MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 40139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012913	T	7	7	1061	1067	0 %	100 %	0 %	0 %	251791818
2	NC_012913	AAT	2	6	1078	1083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791818
3	NC_012913	TAA	2	6	1182	1187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791818
4	NC_012913	A	6	6	1240	1245	100 %	0 %	0 %	0 %	251791818
5	NC_012913	GCA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791818
6	NC_012913	ATA	2	6	1300	1305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791818
7	NC_012913	TCTT	2	8	1316	1323	0 %	75 %	0 %	25 %	251791818
8	NC_012913	TCA	2	6	1331	1336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791818
9	NC_012913	TCA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791818
10	NC_012913	TA	4	8	1362	1369	50 %	50 %	0 %	0 %	251791818
11	NC_012913	GGCG	2	8	1388	1395	0 %	0 %	75 %	25 %	251791818
12	NC_012913	CAT	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791818
13	NC_012913	ATA	2	6	1442	1447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791818
14	NC_012913	ATGAT	2	10	1451	1460	40 %	40 %	20 %	0 %	251791818
15	NC_012913	GTA	2	6	1525	1530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791818
16	NC_012913	CCGCTT	2	12	1569	1580	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	251791818
17	NC_012913	TTG	2	6	1596	1601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791818
18	NC_012913	CGC	2	6	1647	1652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251791818
19	NC_012913	TCT	2	6	1692	1697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791818
20	NC_012913	A	6	6	1777	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	251791818
21	NC_012913	T	6	6	1792	1797	0 %	100 %	0 %	0 %	251791818
22	NC_012913	CCA	2	6	1808	1813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791818
23	NC_012913	TTGT	2	8	1843	1850	0 %	75 %	25 %	0 %	251791818
24	NC_012913	CAA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791818
25	NC_012913	TGT	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791818
26	NC_012913	CTG	2	6	1986	1991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791818
27	NC_012913	T	6	6	2016	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	251791818
28	NC_012913	CAT	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791818
29	NC_012913	GAGT	2	8	2087	2094	25 %	25 %	50 %	0 %	251791818
30	NC_012913	TCA	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791818
31	NC_012913	T	7	7	2128	2134	0 %	100 %	0 %	0 %	251791818
32	NC_012913	GCA	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791818
33	NC_012913	TTC	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791818
34	NC_012913	TCA	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791818
35	NC_012913	AT	3	6	2468	2473	50 %	50 %	0 %	0 %	251791818
36	NC_012913	TGG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791818
37	NC_012913	CAC	2	6	2598	2603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791818
38	NC_012913	ATCA	2	8	2620	2627	50 %	25 %	0 %	25 %	251791818
39	NC_012913	A	6	6	2672	2677	100 %	0 %	0 %	0 %	251791818
40	NC_012913	GGT	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791818
41	NC_012913	GTAG	2	8	2707	2714	25 %	25 %	50 %	0 %	251791818
42	NC_012913	TTA	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791818
43	NC_012913	CAT	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791818
44	NC_012913	A	6	6	2988	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	251791818
45	NC_012913	ATTA	2	8	3070	3077	50 %	50 %	0 %	0 %	251791818
46	NC_012913	TGA	2	6	3083	3088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791818
47	NC_012913	AAC	2	6	3115	3120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791818
48	NC_012913	AAT	2	6	3163	3168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791818
49	NC_012913	TAT	2	6	3198	3203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791818
50	NC_012913	TGC	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791818
51	NC_012913	GTT	2	6	3322	3327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791819
52	NC_012913	TTTA	2	8	3341	3348	25 %	75 %	0 %	0 %	251791819
53	NC_012913	TAA	2	6	3382	3387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791819
54	NC_012913	TCA	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791819
55	NC_012913	ATA	2	6	3424	3429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791819
56	NC_012913	A	6	6	3444	3449	100 %	0 %	0 %	0 %	251791819
57	NC_012913	TGT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791819
58	NC_012913	T	6	6	3536	3541	0 %	100 %	0 %	0 %	251791819
59	NC_012913	TCA	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791819
60	NC_012913	T	7	7	3600	3606	0 %	100 %	0 %	0 %	251791819
61	NC_012913	CTT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791819
62	NC_012913	TTG	2	6	3676	3681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791819
63	NC_012913	ATG	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791819
64	NC_012913	GTA	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791819
65	NC_012913	CGTC	2	8	3834	3841	0 %	25 %	25 %	50 %	251791819
66	NC_012913	TCA	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791819
67	NC_012913	GAA	2	6	3908	3913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251791819
68	NC_012913	TCT	2	6	3948	3953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791819
69	NC_012913	TTC	2	6	3986	3991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791819
70	NC_012913	CAA	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791819
71	NC_012913	CTT	2	6	4054	4059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791819
72	NC_012913	TAAA	2	8	4066	4073	75 %	25 %	0 %	0 %	251791819
73	NC_012913	ATC	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791819
74	NC_012913	ATG	2	6	4137	4142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791819
75	NC_012913	TCT	2	6	4233	4238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791819
76	NC_012913	T	6	6	4282	4287	0 %	100 %	0 %	0 %	251791819
77	NC_012913	TGT	2	6	4352	4357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791819
78	NC_012913	CAAT	2	8	4369	4376	50 %	25 %	0 %	25 %	251791819
79	NC_012913	GGCGT	2	10	4385	4394	0 %	20 %	60 %	20 %	251791819
80	NC_012913	GAA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251791819
81	NC_012913	TGT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791819
82	NC_012913	GGC	2	6	4496	4501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	251791819
83	NC_012913	ATA	3	9	4512	4520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791819
84	NC_012913	TCT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791819
85	NC_012913	TAGAT	2	10	4563	4572	40 %	40 %	20 %	0 %	251791819
86	NC_012913	CTG	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791820
87	NC_012913	TTTGGT	2	12	4788	4799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791820
88	NC_012913	GTG	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791820
89	NC_012913	ACT	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791820
90	NC_012913	AAT	2	6	4960	4965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791820
91	NC_012913	TAA	2	6	5009	5014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791820
92	NC_012913	TAA	2	6	5034	5039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791820
93	NC_012913	TCGG	2	8	5053	5060	0 %	25 %	50 %	25 %	251791820
94	NC_012913	GT	3	6	5126	5131	0 %	50 %	50 %	0 %	251791820
95	NC_012913	GTG	2	6	5134	5139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791820
96	NC_012913	CG	3	6	5257	5262	0 %	0 %	50 %	50 %	251791820
97	NC_012913	CGGC	2	8	5299	5306	0 %	0 %	50 %	50 %	251791820
98	NC_012913	T	6	6	5310	5315	0 %	100 %	0 %	0 %	251791820
99	NC_012913	T	6	6	5366	5371	0 %	100 %	0 %	0 %	251791820
100	NC_012913	ACC	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791820
101	NC_012913	TTC	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791820
102	NC_012913	CCGTG	2	10	5462	5471	0 %	20 %	40 %	40 %	251791820
103	NC_012913	TAA	2	6	5474	5479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791820
104	NC_012913	TTA	2	6	5506	5511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791820
105	NC_012913	TCA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791820
106	NC_012913	ACC	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791820
107	NC_012913	CGC	2	6	5579	5584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251791820
108	NC_012913	TTTCA	2	10	5601	5610	20 %	60 %	0 %	20 %	251791820
109	NC_012913	CAC	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791820
110	NC_012913	CCG	2	6	5698	5703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	251791820
111	NC_012913	AGA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	251791820
112	NC_012913	T	7	7	5784	5790	0 %	100 %	0 %	0 %	251791820
113	NC_012913	ATA	2	6	5797	5802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791820
114	NC_012913	TAAAA	2	10	5837	5846	80 %	20 %	0 %	0 %	251791821
115	NC_012913	A	6	6	5883	5888	100 %	0 %	0 %	0 %	251791821
116	NC_012913	T	7	7	5895	5901	0 %	100 %	0 %	0 %	251791821
117	NC_012913	A	6	6	5924	5929	100 %	0 %	0 %	0 %	251791821
118	NC_012913	AAC	2	6	6104	6109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791822
119	NC_012913	TGC	2	6	6120	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791822
120	NC_012913	A	7	7	6141	6147	100 %	0 %	0 %	0 %	251791822
121	NC_012913	T	6	6	6187	6192	0 %	100 %	0 %	0 %	251791822
122	NC_012913	ATA	2	6	6269	6274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791822
123	NC_012913	AAC	2	6	6351	6356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791823
124	NC_012913	CAA	2	6	6401	6406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791823
125	NC_012913	TA	3	6	6417	6422	50 %	50 %	0 %	0 %	251791823
126	NC_012913	TTC	2	6	6454	6459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	251791823
127	NC_012913	GGTT	2	8	6463	6470	0 %	50 %	50 %	0 %	251791823
128	NC_012913	CAA	2	6	6503	6508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791823
129	NC_012913	ATT	2	6	6539	6544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791823
130	NC_012913	ATT	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791823
131	NC_012913	TGA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791823
132	NC_012913	TGAT	2	8	6771	6778	25 %	50 %	25 %	0 %	251791823
133	NC_012913	TGCA	2	8	6798	6805	25 %	25 %	25 %	25 %	251791823
134	NC_012913	ATG	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	251791823
135	NC_012913	A	6	6	6845	6850	100 %	0 %	0 %	0 %	251791823
136	NC_012913	TTGA	2	8	6866	6873	25 %	50 %	25 %	0 %	251791823
137	NC_012913	TCA	2	6	6973	6978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791823
138	NC_012913	A	6	6	6994	6999	100 %	0 %	0 %	0 %	251791823
139	NC_012913	A	6	6	7089	7094	100 %	0 %	0 %	0 %	251791823
140	NC_012913	A	6	6	7211	7216	100 %	0 %	0 %	0 %	251791823
141	NC_012913	AAT	2	6	7248	7253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791823
142	NC_012913	T	6	6	7293	7298	0 %	100 %	0 %	0 %	251791824
143	NC_012913	ATTT	2	8	7312	7319	25 %	75 %	0 %	0 %	251791824
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151	NC_012913	ATC	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791824
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168	NC_012913	CTG	2	6	8825	8830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	251791825
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173	NC_012913	AAT	2	6	9079	9084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791826
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263	NC_012913	TCA	2	6	13576	13581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791831
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266	NC_012913	CCCA	2	8	13688	13695	25 %	0 %	0 %	75 %	251791831
267	NC_012913	AGAA	2	8	13715	13722	75 %	0 %	25 %	0 %	251791831
268	NC_012913	AGAA	2	8	13741	13748	75 %	0 %	25 %	0 %	251791831
269	NC_012913	GGT	2	6	13835	13840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791831
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272	NC_012913	TGG	2	6	13873	13878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791831
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367	NC_012913	CAT	2	6	19106	19111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791834
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371	NC_012913	T	6	6	19292	19297	0 %	100 %	0 %	0 %	251791834
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374	NC_012913	T	6	6	19508	19513	0 %	100 %	0 %	0 %	251791834
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378	NC_012913	ACCGT	2	10	19686	19695	20 %	20 %	20 %	40 %	251791834
379	NC_012913	TAA	2	6	19706	19711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791834
380	NC_012913	AAT	2	6	19715	19720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791834
381	NC_012913	ATC	2	6	19748	19753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791834
382	NC_012913	CTC	2	6	19763	19768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	251791834
383	NC_012913	AAT	3	9	19794	19802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791834
384	NC_012913	TCA	2	6	19824	19829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791834
385	NC_012913	CTA	2	6	19833	19838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791834
386	NC_012913	GAC	2	6	19849	19854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	251791834
387	NC_012913	ACA	3	9	19887	19895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	251791834
388	NC_012913	TAT	2	6	19916	19921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791834
389	NC_012913	T	7	7	19934	19940	0 %	100 %	0 %	0 %	251791834
390	NC_012913	TCA	2	6	19945	19950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791834
391	NC_012913	A	7	7	20405	20411	100 %	0 %	0 %	0 %	251791835
392	NC_012913	TAA	2	6	20420	20425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	251791835
393	NC_012913	ATT	2	6	20511	20516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791835
394	NC_012913	TAT	2	6	20534	20539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	251791835
395	NC_012913	TTGCCA	2	12	20563	20574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	251791835
396	NC_012913	GTG	2	6	20575	20580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	251791835
397	NC_012913	ACC	2	6	20582	20587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791835
398	NC_012913	GTT	2	6	20610	20615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	251791835
399	NC_012913	ATC	2	6	20625	20630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	251791835
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493	NC_012913	CCA	2	6	25738	25743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	251791838
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