MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 50757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013124	CGA	2	6	544394	544399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13002	NC_013124	TGC	2	6	544404	544409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13003	NC_013124	GGA	2	6	544425	544430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371351
13004	NC_013124	CGA	2	6	544460	544465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13005	NC_013124	CGAT	2	8	544469	544476	25 %	25 %	25 %	25 %	256371351
13006	NC_013124	GGC	2	6	544506	544511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371351
13007	NC_013124	ACCGA	2	10	544538	544547	40 %	0 %	20 %	40 %	256371351
13008	NC_013124	CGG	2	6	544556	544561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371351
13009	NC_013124	GCC	2	6	544573	544578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371351
13010	NC_013124	GCC	2	6	544582	544587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371351
13011	NC_013124	CGAT	2	8	544590	544597	25 %	25 %	25 %	25 %	256371351
13012	NC_013124	GAC	2	6	544609	544614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13013	NC_013124	GGT	2	6	544675	544680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371351
13014	NC_013124	GCGATC	2	12	544693	544704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13015	NC_013124	TCG	2	6	544709	544714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13016	NC_013124	CCA	2	6	544731	544736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371351
13017	NC_013124	GCA	2	6	544741	544746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13018	NC_013124	TCG	2	6	544777	544782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13019	NC_013124	GTC	2	6	544803	544808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13020	NC_013124	CGA	2	6	544823	544828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13021	NC_013124	GAA	2	6	544839	544844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371351
13022	NC_013124	CGA	2	6	544850	544855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13023	NC_013124	GAC	2	6	544863	544868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13024	NC_013124	GTC	2	6	544869	544874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13025	NC_013124	GAA	2	6	544878	544883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371351
13026	NC_013124	CGG	2	6	544910	544915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371351
13027	NC_013124	CAG	2	6	544932	544937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13028	NC_013124	CGG	2	6	544962	544967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371351
13029	NC_013124	CGT	2	6	544977	544982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13030	NC_013124	CTG	2	6	545004	545009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13031	NC_013124	GGT	2	6	545032	545037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371351
13032	NC_013124	CGG	2	6	545063	545068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371351
13033	NC_013124	CCG	2	6	545176	545181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371351
13034	NC_013124	CTG	2	6	545194	545199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371351
13035	NC_013124	GTCG	2	8	545217	545224	0 %	25 %	50 %	25 %	256371351
13036	NC_013124	TCG	2	6	545266	545271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13037	NC_013124	TCG	3	9	545314	545322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13038	NC_013124	GAA	2	6	545388	545393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371352
13039	NC_013124	CGT	2	6	545405	545410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13040	NC_013124	CGG	2	6	545433	545438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371352
13041	NC_013124	CTC	2	6	545523	545528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371352
13042	NC_013124	TCG	2	6	545567	545572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13043	NC_013124	CGA	2	6	545582	545587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13044	NC_013124	CGG	2	6	545603	545608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371352
13045	NC_013124	GCC	2	6	545655	545660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371352
13046	NC_013124	CAC	2	6	545669	545674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371352
13047	NC_013124	ACG	2	6	545725	545730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13048	NC_013124	CGT	2	6	545777	545782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13049	NC_013124	CGC	3	9	545801	545809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371352
13050	NC_013124	GGTCG	2	10	545874	545883	0 %	20 %	60 %	20 %	256371352
13051	NC_013124	CCT	2	6	545888	545893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371352
13052	NC_013124	CGG	2	6	545944	545949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371352
13053	NC_013124	CGT	2	6	545978	545983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13054	NC_013124	CGG	2	6	545984	545989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371352
13055	NC_013124	CGTCT	2	10	546001	546010	0 %	40 %	20 %	40 %	256371352
13056	NC_013124	GTC	2	6	546015	546020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13057	NC_013124	CGT	3	9	546060	546068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13058	NC_013124	GGT	2	6	546072	546077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371352
13059	NC_013124	TGG	2	6	546095	546100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371352
13060	NC_013124	CGA	2	6	546107	546112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13061	NC_013124	TCG	4	12	546136	546147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13062	NC_013124	GCT	2	6	546182	546187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13063	NC_013124	CGA	2	6	546194	546199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13064	NC_013124	TCGC	2	8	546211	546218	0 %	25 %	25 %	50 %	256371352
13065	NC_013124	ACGAC	2	10	546239	546248	40 %	0 %	20 %	40 %	256371352
13066	NC_013124	GCG	2	6	546258	546263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371352
13067	NC_013124	CGG	2	6	546362	546367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371352
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13069	NC_013124	CTC	2	6	546453	546458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371352
13070	NC_013124	G	7	7	546478	546484	0 %	0 %	100 %	0 %	256371352
13071	NC_013124	GAG	2	6	546507	546512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371352
13072	NC_013124	CCA	2	6	546513	546518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371352
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13074	NC_013124	CGTC	2	8	546570	546577	0 %	25 %	25 %	50 %	256371352
13075	NC_013124	AGT	2	6	546590	546595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371352
13076	NC_013124	TTC	2	6	546606	546611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256371352
13077	NC_013124	GTC	2	6	546624	546629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13078	NC_013124	TCG	2	6	546682	546687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13079	NC_013124	GCCG	2	8	546738	546745	0 %	0 %	50 %	50 %	256371352
13080	NC_013124	TGA	2	6	546767	546772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371352
13081	NC_013124	GCCG	2	8	546785	546792	0 %	0 %	50 %	50 %	256371352
13082	NC_013124	ACG	2	6	546793	546798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13083	NC_013124	GCT	2	6	546806	546811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13084	NC_013124	CGA	3	9	546833	546841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13085	NC_013124	TCG	3	9	546850	546858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13086	NC_013124	TCG	2	6	546913	546918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13087	NC_013124	GACG	2	8	547016	547023	25 %	0 %	50 %	25 %	256371352
13088	NC_013124	TCG	2	6	547033	547038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13089	NC_013124	TCG	2	6	547061	547066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13090	NC_013124	GCG	2	6	547081	547086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371352
13091	NC_013124	TGC	2	6	547107	547112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13092	NC_013124	GTC	2	6	547155	547160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371352
13093	NC_013124	GCCC	3	12	547197	547208	0 %	0 %	25 %	75 %	256371352
13094	NC_013124	GT	3	6	547216	547221	0 %	50 %	50 %	0 %	256371352
13095	NC_013124	GAG	2	6	547244	547249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371352
13096	NC_013124	TCG	2	6	547466	547471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371353
13097	NC_013124	CGCT	2	8	547525	547532	0 %	25 %	25 %	50 %	256371353
13098	NC_013124	ACT	2	6	547535	547540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371353
13099	NC_013124	CTA	3	9	547605	547613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371353
13100	NC_013124	CCGA	2	8	547621	547628	25 %	0 %	25 %	50 %	256371353
13101	NC_013124	GTC	2	6	547750	547755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371353
13102	NC_013124	ACC	2	6	547757	547762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371353
13103	NC_013124	GAG	2	6	547771	547776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371353
13104	NC_013124	TCC	2	6	547866	547871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371353
13105	NC_013124	ACA	2	6	547877	547882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256371353
13106	NC_013124	G	6	6	547914	547919	0 %	0 %	100 %	0 %	256371353
13107	NC_013124	GCC	2	6	547935	547940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371353
13108	NC_013124	ATC	2	6	548020	548025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371353
13109	NC_013124	GC	3	6	548036	548041	0 %	0 %	50 %	50 %	256371353
13110	NC_013124	CT	3	6	548088	548093	0 %	50 %	0 %	50 %	256371353
13111	NC_013124	GC	3	6	548131	548136	0 %	0 %	50 %	50 %	256371353
13112	NC_013124	GTC	2	6	548163	548168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371353
13113	NC_013124	TCGAG	2	10	548217	548226	20 %	20 %	40 %	20 %	256371353
13114	NC_013124	GAT	2	6	548361	548366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371353
13115	NC_013124	TGC	2	6	548370	548375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371353
13116	NC_013124	CGA	2	6	548457	548462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371353
13117	NC_013124	GC	3	6	548474	548479	0 %	0 %	50 %	50 %	256371353
13118	NC_013124	CGA	2	6	548511	548516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371353
13119	NC_013124	GC	3	6	548559	548564	0 %	0 %	50 %	50 %	256371353
13120	NC_013124	CGA	2	6	548604	548609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371353
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13222	NC_013124	CGAG	2	8	560323	560330	25 %	0 %	50 %	25 %	256371360
13223	NC_013124	CCGGA	2	10	560345	560354	20 %	0 %	40 %	40 %	256371360
13224	NC_013124	TCG	2	6	560356	560361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371360
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13227	NC_013124	GCCCA	2	10	560446	560455	20 %	0 %	20 %	60 %	256371360
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13232	NC_013124	GTC	2	6	560636	560641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371360
13233	NC_013124	CCGT	2	8	560664	560671	0 %	25 %	25 %	50 %	256371360
13234	NC_013124	CTG	2	6	560697	560702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371360
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13236	NC_013124	ACC	2	6	560824	560829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371360
13237	NC_013124	CTC	2	6	560853	560858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371360
13238	NC_013124	GGC	2	6	560987	560992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371360
13239	NC_013124	CCG	2	6	561015	561020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371360
13240	NC_013124	GGAG	2	8	561024	561031	25 %	0 %	75 %	0 %	256371361
13241	NC_013124	CGC	2	6	561039	561044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371361
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13244	NC_013124	CGC	2	6	561126	561131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371361
13245	NC_013124	ACC	2	6	561176	561181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371361
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13252	NC_013124	GTC	2	6	561397	561402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371361
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13262	NC_013124	CGA	2	6	561984	561989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371362
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13325	NC_013124	GTCG	2	8	564350	564357	0 %	25 %	50 %	25 %	256371364
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13333	NC_013124	GC	3	6	564662	564667	0 %	0 %	50 %	50 %	256371364
13334	NC_013124	TCG	2	6	564668	564673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371364
13335	NC_013124	AGGTCG	2	12	564674	564685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256371364
13336	NC_013124	TC	3	6	564714	564719	0 %	50 %	0 %	50 %	256371364
13337	NC_013124	G	6	6	564723	564728	0 %	0 %	100 %	0 %	256371364
13338	NC_013124	GCA	2	6	564734	564739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371364
13339	NC_013124	TCC	2	6	564746	564751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371364
13340	NC_013124	TCG	2	6	564785	564790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371364
13341	NC_013124	ACC	2	6	564818	564823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371364
13342	NC_013124	CG	5	10	564856	564865	0 %	0 %	50 %	50 %	256371364
13343	NC_013124	TCG	2	6	564884	564889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371364
13344	NC_013124	GGA	2	6	564906	564911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371364
13345	NC_013124	TCG	2	6	564923	564928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371364
13346	NC_013124	GC	4	8	565084	565091	0 %	0 %	50 %	50 %	256371364
13347	NC_013124	GCT	2	6	565133	565138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371364
13348	NC_013124	CTT	2	6	565239	565244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256371364
13349	NC_013124	GC	3	6	565275	565280	0 %	0 %	50 %	50 %	256371364
13350	NC_013124	GGA	2	6	565299	565304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371364
13351	NC_013124	GGA	2	6	565328	565333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371365
13352	NC_013124	TCG	2	6	565336	565341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371365
13353	NC_013124	GT	4	8	565380	565387	0 %	50 %	50 %	0 %	256371365
13354	NC_013124	TTC	2	6	565407	565412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256371365
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13356	NC_013124	GGC	2	6	565528	565533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371365
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13455	NC_013124	CGA	2	6	569901	569906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371371
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13463	NC_013124	CTT	2	6	570784	570789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256371372
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13469	NC_013124	GC	3	6	570925	570930	0 %	0 %	50 %	50 %	256371372
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13471	NC_013124	GC	3	6	571043	571048	0 %	0 %	50 %	50 %	256371372
13472	NC_013124	TGA	2	6	571104	571109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371372
13473	NC_013124	ATCG	2	8	571114	571121	25 %	25 %	25 %	25 %	256371372
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