MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35118	NC_013205	CGG	2	6	1802886	1802891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511708
35119	NC_013205	GGC	2	6	1802911	1802916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511708
35120	NC_013205	CGCC	2	8	1803039	1803046	0 %	0 %	25 %	75 %	258511708
35121	NC_013205	TGA	2	6	1803057	1803062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511708
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35123	NC_013205	CGA	2	6	1803105	1803110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511708
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35125	NC_013205	C	6	6	1803229	1803234	0 %	0 %	0 %	100 %	258511709
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35134	NC_013205	GGGC	2	8	1803770	1803777	0 %	0 %	75 %	25 %	258511709
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35145	NC_013205	GCG	2	6	1804401	1804406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511710
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35154	NC_013205	AGAT	2	8	1805042	1805049	50 %	25 %	25 %	0 %	258511711
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35156	NC_013205	GC	3	6	1805094	1805099	0 %	0 %	50 %	50 %	258511711
35157	NC_013205	GGC	2	6	1805175	1805180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511711
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35217	NC_013205	CG	3	6	1808682	1808687	0 %	0 %	50 %	50 %	258511715
35218	NC_013205	GCGA	2	8	1808697	1808704	25 %	0 %	50 %	25 %	258511715
35219	NC_013205	CGT	2	6	1808753	1808758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511715
35220	NC_013205	GCGATG	2	12	1808767	1808778	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258511715
35221	NC_013205	GGC	2	6	1808847	1808852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511715
35222	NC_013205	TCGC	3	12	1808853	1808864	0 %	25 %	25 %	50 %	258511715
35223	NC_013205	CGGC	2	8	1809050	1809057	0 %	0 %	50 %	50 %	258511715
35224	NC_013205	CCG	2	6	1809080	1809085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511715
35225	NC_013205	TCG	2	6	1809146	1809151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511715
35226	NC_013205	CGA	2	6	1809152	1809157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511715
35227	NC_013205	GCCGAG	2	12	1809168	1809179	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258511715
35228	NC_013205	CG	3	6	1809460	1809465	0 %	0 %	50 %	50 %	258511716
35229	NC_013205	CGG	2	6	1809505	1809510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511716
35230	NC_013205	TGA	2	6	1809511	1809516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511716
35231	NC_013205	TCGAA	2	10	1809622	1809631	40 %	20 %	20 %	20 %	258511716
35232	NC_013205	CCA	2	6	1809634	1809639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511716
35233	NC_013205	CCA	2	6	1809682	1809687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511716
35234	NC_013205	CCGC	2	8	1809724	1809731	0 %	0 %	25 %	75 %	258511716
35235	NC_013205	TCCCGA	2	12	1809766	1809777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258511716
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35339	NC_013205	CG	3	6	1814099	1814104	0 %	0 %	50 %	50 %	258511721
35340	NC_013205	CGC	2	6	1814140	1814145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511721
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35342	NC_013205	CCGG	2	8	1814157	1814164	0 %	0 %	50 %	50 %	258511721
35343	NC_013205	CATG	2	8	1814199	1814206	25 %	25 %	25 %	25 %	258511721
35344	NC_013205	GCC	2	6	1814237	1814242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511722
35345	NC_013205	CAA	2	6	1814245	1814250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511722
35346	NC_013205	CG	3	6	1814261	1814266	0 %	0 %	50 %	50 %	258511722
35347	NC_013205	CT	3	6	1814270	1814275	0 %	50 %	0 %	50 %	258511722
35348	NC_013205	TCCGC	2	10	1814283	1814292	0 %	20 %	20 %	60 %	258511722
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35351	NC_013205	CGCGC	2	10	1814486	1814495	0 %	0 %	40 %	60 %	258511722
35352	NC_013205	GC	3	6	1814539	1814544	0 %	0 %	50 %	50 %	258511722
35353	NC_013205	GAA	2	6	1814616	1814621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511722
35354	NC_013205	CCT	2	6	1814667	1814672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511722
35355	NC_013205	CG	3	6	1814711	1814716	0 %	0 %	50 %	50 %	258511722
35356	NC_013205	GC	3	6	1814734	1814739	0 %	0 %	50 %	50 %	258511722
35357	NC_013205	CGA	3	9	1814787	1814795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511722
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35360	NC_013205	CCG	2	6	1814821	1814826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511722
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35362	NC_013205	CGG	2	6	1814934	1814939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511722
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35365	NC_013205	CGC	3	9	1815005	1815013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511722
35366	NC_013205	GC	3	6	1815048	1815053	0 %	0 %	50 %	50 %	258511722
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35375	NC_013205	CCCA	2	8	1815553	1815560	25 %	0 %	0 %	75 %	258511723
35376	NC_013205	ATC	2	6	1815573	1815578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511723
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35379	NC_013205	GAC	2	6	1815621	1815626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511723
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35468	NC_013205	CACT	2	8	1820120	1820127	25 %	25 %	0 %	50 %	258511729
35469	NC_013205	CTG	2	6	1820165	1820170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511729
35470	NC_013205	CA	3	6	1820172	1820177	50 %	0 %	0 %	50 %	258511729
35471	NC_013205	TCC	2	6	1820229	1820234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511729
35472	NC_013205	GCA	2	6	1820262	1820267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511729
35473	NC_013205	T	6	6	1820280	1820285	0 %	100 %	0 %	0 %	258511729
35474	NC_013205	TGC	2	6	1820307	1820312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511729
35475	NC_013205	GC	3	6	1820317	1820322	0 %	0 %	50 %	50 %	258511729
35476	NC_013205	GTA	2	6	1820375	1820380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511729
35477	NC_013205	GGC	2	6	1820520	1820525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511729
35478	NC_013205	AACAGA	2	12	1820612	1820623	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	258511729
35479	NC_013205	TCG	2	6	1820793	1820798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511730
35480	NC_013205	GAACTG	2	12	1820804	1820815	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258511730
35481	NC_013205	TCG	2	6	1820826	1820831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511730
35482	NC_013205	AACG	2	8	1820853	1820860	50 %	0 %	25 %	25 %	258511730
35483	NC_013205	TCC	2	6	1820874	1820879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511730
35484	NC_013205	CG	3	6	1820928	1820933	0 %	0 %	50 %	50 %	258511730
35485	NC_013205	GGCG	2	8	1821019	1821026	0 %	0 %	75 %	25 %	258511730
35486	NC_013205	GATC	2	8	1821088	1821095	25 %	25 %	25 %	25 %	258511730
35487	NC_013205	ACC	2	6	1821099	1821104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511730
35488	NC_013205	GAC	2	6	1821131	1821136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511730
35489	NC_013205	GAGC	2	8	1821191	1821198	25 %	0 %	50 %	25 %	258511730
35490	NC_013205	GAT	2	6	1821199	1821204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511730
35491	NC_013205	GC	3	6	1821410	1821415	0 %	0 %	50 %	50 %	258511730
35492	NC_013205	AGCG	2	8	1821438	1821445	25 %	0 %	50 %	25 %	258511730
35493	NC_013205	CAA	2	6	1821545	1821550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511731
35494	NC_013205	CGA	3	9	1821563	1821571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35495	NC_013205	GAT	2	6	1821599	1821604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511731
35496	NC_013205	GCG	2	6	1821630	1821635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511731
35497	NC_013205	GAA	2	6	1821645	1821650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511731
35498	NC_013205	CGC	2	6	1821692	1821697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511731
35499	NC_013205	TCG	2	6	1821701	1821706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35500	NC_013205	TCC	3	9	1821736	1821744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511731

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