MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013205	GTC	2	6	586072	586077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510533
11502	NC_013205	CG	4	8	586114	586121	0 %	0 %	50 %	50 %	258510533
11503	NC_013205	GAT	2	6	586148	586153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510533
11504	NC_013205	GAT	2	6	586226	586231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510533
11505	NC_013205	TGG	2	6	586295	586300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510533
11506	NC_013205	GAC	2	6	586353	586358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510533
11507	NC_013205	CGT	2	6	586397	586402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510533
11508	NC_013205	GAA	2	6	586499	586504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510533
11509	NC_013205	GCG	2	6	586508	586513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510533
11510	NC_013205	GAAG	2	8	586528	586535	50 %	0 %	50 %	0 %	258510533
11511	NC_013205	GA	3	6	586552	586557	50 %	0 %	50 %	0 %	258510533
11512	NC_013205	TATT	2	8	586626	586633	25 %	75 %	0 %	0 %	258510534
11513	NC_013205	CAG	2	6	586661	586666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510534
11514	NC_013205	GC	3	6	586687	586692	0 %	0 %	50 %	50 %	258510534
11515	NC_013205	AAG	2	6	586832	586837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510534
11516	NC_013205	CGT	2	6	586867	586872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510534
11517	NC_013205	GTG	2	6	586891	586896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510534
11518	NC_013205	AGCAAA	2	12	586911	586922	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	258510534
11519	NC_013205	GA	3	6	586926	586931	50 %	0 %	50 %	0 %	258510534
11520	NC_013205	GCT	2	6	586954	586959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510534
11521	NC_013205	AAAC	2	8	587002	587009	75 %	0 %	0 %	25 %	258510534
11522	NC_013205	AGC	2	6	587055	587060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510534
11523	NC_013205	AAC	2	6	587139	587144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510534
11524	NC_013205	ATC	2	6	587271	587276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510534
11525	NC_013205	CT	3	6	587346	587351	0 %	50 %	0 %	50 %	258510534
11526	NC_013205	GCA	2	6	587377	587382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510534
11527	NC_013205	CGGG	2	8	587383	587390	0 %	0 %	75 %	25 %	258510534
11528	NC_013205	GTC	2	6	587413	587418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510534
11529	NC_013205	CT	3	6	587437	587442	0 %	50 %	0 %	50 %	258510534
11530	NC_013205	GATG	2	8	587670	587677	25 %	25 %	50 %	0 %	258510534
11531	NC_013205	ATG	2	6	587773	587778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510534
11532	NC_013205	GGT	2	6	587852	587857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510534
11533	NC_013205	ATGTGC	2	12	589587	589598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510535
11534	NC_013205	CGG	2	6	589608	589613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510535
11535	NC_013205	CGG	2	6	589761	589766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510535
11536	NC_013205	CA	3	6	589819	589824	50 %	0 %	0 %	50 %	258510535
11537	NC_013205	CGG	2	6	589869	589874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510535
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11539	NC_013205	AGGC	2	8	589889	589896	25 %	0 %	50 %	25 %	258510535
11540	NC_013205	TGG	2	6	589902	589907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510535
11541	NC_013205	TCG	2	6	590099	590104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510536
11542	NC_013205	GCG	2	6	590138	590143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510536
11543	NC_013205	GGC	3	9	590215	590223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510536
11544	NC_013205	GCT	2	6	590273	590278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510536
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11551	NC_013205	AAG	2	6	590667	590672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510536
11552	NC_013205	GA	3	6	590703	590708	50 %	0 %	50 %	0 %	258510536
11553	NC_013205	GGA	2	6	590804	590809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510536
11554	NC_013205	GAG	2	6	590841	590846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510536
11555	NC_013205	AGAC	2	8	590874	590881	50 %	0 %	25 %	25 %	258510536
11556	NC_013205	CTT	2	6	590888	590893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510536
11557	NC_013205	GC	3	6	590894	590899	0 %	0 %	50 %	50 %	258510536
11558	NC_013205	CAT	2	6	590919	590924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510536
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11560	NC_013205	GAA	2	6	590996	591001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510536
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11564	NC_013205	GAG	2	6	591183	591188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510536
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11582	NC_013205	GCGG	2	8	592038	592045	0 %	0 %	75 %	25 %	258510538
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11586	NC_013205	GA	3	6	592111	592116	50 %	0 %	50 %	0 %	258510538
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11591	NC_013205	CGA	2	6	592409	592414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510538
11592	NC_013205	AAG	2	6	592663	592668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510539
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11596	NC_013205	AC	3	6	593167	593172	50 %	0 %	0 %	50 %	258510539
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11599	NC_013205	AAAT	2	8	593326	593333	75 %	25 %	0 %	0 %	258510539
11600	NC_013205	TAGT	2	8	593439	593446	25 %	50 %	25 %	0 %	258510539
11601	NC_013205	CGAG	2	8	593535	593542	25 %	0 %	50 %	25 %	258510539
11602	NC_013205	ACGA	2	8	595685	595692	50 %	0 %	25 %	25 %	258510540
11603	NC_013205	TTC	2	6	595743	595748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510540
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11605	NC_013205	TGT	2	6	595811	595816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510540
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11607	NC_013205	GGT	2	6	595960	595965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510540
11608	NC_013205	TGA	2	6	595986	595991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510540
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11610	NC_013205	TTTG	2	8	596106	596113	0 %	75 %	25 %	0 %	258510541
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11618	NC_013205	TTG	2	6	596460	596465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510541
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11742	NC_013205	TGC	2	6	605843	605848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510553
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11850	NC_013205	ATCA	2	8	612499	612506	50 %	25 %	0 %	25 %	258510563
11851	NC_013205	CCGTC	2	10	612544	612553	0 %	20 %	20 %	60 %	258510563
11852	NC_013205	GC	3	6	612570	612575	0 %	0 %	50 %	50 %	258510563
11853	NC_013205	CCAG	2	8	612637	612644	25 %	0 %	25 %	50 %	258510563
11854	NC_013205	CAG	2	6	612660	612665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510563
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11856	NC_013205	CTC	2	6	612703	612708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510563
11857	NC_013205	ATGT	2	8	612725	612732	25 %	50 %	25 %	0 %	258510563
11858	NC_013205	CAT	3	9	612949	612957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510563
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11860	NC_013205	CGGCAC	2	12	612988	612999	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258510563
11861	NC_013205	GC	3	6	613059	613064	0 %	0 %	50 %	50 %	258510563
11862	NC_013205	CTA	2	6	613132	613137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510563
11863	NC_013205	GTT	2	6	613168	613173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510563
11864	NC_013205	GTGG	2	8	613190	613197	0 %	25 %	75 %	0 %	258510563
11865	NC_013205	GGC	2	6	613279	613284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510563
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11978	NC_013205	TCT	2	6	620876	620881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510572
11979	NC_013205	GT	3	6	620917	620922	0 %	50 %	50 %	0 %	258510572
11980	NC_013205	GACG	2	8	621007	621014	25 %	0 %	50 %	25 %	258510572
11981	NC_013205	GAG	2	6	621016	621021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510572
11982	NC_013205	TGC	2	6	621047	621052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510572
11983	NC_013205	TCG	2	6	621062	621067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510572
11984	NC_013205	CG	3	6	621081	621086	0 %	0 %	50 %	50 %	258510572
11985	NC_013205	CG	3	6	621107	621112	0 %	0 %	50 %	50 %	258510572
11986	NC_013205	GCAACT	2	12	621171	621182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258510572
11987	NC_013205	CGA	2	6	621237	621242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510572
11988	NC_013205	GAA	2	6	621290	621295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510572
11989	NC_013205	ACC	2	6	621373	621378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510573
11990	NC_013205	CGG	2	6	621428	621433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510573
11991	NC_013205	CAA	2	6	621436	621441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510573
11992	NC_013205	CTG	2	6	621442	621447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510573
11993	NC_013205	CGA	2	6	621696	621701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510573
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11995	NC_013205	TCC	2	6	622757	622762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510574
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11998	NC_013205	GCG	2	6	622803	622808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510575
11999	NC_013205	GGC	2	6	622865	622870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510575
12000	NC_013205	GCCGC	2	10	622881	622890	0 %	0 %	40 %	60 %	258510575

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