MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_013205	TGT	2	6	865347	865352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510791
17003	NC_013205	CTT	2	6	865396	865401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510791
17004	NC_013205	GTCAA	2	10	865528	865537	40 %	20 %	20 %	20 %	258510791
17005	NC_013205	CGGT	2	8	865538	865545	0 %	25 %	50 %	25 %	258510791
17006	NC_013205	AAG	2	6	865616	865621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510791
17007	NC_013205	GC	3	6	865622	865627	0 %	0 %	50 %	50 %	258510791
17008	NC_013205	GGC	2	6	865752	865757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510791
17009	NC_013205	CAC	2	6	865776	865781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510791
17010	NC_013205	GGA	2	6	865808	865813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510791
17011	NC_013205	GA	3	6	865892	865897	50 %	0 %	50 %	0 %	258510791
17012	NC_013205	GCC	2	6	865921	865926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510791
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17014	NC_013205	TGC	2	6	865970	865975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510792
17015	NC_013205	TACT	2	8	866032	866039	25 %	50 %	0 %	25 %	258510792
17016	NC_013205	TACT	2	8	866148	866155	25 %	50 %	0 %	25 %	258510792
17017	NC_013205	GAA	2	6	866249	866254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510792
17018	NC_013205	TTTA	2	8	866269	866276	25 %	75 %	0 %	0 %	258510792
17019	NC_013205	ATG	2	6	866325	866330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510792
17020	NC_013205	CTA	2	6	866354	866359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510792
17021	NC_013205	GAA	2	6	866445	866450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510792
17022	NC_013205	ATC	2	6	866496	866501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510792
17023	NC_013205	GTC	2	6	866552	866557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510792
17024	NC_013205	AAC	2	6	866562	866567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510792
17025	NC_013205	TTTCAA	2	12	866634	866645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258510792
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17027	NC_013205	GCT	2	6	866673	866678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510792
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17029	NC_013205	GTT	2	6	866906	866911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510793
17030	NC_013205	TCA	2	6	866962	866967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510793
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17033	NC_013205	GA	3	6	867271	867276	50 %	0 %	50 %	0 %	258510793
17034	NC_013205	AAG	2	6	867368	867373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510793
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17039	NC_013205	GCCA	2	8	867492	867499	25 %	0 %	25 %	50 %	258510793
17040	NC_013205	TTA	2	6	867562	867567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510793
17041	NC_013205	ATT	2	6	867751	867756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510793
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17043	NC_013205	GCAA	2	8	867818	867825	50 %	0 %	25 %	25 %	258510793
17044	NC_013205	GT	3	6	867870	867875	0 %	50 %	50 %	0 %	258510793
17045	NC_013205	AAGC	2	8	867926	867933	50 %	0 %	25 %	25 %	258510793
17046	NC_013205	TGGC	2	8	867950	867957	0 %	25 %	50 %	25 %	258510793
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17053	NC_013205	CTG	2	6	868455	868460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510794
17054	NC_013205	TTG	2	6	868515	868520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510794
17055	NC_013205	CACTC	2	10	868560	868569	20 %	20 %	0 %	60 %	258510794
17056	NC_013205	TAT	2	6	868586	868591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510794
17057	NC_013205	TTGC	2	8	868631	868638	0 %	50 %	25 %	25 %	258510794
17058	NC_013205	TTG	2	6	868643	868648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510794
17059	NC_013205	TCCT	2	8	868692	868699	0 %	50 %	0 %	50 %	258510794
17060	NC_013205	TGGC	2	8	868700	868707	0 %	25 %	50 %	25 %	258510794
17061	NC_013205	GTG	2	6	868727	868732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510794
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17063	NC_013205	GCA	2	6	868801	868806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510794
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17066	NC_013205	GGGGC	2	10	868946	868955	0 %	0 %	80 %	20 %	258510794
17067	NC_013205	TGT	2	6	869004	869009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510794
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17088	NC_013205	AAT	2	6	870029	870034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510795
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17094	NC_013205	GA	3	6	870341	870346	50 %	0 %	50 %	0 %	258510795
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17114	NC_013205	CGAAT	2	10	871763	871772	40 %	20 %	20 %	20 %	258510796
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17361	NC_013205	GGC	2	6	882194	882199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510806
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17481	NC_013205	GGC	2	6	887886	887891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510813
17482	NC_013205	CATCGC	2	12	887919	887930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510813
17483	NC_013205	GCG	2	6	887933	887938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510813
17484	NC_013205	CG	4	8	887951	887958	0 %	0 %	50 %	50 %	258510813
17485	NC_013205	ACG	2	6	888019	888024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510813
17486	NC_013205	CG	3	6	888116	888121	0 %	0 %	50 %	50 %	258510813
17487	NC_013205	CAG	2	6	888151	888156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510813
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17489	NC_013205	CGT	3	9	888207	888215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510813
17490	NC_013205	GAA	2	6	888222	888227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510813
17491	NC_013205	GGT	2	6	888237	888242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510813
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17493	NC_013205	ACC	2	6	888271	888276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510813
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