MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_013205	GAG	2	6	549341	549346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510497
11003	NC_013205	GCG	2	6	549392	549397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510497
11004	NC_013205	CG	3	6	549498	549503	0 %	0 %	50 %	50 %	258510497
11005	NC_013205	ACG	2	6	549777	549782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510498
11006	NC_013205	GAT	2	6	549821	549826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510498
11007	NC_013205	AAT	2	6	549891	549896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510498
11008	NC_013205	GT	3	6	549919	549924	0 %	50 %	50 %	0 %	258510498
11009	NC_013205	ATG	2	6	549981	549986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510498
11010	NC_013205	GC	3	6	550016	550021	0 %	0 %	50 %	50 %	258510498
11011	NC_013205	CGG	2	6	550051	550056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510498
11012	NC_013205	CGG	2	6	550087	550092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510498
11013	NC_013205	CGC	2	6	550109	550114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510498
11014	NC_013205	AC	3	6	550127	550132	50 %	0 %	0 %	50 %	258510498
11015	NC_013205	CTG	2	6	550155	550160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510498
11016	NC_013205	CGA	2	6	550184	550189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510498
11017	NC_013205	TGA	2	6	550320	550325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510499
11018	NC_013205	ACG	2	6	550329	550334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510499
11019	NC_013205	CGA	2	6	550409	550414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510499
11020	NC_013205	GAC	2	6	550415	550420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510499
11021	NC_013205	GCG	2	6	550431	550436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510499
11022	NC_013205	GGT	2	6	550822	550827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510500
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11031	NC_013205	GT	3	6	551467	551472	0 %	50 %	50 %	0 %	258510502
11032	NC_013205	GAT	2	6	551628	551633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510503
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11051	NC_013205	CGAGC	2	10	553172	553181	20 %	0 %	40 %	40 %	258510507
11052	NC_013205	CGG	2	6	553381	553386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510508
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11056	NC_013205	GA	3	6	553514	553519	50 %	0 %	50 %	0 %	258510508
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11085	NC_013205	CTGCC	2	10	556134	556143	0 %	20 %	20 %	60 %	258510512
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11102	NC_013205	GAA	2	6	556728	556733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510512
11103	NC_013205	CAG	2	6	556761	556766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510512
11104	NC_013205	GA	3	6	556778	556783	50 %	0 %	50 %	0 %	258510512
11105	NC_013205	TCAA	2	8	556790	556797	50 %	25 %	0 %	25 %	258510512
11106	NC_013205	CTT	2	6	556824	556829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510512
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11111	NC_013205	AAGC	2	8	557389	557396	50 %	0 %	25 %	25 %	258510513
11112	NC_013205	CG	3	6	557556	557561	0 %	0 %	50 %	50 %	258510513
11113	NC_013205	GTC	2	6	557596	557601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510513
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11116	NC_013205	CG	4	8	557751	557758	0 %	0 %	50 %	50 %	258510514
11117	NC_013205	ACG	2	6	557776	557781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510514
11118	NC_013205	CG	3	6	557847	557852	0 %	0 %	50 %	50 %	258510514
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11120	NC_013205	GGC	2	6	557900	557905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510514
11121	NC_013205	GCG	2	6	557906	557911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510514
11122	NC_013205	AGG	2	6	557956	557961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510514
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11124	NC_013205	CG	3	6	558073	558078	0 %	0 %	50 %	50 %	258510514
11125	NC_013205	GA	3	6	558152	558157	50 %	0 %	50 %	0 %	258510514
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11154	NC_013205	TGCG	2	8	560771	560778	0 %	25 %	50 %	25 %	258510518
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11219	NC_013205	CTG	2	6	568007	568012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510521
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11222	NC_013205	TGC	2	6	568128	568133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510521
11223	NC_013205	CAG	2	6	568147	568152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510521
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11226	NC_013205	GT	3	6	568397	568402	0 %	50 %	50 %	0 %	258510521
11227	NC_013205	ATTTTG	2	12	568522	568533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258510522
11228	NC_013205	A	7	7	568572	568578	100 %	0 %	0 %	0 %	258510522
11229	NC_013205	GGAA	2	8	568592	568599	50 %	0 %	50 %	0 %	258510522
11230	NC_013205	CAT	2	6	568632	568637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510522
11231	NC_013205	TTC	2	6	568663	568668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510522
11232	NC_013205	GGC	2	6	568672	568677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510522
11233	NC_013205	TTG	2	6	568690	568695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510522
11234	NC_013205	GTT	2	6	568890	568895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510522
11235	NC_013205	CTT	2	6	568896	568901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510522
11236	NC_013205	TGG	2	6	568935	568940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510522
11237	NC_013205	TCC	2	6	568968	568973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510522
11238	NC_013205	GTA	2	6	569048	569053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
11239	NC_013205	TATCAT	2	12	569157	569168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258510522
11240	NC_013205	TGA	2	6	569207	569212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
11241	NC_013205	CGG	2	6	569253	569258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510522
11242	NC_013205	ATG	2	6	569266	569271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
11243	NC_013205	TG	3	6	569436	569441	0 %	50 %	50 %	0 %	258510522
11244	NC_013205	CAC	2	6	569446	569451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510522
11245	NC_013205	GGGAGC	2	12	569463	569474	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258510522
11246	NC_013205	TTGCGA	2	12	569492	569503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510522
11247	NC_013205	GTT	2	6	569547	569552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510522
11248	NC_013205	CGG	2	6	569628	569633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510522
11249	NC_013205	TCA	2	6	569709	569714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510522
11250	NC_013205	TAT	2	6	569758	569763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510522
11251	NC_013205	TGG	2	6	569764	569769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510522
11252	NC_013205	TGA	2	6	569793	569798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
11253	NC_013205	TGGGG	2	10	569918	569927	0 %	20 %	80 %	0 %	258510522
11254	NC_013205	TCG	2	6	569939	569944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510522
11255	NC_013205	CCA	2	6	569945	569950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510522
11256	NC_013205	GCGA	2	8	570020	570027	25 %	0 %	50 %	25 %	258510522
11257	NC_013205	GTG	2	6	570135	570140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510522
11258	NC_013205	AG	3	6	570152	570157	50 %	0 %	50 %	0 %	258510522
11259	NC_013205	GGCG	2	8	570237	570244	0 %	0 %	75 %	25 %	258510522
11260	NC_013205	CGA	3	9	570345	570353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510522
11261	NC_013205	ATGAA	2	10	570362	570371	60 %	20 %	20 %	0 %	258510522
11262	NC_013205	CGA	2	6	570375	570380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510522
11263	NC_013205	CAT	2	6	570381	570386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510522
11264	NC_013205	AAGCT	2	10	570395	570404	40 %	20 %	20 %	20 %	258510522
11265	NC_013205	TTC	2	6	570555	570560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510523
11266	NC_013205	AC	4	8	570563	570570	50 %	0 %	0 %	50 %	258510523
11267	NC_013205	TGG	2	6	570574	570579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510523
11268	NC_013205	ATG	2	6	570725	570730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510523
11269	NC_013205	TTGGC	2	10	570732	570741	0 %	40 %	40 %	20 %	258510523
11270	NC_013205	ATG	2	6	570774	570779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510523
11271	NC_013205	CGGT	2	8	570783	570790	0 %	25 %	50 %	25 %	258510523
11272	NC_013205	CGA	2	6	570792	570797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510523
11273	NC_013205	CTT	2	6	570823	570828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510523
11274	NC_013205	TCG	2	6	570942	570947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510523
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11277	NC_013205	GTG	2	6	571016	571021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510523
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11284	NC_013205	TCC	2	6	571245	571250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510524
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11293	NC_013205	ATC	2	6	571851	571856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510525
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11303	NC_013205	TTG	2	6	572170	572175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510525
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11307	NC_013205	AGA	2	6	572302	572307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510525
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11357	NC_013205	GCC	2	6	575266	575271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510527
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11479	NC_013205	GAT	2	6	585101	585106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510533
11480	NC_013205	TCA	2	6	585114	585119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510533
11481	NC_013205	CGG	2	6	585166	585171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510533
11482	NC_013205	CGTTT	2	10	585182	585191	0 %	60 %	20 %	20 %	258510533
11483	NC_013205	G	7	7	585216	585222	0 %	0 %	100 %	0 %	258510533
11484	NC_013205	GGA	2	6	585280	585285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510533
11485	NC_013205	ATT	2	6	585286	585291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510533
11486	NC_013205	AACG	2	8	585323	585330	50 %	0 %	25 %	25 %	258510533
11487	NC_013205	TGTAG	2	10	585347	585356	20 %	40 %	40 %	0 %	258510533
11488	NC_013205	ACT	2	6	585409	585414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510533
11489	NC_013205	AAC	2	6	585480	585485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510533
11490	NC_013205	ATCA	2	8	585491	585498	50 %	25 %	0 %	25 %	258510533
11491	NC_013205	TCA	2	6	585520	585525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510533
11492	NC_013205	TCG	2	6	585676	585681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510533
11493	NC_013205	TTC	2	6	585735	585740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510533
11494	NC_013205	CAG	2	6	585813	585818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510533
11495	NC_013205	GTAC	2	8	585860	585867	25 %	25 %	25 %	25 %	258510533
11496	NC_013205	AT	3	6	585913	585918	50 %	50 %	0 %	0 %	258510533
11497	NC_013205	AT	3	6	585924	585929	50 %	50 %	0 %	0 %	258510533
11498	NC_013205	TGCA	2	8	585975	585982	25 %	25 %	25 %	25 %	258510533
11499	NC_013205	TGGC	2	8	586013	586020	0 %	25 %	50 %	25 %	258510533
11500	NC_013205	TTGA	2	8	586043	586050	25 %	50 %	25 %	0 %	258510533

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