MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 50757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013124	GCG	2	6	650713	650718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371446
15502	NC_013124	CGC	2	6	650739	650744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371446
15503	NC_013124	GTC	2	6	650777	650782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15504	NC_013124	TCC	2	6	650814	650819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371446
15505	NC_013124	CGA	2	6	650923	650928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15506	NC_013124	GCTCTC	2	12	650947	650958	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256371446
15507	NC_013124	TCG	2	6	650961	650966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15508	NC_013124	ACG	2	6	650967	650972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15509	NC_013124	TCG	2	6	651017	651022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15510	NC_013124	TCG	2	6	651064	651069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15511	NC_013124	CGT	2	6	651101	651106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15512	NC_013124	TCG	3	9	651110	651118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371446
15513	NC_013124	ACC	2	6	651390	651395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371447
15514	NC_013124	CGC	2	6	651415	651420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371447
15515	NC_013124	AGGC	2	8	651434	651441	25 %	0 %	50 %	25 %	256371447
15516	NC_013124	CGA	2	6	651474	651479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371447
15517	NC_013124	GC	3	6	651526	651531	0 %	0 %	50 %	50 %	256371447
15518	NC_013124	GCGT	2	8	651552	651559	0 %	25 %	50 %	25 %	256371447
15519	NC_013124	TCG	3	9	651570	651578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371447
15520	NC_013124	GAG	2	6	651581	651586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371447
15521	NC_013124	TTCGG	2	10	651587	651596	0 %	40 %	40 %	20 %	256371447
15522	NC_013124	GGC	2	6	651609	651614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371447
15523	NC_013124	TCG	2	6	651624	651629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371447
15524	NC_013124	CGC	2	6	651688	651693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371447
15525	NC_013124	TGG	2	6	651714	651719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371447
15526	NC_013124	GTG	2	6	651722	651727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371447
15527	NC_013124	AGACG	2	10	651742	651751	40 %	0 %	40 %	20 %	256371447
15528	NC_013124	AC	3	6	651789	651794	50 %	0 %	0 %	50 %	256371447
15529	NC_013124	TCG	2	6	651834	651839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371447
15530	NC_013124	ACG	2	6	651855	651860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371447
15531	NC_013124	GGC	2	6	651892	651897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371447
15532	NC_013124	GAT	2	6	651898	651903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371447
15533	NC_013124	GGC	2	6	651934	651939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371447
15534	NC_013124	CGG	2	6	651960	651965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371447
15535	NC_013124	TGG	2	6	652029	652034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371447
15536	NC_013124	CGAC	2	8	652059	652066	25 %	0 %	25 %	50 %	256371447
15537	NC_013124	CGA	2	6	652081	652086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371447
15538	NC_013124	AGCG	2	8	652130	652137	25 %	0 %	50 %	25 %	256371447
15539	NC_013124	CCT	2	6	652188	652193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371447
15540	NC_013124	TCGCCG	2	12	652288	652299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256371448
15541	NC_013124	TCGG	2	8	652339	652346	0 %	25 %	50 %	25 %	256371448
15542	NC_013124	CCGG	2	8	652347	652354	0 %	0 %	50 %	50 %	256371448
15543	NC_013124	TGG	2	6	652360	652365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371448
15544	NC_013124	CGT	2	6	652409	652414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371448
15545	NC_013124	GCC	2	6	652467	652472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371448
15546	NC_013124	GAC	2	6	652490	652495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371448
15547	NC_013124	TCGG	2	8	652525	652532	0 %	25 %	50 %	25 %	256371448
15548	NC_013124	CAT	2	6	652559	652564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371448
15549	NC_013124	TGCG	2	8	652605	652612	0 %	25 %	50 %	25 %	256371448
15550	NC_013124	TCGA	2	8	652635	652642	25 %	25 %	25 %	25 %	256371448
15551	NC_013124	TCG	2	6	652645	652650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371448
15552	NC_013124	CAC	2	6	652656	652661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371448
15553	NC_013124	GCTC	2	8	652700	652707	0 %	25 %	25 %	50 %	256371448
15554	NC_013124	TCG	2	6	652750	652755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371448
15555	NC_013124	CACG	2	8	652766	652773	25 %	0 %	25 %	50 %	256371448
15556	NC_013124	TGCGC	2	10	652826	652835	0 %	20 %	40 %	40 %	256371448
15557	NC_013124	GTTC	2	8	652921	652928	0 %	50 %	25 %	25 %	256371448
15558	NC_013124	TGC	2	6	652939	652944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371448
15559	NC_013124	CGA	2	6	652991	652996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371448
15560	NC_013124	GCT	2	6	652997	653002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371448
15561	NC_013124	GC	3	6	653090	653095	0 %	0 %	50 %	50 %	256371449
15562	NC_013124	TCG	2	6	653156	653161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15563	NC_013124	CGA	3	9	653196	653204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15564	NC_013124	GGT	2	6	653223	653228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371449
15565	NC_013124	ACC	2	6	653266	653271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371449
15566	NC_013124	TCG	2	6	653297	653302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15567	NC_013124	CGC	2	6	653304	653309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371449
15568	NC_013124	CGT	2	6	653340	653345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15569	NC_013124	CTA	2	6	653349	653354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371449
15570	NC_013124	TCC	2	6	653361	653366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371449
15571	NC_013124	CGA	2	6	653408	653413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15572	NC_013124	TGC	2	6	653423	653428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15573	NC_013124	ACG	2	6	653432	653437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15574	NC_013124	CG	3	6	653442	653447	0 %	0 %	50 %	50 %	256371449
15575	NC_013124	GAC	2	6	653472	653477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15576	NC_013124	GCTC	2	8	653484	653491	0 %	25 %	25 %	50 %	256371449
15577	NC_013124	CGA	2	6	653498	653503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15578	NC_013124	TGG	2	6	653555	653560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371449
15579	NC_013124	GCG	2	6	653591	653596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371449
15580	NC_013124	GGCC	2	8	653664	653671	0 %	0 %	50 %	50 %	256371449
15581	NC_013124	TGA	2	6	653684	653689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371449
15582	NC_013124	GC	3	6	653698	653703	0 %	0 %	50 %	50 %	256371449
15583	NC_013124	GAGC	2	8	653716	653723	25 %	0 %	50 %	25 %	256371449
15584	NC_013124	CGG	2	6	653725	653730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371449
15585	NC_013124	CGC	2	6	653811	653816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371449
15586	NC_013124	CGC	2	6	653846	653851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371449
15587	NC_013124	CGA	2	6	653877	653882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371449
15588	NC_013124	GC	3	6	653884	653889	0 %	0 %	50 %	50 %	256371449
15589	NC_013124	AAGG	2	8	653923	653930	50 %	0 %	50 %	0 %	256371449
15590	NC_013124	CGC	2	6	654001	654006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371450
15591	NC_013124	GGAC	2	8	654019	654026	25 %	0 %	50 %	25 %	256371450
15592	NC_013124	G	6	6	654027	654032	0 %	0 %	100 %	0 %	256371450
15593	NC_013124	TGC	2	6	654090	654095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15594	NC_013124	CGA	2	6	654112	654117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371450
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15596	NC_013124	CTT	2	6	654178	654183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256371450
15597	NC_013124	TTCG	2	8	654233	654240	0 %	50 %	25 %	25 %	256371450
15598	NC_013124	GC	3	6	654299	654304	0 %	0 %	50 %	50 %	256371450
15599	NC_013124	GCCGTC	2	12	654362	654373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256371450
15600	NC_013124	ACG	2	6	654380	654385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15601	NC_013124	GTC	2	6	654444	654449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15602	NC_013124	GCTC	2	8	654457	654464	0 %	25 %	25 %	50 %	256371450
15603	NC_013124	TGC	2	6	654501	654506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15604	NC_013124	CGA	2	6	654516	654521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15605	NC_013124	CGA	2	6	654526	654531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15606	NC_013124	GAGC	2	8	654551	654558	25 %	0 %	50 %	25 %	256371450
15607	NC_013124	TCG	2	6	654626	654631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15608	NC_013124	CAG	2	6	654647	654652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15609	NC_013124	TGC	2	6	654690	654695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15610	NC_013124	CG	3	6	654780	654785	0 %	0 %	50 %	50 %	256371450
15611	NC_013124	GGC	2	6	654850	654855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371450
15612	NC_013124	CCA	2	6	654859	654864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371450
15613	NC_013124	CGCT	2	8	654880	654887	0 %	25 %	25 %	50 %	256371450
15614	NC_013124	CGA	2	6	654904	654909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371450
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15619	NC_013124	CGCC	2	8	655075	655082	0 %	0 %	25 %	75 %	256371450
15620	NC_013124	ACT	2	6	655086	655091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371450
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15622	NC_013124	GTC	2	6	655199	655204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15623	NC_013124	CGA	2	6	655210	655215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371450
15624	NC_013124	GCTG	2	8	655225	655232	0 %	25 %	50 %	25 %	256371450
15625	NC_013124	GTC	2	6	655268	655273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371450
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15662	NC_013124	CGA	2	6	656956	656961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371451
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15845	NC_013124	TCG	2	6	664569	664574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371457
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15847	NC_013124	ATC	2	6	664604	664609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371457
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15969	NC_013124	GCGG	2	8	669069	669076	0 %	0 %	75 %	25 %	256371462
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15972	NC_013124	CGGTG	2	10	669246	669255	0 %	20 %	60 %	20 %	256371462
15973	NC_013124	GC	3	6	669308	669313	0 %	0 %	50 %	50 %	256371462
15974	NC_013124	GC	3	6	669315	669320	0 %	0 %	50 %	50 %	256371462
15975	NC_013124	CGCTCG	2	12	669335	669346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256371462
15976	NC_013124	GGCG	2	8	669396	669403	0 %	0 %	75 %	25 %	256371462
15977	NC_013124	GGT	2	6	669423	669428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371462
15978	NC_013124	CG	3	6	669429	669434	0 %	0 %	50 %	50 %	256371462
15979	NC_013124	CG	3	6	669439	669444	0 %	0 %	50 %	50 %	256371462
15980	NC_013124	GGC	2	6	669480	669485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371462
15981	NC_013124	CGA	2	6	669498	669503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371462
15982	NC_013124	AGC	2	6	669518	669523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371462
15983	NC_013124	GGC	2	6	669539	669544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371462
15984	NC_013124	GGC	2	6	669604	669609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371462
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15987	NC_013124	TCG	3	9	669683	669691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371462
15988	NC_013124	GCG	2	6	669733	669738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371462
15989	NC_013124	CGAT	2	8	669755	669762	25 %	25 %	25 %	25 %	256371462
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15991	NC_013124	CG	3	6	669800	669805	0 %	0 %	50 %	50 %	256371463
15992	NC_013124	CGAT	2	8	669844	669851	25 %	25 %	25 %	25 %	256371463
15993	NC_013124	GCGCG	2	10	669887	669896	0 %	0 %	60 %	40 %	256371463
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15995	NC_013124	AGG	2	6	669955	669960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371463
15996	NC_013124	GGCC	2	8	670004	670011	0 %	0 %	50 %	50 %	256371463
15997	NC_013124	GCG	2	6	670040	670045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371463
15998	NC_013124	GCG	2	6	670091	670096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371463
15999	NC_013124	TCGG	2	8	670155	670162	0 %	25 %	50 %	25 %	256371463
16000	NC_013124	CGA	2	6	670168	670173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371463

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