MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_013205	GCA	2	6	1159387	1159392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511095
23002	NC_013205	GAT	2	6	1159403	1159408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511095
23003	NC_013205	AAC	2	6	1159466	1159471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511095
23004	NC_013205	TCT	3	9	1159516	1159524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511095
23005	NC_013205	CAT	2	6	1159525	1159530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511095
23006	NC_013205	TAT	2	6	1159765	1159770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258511096
23007	NC_013205	GAC	2	6	1159776	1159781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511096
23008	NC_013205	GAC	2	6	1159788	1159793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511096
23009	NC_013205	CGGC	2	8	1159823	1159830	0 %	0 %	50 %	50 %	258511096
23010	NC_013205	TGGA	2	8	1159832	1159839	25 %	25 %	50 %	0 %	258511096
23011	NC_013205	GTATCC	2	12	1159846	1159857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258511096
23012	NC_013205	TGG	2	6	1159862	1159867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511096
23013	NC_013205	GAA	2	6	1159915	1159920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511096
23014	NC_013205	TCG	2	6	1160012	1160017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511096
23015	NC_013205	ACC	2	6	1160033	1160038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511096
23016	NC_013205	CGG	2	6	1160229	1160234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511096
23017	NC_013205	AAC	2	6	1160404	1160409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511096
23018	NC_013205	TGA	2	6	1160648	1160653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511096
23019	NC_013205	GGAC	2	8	1160688	1160695	25 %	0 %	50 %	25 %	258511096
23020	NC_013205	CCAAC	2	10	1160705	1160714	40 %	0 %	0 %	60 %	258511096
23021	NC_013205	CTC	2	6	1160731	1160736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511096
23022	NC_013205	CCG	2	6	1160888	1160893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511096
23023	NC_013205	GCC	2	6	1161075	1161080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511096
23024	NC_013205	TCG	2	6	1161083	1161088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511096
23025	NC_013205	GAA	2	6	1161090	1161095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511096
23026	NC_013205	CAC	2	6	1161313	1161318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511096
23027	NC_013205	GATG	2	8	1161330	1161337	25 %	25 %	50 %	0 %	258511096
23028	NC_013205	TCG	2	6	1161338	1161343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511096
23029	NC_013205	TC	3	6	1161559	1161564	0 %	50 %	0 %	50 %	258511097
23030	NC_013205	CGT	2	6	1161614	1161619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511097
23031	NC_013205	GCC	2	6	1161643	1161648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511097
23032	NC_013205	ATG	2	6	1161649	1161654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511097
23033	NC_013205	CAG	2	6	1161711	1161716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511097
23034	NC_013205	AGC	2	6	1161727	1161732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511097
23035	NC_013205	CGCAC	2	10	1161812	1161821	20 %	0 %	20 %	60 %	258511097
23036	NC_013205	GAT	2	6	1161954	1161959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511098
23037	NC_013205	TCC	2	6	1161996	1162001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511098
23038	NC_013205	GGA	2	6	1162003	1162008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511098
23039	NC_013205	GCA	2	6	1162058	1162063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511098
23040	NC_013205	AAC	2	6	1162111	1162116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511098
23041	NC_013205	TC	3	6	1162130	1162135	0 %	50 %	0 %	50 %	258511098
23042	NC_013205	GCC	2	6	1162173	1162178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511098
23043	NC_013205	A	6	6	1162328	1162333	100 %	0 %	0 %	0 %	258511099
23044	NC_013205	TCGT	2	8	1162362	1162369	0 %	50 %	25 %	25 %	258511099
23045	NC_013205	ACC	2	6	1162479	1162484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511099
23046	NC_013205	TGA	2	6	1162564	1162569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511099
23047	NC_013205	GAT	2	6	1162677	1162682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511099
23048	NC_013205	CCA	2	6	1162723	1162728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511099
23049	NC_013205	GCG	2	6	1162776	1162781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511099
23050	NC_013205	T	6	6	1162811	1162816	0 %	100 %	0 %	0 %	258511099
23051	NC_013205	CCTTA	2	10	1162831	1162840	20 %	40 %	0 %	40 %	258511100
23052	NC_013205	CAT	2	6	1162925	1162930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511100
23053	NC_013205	A	6	6	1163009	1163014	100 %	0 %	0 %	0 %	258511100
23054	NC_013205	TCA	2	6	1163080	1163085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511100
23055	NC_013205	GCG	2	6	1163094	1163099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511100
23056	NC_013205	ACC	2	6	1163122	1163127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511100
23057	NC_013205	GCA	2	6	1163130	1163135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511100
23058	NC_013205	T	6	6	1163195	1163200	0 %	100 %	0 %	0 %	258511100
23059	NC_013205	CAT	3	9	1163204	1163212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511100
23060	NC_013205	GAT	2	6	1163363	1163368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511100
23061	NC_013205	GT	4	8	1163379	1163386	0 %	50 %	50 %	0 %	258511100
23062	NC_013205	GAT	2	6	1163401	1163406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511100
23063	NC_013205	ACA	2	6	1163480	1163485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511100
23064	NC_013205	GA	3	6	1163490	1163495	50 %	0 %	50 %	0 %	258511100
23065	NC_013205	GGT	2	6	1165939	1165944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511101
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23069	NC_013205	GCA	2	6	1166030	1166035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511101
23070	NC_013205	CGA	2	6	1166118	1166123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511101
23071	NC_013205	GAT	2	6	1166328	1166333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511101
23072	NC_013205	CCA	2	6	1166349	1166354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511101
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23079	NC_013205	ACC	2	6	1166702	1166707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511101
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23084	NC_013205	AAGA	2	8	1167111	1167118	75 %	0 %	25 %	0 %	258511102
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23087	NC_013205	A	6	6	1167166	1167171	100 %	0 %	0 %	0 %	258511102
23088	NC_013205	GAA	2	6	1167177	1167182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511102
23089	NC_013205	GT	3	6	1167278	1167283	0 %	50 %	50 %	0 %	258511102
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23095	NC_013205	AC	3	6	1167544	1167549	50 %	0 %	0 %	50 %	258511103
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23099	NC_013205	CGA	2	6	1167752	1167757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511103
23100	NC_013205	CAT	2	6	1167764	1167769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511103
23101	NC_013205	GGC	2	6	1167815	1167820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511103
23102	NC_013205	AGAA	2	8	1167832	1167839	75 %	0 %	25 %	0 %	258511103
23103	NC_013205	TCG	2	6	1167931	1167936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511103
23104	NC_013205	GAC	2	6	1167940	1167945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511103
23105	NC_013205	CT	3	6	1167963	1167968	0 %	50 %	0 %	50 %	258511103
23106	NC_013205	CTC	2	6	1167972	1167977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511103
23107	NC_013205	GTTG	2	8	1168064	1168071	0 %	50 %	50 %	0 %	258511103
23108	NC_013205	AGCGT	2	10	1168083	1168092	20 %	20 %	40 %	20 %	258511103
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23113	NC_013205	GACG	2	8	1168352	1168359	25 %	0 %	50 %	25 %	258511103
23114	NC_013205	CATC	2	8	1168456	1168463	25 %	25 %	0 %	50 %	258511103
23115	NC_013205	TGT	2	6	1168610	1168615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511103
23116	NC_013205	GCG	2	6	1168623	1168628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511103
23117	NC_013205	CTT	2	6	1168638	1168643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511103
23118	NC_013205	CAT	2	6	1168745	1168750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511103
23119	NC_013205	GGT	2	6	1168832	1168837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511103
23120	NC_013205	GACG	2	8	1168880	1168887	25 %	0 %	50 %	25 %	258511103
23121	NC_013205	GAT	2	6	1168914	1168919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511103
23122	NC_013205	TCG	2	6	1169104	1169109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511103
23123	NC_013205	CGA	2	6	1169129	1169134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511103
23124	NC_013205	GGC	2	6	1169141	1169146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511103
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23128	NC_013205	CCGCA	2	10	1169306	1169315	20 %	0 %	20 %	60 %	258511103
23129	NC_013205	TTC	2	6	1169362	1169367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511103
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23132	NC_013205	GGC	2	6	1169459	1169464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511103
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23139	NC_013205	CGT	2	6	1169711	1169716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511103
23140	NC_013205	CTG	2	6	1169727	1169732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511103
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23142	NC_013205	TGCA	2	8	1169761	1169768	25 %	25 %	25 %	25 %	258511103
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23144	NC_013205	CAT	2	6	1169866	1169871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511104
23145	NC_013205	AGG	2	6	1169943	1169948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511104
23146	NC_013205	GACGA	2	10	1169990	1169999	40 %	0 %	40 %	20 %	258511104
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23152	NC_013205	CAT	2	6	1170369	1170374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511105
23153	NC_013205	CCCAT	2	10	1170376	1170385	20 %	20 %	0 %	60 %	258511105
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23181	NC_013205	CGT	2	6	1172367	1172372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511109
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23208	NC_013205	TGC	2	6	1174251	1174256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511111
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23213	NC_013205	CAG	2	6	1174441	1174446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511111
23214	NC_013205	T	6	6	1174473	1174478	0 %	100 %	0 %	0 %	258511111
23215	NC_013205	GAT	2	6	1174561	1174566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511111
23216	NC_013205	ATG	2	6	1174607	1174612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511111
23217	NC_013205	CCG	2	6	1174629	1174634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511111
23218	NC_013205	GAC	2	6	1174687	1174692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511111
23219	NC_013205	TCCT	2	8	1174722	1174729	0 %	50 %	0 %	50 %	258511112
23220	NC_013205	CGA	2	6	1174902	1174907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511112
23221	NC_013205	TTC	2	6	1174929	1174934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511112
23222	NC_013205	TTG	2	6	1174969	1174974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511112
23223	NC_013205	CGA	2	6	1175001	1175006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511112
23224	NC_013205	GTCT	2	8	1175057	1175064	0 %	50 %	25 %	25 %	258511112
23225	NC_013205	CAA	2	6	1175092	1175097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511112
23226	NC_013205	ATG	2	6	1175153	1175158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511112
23227	NC_013205	ATA	2	6	1175165	1175170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258511112
23228	NC_013205	CGC	2	6	1175182	1175187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511112
23229	NC_013205	TTC	2	6	1175233	1175238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511112
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23231	NC_013205	AGC	2	6	1175398	1175403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511112
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23463	NC_013205	CGT	2	6	1194533	1194538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511136
23464	NC_013205	CAATC	2	10	1194565	1194574	40 %	20 %	0 %	40 %	258511136
23465	NC_013205	ACA	2	6	1194594	1194599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511136
23466	NC_013205	AAC	2	6	1194720	1194725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511136
23467	NC_013205	CGG	2	6	1194738	1194743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511136
23468	NC_013205	ACG	2	6	1194763	1194768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511136
23469	NC_013205	CAA	2	6	1194849	1194854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511136
23470	NC_013205	CCG	2	6	1194907	1194912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511136
23471	NC_013205	GAG	2	6	1194973	1194978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511136
23472	NC_013205	CGC	2	6	1195004	1195009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511136
23473	NC_013205	GT	3	6	1195038	1195043	0 %	50 %	50 %	0 %	258511136
23474	NC_013205	AAC	2	6	1195087	1195092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511136
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23482	NC_013205	ACCA	2	8	1195523	1195530	50 %	0 %	0 %	50 %	258511136
23483	NC_013205	GC	3	6	1195655	1195660	0 %	0 %	50 %	50 %	258511136
23484	NC_013205	CAA	2	6	1195801	1195806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511136
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23487	NC_013205	CCAC	2	8	1196081	1196088	25 %	0 %	0 %	75 %	258511137
23488	NC_013205	ACG	2	6	1196198	1196203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511137
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23490	NC_013205	CTG	2	6	1196227	1196232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511137
23491	NC_013205	GAA	2	6	1196245	1196250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511137
23492	NC_013205	GAT	2	6	1196266	1196271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511137
23493	NC_013205	TGC	2	6	1196412	1196417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511137
23494	NC_013205	GCAA	2	8	1196479	1196486	50 %	0 %	25 %	25 %	258511137
23495	NC_013205	CCG	2	6	1196498	1196503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511137
23496	NC_013205	CG	3	6	1196539	1196544	0 %	0 %	50 %	50 %	258511137
23497	NC_013205	CGT	2	6	1196605	1196610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511137
23498	NC_013205	CGT	2	6	1196626	1196631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511137
23499	NC_013205	GCG	2	6	1196734	1196739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511137
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