MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10004	NC_013205	CGC	2	6	497756	497761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510446
10005	NC_013205	GC	3	6	497760	497765	0 %	0 %	50 %	50 %	258510446
10006	NC_013205	GTC	2	6	497829	497834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510446
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10011	NC_013205	AGA	2	6	498049	498054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510446
10012	NC_013205	GTG	2	6	498075	498080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510446
10013	NC_013205	CGC	2	6	498101	498106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510446
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10122	NC_013205	CGG	2	6	502961	502966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510449
10123	NC_013205	GCG	2	6	503027	503032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510449
10124	NC_013205	CGT	2	6	503042	503047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510449
10125	NC_013205	CGG	2	6	503051	503056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510449
10126	NC_013205	CCG	2	6	503127	503132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510449
10127	NC_013205	CCG	2	6	503135	503140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510449
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10129	NC_013205	CG	3	6	503344	503349	0 %	0 %	50 %	50 %	258510450
10130	NC_013205	GCT	2	6	503380	503385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510450
10131	NC_013205	GC	3	6	503564	503569	0 %	0 %	50 %	50 %	258510450
10132	NC_013205	TCG	2	6	503574	503579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510450
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10134	NC_013205	CGT	2	6	503656	503661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510450
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10137	NC_013205	CAC	2	6	503813	503818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510450
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10139	NC_013205	TCA	2	6	503975	503980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510451
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10142	NC_013205	TCG	2	6	504263	504268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510451
10143	NC_013205	TCG	2	6	504406	504411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510451
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10145	NC_013205	CTCG	2	8	504498	504505	0 %	25 %	25 %	50 %	258510451
10146	NC_013205	CT	3	6	504529	504534	0 %	50 %	0 %	50 %	258510451
10147	NC_013205	GC	3	6	504650	504655	0 %	0 %	50 %	50 %	258510452
10148	NC_013205	CGA	2	6	504675	504680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510452
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10150	NC_013205	CGA	3	9	504714	504722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510452
10151	NC_013205	ACG	2	6	504778	504783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510452
10152	NC_013205	GCG	2	6	504837	504842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510452
10153	NC_013205	GGCGG	2	10	504843	504852	0 %	0 %	80 %	20 %	258510452
10154	NC_013205	GAG	2	6	504859	504864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510452
10155	NC_013205	CAG	2	6	504889	504894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510452
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10157	NC_013205	CGA	2	6	504915	504920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510452
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10160	NC_013205	TCGG	2	8	504988	504995	0 %	25 %	50 %	25 %	258510452
10161	NC_013205	GTC	2	6	505027	505032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510452
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10169	NC_013205	CGT	2	6	505314	505319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510452
10170	NC_013205	CAT	2	6	505449	505454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510452
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10184	NC_013205	CGT	2	6	506087	506092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510452
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10204	NC_013205	CAT	2	6	507101	507106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510453
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10211	NC_013205	TGGA	2	8	507411	507418	25 %	25 %	50 %	0 %	258510453
10212	NC_013205	TTC	2	6	507490	507495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510453
10213	NC_013205	TCG	2	6	507518	507523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510453
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10215	NC_013205	GAT	2	6	507564	507569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510454
10216	NC_013205	GGGCG	2	10	507614	507623	0 %	0 %	80 %	20 %	258510454
10217	NC_013205	GTG	2	6	507679	507684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510454
10218	NC_013205	CCTGA	2	10	507708	507717	20 %	20 %	20 %	40 %	258510454
10219	NC_013205	TGC	2	6	507979	507984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10220	NC_013205	CGT	2	6	507991	507996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10221	NC_013205	CGGCT	2	10	508044	508053	0 %	20 %	40 %	40 %	258510455
10222	NC_013205	GGCG	2	8	508085	508092	0 %	0 %	75 %	25 %	258510455
10223	NC_013205	CCGA	2	8	508128	508135	25 %	0 %	25 %	50 %	258510455
10224	NC_013205	GC	3	6	508157	508162	0 %	0 %	50 %	50 %	258510455
10225	NC_013205	GCA	2	6	508169	508174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10226	NC_013205	ACC	2	6	508183	508188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510455
10227	NC_013205	CGG	2	6	508199	508204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510455
10228	NC_013205	CGC	2	6	508220	508225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510455
10229	NC_013205	GGC	2	6	508278	508283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510455
10230	NC_013205	CGA	2	6	508327	508332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10231	NC_013205	GAC	2	6	508386	508391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10232	NC_013205	GAT	3	9	508397	508405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510455
10233	NC_013205	TCG	2	6	508461	508466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10234	NC_013205	GCG	2	6	508489	508494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510455
10235	NC_013205	GAA	2	6	508534	508539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510455
10236	NC_013205	GACG	2	8	508550	508557	25 %	0 %	50 %	25 %	258510455
10237	NC_013205	GAA	2	6	508577	508582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510455
10238	NC_013205	ACG	2	6	508612	508617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10239	NC_013205	GC	3	6	508632	508637	0 %	0 %	50 %	50 %	258510455
10240	NC_013205	GCATG	2	10	508703	508712	20 %	20 %	40 %	20 %	258510455
10241	NC_013205	TGA	2	6	508796	508801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510455
10242	NC_013205	GCT	2	6	508820	508825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510455
10243	NC_013205	CG	3	6	508826	508831	0 %	0 %	50 %	50 %	258510455
10244	NC_013205	GC	4	8	508967	508974	0 %	0 %	50 %	50 %	258510455
10245	NC_013205	ACC	2	6	509020	509025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510455
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10253	NC_013205	TCT	2	6	509363	509368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510456
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10257	NC_013205	CTC	2	6	509512	509517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510456
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10264	NC_013205	ATC	2	6	509965	509970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510456
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10342	NC_013205	CGC	2	6	514274	514279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510459
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10350	NC_013205	GAC	2	6	514682	514687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510459
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10354	NC_013205	TCG	2	6	514832	514837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510459
10355	NC_013205	GC	3	6	514902	514907	0 %	0 %	50 %	50 %	258510459
10356	NC_013205	GAC	2	6	514909	514914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510459
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10359	NC_013205	GAG	2	6	514957	514962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510459
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10477	NC_013205	GGC	2	6	521384	521389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510466
10478	NC_013205	TGC	2	6	521404	521409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510466
10479	NC_013205	CG	3	6	521419	521424	0 %	0 %	50 %	50 %	258510466
10480	NC_013205	TGG	2	6	521484	521489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510466
10481	NC_013205	GAC	2	6	521523	521528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510466
10482	NC_013205	G	6	6	521561	521566	0 %	0 %	100 %	0 %	258510466
10483	NC_013205	TGG	2	6	521604	521609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510466
10484	NC_013205	GC	3	6	521692	521697	0 %	0 %	50 %	50 %	258510466
10485	NC_013205	GTG	2	6	521700	521705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510466
10486	NC_013205	CGC	2	6	521884	521889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510466
10487	NC_013205	TCG	2	6	522105	522110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510467
10488	NC_013205	GCGG	2	8	522148	522155	0 %	0 %	75 %	25 %	258510467
10489	NC_013205	GAA	2	6	522203	522208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510467
10490	NC_013205	GGT	2	6	522264	522269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510467
10491	NC_013205	CGT	2	6	522364	522369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510467
10492	NC_013205	CG	3	6	522397	522402	0 %	0 %	50 %	50 %	258510467
10493	NC_013205	GTC	2	6	522431	522436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510467
10494	NC_013205	GAT	2	6	522472	522477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510467
10495	NC_013205	TGA	2	6	522564	522569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510468
10496	NC_013205	CGG	2	6	522597	522602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510468
10497	NC_013205	TC	3	6	522615	522620	0 %	50 %	0 %	50 %	258510468
10498	NC_013205	GAT	2	6	522700	522705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510468
10499	NC_013205	ACC	2	6	522725	522730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510468
10500	NC_013205	CGA	2	6	522738	522743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510468

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