MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 50757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_013124	GGT	2	6	501292	501297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371312
12005	NC_013124	CGA	2	6	501331	501336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371313
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12008	NC_013124	TGC	2	6	501409	501414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371313
12009	NC_013124	CGT	2	6	501452	501457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371313
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12011	NC_013124	TCG	2	6	501475	501480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371313
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12021	NC_013124	CCGC	2	8	501874	501881	0 %	0 %	25 %	75 %	256371313
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12118	NC_013124	GCGTGT	2	12	505448	505459	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256371316
12119	NC_013124	GGC	2	6	505467	505472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371316
12120	NC_013124	GCT	2	6	505506	505511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371316
12121	NC_013124	GAC	2	6	505572	505577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371316
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12123	NC_013124	CGT	2	6	505587	505592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371316
12124	NC_013124	CGG	2	6	505595	505600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371316
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12126	NC_013124	CTC	2	6	505627	505632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371316
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12130	NC_013124	GCG	2	6	505784	505789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371317
12131	NC_013124	GCT	2	6	505853	505858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371317
12132	NC_013124	TCG	2	6	505867	505872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371317
12133	NC_013124	TCG	2	6	505903	505908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371317
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12149	NC_013124	GCGA	2	8	506402	506409	25 %	0 %	50 %	25 %	256371318
12150	NC_013124	ATCG	2	8	506444	506451	25 %	25 %	25 %	25 %	256371318
12151	NC_013124	GC	4	8	506470	506477	0 %	0 %	50 %	50 %	256371318
12152	NC_013124	CGC	2	6	506491	506496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371318
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12155	NC_013124	GA	3	6	506541	506546	50 %	0 %	50 %	0 %	256371318
12156	NC_013124	CA	4	8	506554	506561	50 %	0 %	0 %	50 %	256371318
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12200	NC_013124	CTCG	2	8	508804	508811	0 %	25 %	25 %	50 %	256371320
12201	NC_013124	TCC	2	6	508817	508822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371320
12202	NC_013124	TCG	2	6	508935	508940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371320
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12212	NC_013124	TCGGC	2	10	509381	509390	0 %	20 %	40 %	40 %	256371321
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12214	NC_013124	CCAGCT	2	12	509507	509518	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256371321
12215	NC_013124	CTG	2	6	509520	509525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371321
12216	NC_013124	TCG	2	6	509759	509764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371321
12217	NC_013124	TGCC	2	8	509768	509775	0 %	25 %	25 %	50 %	256371321
12218	NC_013124	GATC	2	8	509799	509806	25 %	25 %	25 %	25 %	256371321
12219	NC_013124	ACC	2	6	509875	509880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371321
12220	NC_013124	GTC	2	6	509893	509898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371321
12221	NC_013124	ATCGG	2	10	509927	509936	20 %	20 %	40 %	20 %	256371322
12222	NC_013124	GC	3	6	509968	509973	0 %	0 %	50 %	50 %	256371322
12223	NC_013124	CGGA	2	8	509998	510005	25 %	0 %	50 %	25 %	256371322
12224	NC_013124	GAG	2	6	510074	510079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371322
12225	NC_013124	GTT	2	6	510151	510156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256371322
12226	NC_013124	GGC	2	6	510178	510183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371322
12227	NC_013124	CGA	2	6	510267	510272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371322
12228	NC_013124	GCG	2	6	510378	510383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371322
12229	NC_013124	AGC	2	6	510404	510409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371322
12230	NC_013124	CAG	2	6	510410	510415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371322
12231	NC_013124	GTT	2	6	510541	510546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256371322
12232	NC_013124	GAT	2	6	510562	510567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371322
12233	NC_013124	CGG	2	6	510573	510578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371322
12234	NC_013124	GCC	2	6	510612	510617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371322
12235	NC_013124	CGC	2	6	510661	510666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371322
12236	NC_013124	GTA	2	6	510712	510717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371322
12237	NC_013124	GCGAC	2	10	510747	510756	20 %	0 %	40 %	40 %	256371322
12238	NC_013124	CCG	2	6	510770	510775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371322
12239	NC_013124	TGA	2	6	510789	510794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371322
12240	NC_013124	TGT	2	6	510852	510857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256371322
12241	NC_013124	ATG	2	6	510908	510913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371322
12242	NC_013124	CCT	2	6	510916	510921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371323
12243	NC_013124	AAG	2	6	510984	510989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371323
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12250	NC_013124	CGG	2	6	511255	511260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371323
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12252	NC_013124	CAG	3	9	511316	511324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371323
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12292	NC_013124	CGCT	2	8	514587	514594	0 %	25 %	25 %	50 %	256371326
12293	NC_013124	CTA	2	6	514641	514646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371326
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12337	NC_013124	CGA	2	6	516605	516610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371327
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12339	NC_013124	CGA	2	6	516644	516649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371327
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12341	NC_013124	TG	3	6	516703	516708	0 %	50 %	50 %	0 %	256371327
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12343	NC_013124	TG	3	6	516796	516801	0 %	50 %	50 %	0 %	256371327
12344	NC_013124	AGG	2	6	517671	517676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371328
12345	NC_013124	ACG	2	6	517715	517720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371328
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12347	NC_013124	GCGA	2	8	517789	517796	25 %	0 %	50 %	25 %	256371328
12348	NC_013124	TC	3	6	517818	517823	0 %	50 %	0 %	50 %	256371328
12349	NC_013124	TGG	2	6	517835	517840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371328
12350	NC_013124	CGT	2	6	517867	517872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371328
12351	NC_013124	ACG	2	6	517937	517942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371328
12352	NC_013124	GCT	2	6	517963	517968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371328
12353	NC_013124	GTGC	2	8	518017	518024	0 %	25 %	50 %	25 %	256371328
12354	NC_013124	CG	3	6	518041	518046	0 %	0 %	50 %	50 %	256371328
12355	NC_013124	C	6	6	518062	518067	0 %	0 %	0 %	100 %	256371328
12356	NC_013124	GGCCAC	2	12	520661	520672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256371329
12357	NC_013124	GGTA	2	8	520710	520717	25 %	25 %	50 %	0 %	256371329
12358	NC_013124	CCA	2	6	520813	520818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371329
12359	NC_013124	GAA	2	6	520838	520843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371329
12360	NC_013124	CCAG	2	8	520974	520981	25 %	0 %	25 %	50 %	256371329
12361	NC_013124	ACC	2	6	521019	521024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371329
12362	NC_013124	GACG	2	8	521179	521186	25 %	0 %	50 %	25 %	256371329
12363	NC_013124	TCG	2	6	521218	521223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371329
12364	NC_013124	GCTC	2	8	521380	521387	0 %	25 %	25 %	50 %	256371329
12365	NC_013124	CCTCG	2	10	521410	521419	0 %	20 %	20 %	60 %	256371329
12366	NC_013124	GTA	2	6	521441	521446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371329
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12368	NC_013124	TGC	3	9	521474	521482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371329
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12371	NC_013124	TCGC	2	8	521565	521572	0 %	25 %	25 %	50 %	256371330
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12455	NC_013124	GGGCGA	2	12	525943	525954	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256371332
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12457	NC_013124	GAG	2	6	526019	526024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371332
12458	NC_013124	GCA	2	6	526062	526067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371332
12459	NC_013124	GGT	2	6	526117	526122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371332
12460	NC_013124	GAT	2	6	526127	526132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371332
12461	NC_013124	GTC	2	6	526148	526153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12462	NC_013124	CGT	2	6	526159	526164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12463	NC_013124	GCG	2	6	526225	526230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371333
12464	NC_013124	TGA	2	6	526257	526262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371333
12465	NC_013124	CG	3	6	526281	526286	0 %	0 %	50 %	50 %	256371333
12466	NC_013124	AGC	2	6	526289	526294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371333
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12468	NC_013124	TCG	2	6	526332	526337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12469	NC_013124	TCG	2	6	526340	526345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12470	NC_013124	CGAGTG	2	12	526365	526376	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256371333
12471	NC_013124	CG	3	6	526379	526384	0 %	0 %	50 %	50 %	256371333
12472	NC_013124	TCGTTG	2	12	526393	526404	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	256371333
12473	NC_013124	CCG	2	6	526407	526412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371333
12474	NC_013124	C	7	7	526422	526428	0 %	0 %	0 %	100 %	256371333
12475	NC_013124	GTC	2	6	526441	526446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12476	NC_013124	GCG	2	6	526447	526452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371333
12477	NC_013124	GAG	2	6	526483	526488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371333
12478	NC_013124	CGA	2	6	526521	526526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12479	NC_013124	CGTT	2	8	526585	526592	0 %	50 %	25 %	25 %	256371333
12480	NC_013124	AGC	2	6	526673	526678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12481	NC_013124	CGA	2	6	526704	526709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12482	NC_013124	GCGA	2	8	526730	526737	25 %	0 %	50 %	25 %	256371333
12483	NC_013124	ACGGA	2	10	526778	526787	40 %	0 %	40 %	20 %	256371333
12484	NC_013124	AGC	2	6	526793	526798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12485	NC_013124	CGTG	2	8	526852	526859	0 %	25 %	50 %	25 %	256371333
12486	NC_013124	AGG	2	6	526873	526878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371333
12487	NC_013124	CGC	2	6	526879	526884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371333
12488	NC_013124	GCT	2	6	526904	526909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12489	NC_013124	CGG	2	6	526920	526925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371333
12490	NC_013124	CGT	2	6	527019	527024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12491	NC_013124	CGA	2	6	527049	527054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12492	NC_013124	ACG	2	6	527060	527065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12493	NC_013124	GCG	2	6	527150	527155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371333
12494	NC_013124	TCG	2	6	527174	527179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12495	NC_013124	GGC	2	6	527191	527196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371333
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12498	NC_013124	GCTCGA	2	12	527235	527246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256371333
12499	NC_013124	TGG	2	6	527247	527252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371333
12500	NC_013124	GC	3	6	527270	527275	0 %	0 %	50 %	50 %	256371333

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