1862350	1862355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511782
36323	NC_013205	GTC	2	6	1862410	1862415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511782
36324	NC_013205	TGCCGA	2	12	1862418	1862429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258511782
36325	NC_013205	GGAT	2	8	1862441	1862448	25 %	25 %	50 %	0 %	258511782
36326	NC_013205	TGC	2	6	1862475	1862480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511782
36327	NC_013205	GGA	2	6	1862554	1862559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511782
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36329	NC_013205	CAT	2	6	1862602	1862607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511782
36330	NC_013205	GC	3	6	1862667	1862672	0 %	0 %	50 %	50 %	258511783
36331	NC_013205	AAC	3	9	1862746	1862754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511783
36332	NC_013205	GGA	2	6	1862776	1862781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511783
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36334	NC_013205	CCG	2	6	1862843	1862848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511783
36335	NC_013205	TGA	2	6	1862852	1862857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511783
36336	NC_013205	CGCGAA	2	12	1862927	1862938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511783
36337	NC_013205	AGG	2	6	1862962	1862967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511783
36338	NC_013205	TTC	2	6	1863051	1863056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511784
36339	NC_013205	GAT	2	6	1863077	1863082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511784
36340	NC_013205	CGA	2	6	1863115	1863120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511784
36341	NC_013205	ACCTGG	2	12	1863150	1863161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258511784
36342	NC_013205	TCCGA	2	10	1863201	1863210	20 %	20 %	20 %	40 %	258511784
36343	NC_013205	ACG	2	6	1863231	1863236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511784
36344	NC_013205	CCA	2	6	1863270	1863275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511784
36345	NC_013205	TCC	2	6	1863496	1863501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511785
36346	NC_013205	ATC	2	6	1863525	1863530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511785
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36466	NC_013205	GC	3	6	1868914	1868919	0 %	0 %	50 %	50 %	258511791
36467	NC_013205	CGG	2	6	1868927	1868932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511791
36468	NC_013205	CGGA	2	8	1868939	1868946	25 %	0 %	50 %	25 %	258511791
36469	NC_013205	ATC	2	6	1868953	1868958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511791
36470	NC_013205	ACG	2	6	1868978	1868983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511791
36471	NC_013205	GCA	2	6	1869017	1869022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511791
36472	NC_013205	ATC	2	6	1869103	1869108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511791
36473	NC_013205	TGC	2	6	1869137	1869142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511791
36474	NC_013205	CGA	2	6	1869161	1869166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511791
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36476	NC_013205	CG	3	6	1869304	1869309	0 %	0 %	50 %	50 %	258511792
36477	NC_013205	CCCGC	2	10	1869369	1869378	0 %	0 %	20 %	80 %	258511792
36478	NC_013205	CGA	2	6	1869381	1869386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511792
36479	NC_013205	TATG	2	8	1869444	1869451	25 %	50 %	25 %	0 %	258511792
36480	NC_013205	CG	3	6	1869481	1869486	0 %	0 %	50 %	50 %	258511792
36481	NC_013205	CG	3	6	1869498	1869503	0 %	0 %	50 %	50 %	258511792
36482	NC_013205	GAC	2	6	1869536	1869541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511792
36483	NC_013205	AGA	2	6	1869578	1869583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511792
36484	NC_013205	GCG	2	6	1869635	1869640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511792
36485	NC_013205	CGG	2	6	1869673	1869678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511792
36486	NC_013205	CCG	3	9	1869708	1869716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511792
36487	NC_013205	ATG	2	6	1869863	1869868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511792
36488	NC_013205	GC	3	6	1869894	1869899	0 %	0 %	50 %	50 %	258511792
36489	NC_013205	CG	3	6	1869924	1869929	0 %	0 %	50 %	50 %	258511792
36490	NC_013205	TCC	2	6	1869935	1869940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511792
36491	NC_013205	CGA	2	6	1870231	1870236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511793
36492	NC_013205	GC	3	6	1870275	1870280	0 %	0 %	50 %	50 %	258511793
36493	NC_013205	GCG	2	6	1870298	1870303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511793
36494	NC_013205	CG	3	6	1870302	1870307	0 %	0 %	50 %	50 %	258511793
36495	NC_013205	TGA	2	6	1870314	1870319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511793
36496	NC_013205	GTCC	2	8	1870355	1870362	0 %	25 %	25 %	50 %	258511793
36497	NC_013205	CGT	2	6	1870397	1870402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511793
36498	NC_013205	GCTC	2	8	1870431	1870438	0 %	25 %	25 %	50 %	258511793
36499	NC_013205	TCC	2	6	1870443	1870448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511793
36500	NC_013205	C	6	6	1870454	1870459	0 %	0 %	0 %	100 %	258511793

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