MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_013205	TCG	2	6	960390	960395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510881
19003	NC_013205	GAT	2	6	960431	960436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510881
19004	NC_013205	GTGG	2	8	960449	960456	0 %	25 %	75 %	0 %	258510881
19005	NC_013205	CG	3	6	960542	960547	0 %	0 %	50 %	50 %	258510881
19006	NC_013205	AGG	2	6	960598	960603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510882
19007	NC_013205	TCA	2	6	960605	960610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510882
19008	NC_013205	CGG	2	6	960638	960643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510882
19009	NC_013205	GCGA	2	8	960657	960664	25 %	0 %	50 %	25 %	258510882
19010	NC_013205	GGCG	2	8	960696	960703	0 %	0 %	75 %	25 %	258510882
19011	NC_013205	TGACGA	2	12	960710	960721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258510882
19012	NC_013205	AAGC	2	8	960790	960797	50 %	0 %	25 %	25 %	258510882
19013	NC_013205	GCT	2	6	960936	960941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510882
19014	NC_013205	GA	3	6	960953	960958	50 %	0 %	50 %	0 %	258510882
19015	NC_013205	GAT	2	6	960963	960968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510882
19016	NC_013205	TTTC	2	8	961008	961015	0 %	75 %	0 %	25 %	258510882
19017	NC_013205	GTG	2	6	961033	961038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510882
19018	NC_013205	GGC	3	9	961039	961047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510882
19019	NC_013205	GGA	2	6	961059	961064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510882
19020	NC_013205	CCG	2	6	961110	961115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510882
19021	NC_013205	GAG	2	6	961117	961122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510882
19022	NC_013205	CG	3	6	961126	961131	0 %	0 %	50 %	50 %	258510882
19023	NC_013205	GC	3	6	961149	961154	0 %	0 %	50 %	50 %	258510882
19024	NC_013205	TGA	2	6	961181	961186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510882
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19032	NC_013205	TCA	2	6	961762	961767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510883
19033	NC_013205	GCA	2	6	961774	961779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510883
19034	NC_013205	CATGGG	2	12	961828	961839	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510883
19035	NC_013205	CGG	2	6	961915	961920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510883
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19044	NC_013205	GGT	2	6	962245	962250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510883
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19047	NC_013205	CAG	2	6	962491	962496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510884
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19052	NC_013205	CCA	2	6	962754	962759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510884
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19054	NC_013205	CG	3	6	962817	962822	0 %	0 %	50 %	50 %	258510884
19055	NC_013205	GCA	2	6	963124	963129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510885
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19103	NC_013205	CGCC	2	8	965212	965219	0 %	0 %	25 %	75 %	258510887
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19119	NC_013205	CTT	2	6	965807	965812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510887
19120	NC_013205	CTG	2	6	965823	965828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510887
19121	NC_013205	CGA	2	6	965830	965835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510887
19122	NC_013205	GAT	2	6	965852	965857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510887
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19479	NC_013205	GTGC	2	8	982038	982045	0 %	25 %	50 %	25 %	258510901
19480	NC_013205	CGA	2	6	982121	982126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510901
19481	NC_013205	CCG	2	6	982133	982138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510901
19482	NC_013205	ACG	2	6	982141	982146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510901
19483	NC_013205	GCG	2	6	982147	982152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510901
19484	NC_013205	TCG	2	6	982168	982173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510901
19485	NC_013205	GC	3	6	982176	982181	0 %	0 %	50 %	50 %	258510901
19486	NC_013205	CGGCCT	2	12	982187	982198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510901
19487	NC_013205	GCG	2	6	982200	982205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510901
19488	NC_013205	TCGTC	2	10	982250	982259	0 %	40 %	20 %	40 %	258510901
19489	NC_013205	TGGCT	2	10	982264	982273	0 %	40 %	40 %	20 %	258510901
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19491	NC_013205	CGA	2	6	982474	982479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510902
19492	NC_013205	TGA	2	6	982494	982499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510902
19493	NC_013205	CG	3	6	982514	982519	0 %	0 %	50 %	50 %	258510902
19494	NC_013205	CGA	2	6	982621	982626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510902
19495	NC_013205	GC	3	6	982742	982747	0 %	0 %	50 %	50 %	258510903
19496	NC_013205	CGCTT	2	10	982748	982757	0 %	40 %	20 %	40 %	258510903
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19499	NC_013205	CCCG	2	8	982799	982806	0 %	0 %	25 %	75 %	258510903
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