MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_013205	TAT	2	6	774682	774687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510726
15003	NC_013205	CG	3	6	774689	774694	0 %	0 %	50 %	50 %	258510726
15004	NC_013205	CG	3	6	774717	774722	0 %	0 %	50 %	50 %	258510726
15005	NC_013205	GGGAG	2	10	774804	774813	20 %	0 %	80 %	0 %	258510726
15006	NC_013205	TGGC	2	8	774888	774895	0 %	25 %	50 %	25 %	258510726
15007	NC_013205	CG	4	8	774923	774930	0 %	0 %	50 %	50 %	258510726
15008	NC_013205	T	6	6	774946	774951	0 %	100 %	0 %	0 %	258510726
15009	NC_013205	GGC	2	6	774952	774957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510726
15010	NC_013205	GCTTC	2	10	774993	775002	0 %	40 %	20 %	40 %	258510726
15011	NC_013205	TGC	2	6	775055	775060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510726
15012	NC_013205	TCC	2	6	775087	775092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510726
15013	NC_013205	CGC	2	6	775098	775103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510726
15014	NC_013205	TCG	2	6	775127	775132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510726
15015	NC_013205	TCG	2	6	775139	775144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510726
15016	NC_013205	GC	3	6	775174	775179	0 %	0 %	50 %	50 %	258510726
15017	NC_013205	ACG	2	6	775263	775268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510727
15018	NC_013205	CG	4	8	775275	775282	0 %	0 %	50 %	50 %	258510727
15019	NC_013205	CGT	2	6	775303	775308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510727
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15021	NC_013205	GAG	2	6	775355	775360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510727
15022	NC_013205	GCGT	2	8	775386	775393	0 %	25 %	50 %	25 %	258510727
15023	NC_013205	TGG	2	6	775410	775415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510727
15024	NC_013205	CGGC	2	8	775566	775573	0 %	0 %	50 %	50 %	258510727
15025	NC_013205	GGT	2	6	775645	775650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510727
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15028	NC_013205	ACG	2	6	775742	775747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510727
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15030	NC_013205	GGC	2	6	775910	775915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510727
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15032	NC_013205	GAC	2	6	775958	775963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510727
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15034	NC_013205	CGA	2	6	776001	776006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510727
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15040	NC_013205	GCG	2	6	776124	776129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510727
15041	NC_013205	GCC	2	6	776191	776196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510727
15042	NC_013205	GC	3	6	776199	776204	0 %	0 %	50 %	50 %	258510727
15043	NC_013205	TCGG	2	8	776216	776223	0 %	25 %	50 %	25 %	258510727
15044	NC_013205	CTACGG	2	12	776356	776367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510727
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15057	NC_013205	GCTT	2	8	776764	776771	0 %	50 %	25 %	25 %	258510727
15058	NC_013205	GAA	2	6	776823	776828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510728
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15090	NC_013205	AGCC	2	8	778858	778865	25 %	0 %	25 %	50 %	258510729
15091	NC_013205	ACGC	2	8	778894	778901	25 %	0 %	25 %	50 %	258510729
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15120	NC_013205	CGG	2	6	780355	780360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510731
15121	NC_013205	CGGC	2	8	780381	780388	0 %	0 %	50 %	50 %	258510731
15122	NC_013205	CATG	2	8	780409	780416	25 %	25 %	25 %	25 %	258510731
15123	NC_013205	CAA	3	9	780418	780426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510731
15124	NC_013205	GGA	2	6	780433	780438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510731
15125	NC_013205	CGA	2	6	780490	780495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510731
15126	NC_013205	GATC	2	8	780496	780503	25 %	25 %	25 %	25 %	258510731
15127	NC_013205	CACG	2	8	780580	780587	25 %	0 %	25 %	50 %	258510731
15128	NC_013205	GCA	2	6	780604	780609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510731
15129	NC_013205	GCCA	2	8	780635	780642	25 %	0 %	25 %	50 %	258510731
15130	NC_013205	GGA	2	6	780649	780654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510731
15131	NC_013205	CG	4	8	780683	780690	0 %	0 %	50 %	50 %	258510731
15132	NC_013205	GGCG	2	8	780766	780773	0 %	0 %	75 %	25 %	258510731
15133	NC_013205	GCC	2	6	780865	780870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510731
15134	NC_013205	CGC	2	6	780901	780906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510731
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15136	NC_013205	GCG	2	6	780920	780925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510731
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15138	NC_013205	GCG	2	6	781124	781129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510731
15139	NC_013205	CCG	2	6	781133	781138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510731
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15141	NC_013205	CGT	2	6	781303	781308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510731
15142	NC_013205	GC	3	6	781328	781333	0 %	0 %	50 %	50 %	258510731
15143	NC_013205	GGCGC	2	10	781339	781348	0 %	0 %	60 %	40 %	258510731
15144	NC_013205	CGA	2	6	781526	781531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510732
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15149	NC_013205	CAT	2	6	781662	781667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510732
15150	NC_013205	ACA	2	6	781670	781675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510732
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15152	NC_013205	CGGT	2	8	781748	781755	0 %	25 %	50 %	25 %	258510732
15153	NC_013205	TCG	2	6	781785	781790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510732
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15157	NC_013205	CGG	2	6	782112	782117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510732
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15167	NC_013205	GTG	2	6	782527	782532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510732
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15175	NC_013205	GGC	2	6	782767	782772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510732
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15225	NC_013205	T	6	6	785403	785408	0 %	100 %	0 %	0 %	258510735
15226	NC_013205	CG	4	8	785426	785433	0 %	0 %	50 %	50 %	258510735
15227	NC_013205	CGAGAT	2	12	785445	785456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258510735
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15230	NC_013205	CCG	2	6	785515	785520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510735
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15232	NC_013205	GAG	2	6	785737	785742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510735
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15482	NC_013205	ATC	2	6	796637	796642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510743
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