MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18004	NC_013205	CG	3	6	910221	910226	0 %	0 %	50 %	50 %	258510833
18005	NC_013205	GTA	3	9	910272	910280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510833
18006	NC_013205	TCG	2	6	910351	910356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510833
18007	NC_013205	GTA	2	6	910389	910394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510833
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18015	NC_013205	ATG	2	6	911039	911044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510834
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18033	NC_013205	GCGA	2	8	911942	911949	25 %	0 %	50 %	25 %	258510834
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18120	NC_013205	GAA	2	6	916189	916194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510838
18121	NC_013205	GGA	3	9	916239	916247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510838
18122	NC_013205	CGGA	2	8	916301	916308	25 %	0 %	50 %	25 %	258510838
18123	NC_013205	AGA	2	6	916721	916726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510839
18124	NC_013205	GAAG	2	8	916728	916735	50 %	0 %	50 %	0 %	258510839
18125	NC_013205	TGG	2	6	916738	916743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510839
18126	NC_013205	GCT	2	6	916746	916751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510839
18127	NC_013205	GGC	2	6	916858	916863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510839
18128	NC_013205	GTG	2	6	916904	916909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510839
18129	NC_013205	ATG	2	6	916927	916932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510839
18130	NC_013205	GC	3	6	916959	916964	0 %	0 %	50 %	50 %	258510839
18131	NC_013205	TCG	2	6	917030	917035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510839
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18133	NC_013205	TTG	2	6	917062	917067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510839
18134	NC_013205	TGGT	2	8	917164	917171	0 %	50 %	50 %	0 %	258510839
18135	NC_013205	CAT	2	6	917241	917246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510839
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18144	NC_013205	CG	3	6	917835	917840	0 %	0 %	50 %	50 %	258510840
18145	NC_013205	GAA	2	6	917874	917879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510840
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18148	NC_013205	ACA	2	6	917933	917938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510840
18149	NC_013205	GCA	2	6	918033	918038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510840
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18225	NC_013205	GC	4	8	921425	921432	0 %	0 %	50 %	50 %	258510842
18226	NC_013205	CGTCCA	2	12	921481	921492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510842
18227	NC_013205	GGGC	2	8	921535	921542	0 %	0 %	75 %	25 %	258510842
18228	NC_013205	CGC	2	6	921550	921555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510842
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18230	NC_013205	CGTT	2	8	921633	921640	0 %	50 %	25 %	25 %	258510842
18231	NC_013205	CGC	2	6	921655	921660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510842
18232	NC_013205	CGA	2	6	921664	921669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510842
18233	NC_013205	TGG	2	6	921696	921701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510842
18234	NC_013205	GCCC	2	8	921832	921839	0 %	0 %	25 %	75 %	258510842
18235	NC_013205	C	6	6	921837	921842	0 %	0 %	0 %	100 %	258510842
18236	NC_013205	CGC	2	6	921926	921931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510842
18237	NC_013205	GC	3	6	921930	921935	0 %	0 %	50 %	50 %	258510842
18238	NC_013205	GT	3	6	922015	922020	0 %	50 %	50 %	0 %	258510842
18239	NC_013205	CGA	2	6	922048	922053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510842
18240	NC_013205	GAT	3	9	922088	922096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510842
18241	NC_013205	CTCG	2	8	922097	922104	0 %	25 %	25 %	50 %	258510842
18242	NC_013205	TTC	2	6	922121	922126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510842
18243	NC_013205	TGCCG	2	10	922231	922240	0 %	20 %	40 %	40 %	258510842
18244	NC_013205	GCC	2	6	922265	922270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510842
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18246	NC_013205	GAT	2	6	922481	922486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510843
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18250	NC_013205	CGG	2	6	922788	922793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510844
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18252	NC_013205	TCA	2	6	922920	922925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510844
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18254	NC_013205	GGC	2	6	922948	922953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510844
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18261	NC_013205	GGGC	2	8	923279	923286	0 %	0 %	75 %	25 %	258510845
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18342	NC_013205	TCGT	2	8	929333	929340	0 %	50 %	25 %	25 %	258510848
18343	NC_013205	CGT	2	6	929368	929373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510848
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18352	NC_013205	GGC	2	6	929807	929812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510848
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18355	NC_013205	GC	4	8	929914	929921	0 %	0 %	50 %	50 %	258510849
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18359	NC_013205	CCT	2	6	930022	930027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510849
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18476	NC_013205	ACC	2	6	936488	936493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510856
18477	NC_013205	GTG	2	6	936527	936532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510856
18478	NC_013205	CAT	2	6	936535	936540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510856
18479	NC_013205	GTC	2	6	936763	936768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510857
18480	NC_013205	ACC	2	6	936849	936854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510857
18481	NC_013205	GGA	2	6	936946	936951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510857
18482	NC_013205	TCG	2	6	936960	936965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510857
18483	NC_013205	CATG	2	8	937051	937058	25 %	25 %	25 %	25 %	258510857
18484	NC_013205	GAGC	2	8	937091	937098	25 %	0 %	50 %	25 %	258510857
18485	NC_013205	GTC	2	6	937225	937230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510858
18486	NC_013205	TCG	2	6	937364	937369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510858
18487	NC_013205	ACGTGC	2	12	937370	937381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510858
18488	NC_013205	GCG	2	6	937391	937396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510858
18489	NC_013205	GATG	2	8	937416	937423	25 %	25 %	50 %	0 %	258510858
18490	NC_013205	ACGC	2	8	937444	937451	25 %	0 %	25 %	50 %	258510858
18491	NC_013205	ACG	2	6	937462	937467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510858
18492	NC_013205	TTG	2	6	937474	937479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510858
18493	NC_013205	ACG	2	6	937480	937485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510858
18494	NC_013205	CGC	2	6	937488	937493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510858
18495	NC_013205	CATC	2	8	937590	937597	25 %	25 %	0 %	50 %	258510858
18496	NC_013205	GGCGC	2	10	937604	937613	0 %	0 %	60 %	40 %	258510858
18497	NC_013205	CCG	2	6	937619	937624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510858
18498	NC_013205	GGGC	2	8	937670	937677	0 %	0 %	75 %	25 %	258510858
18499	NC_013205	TCG	2	6	937754	937759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510858
18500	NC_013205	CGG	2	6	937775	937780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510858

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