MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32118	NC_013205	CG	4	8	1651178	1651185	0 %	0 %	50 %	50 %	258511552
32119	NC_013205	TCG	2	6	1651194	1651199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511552
32120	NC_013205	TGC	2	6	1651266	1651271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511552
32121	NC_013205	GGCCC	2	10	1651300	1651309	0 %	0 %	40 %	60 %	258511552
32122	NC_013205	CGG	2	6	1651330	1651335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511552
32123	NC_013205	CGA	2	6	1651336	1651341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511552
32124	NC_013205	TCATCG	2	12	1651344	1651355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258511552
32125	NC_013205	GGC	2	6	1651377	1651382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511552
32126	NC_013205	GGA	2	6	1651448	1651453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511552
32127	NC_013205	CGC	2	6	1651689	1651694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511553
32128	NC_013205	GC	3	6	1651725	1651730	0 %	0 %	50 %	50 %	258511553
32129	NC_013205	GCT	2	6	1651739	1651744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511553
32130	NC_013205	CGG	2	6	1651765	1651770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511553
32131	NC_013205	GGCG	2	8	1652089	1652096	0 %	0 %	75 %	25 %	258511554
32132	NC_013205	TGA	2	6	1652103	1652108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511554
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32134	NC_013205	CAA	2	6	1652200	1652205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511554
32135	NC_013205	GACC	2	8	1652243	1652250	25 %	0 %	25 %	50 %	258511554
32136	NC_013205	GCTG	2	8	1652268	1652275	0 %	25 %	50 %	25 %	258511554
32137	NC_013205	ATC	2	6	1652332	1652337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511555
32138	NC_013205	CATGCC	2	12	1652411	1652422	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258511555
32139	NC_013205	CTTT	2	8	1652440	1652447	0 %	75 %	0 %	25 %	258511555
32140	NC_013205	AGC	2	6	1652499	1652504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511555
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32142	NC_013205	GC	3	6	1652617	1652622	0 %	0 %	50 %	50 %	258511555
32143	NC_013205	GATC	2	8	1652672	1652679	25 %	25 %	25 %	25 %	258511555
32144	NC_013205	GCT	2	6	1652729	1652734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511555
32145	NC_013205	GC	3	6	1652760	1652765	0 %	0 %	50 %	50 %	258511555
32146	NC_013205	CTT	2	6	1652827	1652832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511556
32147	NC_013205	GC	3	6	1652833	1652838	0 %	0 %	50 %	50 %	258511556
32148	NC_013205	CTC	2	6	1652885	1652890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511556
32149	NC_013205	CGT	2	6	1652905	1652910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511556
32150	NC_013205	CATG	2	8	1653040	1653047	25 %	25 %	25 %	25 %	258511556
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32152	NC_013205	CGAT	2	8	1653072	1653079	25 %	25 %	25 %	25 %	258511556
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32154	NC_013205	CGG	2	6	1653205	1653210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511556
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32165	NC_013205	CGC	2	6	1653701	1653706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511557
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32180	NC_013205	TGC	2	6	1654174	1654179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511557
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32189	NC_013205	AGGGTG	2	12	1654535	1654546	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	258511558
32190	NC_013205	TCT	2	6	1654557	1654562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511558
32191	NC_013205	GCG	2	6	1654721	1654726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511558
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32195	NC_013205	TCG	2	6	1654865	1654870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511558
32196	NC_013205	CGT	2	6	1654939	1654944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511558
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32199	NC_013205	TCG	2	6	1655024	1655029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511558
32200	NC_013205	TGA	2	6	1655037	1655042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511558
32201	NC_013205	CATG	2	8	1655130	1655137	25 %	25 %	25 %	25 %	258511558
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32204	NC_013205	CAA	2	6	1655305	1655310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511559
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32212	NC_013205	GCTG	2	8	1656007	1656014	0 %	25 %	50 %	25 %	258511560
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32218	NC_013205	GC	3	6	1656246	1656251	0 %	0 %	50 %	50 %	258511560
32219	NC_013205	CAT	2	6	1656256	1656261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511560
32220	NC_013205	GGC	2	6	1656282	1656287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511560
32221	NC_013205	GTGG	2	8	1656331	1656338	0 %	25 %	75 %	0 %	258511560
32222	NC_013205	CGC	2	6	1656352	1656357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511560
32223	NC_013205	CCG	2	6	1656376	1656381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511560
32224	NC_013205	TCCTCA	2	12	1656432	1656443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258511560
32225	NC_013205	TGA	2	6	1656453	1656458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511560
32226	NC_013205	GTG	2	6	1656514	1656519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511560
32227	NC_013205	TC	3	6	1656533	1656538	0 %	50 %	0 %	50 %	258511560
32228	NC_013205	TGG	2	6	1656599	1656604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511560
32229	NC_013205	CTG	2	6	1656620	1656625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511560
32230	NC_013205	GGA	2	6	1656775	1656780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511560
32231	NC_013205	GAT	2	6	1656796	1656801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511560
32232	NC_013205	GCGG	2	8	1656825	1656832	0 %	0 %	75 %	25 %	258511560
32233	NC_013205	CT	3	6	1656872	1656877	0 %	50 %	0 %	50 %	258511560
32234	NC_013205	CGG	2	6	1657006	1657011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511560
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32340	NC_013205	CGG	2	6	1661310	1661315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511562
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32343	NC_013205	GCA	2	6	1661391	1661396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511562
32344	NC_013205	CAT	2	6	1661457	1661462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511562
32345	NC_013205	TCGC	2	8	1661515	1661522	0 %	25 %	25 %	50 %	258511562
32346	NC_013205	GTCAAC	2	12	1661608	1661619	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258511562
32347	NC_013205	GGC	2	6	1661620	1661625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511562
32348	NC_013205	CGGCG	2	10	1661698	1661707	0 %	0 %	60 %	40 %	258511562
32349	NC_013205	CGT	2	6	1661718	1661723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511562
32350	NC_013205	CGG	3	9	1661736	1661744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511562
32351	NC_013205	GCG	2	6	1661839	1661844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511563
32352	NC_013205	TCA	2	6	1661848	1661853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511563
32353	NC_013205	GGA	2	6	1661855	1661860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511563
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32356	NC_013205	GAA	2	6	1661930	1661935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511563
32357	NC_013205	TCG	2	6	1661938	1661943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511563
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32434	NC_013205	GC	3	6	1665457	1665462	0 %	0 %	50 %	50 %	258511565
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32442	NC_013205	GGAGA	2	10	1665667	1665676	40 %	0 %	60 %	0 %	258511565
32443	NC_013205	ACGG	2	8	1666278	1666285	25 %	0 %	50 %	25 %	258511566
32444	NC_013205	GCGA	2	8	1666308	1666315	25 %	0 %	50 %	25 %	258511566
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32449	NC_013205	GC	3	6	1666516	1666521	0 %	0 %	50 %	50 %	258511566
32450	NC_013205	GCG	2	6	1666534	1666539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511566
32451	NC_013205	TTG	2	6	1666591	1666596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511566
32452	NC_013205	TCG	2	6	1666673	1666678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511566
32453	NC_013205	GCA	2	6	1666716	1666721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511566
32454	NC_013205	GCC	2	6	1666750	1666755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511566
32455	NC_013205	CTG	2	6	1666807	1666812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511566
32456	NC_013205	GAAGGA	2	12	1666899	1666910	50 %	0 %	50 %	0 %	258511566
32457	NC_013205	TGT	2	6	1666943	1666948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511566
32458	NC_013205	CCACGC	2	12	1666970	1666981	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258511566
32459	NC_013205	CG	3	6	1666989	1666994	0 %	0 %	50 %	50 %	258511566
32460	NC_013205	GC	3	6	1667080	1667085	0 %	0 %	50 %	50 %	258511566
32461	NC_013205	CGG	3	9	1667097	1667105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511566
32462	NC_013205	ATC	2	6	1667156	1667161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511566
32463	NC_013205	GCG	2	6	1667174	1667179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511566
32464	NC_013205	CAA	2	6	1667202	1667207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511566
32465	NC_013205	GC	3	6	1667238	1667243	0 %	0 %	50 %	50 %	258511566
32466	NC_013205	GCC	2	6	1667251	1667256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511566
32467	NC_013205	AAC	2	6	1667311	1667316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511566
32468	NC_013205	CGA	2	6	1667319	1667324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511566
32469	NC_013205	GCG	2	6	1667379	1667384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511566
32470	NC_013205	GGA	2	6	1667388	1667393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511566
32471	NC_013205	GCG	2	6	1667481	1667486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511566
32472	NC_013205	GCGT	2	8	1667494	1667501	0 %	25 %	50 %	25 %	258511566
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32478	NC_013205	GGC	2	6	1667889	1667894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511566
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32481	NC_013205	GC	3	6	1668058	1668063	0 %	0 %	50 %	50 %	258511566
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32485	NC_013205	CGG	2	6	1668260	1668265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511566
32486	NC_013205	CG	3	6	1668282	1668287	0 %	0 %	50 %	50 %	258511566
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32489	NC_013205	TAC	2	6	1668361	1668366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511566
32490	NC_013205	GCGCG	2	10	1668410	1668419	0 %	0 %	60 %	40 %	258511566
32491	NC_013205	GC	3	6	1668476	1668481	0 %	0 %	50 %	50 %	258511566
32492	NC_013205	GCA	2	6	1668545	1668550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511566
32493	NC_013205	GTCG	2	8	1668552	1668559	0 %	25 %	50 %	25 %	258511566
32494	NC_013205	GAG	2	6	1668627	1668632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511567
32495	NC_013205	AGG	2	6	1668637	1668642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511567
32496	NC_013205	GCG	2	6	1668707	1668712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511567
32497	NC_013205	ATC	2	6	1668714	1668719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511567
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32499	NC_013205	CAA	2	6	1668749	1668754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511567
32500	NC_013205	ATG	2	6	1668792	1668797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511567

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