MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20117	NC_013205	GCC	2	6	1011461	1011466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510929
20118	NC_013205	CAC	2	6	1011475	1011480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510929
20119	NC_013205	ACA	2	6	1011498	1011503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510929
20120	NC_013205	GCGG	2	8	1011614	1011621	0 %	0 %	75 %	25 %	258510929
20121	NC_013205	TCTTTC	2	12	1011675	1011686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510929
20122	NC_013205	CGT	2	6	1011697	1011702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510929
20123	NC_013205	CCG	2	6	1011726	1011731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510929
20124	NC_013205	CGG	2	6	1011777	1011782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510929
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20128	NC_013205	CCT	2	6	1011994	1011999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510929
20129	NC_013205	GGT	2	6	1012006	1012011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510929
20130	NC_013205	CAT	2	6	1012114	1012119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510929
20131	NC_013205	GTG	3	9	1012124	1012132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510929
20132	NC_013205	CGT	2	6	1012176	1012181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510929
20133	NC_013205	CGT	2	6	1012194	1012199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510929
20134	NC_013205	CGT	2	6	1012270	1012275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510929
20135	NC_013205	CG	3	6	1012318	1012323	0 %	0 %	50 %	50 %	258510929
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20146	NC_013205	CGG	2	6	1012668	1012673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510930
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20227	NC_013205	AGA	2	6	1016022	1016027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510933
20228	NC_013205	GCATTG	2	12	1016101	1016112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510934
20229	NC_013205	TGG	2	6	1016149	1016154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510934
20230	NC_013205	GGT	2	6	1016240	1016245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510934
20231	NC_013205	ACG	2	6	1016275	1016280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510934
20232	NC_013205	GGT	2	6	1016282	1016287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510934
20233	NC_013205	GGC	2	6	1016345	1016350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510934
20234	NC_013205	GC	3	6	1016438	1016443	0 %	0 %	50 %	50 %	258510934
20235	NC_013205	CAA	2	6	1016459	1016464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510934
20236	NC_013205	GCG	2	6	1016507	1016512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510934
20237	NC_013205	GC	3	6	1016519	1016524	0 %	0 %	50 %	50 %	258510934
20238	NC_013205	GCCCG	2	10	1016701	1016710	0 %	0 %	40 %	60 %	258510935
20239	NC_013205	AGC	2	6	1016734	1016739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510935
20240	NC_013205	GGC	2	6	1016762	1016767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510935
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20244	NC_013205	CGA	2	6	1016892	1016897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510935
20245	NC_013205	TCGG	2	8	1016935	1016942	0 %	25 %	50 %	25 %	258510935
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20332	NC_013205	ATG	2	6	1021840	1021845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510941
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20335	NC_013205	GCT	2	6	1022070	1022075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510941
20336	NC_013205	ACG	2	6	1022090	1022095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510941
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20338	NC_013205	GGGCA	2	10	1022200	1022209	20 %	0 %	60 %	20 %	258510941
20339	NC_013205	ATGGCG	2	12	1022227	1022238	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510941
20340	NC_013205	GGC	2	6	1022250	1022255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510941
20341	NC_013205	GATC	2	8	1022283	1022290	25 %	25 %	25 %	25 %	258510941
20342	NC_013205	GCG	2	6	1022309	1022314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510941
20343	NC_013205	GCTC	2	8	1022351	1022358	0 %	25 %	25 %	50 %	258510941
20344	NC_013205	GAA	2	6	1022454	1022459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510941
20345	NC_013205	TGC	2	6	1022486	1022491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510941
20346	NC_013205	CAA	2	6	1022505	1022510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510941
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20348	NC_013205	GCC	2	6	1022527	1022532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510941
20349	NC_013205	CAT	2	6	1022586	1022591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510941
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20352	NC_013205	GAA	2	6	1022653	1022658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510941
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20464	NC_013205	TGG	2	6	1027972	1027977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510946
20465	NC_013205	CGG	2	6	1028056	1028061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510946
20466	NC_013205	CGA	2	6	1028117	1028122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510946
20467	NC_013205	GAT	2	6	1028123	1028128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510946
20468	NC_013205	GGCG	2	8	1028147	1028154	0 %	0 %	75 %	25 %	258510946
20469	NC_013205	G	6	6	1028173	1028178	0 %	0 %	100 %	0 %	258510946
20470	NC_013205	CGT	2	6	1028182	1028187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510946
20471	NC_013205	CGC	2	6	1028218	1028223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510947
20472	NC_013205	GC	3	6	1028293	1028298	0 %	0 %	50 %	50 %	258510947
20473	NC_013205	CGG	2	6	1028374	1028379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510947
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20475	NC_013205	CGC	2	6	1028410	1028415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510947
20476	NC_013205	GCG	2	6	1028430	1028435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510947
20477	NC_013205	GGT	3	9	1028452	1028460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510947
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20480	NC_013205	GA	3	6	1028563	1028568	50 %	0 %	50 %	0 %	258510947
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20482	NC_013205	GCG	2	6	1028662	1028667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510947
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20491	NC_013205	CG	3	6	1029477	1029482	0 %	0 %	50 %	50 %	258510949
20492	NC_013205	CGG	2	6	1029494	1029499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510949
20493	NC_013205	GC	3	6	1029537	1029542	0 %	0 %	50 %	50 %	258510949
20494	NC_013205	GCC	2	6	1029588	1029593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510949
20495	NC_013205	TCC	2	6	1029597	1029602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510949
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20499	NC_013205	CGG	2	6	1029718	1029723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510949
20500	NC_013205	GC	4	8	1029795	1029802	0 %	0 %	50 %	50 %	258510949

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