MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAgK84

Total Repeats: 717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011994	TGGC	2	8	412	419	0 %	25 %	50 %	25 %	222112729
2	NC_011994	GGC	2	6	472	477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112729
3	NC_011994	GGC	2	6	496	501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112729
4	NC_011994	AAT	2	6	826	831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112729
5	NC_011994	TAT	2	6	853	858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112729
6	NC_011994	ATCA	2	8	868	875	50 %	25 %	0 %	25 %	222112729
7	NC_011994	GATT	2	8	900	907	25 %	50 %	25 %	0 %	222112729
8	NC_011994	CATC	2	8	909	916	25 %	25 %	0 %	50 %	222112729
9	NC_011994	TAT	3	9	984	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112729
10	NC_011994	ATT	2	6	1030	1035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112729
11	NC_011994	AGA	2	6	1125	1130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222112729
12	NC_011994	CAG	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112729
13	NC_011994	T	8	8	1159	1166	0 %	100 %	0 %	0 %	222112729
14	NC_011994	TC	3	6	1172	1177	0 %	50 %	0 %	50 %	222112729
15	NC_011994	GTT	2	6	1202	1207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222112729
16	NC_011994	GAT	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112729
17	NC_011994	CCG	2	6	1310	1315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112729
18	NC_011994	TTTG	2	8	1366	1373	0 %	75 %	25 %	0 %	222112729
19	NC_011994	GAC	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112729
20	NC_011994	CGT	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112729
21	NC_011994	TAATA	2	10	1582	1591	60 %	40 %	0 %	0 %	222112729
22	NC_011994	ATT	2	6	1619	1624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112729
23	NC_011994	CCA	2	6	1662	1667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112729
24	NC_011994	TTA	2	6	1713	1718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112729
25	NC_011994	TTGT	2	8	1742	1749	0 %	75 %	25 %	0 %	222112729
26	NC_011994	A	6	6	2213	2218	100 %	0 %	0 %	0 %	222112730
27	NC_011994	CAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222112730
28	NC_011994	A	7	7	2399	2405	100 %	0 %	0 %	0 %	222112730
29	NC_011994	T	6	6	2421	2426	0 %	100 %	0 %	0 %	222112730
30	NC_011994	CGA	2	6	2457	2462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112730
31	NC_011994	AGA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222112730
32	NC_011994	TGATAT	2	12	2598	2609	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222112730
33	NC_011994	TTG	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222112730
34	NC_011994	TGT	2	6	2628	2633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222112730
35	NC_011994	AGCG	2	8	2928	2935	25 %	0 %	50 %	25 %	222112730
36	NC_011994	TCAA	2	8	2936	2943	50 %	25 %	0 %	25 %	222112730
37	NC_011994	AAT	2	6	2973	2978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112730
38	NC_011994	GTC	2	6	2997	3002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112730
39	NC_011994	ATT	2	6	3041	3046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112730
40	NC_011994	CAT	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112730
41	NC_011994	CGA	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112730
42	NC_011994	GA	3	6	3216	3221	50 %	0 %	50 %	0 %	222112730
43	NC_011994	A	7	7	3288	3294	100 %	0 %	0 %	0 %	222112730
44	NC_011994	GAG	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222112730
45	NC_011994	CCG	2	6	3348	3353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112730
46	NC_011994	TCT	2	6	3440	3445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112730
47	NC_011994	CCG	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112730
48	NC_011994	TCAT	2	8	3475	3482	25 %	50 %	0 %	25 %	222112730
49	NC_011994	TGT	2	6	3495	3500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222112730
50	NC_011994	GAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112730
51	NC_011994	CGA	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112730
52	NC_011994	TTTC	2	8	3597	3604	0 %	75 %	0 %	25 %	222112730
53	NC_011994	GCA	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112731
54	NC_011994	CTT	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112731
55	NC_011994	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222112731
56	NC_011994	TTA	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112731
57	NC_011994	C	6	6	4067	4072	0 %	0 %	0 %	100 %	222112731
58	NC_011994	CT	3	6	4135	4140	0 %	50 %	0 %	50 %	222112731
59	NC_011994	ATA	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112731
60	NC_011994	AAT	2	6	4260	4265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112731
61	NC_011994	TAC	2	6	4314	4319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112731
62	NC_011994	T	6	6	4367	4372	0 %	100 %	0 %	0 %	222112731
63	NC_011994	GCT	2	6	4425	4430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112731
64	NC_011994	GA	3	6	4465	4470	50 %	0 %	50 %	0 %	222112731
65	NC_011994	T	6	6	4539	4544	0 %	100 %	0 %	0 %	222112731
66	NC_011994	CAA	2	6	4601	4606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222112731
67	NC_011994	TCA	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112731
68	NC_011994	T	7	7	4778	4784	0 %	100 %	0 %	0 %	222112731
69	NC_011994	TGT	2	6	4855	4860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222112732
70	NC_011994	GCC	2	6	4876	4881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112732
71	NC_011994	CA	4	8	4927	4934	50 %	0 %	0 %	50 %	222112732
72	NC_011994	AAC	2	6	4943	4948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222112732
73	NC_011994	AG	3	6	4967	4972	50 %	0 %	50 %	0 %	222112732
74	NC_011994	GAA	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222112732
75	NC_011994	TCG	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112732
76	NC_011994	CCGC	2	8	5304	5311	0 %	0 %	25 %	75 %	222112732
77	NC_011994	GCA	2	6	5313	5318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112732
78	NC_011994	ATATG	2	10	5365	5374	40 %	40 %	20 %	0 %	222112732
79	NC_011994	TAG	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112732
80	NC_011994	TCA	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112732
81	NC_011994	TCA	2	6	5592	5597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112732
82	NC_011994	ATA	2	6	5678	5683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112732
83	NC_011994	TTC	2	6	5708	5713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112732
84	NC_011994	GGA	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222112733
85	NC_011994	TCT	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112733
86	NC_011994	ACGT	2	8	6946	6953	25 %	25 %	25 %	25 %	222112733
87	NC_011994	GGAC	2	8	6986	6993	25 %	0 %	50 %	25 %	222112733
88	NC_011994	ACC	2	6	7108	7113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112733
89	NC_011994	AAC	2	6	7242	7247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222112733
90	NC_011994	TGC	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112733
91	NC_011994	AG	3	6	7342	7347	50 %	0 %	50 %	0 %	222112733
92	NC_011994	GT	3	6	7359	7364	0 %	50 %	50 %	0 %	222112733
93	NC_011994	GAT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112733
94	NC_011994	GGCC	2	8	8557	8564	0 %	0 %	50 %	50 %	222112740
95	NC_011994	TTGTTT	2	12	8644	8655	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	222112740
96	NC_011994	GGC	2	6	8704	8709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112740
97	NC_011994	TCT	2	6	8785	8790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112740
98	NC_011994	CGA	2	6	8797	8802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112740
99	NC_011994	CGG	2	6	8869	8874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112740
100	NC_011994	ATG	2	6	8885	8890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112740
101	NC_011994	GCA	2	6	8900	8905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112740
102	NC_011994	CCA	2	6	8943	8948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112740
103	NC_011994	GCA	2	6	8951	8956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112740
104	NC_011994	TCT	2	6	8960	8965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112740
105	NC_011994	AAAC	2	8	9039	9046	75 %	0 %	0 %	25 %	222112740
106	NC_011994	CCGG	2	8	9092	9099	0 %	0 %	50 %	50 %	222112740
107	NC_011994	TCT	2	6	9158	9163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112740
108	NC_011994	TA	3	6	9164	9169	50 %	50 %	0 %	0 %	222112740
109	NC_011994	AGC	2	6	9254	9259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112734
110	NC_011994	TTC	2	6	9353	9358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112734
111	NC_011994	ATCG	2	8	9389	9396	25 %	25 %	25 %	25 %	222112734
112	NC_011994	GC	3	6	9441	9446	0 %	0 %	50 %	50 %	222112734
113	NC_011994	TAT	2	6	9467	9472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112734
114	NC_011994	CTT	2	6	9477	9482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112734
115	NC_011994	GC	3	6	9490	9495	0 %	0 %	50 %	50 %	222112734
116	NC_011994	AAAC	2	8	9553	9560	75 %	0 %	0 %	25 %	222112734
117	NC_011994	CTCGA	2	10	9585	9594	20 %	20 %	20 %	40 %	222112734
118	NC_011994	TTC	2	6	9674	9679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112734
119	NC_011994	AAT	2	6	9821	9826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112734
120	NC_011994	GGT	2	6	9877	9882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222112734
121	NC_011994	TC	3	6	9907	9912	0 %	50 %	0 %	50 %	222112734
122	NC_011994	TCGA	2	8	9924	9931	25 %	25 %	25 %	25 %	222112734
123	NC_011994	GGAG	2	8	10020	10027	25 %	0 %	75 %	0 %	222112734
124	NC_011994	TGC	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112734
125	NC_011994	AGG	2	6	10059	10064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222112734
126	NC_011994	C	6	6	10071	10076	0 %	0 %	0 %	100 %	222112734
127	NC_011994	AAT	2	6	10171	10176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112734
128	NC_011994	AC	3	6	10185	10190	50 %	0 %	0 %	50 %	222112734
129	NC_011994	TTG	2	6	10242	10247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222112734
130	NC_011994	CTCTT	2	10	10314	10323	0 %	60 %	0 %	40 %	222112735
131	NC_011994	TCC	2	6	10397	10402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222112735
132	NC_011994	GTG	2	6	10452	10457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222112735
133	NC_011994	AAT	2	6	10473	10478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112735
134	NC_011994	ATC	2	6	10513	10518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112735
135	NC_011994	CAAT	2	8	10589	10596	50 %	25 %	0 %	25 %	222112735
136	NC_011994	CAGT	2	8	10641	10648	25 %	25 %	25 %	25 %	222112735
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264	NC_011994	TCG	2	6	17402	17407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112707
265	NC_011994	CTTC	2	8	17426	17433	0 %	50 %	0 %	50 %	222112707
266	NC_011994	TAA	2	6	17436	17441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222112707
267	NC_011994	GAT	2	6	17442	17447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112707
268	NC_011994	AATG	2	8	17505	17512	50 %	25 %	25 %	0 %	222112707
269	NC_011994	GA	3	6	17544	17549	50 %	0 %	50 %	0 %	222112707
270	NC_011994	GA	3	6	17603	17608	50 %	0 %	50 %	0 %	222112707
271	NC_011994	GCT	2	6	17635	17640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112707
272	NC_011994	CGA	2	6	17652	17657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112707
273	NC_011994	TCA	2	6	17774	17779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112707
274	NC_011994	CT	4	8	17850	17857	0 %	50 %	0 %	50 %	222112707
275	NC_011994	ACC	2	6	17873	17878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112707
276	NC_011994	TTC	2	6	17920	17925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112707
277	NC_011994	GATT	2	8	17941	17948	25 %	50 %	25 %	0 %	222112707
278	NC_011994	AGT	2	6	17952	17957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112707
279	NC_011994	TG	3	6	18007	18012	0 %	50 %	50 %	0 %	222112707
280	NC_011994	TCAGA	2	10	18081	18090	40 %	20 %	20 %	20 %	222112707
281	NC_011994	CTA	2	6	18096	18101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112707
282	NC_011994	GTCC	2	8	18125	18132	0 %	25 %	25 %	50 %	222112707
283	NC_011994	CAA	2	6	18196	18201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222112707
284	NC_011994	CGA	2	6	18225	18230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112707
285	NC_011994	GCG	2	6	18237	18242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112707
286	NC_011994	CCG	2	6	18258	18263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112707
287	NC_011994	ATC	2	6	18346	18351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112707
288	NC_011994	CTG	2	6	18394	18399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112707
289	NC_011994	CAT	2	6	18466	18471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112707
290	NC_011994	TTTC	2	8	18703	18710	0 %	75 %	0 %	25 %	222112707
291	NC_011994	CTG	2	6	18757	18762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112707
292	NC_011994	GGT	2	6	18783	18788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222112707
293	NC_011994	TGCC	2	8	18801	18808	0 %	25 %	25 %	50 %	222112708
294	NC_011994	TCG	2	6	18811	18816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112708
295	NC_011994	AT	3	6	18884	18889	50 %	50 %	0 %	0 %	222112708
296	NC_011994	AT	3	6	18914	18919	50 %	50 %	0 %	0 %	222112708
297	NC_011994	GCG	2	6	19004	19009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112708
298	NC_011994	T	7	7	19023	19029	0 %	100 %	0 %	0 %	222112708
299	NC_011994	A	6	6	19078	19083	100 %	0 %	0 %	0 %	222112708
300	NC_011994	CCA	2	6	19146	19151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112708
301	NC_011994	CGG	2	6	19188	19193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112708
302	NC_011994	TCG	2	6	19250	19255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112708
303	NC_011994	AGGGC	2	10	19308	19317	20 %	0 %	60 %	20 %	222112708
304	NC_011994	GC	3	6	19358	19363	0 %	0 %	50 %	50 %	222112708
305	NC_011994	TGC	2	6	19464	19469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112708
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308	NC_011994	CAC	2	6	19567	19572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112708
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312	NC_011994	CTT	2	6	19930	19935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222112709
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319	NC_011994	CCTCG	2	10	20320	20329	0 %	20 %	20 %	60 %	222112709
320	NC_011994	TAG	2	6	20346	20351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112709
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329	NC_011994	CCT	2	6	21109	21114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222112710
330	NC_011994	CGA	2	6	21131	21136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112710
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332	NC_011994	A	6	6	21172	21177	100 %	0 %	0 %	0 %	222112710
333	NC_011994	GAA	2	6	21197	21202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222112710
334	NC_011994	GTG	2	6	21238	21243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222112710
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342	NC_011994	CGGG	2	8	22005	22012	0 %	0 %	75 %	25 %	222112711
343	NC_011994	TGCT	2	8	22029	22036	0 %	50 %	25 %	25 %	222112711
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349	NC_011994	TGA	2	6	22288	22293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222112711
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353	NC_011994	GCA	2	6	22462	22467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112711
354	NC_011994	TCG	2	6	22476	22481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112711
355	NC_011994	GC	3	6	22485	22490	0 %	0 %	50 %	50 %	222112711
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366	NC_011994	GGC	2	6	23425	23430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112712
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372	NC_011994	CAT	2	6	23892	23897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112713
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375	NC_011994	ACC	2	6	24075	24080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222112713
376	NC_011994	CGA	2	6	24104	24109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112713
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379	NC_011994	GCC	2	6	24181	24186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222112713
380	NC_011994	CCGA	2	8	24238	24245	25 %	0 %	25 %	50 %	222112713
381	NC_011994	GCA	2	6	24251	24256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112713
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383	NC_011994	GCA	2	6	24368	24373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112713
384	NC_011994	ATT	2	6	24456	24461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222112713
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386	NC_011994	GCG	2	6	24566	24571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112713
387	NC_011994	TCA	2	6	24575	24580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112713
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389	NC_011994	CGA	2	6	24686	24691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222112713
390	NC_011994	CGAT	2	8	24734	24741	25 %	25 %	25 %	25 %	222112713
391	NC_011994	GTT	2	6	24806	24811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222112713
392	NC_011994	CTG	2	6	24816	24821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112713
393	NC_011994	CGG	2	6	24847	24852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112713
394	NC_011994	ATC	2	6	24892	24897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222112713
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397	NC_011994	AACC	2	8	25076	25083	50 %	0 %	0 %	50 %	222112713
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400	NC_011994	CGG	2	6	25139	25144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222112713
401	NC_011994	CTG	2	6	25152	25157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222112713
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500	NC_011994	TC	3	6	31320	31325	0 %	50 %	0 %	50 %	222112719

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