MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_013205	TCA	2	6	1124280	1124285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511050
22502	NC_013205	CGA	2	6	1124320	1124325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511050
22503	NC_013205	GCT	2	6	1124374	1124379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511050
22504	NC_013205	GAG	3	9	1124477	1124485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511050
22505	NC_013205	GAT	2	6	1124587	1124592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511050
22506	NC_013205	TGG	2	6	1124638	1124643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511050
22507	NC_013205	GAG	2	6	1124690	1124695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511050
22508	NC_013205	CAC	2	6	1124698	1124703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511050
22509	NC_013205	TCG	2	6	1125018	1125023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511051
22510	NC_013205	AC	3	6	1125042	1125047	50 %	0 %	0 %	50 %	258511051
22511	NC_013205	TCA	2	6	1125053	1125058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511051
22512	NC_013205	ATC	2	6	1125106	1125111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511051
22513	NC_013205	AGC	2	6	1125160	1125165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511051
22514	NC_013205	GTT	2	6	1126057	1126062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511052
22515	NC_013205	CGA	2	6	1126117	1126122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511052
22516	NC_013205	CGA	2	6	1126144	1126149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511052
22517	NC_013205	GGA	2	6	1126246	1126251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511052
22518	NC_013205	GCG	2	6	1126290	1126295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511052
22519	NC_013205	ATG	2	6	1126314	1126319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511052
22520	NC_013205	ACG	2	6	1126350	1126355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511052
22521	NC_013205	CG	3	6	1126375	1126380	0 %	0 %	50 %	50 %	258511052
22522	NC_013205	CCAT	2	8	1126440	1126447	25 %	25 %	0 %	50 %	258511052
22523	NC_013205	CT	3	6	1126463	1126468	0 %	50 %	0 %	50 %	258511052
22524	NC_013205	ACC	2	6	1126527	1126532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511052
22525	NC_013205	CA	3	6	1126622	1126627	50 %	0 %	0 %	50 %	258511052
22526	NC_013205	GAG	2	6	1126670	1126675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511052
22527	NC_013205	GGA	2	6	1126744	1126749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511052
22528	NC_013205	AG	3	6	1126806	1126811	50 %	0 %	50 %	0 %	258511052
22529	NC_013205	GAAA	2	8	1126822	1126829	75 %	0 %	25 %	0 %	258511052
22530	NC_013205	GTCG	2	8	1126844	1126851	0 %	25 %	50 %	25 %	258511052
22531	NC_013205	TCG	2	6	1126929	1126934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511052
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22533	NC_013205	CCGC	2	8	1127121	1127128	0 %	0 %	25 %	75 %	258511052
22534	NC_013205	CG	4	8	1127156	1127163	0 %	0 %	50 %	50 %	258511052
22535	NC_013205	CCG	2	6	1127195	1127200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511052
22536	NC_013205	GAG	2	6	1127246	1127251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511052
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22538	NC_013205	GA	3	6	1127268	1127273	50 %	0 %	50 %	0 %	258511052
22539	NC_013205	TCA	2	6	1127292	1127297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511052
22540	NC_013205	GAT	2	6	1127309	1127314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511052
22541	NC_013205	GT	3	6	1127319	1127324	0 %	50 %	50 %	0 %	258511052
22542	NC_013205	TCC	2	6	1127337	1127342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511052
22543	NC_013205	AAC	2	6	1127355	1127360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511052
22544	NC_013205	GA	3	6	1127505	1127510	50 %	0 %	50 %	0 %	258511052
22545	NC_013205	TGC	2	6	1127538	1127543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511052
22546	NC_013205	TGGA	2	8	1127595	1127602	25 %	25 %	50 %	0 %	258511052
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22549	NC_013205	A	6	6	1127727	1127732	100 %	0 %	0 %	0 %	258511052
22550	NC_013205	CAT	2	6	1128761	1128766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511053
22551	NC_013205	CTCG	2	8	1128776	1128783	0 %	25 %	25 %	50 %	258511053
22552	NC_013205	CGA	2	6	1128851	1128856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511053
22553	NC_013205	GCT	2	6	1128878	1128883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511053
22554	NC_013205	TCG	2	6	1128901	1128906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511053
22555	NC_013205	GGA	2	6	1128909	1128914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511053
22556	NC_013205	GCG	2	6	1128935	1128940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511053
22557	NC_013205	GCG	2	6	1128997	1129002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511053
22558	NC_013205	AAG	2	6	1129003	1129008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511053
22559	NC_013205	CAT	2	6	1129028	1129033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511053
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22574	NC_013205	ATCTCG	2	12	1129663	1129674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258511053
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22598	NC_013205	TC	3	6	1131360	1131365	0 %	50 %	0 %	50 %	258511054
22599	NC_013205	CGC	2	6	1131419	1131424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511054
22600	NC_013205	CGT	2	6	1131475	1131480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511054
22601	NC_013205	TGG	2	6	1131518	1131523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511054
22602	NC_013205	GCA	2	6	1131570	1131575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511054
22603	NC_013205	ATG	2	6	1131728	1131733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511054
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22605	NC_013205	T	7	7	1131969	1131975	0 %	100 %	0 %	0 %	258511054
22606	NC_013205	CCA	2	6	1132154	1132159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511055
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22610	NC_013205	TTC	2	6	1132643	1132648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511056
22611	NC_013205	CGG	2	6	1132798	1132803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511056
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22613	NC_013205	TGT	2	6	1132915	1132920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511056
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22615	NC_013205	TTTC	2	8	1133031	1133038	0 %	75 %	0 %	25 %	258511056
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22729	NC_013205	GCGG	2	8	1141397	1141404	0 %	0 %	75 %	25 %	258511071
22730	NC_013205	GAC	2	6	1141440	1141445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511071
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22732	NC_013205	CTG	2	6	1141477	1141482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511071
22733	NC_013205	GC	3	6	1141510	1141515	0 %	0 %	50 %	50 %	258511071
22734	NC_013205	GGC	2	6	1141620	1141625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511071
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22842	NC_013205	GCG	2	6	1147941	1147946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511078
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22848	NC_013205	GTC	2	6	1148384	1148389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511078
22849	NC_013205	GCGA	2	8	1148390	1148397	25 %	0 %	50 %	25 %	258511078
22850	NC_013205	GA	3	6	1148396	1148401	50 %	0 %	50 %	0 %	258511078
22851	NC_013205	GC	3	6	1148412	1148417	0 %	0 %	50 %	50 %	258511078
22852	NC_013205	GAA	2	6	1148448	1148453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511078
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22855	NC_013205	GAT	2	6	1148565	1148570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511078
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22863	NC_013205	CGT	2	6	1149099	1149104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511080
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22944	NC_013205	GAC	2	6	1154448	1154453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511092
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22950	NC_013205	T	6	6	1156087	1156092	0 %	100 %	0 %	0 %	258511093
22951	NC_013205	TCCG	2	8	1156205	1156212	0 %	25 %	25 %	50 %	258511093
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22953	NC_013205	GATCG	2	10	1156251	1156260	20 %	20 %	40 %	20 %	258511093
22954	NC_013205	G	6	6	1156260	1156265	0 %	0 %	100 %	0 %	258511093
22955	NC_013205	GGC	2	6	1156417	1156422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511093
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22961	NC_013205	TTGC	2	8	1156837	1156844	0 %	50 %	25 %	25 %	258511093
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22964	NC_013205	GGCG	2	8	1156992	1156999	0 %	0 %	75 %	25 %	258511093
22965	NC_013205	TTC	2	6	1157075	1157080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511093
22966	NC_013205	TC	3	6	1157126	1157131	0 %	50 %	0 %	50 %	258511093
22967	NC_013205	CCG	2	6	1157160	1157165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511093
22968	NC_013205	GCG	2	6	1157336	1157341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511093
22969	NC_013205	CTA	2	6	1157416	1157421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511093
22970	NC_013205	CG	3	6	1157449	1157454	0 %	0 %	50 %	50 %	258511093
22971	NC_013205	TGA	2	6	1157477	1157482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511093
22972	NC_013205	TCT	2	6	1157502	1157507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511093
22973	NC_013205	AT	3	6	1157945	1157950	50 %	50 %	0 %	0 %	258511094
22974	NC_013205	TCC	2	6	1157959	1157964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511094
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22980	NC_013205	TGC	2	6	1158103	1158108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511094
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22991	NC_013205	ATG	2	6	1158811	1158816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511094
22992	NC_013205	A	6	6	1158829	1158834	100 %	0 %	0 %	0 %	258511094
22993	NC_013205	ATCCC	2	10	1158886	1158895	20 %	20 %	0 %	60 %	258511095
22994	NC_013205	TTC	2	6	1158954	1158959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511095
22995	NC_013205	TCAA	2	8	1159014	1159021	50 %	25 %	0 %	25 %	258511095
22996	NC_013205	TCC	2	6	1159023	1159028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511095
22997	NC_013205	CGC	2	6	1159041	1159046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511095
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22999	NC_013205	GCAC	2	8	1159347	1159354	25 %	0 %	25 %	50 %	258511095
23000	NC_013205	CCT	2	6	1159366	1159371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511095

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