MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013205	TAC	2	6	652053	652058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510609
12502	NC_013205	ACGGG	2	10	652126	652135	20 %	0 %	60 %	20 %	258510609
12503	NC_013205	CGT	2	6	652159	652164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12504	NC_013205	CCAA	2	8	652246	652253	50 %	0 %	0 %	50 %	258510609
12505	NC_013205	GCG	2	6	652417	652422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510609
12506	NC_013205	GAT	2	6	652481	652486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510609
12507	NC_013205	CGGCA	2	10	652511	652520	20 %	0 %	40 %	40 %	258510609
12508	NC_013205	TGGCG	2	10	652523	652532	0 %	20 %	60 %	20 %	258510609
12509	NC_013205	AAT	2	6	652587	652592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510609
12510	NC_013205	AGT	2	6	652638	652643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510609
12511	NC_013205	GT	3	6	652642	652647	0 %	50 %	50 %	0 %	258510609
12512	NC_013205	CGA	2	6	652681	652686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12513	NC_013205	CAA	2	6	652764	652769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510609
12514	NC_013205	GC	3	6	652804	652809	0 %	0 %	50 %	50 %	258510609
12515	NC_013205	ATGGA	2	10	652817	652826	40 %	20 %	40 %	0 %	258510609
12516	NC_013205	CAC	2	6	652835	652840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510609
12517	NC_013205	AGC	2	6	652848	652853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12518	NC_013205	TGG	2	6	652910	652915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510609
12519	NC_013205	CGT	2	6	652939	652944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12520	NC_013205	GAC	2	6	653039	653044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12521	NC_013205	ATT	2	6	653095	653100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510609
12522	NC_013205	AAC	2	6	653115	653120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510609
12523	NC_013205	GCC	2	6	653168	653173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510609
12524	NC_013205	CAAC	2	8	653183	653190	50 %	0 %	0 %	50 %	258510609
12525	NC_013205	GACA	2	8	653231	653238	50 %	0 %	25 %	25 %	258510609
12526	NC_013205	GAC	2	6	653306	653311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12527	NC_013205	ACG	2	6	653331	653336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12528	NC_013205	ACG	2	6	653343	653348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12529	NC_013205	GAC	2	6	653351	653356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12530	NC_013205	CGC	2	6	653371	653376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510609
12531	NC_013205	GAC	2	6	653381	653386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510609
12532	NC_013205	TAC	2	6	653570	653575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510610
12533	NC_013205	GTG	2	6	653688	653693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510610
12534	NC_013205	AGGC	2	8	653797	653804	25 %	0 %	50 %	25 %	258510610
12535	NC_013205	CGG	2	6	653840	653845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510610
12536	NC_013205	GGA	2	6	653939	653944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510610
12537	NC_013205	AC	3	6	654067	654072	50 %	0 %	0 %	50 %	258510610
12538	NC_013205	GTA	2	6	654080	654085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510610
12539	NC_013205	GTT	2	6	654190	654195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510611
12540	NC_013205	CGA	2	6	654207	654212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510611
12541	NC_013205	GGC	2	6	654233	654238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510611
12542	NC_013205	ACA	2	6	654240	654245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510611
12543	NC_013205	GCA	2	6	654256	654261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510611
12544	NC_013205	ACG	2	6	654305	654310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510611
12545	NC_013205	CAG	2	6	654323	654328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510611
12546	NC_013205	CAA	2	6	654347	654352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510611
12547	NC_013205	TCC	2	6	654451	654456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510611
12548	NC_013205	CAA	2	6	654491	654496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510611
12549	NC_013205	CAC	3	9	654550	654558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510611
12550	NC_013205	AGTC	2	8	654626	654633	25 %	25 %	25 %	25 %	258510611
12551	NC_013205	GTT	2	6	654787	654792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510612
12552	NC_013205	GGC	2	6	654801	654806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510612
12553	NC_013205	GCG	2	6	654826	654831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510612
12554	NC_013205	GTC	2	6	654895	654900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510612
12555	NC_013205	GTG	2	6	654907	654912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510612
12556	NC_013205	ATCAA	2	10	654959	654968	60 %	20 %	0 %	20 %	258510612
12557	NC_013205	CGG	2	6	655086	655091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510613
12558	NC_013205	CA	3	6	655134	655139	50 %	0 %	0 %	50 %	258510613
12559	NC_013205	AAC	2	6	655166	655171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510613
12560	NC_013205	CGT	2	6	655215	655220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510613
12561	NC_013205	GCA	2	6	655296	655301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510613
12562	NC_013205	AACGA	2	10	655372	655381	60 %	0 %	20 %	20 %	258510613
12563	NC_013205	ATCAC	2	10	655424	655433	40 %	20 %	0 %	40 %	258510613
12564	NC_013205	TAC	2	6	655444	655449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510613
12565	NC_013205	TG	3	6	655518	655523	0 %	50 %	50 %	0 %	258510613
12566	NC_013205	CGG	3	9	655547	655555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510613
12567	NC_013205	CAGG	2	8	655621	655628	25 %	0 %	50 %	25 %	258510614
12568	NC_013205	TTG	2	6	655665	655670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510614
12569	NC_013205	CAGG	2	8	655705	655712	25 %	0 %	50 %	25 %	258510614
12570	NC_013205	GT	3	6	655750	655755	0 %	50 %	50 %	0 %	258510614
12571	NC_013205	CTGAAT	2	12	655976	655987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258510614
12572	NC_013205	TTGC	2	8	656003	656010	0 %	50 %	25 %	25 %	258510614
12573	NC_013205	CGG	2	6	656023	656028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12574	NC_013205	CGC	2	6	656041	656046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510614
12575	NC_013205	GAC	2	6	656104	656109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510614
12576	NC_013205	ACG	2	6	656192	656197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510614
12577	NC_013205	TCA	2	6	656202	656207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510614
12578	NC_013205	GGAA	2	8	656262	656269	50 %	0 %	50 %	0 %	258510614
12579	NC_013205	AAACG	2	10	656293	656302	60 %	0 %	20 %	20 %	258510614
12580	NC_013205	CGC	2	6	656319	656324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510614
12581	NC_013205	TTC	2	6	656399	656404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510614
12582	NC_013205	GCG	2	6	656487	656492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12583	NC_013205	ACCA	2	8	656513	656520	50 %	0 %	0 %	50 %	258510614
12584	NC_013205	GTG	2	6	656536	656541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510614
12585	NC_013205	GGC	2	6	656554	656559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12586	NC_013205	ATC	2	6	656588	656593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510614
12587	NC_013205	GCG	2	6	656594	656599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12588	NC_013205	GGC	2	6	656618	656623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12589	NC_013205	CGG	2	6	656643	656648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12590	NC_013205	CGG	2	6	656688	656693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12591	NC_013205	TGGA	2	8	656720	656727	25 %	25 %	50 %	0 %	258510614
12592	NC_013205	AGG	2	6	656766	656771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510614
12593	NC_013205	CGG	2	6	656785	656790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12594	NC_013205	TAC	2	6	656819	656824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510614
12595	NC_013205	GGC	2	6	656881	656886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12596	NC_013205	TGT	2	6	656899	656904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510614
12597	NC_013205	CGG	2	6	656907	656912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510614
12598	NC_013205	AC	3	6	656925	656930	50 %	0 %	0 %	50 %	258510614
12599	NC_013205	AAC	2	6	657002	657007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510614
12600	NC_013205	CCGAA	2	10	657148	657157	40 %	0 %	20 %	40 %	258510615
12601	NC_013205	GCG	2	6	657253	657258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510615
12602	NC_013205	CCG	2	6	657292	657297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510615
12603	NC_013205	CCG	2	6	657367	657372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510615
12604	NC_013205	AAG	2	6	657508	657513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510615
12605	NC_013205	GACG	2	8	657587	657594	25 %	0 %	50 %	25 %	258510615
12606	NC_013205	CG	3	6	657690	657695	0 %	0 %	50 %	50 %	258510615
12607	NC_013205	TCG	2	6	657720	657725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510615
12608	NC_013205	CTT	2	6	657743	657748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510615
12609	NC_013205	AAG	2	6	657774	657779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510615
12610	NC_013205	GAC	2	6	657842	657847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510615
12611	NC_013205	CTA	2	6	657848	657853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510615
12612	NC_013205	GGT	2	6	657902	657907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510615
12613	NC_013205	GAG	3	9	657993	658001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510615
12614	NC_013205	CGG	3	9	658033	658041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510615
12615	NC_013205	TGC	2	6	658078	658083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510615
12616	NC_013205	GAC	2	6	658089	658094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510615
12617	NC_013205	ATCC	2	8	658128	658135	25 %	25 %	0 %	50 %	258510615
12618	NC_013205	AGG	2	6	658141	658146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510615
12619	NC_013205	ATG	2	6	658236	658241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510615
12620	NC_013205	GGCA	2	8	658282	658289	25 %	0 %	50 %	25 %	258510615
12621	NC_013205	TGC	2	6	658348	658353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510615
12622	NC_013205	CAA	2	6	658362	658367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510615
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12624	NC_013205	TGGATG	2	12	658483	658494	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258510615
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12626	NC_013205	TCA	2	6	658564	658569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510615
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12630	NC_013205	TGGA	2	8	658827	658834	25 %	25 %	50 %	0 %	258510615
12631	NC_013205	CGATC	2	10	658871	658880	20 %	20 %	20 %	40 %	258510615
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12740	NC_013205	GGAT	2	8	663975	663982	25 %	25 %	50 %	0 %	258510620
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