MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013205	GGC	2	6	623081	623086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510575
12003	NC_013205	TCT	2	6	623146	623151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510575
12004	NC_013205	GCC	2	6	623161	623166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510575
12005	NC_013205	TCG	2	6	623251	623256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510575
12006	NC_013205	TGCC	2	8	623281	623288	0 %	25 %	25 %	50 %	258510575
12007	NC_013205	GCA	2	6	623291	623296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510575
12008	NC_013205	CTT	2	6	623307	623312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510575
12009	NC_013205	GTG	2	6	623319	623324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510575
12010	NC_013205	GAA	2	6	623333	623338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510575
12011	NC_013205	CG	3	6	623339	623344	0 %	0 %	50 %	50 %	258510575
12012	NC_013205	AGC	2	6	623409	623414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510576
12013	NC_013205	CAT	2	6	623468	623473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510576
12014	NC_013205	CTT	2	6	623516	623521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510576
12015	NC_013205	AAG	2	6	623568	623573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510576
12016	NC_013205	AGG	2	6	623581	623586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510576
12017	NC_013205	TCA	2	6	623647	623652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510576
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12019	NC_013205	ACT	2	6	623808	623813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510577
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12022	NC_013205	CGT	2	6	623974	623979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510577
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12024	NC_013205	TGGC	2	8	624032	624039	0 %	25 %	50 %	25 %	258510577
12025	NC_013205	CTGGA	2	10	624045	624054	20 %	20 %	40 %	20 %	258510577
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12028	NC_013205	GCA	2	6	625684	625689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510578
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12032	NC_013205	GTC	2	6	625824	625829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510578
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12039	NC_013205	GCT	2	6	626342	626347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510578
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12042	NC_013205	GC	4	8	626438	626445	0 %	0 %	50 %	50 %	258510578
12043	NC_013205	CG	3	6	626446	626451	0 %	0 %	50 %	50 %	258510578
12044	NC_013205	CTC	2	6	626502	626507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510578
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12051	NC_013205	GC	3	6	626765	626770	0 %	0 %	50 %	50 %	258510578
12052	NC_013205	CAA	2	6	626826	626831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510578
12053	NC_013205	CG	3	6	626950	626955	0 %	0 %	50 %	50 %	258510578
12054	NC_013205	TCT	2	6	626992	626997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510578
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12058	NC_013205	GTC	2	6	627238	627243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510578
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12117	NC_013205	CGA	2	6	630562	630567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510579
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12119	NC_013205	ACG	2	6	630720	630725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510579
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12232	NC_013205	GGTAC	2	10	636022	636031	20 %	20 %	40 %	20 %	258510584
12233	NC_013205	CGTC	2	8	636040	636047	0 %	25 %	25 %	50 %	258510584
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12236	NC_013205	GGA	2	6	636094	636099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510584
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12238	NC_013205	ACT	2	6	636231	636236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510584
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12241	NC_013205	CTC	3	9	636380	636388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510584
12242	NC_013205	GCG	2	6	636523	636528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510584
12243	NC_013205	GAT	2	6	636547	636552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510584
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12475	NC_013205	TTGT	2	8	650799	650806	0 %	75 %	25 %	0 %	258510607
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12479	NC_013205	TGT	2	6	650966	650971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510607
12480	NC_013205	TCG	2	6	651038	651043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510607
12481	NC_013205	CGT	2	6	651093	651098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510607
12482	NC_013205	CG	4	8	651105	651112	0 %	0 %	50 %	50 %	258510607
12483	NC_013205	ACT	2	6	651162	651167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510607
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12487	NC_013205	GCCCA	2	10	651348	651357	20 %	0 %	20 %	60 %	258510608
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