MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013205	GC	3	6	677360	677365	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13002	NC_013205	GGC	2	6	677415	677420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13003	NC_013205	GC	4	8	677427	677434	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13004	NC_013205	GGC	2	6	677439	677444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13005	NC_013205	TCGCCG	2	12	677467	677478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510634
13006	NC_013205	CCG	2	6	677480	677485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510634
13007	NC_013205	GAG	3	9	677497	677505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13008	NC_013205	TGCGC	2	10	677610	677619	0 %	20 %	40 %	40 %	258510634
13009	NC_013205	CGA	2	6	677634	677639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13010	NC_013205	GCC	2	6	677656	677661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510634
13011	NC_013205	CGCT	2	8	677693	677700	0 %	25 %	25 %	50 %	258510634
13012	NC_013205	GGC	2	6	677750	677755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13013	NC_013205	CG	3	6	677766	677771	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13014	NC_013205	GGC	2	6	677787	677792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13015	NC_013205	CG	3	6	677817	677822	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13016	NC_013205	GAG	2	6	677839	677844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13017	NC_013205	CA	3	6	677859	677864	50 %	0 %	0 %	50 %	258510634
13018	NC_013205	CGA	2	6	677868	677873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13019	NC_013205	CCG	2	6	677890	677895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510634
13020	NC_013205	GAC	2	6	677920	677925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13021	NC_013205	GGA	2	6	677949	677954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13022	NC_013205	GGC	2	6	677972	677977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13023	NC_013205	AGG	2	6	677993	677998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13024	NC_013205	GAG	2	6	678022	678027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13025	NC_013205	TCG	2	6	678080	678085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13026	NC_013205	AGC	2	6	678095	678100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
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13028	NC_013205	GGA	2	6	678186	678191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13029	NC_013205	CGGGCG	2	12	678205	678216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13030	NC_013205	GCG	2	6	678225	678230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13031	NC_013205	GC	4	8	678300	678307	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13032	NC_013205	GATC	2	8	678315	678322	25 %	25 %	25 %	25 %	258510634
13033	NC_013205	GC	3	6	678349	678354	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13034	NC_013205	AG	3	6	678355	678360	50 %	0 %	50 %	0 %	258510634
13035	NC_013205	GAG	2	6	678379	678384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13036	NC_013205	GAG	2	6	678390	678395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13037	NC_013205	CGA	2	6	678408	678413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13038	NC_013205	AGG	2	6	678470	678475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13039	NC_013205	CG	3	6	678504	678509	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13040	NC_013205	GGA	2	6	678543	678548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13041	NC_013205	GCCA	2	8	678554	678561	25 %	0 %	25 %	50 %	258510634
13042	NC_013205	GGC	2	6	678566	678571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13043	NC_013205	GC	3	6	678644	678649	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13044	NC_013205	GGA	2	6	678663	678668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13045	NC_013205	GGT	2	6	678675	678680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510634
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13049	NC_013205	GTCG	2	8	678883	678890	0 %	25 %	50 %	25 %	258510634
13050	NC_013205	GGC	2	6	678995	679000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13051	NC_013205	TGG	2	6	679043	679048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510634
13052	NC_013205	GAC	2	6	679093	679098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13053	NC_013205	CG	3	6	679131	679136	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13054	NC_013205	AGG	2	6	679139	679144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510634
13055	NC_013205	TAT	2	6	679219	679224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510634
13056	NC_013205	GCG	3	9	679283	679291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510634
13057	NC_013205	GGCGAT	2	12	679296	679307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510634
13058	NC_013205	CGC	2	6	679323	679328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510634
13059	NC_013205	CG	3	6	679335	679340	0 %	0 %	50 %	50 %	258510634
13060	NC_013205	ATC	2	6	679372	679377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510634
13061	NC_013205	GAC	3	9	679405	679413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13062	NC_013205	TCA	2	6	679460	679465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510634
13063	NC_013205	CAG	2	6	679474	679479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
13064	NC_013205	GTG	2	6	679549	679554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510634
13065	NC_013205	CGA	2	6	679605	679610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510634
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13068	NC_013205	GC	3	6	679730	679735	0 %	0 %	50 %	50 %	258510635
13069	NC_013205	GGC	2	6	679737	679742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510635
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13078	NC_013205	GGCG	2	8	679994	680001	0 %	0 %	75 %	25 %	258510635
13079	NC_013205	GGGC	2	8	680034	680041	0 %	0 %	75 %	25 %	258510635
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13088	NC_013205	CGA	2	6	680378	680383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510635
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13093	NC_013205	GTC	2	6	680553	680558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510635
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13104	NC_013205	TCG	2	6	681133	681138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510636
13105	NC_013205	CTTC	2	8	681227	681234	0 %	50 %	0 %	50 %	258510636
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13109	NC_013205	GCACA	2	10	681320	681329	40 %	0 %	20 %	40 %	258510636
13110	NC_013205	ACC	2	6	681336	681341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510636
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13113	NC_013205	GGGCTC	2	12	681468	681479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258510636
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13116	NC_013205	TCG	2	6	681517	681522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510636
13117	NC_013205	CGTT	2	8	681542	681549	0 %	50 %	25 %	25 %	258510636
13118	NC_013205	GGA	2	6	681581	681586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510636
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13120	NC_013205	CG	4	8	681806	681813	0 %	0 %	50 %	50 %	258510637
13121	NC_013205	GGA	2	6	681942	681947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510637
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13139	NC_013205	CGA	2	6	682873	682878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510638
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13176	NC_013205	CGAG	2	8	684612	684619	25 %	0 %	50 %	25 %	258510640
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13241	NC_013205	CGG	2	6	687501	687506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510643
13242	NC_013205	CGGA	2	8	687572	687579	25 %	0 %	50 %	25 %	258510643
13243	NC_013205	TCGGA	2	10	687622	687631	20 %	20 %	40 %	20 %	258510643
13244	NC_013205	TCG	2	6	687641	687646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510643
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13251	NC_013205	GTTC	2	8	687934	687941	0 %	50 %	25 %	25 %	258510644
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13348	NC_013205	TCG	2	6	692331	692336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510646
13349	NC_013205	CGA	2	6	692344	692349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
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13351	NC_013205	CG	3	6	692383	692388	0 %	0 %	50 %	50 %	258510646
13352	NC_013205	GCA	2	6	692497	692502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
13353	NC_013205	CGG	2	6	692572	692577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510646
13354	NC_013205	GCCG	2	8	692612	692619	0 %	0 %	50 %	50 %	258510646
13355	NC_013205	TCG	2	6	692640	692645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510646
13356	NC_013205	AGC	2	6	692652	692657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
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13358	NC_013205	CGA	2	6	692866	692871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
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13361	NC_013205	CGA	2	6	692962	692967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
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13477	NC_013205	CGC	2	6	698420	698425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510653
13478	NC_013205	GAT	2	6	698495	698500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510653
13479	NC_013205	ACG	2	6	698523	698528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510653
13480	NC_013205	GGCC	2	8	698554	698561	0 %	0 %	50 %	50 %	258510653
13481	NC_013205	CAT	2	6	698600	698605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510653
13482	NC_013205	TCG	2	6	698646	698651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510653
13483	NC_013205	GC	3	6	698701	698706	0 %	0 %	50 %	50 %	258510653
13484	NC_013205	CT	3	6	698854	698859	0 %	50 %	0 %	50 %	258510653
13485	NC_013205	CGC	2	6	698897	698902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510653
13486	NC_013205	CGC	2	6	698927	698932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510653
13487	NC_013205	AC	3	6	698944	698949	50 %	0 %	0 %	50 %	258510653
13488	NC_013205	GTT	2	6	699008	699013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510653
13489	NC_013205	GGCG	2	8	699059	699066	0 %	0 %	75 %	25 %	258510653
13490	NC_013205	CG	3	6	699065	699070	0 %	0 %	50 %	50 %	258510653
13491	NC_013205	GAGC	2	8	699074	699081	25 %	0 %	50 %	25 %	258510653
13492	NC_013205	TCG	2	6	699139	699144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510653
13493	NC_013205	CG	3	6	699166	699171	0 %	0 %	50 %	50 %	258510653
13494	NC_013205	GCG	2	6	699211	699216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510653
13495	NC_013205	GCCC	2	8	699228	699235	0 %	0 %	25 %	75 %	258510653
13496	NC_013205	GCC	2	6	699237	699242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510653
13497	NC_013205	TTC	2	6	699261	699266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510653
13498	NC_013205	CGCGG	2	10	699312	699321	0 %	0 %	60 %	40 %	258510653
13499	NC_013205	AT	3	6	699368	699373	50 %	50 %	0 %	0 %	258510653
13500	NC_013205	TCG	2	6	699397	699402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510653

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