MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013205	CGA	2	6	722398	722403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510676
14002	NC_013205	TG	4	8	722418	722425	0 %	50 %	50 %	0 %	258510676
14003	NC_013205	TCA	2	6	722448	722453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510676
14004	NC_013205	CGT	2	6	722530	722535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510676
14005	NC_013205	A	6	6	722582	722587	100 %	0 %	0 %	0 %	258510676
14006	NC_013205	CTACA	2	10	722602	722611	40 %	20 %	0 %	40 %	258510676
14007	NC_013205	AGC	2	6	722661	722666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510676
14008	NC_013205	CGG	2	6	722668	722673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510676
14009	NC_013205	GCA	2	6	722861	722866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510677
14010	NC_013205	GGA	2	6	722880	722885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510677
14011	NC_013205	ATCAG	2	10	722971	722980	40 %	20 %	20 %	20 %	258510677
14012	NC_013205	CGA	2	6	722993	722998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510677
14013	NC_013205	TGGA	2	8	723013	723020	25 %	25 %	50 %	0 %	258510677
14014	NC_013205	AC	4	8	723154	723161	50 %	0 %	0 %	50 %	258510677
14015	NC_013205	CTT	2	6	723336	723341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510677
14016	NC_013205	GGT	2	6	723419	723424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510677
14017	NC_013205	CGA	2	6	723458	723463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510678
14018	NC_013205	CG	3	6	723473	723478	0 %	0 %	50 %	50 %	258510678
14019	NC_013205	CTG	2	6	723479	723484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510678
14020	NC_013205	ATG	2	6	723507	723512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510678
14021	NC_013205	TGA	3	9	723517	723525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510678
14022	NC_013205	ACGG	2	8	723544	723551	25 %	0 %	50 %	25 %	258510678
14023	NC_013205	GTC	2	6	723571	723576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510678
14024	NC_013205	CGA	2	6	723580	723585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510678
14025	NC_013205	TG	3	6	723598	723603	0 %	50 %	50 %	0 %	258510678
14026	NC_013205	CG	3	6	723708	723713	0 %	0 %	50 %	50 %	258510678
14027	NC_013205	GA	3	6	723723	723728	50 %	0 %	50 %	0 %	258510678
14028	NC_013205	GGC	2	6	723770	723775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510678
14029	NC_013205	CCA	2	6	723778	723783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510678
14030	NC_013205	CTG	2	6	723834	723839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510678
14031	NC_013205	CGC	2	6	723840	723845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510678
14032	NC_013205	GCA	2	6	723985	723990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510678
14033	NC_013205	CTC	2	6	724058	724063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510678
14034	NC_013205	CGA	2	6	724084	724089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510678
14035	NC_013205	GCG	2	6	724644	724649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510679
14036	NC_013205	TGG	2	6	724660	724665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510679
14037	NC_013205	TCGGCT	2	12	724688	724699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510679
14038	NC_013205	GCC	2	6	724769	724774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510679
14039	NC_013205	GAG	2	6	724812	724817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510679
14040	NC_013205	TGC	2	6	724882	724887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510679
14041	NC_013205	CGC	2	6	724891	724896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510679
14042	NC_013205	ACG	2	6	725000	725005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510680
14043	NC_013205	CGC	2	6	725026	725031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510680
14044	NC_013205	GCC	2	6	725053	725058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510680
14045	NC_013205	CGATG	2	10	725062	725071	20 %	20 %	40 %	20 %	258510680
14046	NC_013205	GCGCC	2	10	725081	725090	0 %	0 %	40 %	60 %	258510680
14047	NC_013205	CAT	2	6	725098	725103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510680
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14049	NC_013205	GCT	2	6	725192	725197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510680
14050	NC_013205	GTT	2	6	725221	725226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510680
14051	NC_013205	CCG	2	6	725243	725248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510680
14052	NC_013205	GC	3	6	725261	725266	0 %	0 %	50 %	50 %	258510680
14053	NC_013205	CCG	2	6	725289	725294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510680
14054	NC_013205	CTGCG	2	10	725331	725340	0 %	20 %	40 %	40 %	258510680
14055	NC_013205	TCG	2	6	725345	725350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510680
14056	NC_013205	CGG	2	6	725370	725375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510680
14057	NC_013205	CG	4	8	725394	725401	0 %	0 %	50 %	50 %	258510680
14058	NC_013205	CCT	2	6	725403	725408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510680
14059	NC_013205	CG	3	6	725428	725433	0 %	0 %	50 %	50 %	258510680
14060	NC_013205	CGC	2	6	725446	725451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510680
14061	NC_013205	TGA	2	6	725457	725462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510680
14062	NC_013205	GCGAC	2	10	725465	725474	20 %	0 %	40 %	40 %	258510680
14063	NC_013205	AAG	3	9	725486	725494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510680
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14065	NC_013205	ACG	2	6	725973	725978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510681
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14067	NC_013205	CT	3	6	726167	726172	0 %	50 %	0 %	50 %	258510681
14068	NC_013205	GAC	2	6	726247	726252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510681
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14070	NC_013205	ACG	2	6	726509	726514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510681
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14072	NC_013205	CCA	2	6	726585	726590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510681
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14077	NC_013205	GGA	2	6	726863	726868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510682
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14088	NC_013205	AGC	2	6	727564	727569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510684
14089	NC_013205	CGAC	2	8	727585	727592	25 %	0 %	25 %	50 %	258510684
14090	NC_013205	GCC	2	6	727682	727687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510684
14091	NC_013205	GGC	2	6	727721	727726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510684
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14093	NC_013205	GCG	2	6	727820	727825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510684
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14099	NC_013205	CAGC	2	8	727964	727971	25 %	0 %	25 %	50 %	258510684
14100	NC_013205	TGG	2	6	728035	728040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510684
14101	NC_013205	GGC	2	6	728065	728070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510684
14102	NC_013205	CGA	2	6	728096	728101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510684
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14104	NC_013205	TAT	2	6	728154	728159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510684
14105	NC_013205	ACCA	2	8	728202	728209	50 %	0 %	0 %	50 %	258510684
14106	NC_013205	GCT	2	6	728231	728236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510684
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14109	NC_013205	GC	3	6	728349	728354	0 %	0 %	50 %	50 %	258510684
14110	NC_013205	TCC	2	6	728395	728400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510684
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14117	NC_013205	CG	3	6	728816	728821	0 %	0 %	50 %	50 %	258510684
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14240	NC_013205	CTCG	2	8	735491	735498	0 %	25 %	25 %	50 %	258510690
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14359	NC_013205	CTG	2	6	740409	740414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510694
14360	NC_013205	TGT	2	6	740884	740889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510695
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14465	NC_013205	GGC	2	6	748650	748655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510702
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14469	NC_013205	TGG	2	6	748724	748729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510702
14470	NC_013205	AC	3	6	748832	748837	50 %	0 %	0 %	50 %	258510703
14471	NC_013205	GAA	2	6	748862	748867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510703
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14474	NC_013205	CGA	2	6	749018	749023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510703
14475	NC_013205	GC	3	6	749033	749038	0 %	0 %	50 %	50 %	258510703
14476	NC_013205	CGCAG	2	10	749081	749090	20 %	0 %	40 %	40 %	258510703
14477	NC_013205	GGACGT	2	12	749126	749137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510703
14478	NC_013205	CGT	2	6	749165	749170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510703
14479	NC_013205	GAG	2	6	749196	749201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510703
14480	NC_013205	CA	3	6	749284	749289	50 %	0 %	0 %	50 %	258510703
14481	NC_013205	GGA	2	6	749639	749644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510704
14482	NC_013205	GTC	2	6	749691	749696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510704
14483	NC_013205	GGCG	2	8	749864	749871	0 %	0 %	75 %	25 %	258510704
14484	NC_013205	CCG	2	6	749873	749878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510704
14485	NC_013205	CG	3	6	749877	749882	0 %	0 %	50 %	50 %	258510704
14486	NC_013205	AAG	2	6	749971	749976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510704
14487	NC_013205	GAG	2	6	749996	750001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510704
14488	NC_013205	TGCTTC	2	12	750007	750018	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258510704
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14490	NC_013205	CT	3	6	750154	750159	0 %	50 %	0 %	50 %	258510704
14491	NC_013205	GGT	2	6	750230	750235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510704
14492	NC_013205	GTC	2	6	750267	750272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510704
14493	NC_013205	TCG	2	6	750328	750333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510704
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