MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013205	GCC	2	6	819675	819680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510759
16002	NC_013205	CAT	2	6	819681	819686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510759
16003	NC_013205	CGA	2	6	819816	819821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510759
16004	NC_013205	GCAG	2	8	819842	819849	25 %	0 %	50 %	25 %	258510759
16005	NC_013205	GGC	2	6	819888	819893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510759
16006	NC_013205	CGA	2	6	819915	819920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510759
16007	NC_013205	GC	3	6	819951	819956	0 %	0 %	50 %	50 %	258510759
16008	NC_013205	CGCAT	2	10	819997	820006	20 %	20 %	20 %	40 %	258510759
16009	NC_013205	CGA	2	6	820020	820025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510759
16010	NC_013205	CAT	2	6	820068	820073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510759
16011	NC_013205	CG	3	6	820208	820213	0 %	0 %	50 %	50 %	258510759
16012	NC_013205	TGG	2	6	820232	820237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510759
16013	NC_013205	GGC	2	6	820251	820256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510759
16014	NC_013205	AGC	2	6	820274	820279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510759
16015	NC_013205	CG	3	6	820310	820315	0 %	0 %	50 %	50 %	258510759
16016	NC_013205	TGG	2	6	820349	820354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510759
16017	NC_013205	GCGCA	2	10	820360	820369	20 %	0 %	40 %	40 %	258510759
16018	NC_013205	GC	3	6	820371	820376	0 %	0 %	50 %	50 %	258510759
16019	NC_013205	GGAA	2	8	820549	820556	50 %	0 %	50 %	0 %	258510760
16020	NC_013205	GCA	2	6	820597	820602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510760
16021	NC_013205	CAT	2	6	820643	820648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510760
16022	NC_013205	CGT	2	6	820681	820686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510760
16023	NC_013205	GCA	2	6	820702	820707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510760
16024	NC_013205	CGGG	2	8	820731	820738	0 %	0 %	75 %	25 %	258510760
16025	NC_013205	GTG	2	6	820766	820771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510760
16026	NC_013205	CCTCGG	2	12	820819	820830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510760
16027	NC_013205	CG	3	6	820862	820867	0 %	0 %	50 %	50 %	258510760
16028	NC_013205	CGG	2	6	820870	820875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510760
16029	NC_013205	GC	3	6	821028	821033	0 %	0 %	50 %	50 %	258510760
16030	NC_013205	CGG	2	6	821040	821045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510760
16031	NC_013205	TGA	2	6	821094	821099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510760
16032	NC_013205	CGGCG	2	10	821167	821176	0 %	0 %	60 %	40 %	258510760
16033	NC_013205	GTG	2	6	821177	821182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510760
16034	NC_013205	GCG	2	6	821183	821188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510760
16035	NC_013205	GACG	2	8	821191	821198	25 %	0 %	50 %	25 %	258510760
16036	NC_013205	GC	3	6	821204	821209	0 %	0 %	50 %	50 %	258510760
16037	NC_013205	CAG	2	6	821234	821239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510760
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16039	NC_013205	CG	3	6	821334	821339	0 %	0 %	50 %	50 %	258510760
16040	NC_013205	TCG	2	6	821352	821357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510760
16041	NC_013205	CG	3	6	821387	821392	0 %	0 %	50 %	50 %	258510760
16042	NC_013205	CGA	2	6	821403	821408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510760
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16044	NC_013205	CGC	2	6	821449	821454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510760
16045	NC_013205	TCG	2	6	821475	821480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510760
16046	NC_013205	GATC	2	8	821645	821652	25 %	25 %	25 %	25 %	258510761
16047	NC_013205	TCG	2	6	821674	821679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510761
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16050	NC_013205	CGG	2	6	821862	821867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510761
16051	NC_013205	CGC	2	6	821874	821879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510761
16052	NC_013205	TGAT	2	8	821884	821891	25 %	50 %	25 %	0 %	258510761
16053	NC_013205	GCTC	2	8	821906	821913	0 %	25 %	25 %	50 %	258510761
16054	NC_013205	GAC	2	6	821922	821927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510761
16055	NC_013205	GC	3	6	821952	821957	0 %	0 %	50 %	50 %	258510761
16056	NC_013205	CACGGA	2	12	821988	821999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510761
16057	NC_013205	CGG	2	6	822006	822011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510761
16058	NC_013205	GAC	2	6	822021	822026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510761
16059	NC_013205	CCTT	2	8	822061	822068	0 %	50 %	0 %	50 %	258510761
16060	NC_013205	GTC	2	6	822076	822081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510761
16061	NC_013205	GCG	2	6	822137	822142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510761
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16063	NC_013205	GGA	2	6	822542	822547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510762
16064	NC_013205	CG	3	6	822569	822574	0 %	0 %	50 %	50 %	258510762
16065	NC_013205	CAG	2	6	822597	822602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510762
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16067	NC_013205	TCGCCA	2	12	822640	822651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510762
16068	NC_013205	CGA	2	6	822661	822666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510762
16069	NC_013205	CGT	3	9	822743	822751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510762
16070	NC_013205	GGCG	2	8	822800	822807	0 %	0 %	75 %	25 %	258510762
16071	NC_013205	TTCGT	2	10	822823	822832	0 %	60 %	20 %	20 %	258510762
16072	NC_013205	GAT	2	6	822965	822970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510762
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16085	NC_013205	GTC	2	6	823326	823331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510762
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16087	NC_013205	ACC	2	6	823518	823523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510762
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16102	NC_013205	CT	3	6	824048	824053	0 %	50 %	0 %	50 %	258510763
16103	NC_013205	GGC	2	6	824074	824079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510763
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16105	NC_013205	CG	3	6	824164	824169	0 %	0 %	50 %	50 %	258510763
16106	NC_013205	ATC	2	6	824171	824176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510763
16107	NC_013205	ACG	2	6	824240	824245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510763
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16109	NC_013205	CGA	2	6	824256	824261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510763
16110	NC_013205	GC	3	6	824265	824270	0 %	0 %	50 %	50 %	258510763
16111	NC_013205	TCCC	2	8	824459	824466	0 %	25 %	0 %	75 %	258510763
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16115	NC_013205	TCCG	2	8	824625	824632	0 %	25 %	25 %	50 %	258510763
16116	NC_013205	GACG	2	8	824694	824701	25 %	0 %	50 %	25 %	258510763
16117	NC_013205	GC	3	6	824704	824709	0 %	0 %	50 %	50 %	258510763
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16119	NC_013205	T	6	6	824923	824928	0 %	100 %	0 %	0 %	258510764
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16240	NC_013205	CCGG	2	8	830020	830027	0 %	0 %	50 %	50 %	258510766
16241	NC_013205	GCGA	2	8	830037	830044	25 %	0 %	50 %	25 %	258510766
16242	NC_013205	GGA	2	6	830090	830095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510766
16243	NC_013205	GCG	2	6	830104	830109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510766
16244	NC_013205	CTC	2	6	830115	830120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510766
16245	NC_013205	CGG	2	6	830132	830137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510766
16246	NC_013205	GC	3	6	830157	830162	0 %	0 %	50 %	50 %	258510766
16247	NC_013205	GCA	2	6	830204	830209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510766
16248	NC_013205	GCG	2	6	830248	830253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510766
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16250	NC_013205	GC	3	6	830328	830333	0 %	0 %	50 %	50 %	258510766
16251	NC_013205	TGG	2	6	830334	830339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510766
16252	NC_013205	CGA	2	6	830348	830353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510766
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16254	NC_013205	CTG	2	6	830499	830504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510766
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16256	NC_013205	CGG	2	6	830543	830548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510766
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16258	NC_013205	GTG	2	6	830735	830740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510766
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16471	NC_013205	CGA	2	6	841066	841071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510778
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16478	NC_013205	GAC	2	6	841581	841586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510778
16479	NC_013205	GCGTC	2	10	841687	841696	0 %	20 %	40 %	40 %	258510778
16480	NC_013205	TTCA	2	8	841710	841717	25 %	50 %	0 %	25 %	258510778
16481	NC_013205	CGCGCC	2	12	841721	841732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510778
16482	NC_013205	CG	3	6	841738	841743	0 %	0 %	50 %	50 %	258510778
16483	NC_013205	GTG	2	6	841758	841763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510778
16484	NC_013205	TCGCG	2	10	841835	841844	0 %	20 %	40 %	40 %	258510778
16485	NC_013205	GC	3	6	841872	841877	0 %	0 %	50 %	50 %	258510778
16486	NC_013205	CGCAGC	2	12	841924	841935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258510778
16487	NC_013205	TTC	2	6	841938	841943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510778
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16491	NC_013205	CCG	2	6	842058	842063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510778
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16495	NC_013205	TGGC	2	8	842316	842323	0 %	25 %	50 %	25 %	258510778
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