MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_011989	ATTG	2	8	2573437	2573444	25 %	50 %	25 %	0 %	222149277
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44004	NC_011989	GGC	2	6	2573529	2573534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149277
44005	NC_011989	CGCC	2	8	2573544	2573551	0 %	0 %	25 %	75 %	222149277
44006	NC_011989	GCAA	2	8	2573559	2573566	50 %	0 %	25 %	25 %	222149277
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44009	NC_011989	GCC	2	6	2573660	2573665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149277
44010	NC_011989	CCA	2	6	2573694	2573699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149277
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44013	NC_011989	GCG	2	6	2573909	2573914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149278
44014	NC_011989	GCC	2	6	2573946	2573951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149278
44015	NC_011989	TGC	2	6	2574028	2574033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149278
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44116	NC_011989	CCGA	2	8	2578811	2578818	25 %	0 %	25 %	50 %	222149282
44117	NC_011989	GGC	2	6	2578908	2578913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149282
44118	NC_011989	GCT	2	6	2578950	2578955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44119	NC_011989	CAGCGA	2	12	2578984	2578995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44120	NC_011989	GAC	2	6	2579051	2579056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44121	NC_011989	CAGGC	2	10	2579069	2579078	20 %	0 %	40 %	40 %	222149282
44122	NC_011989	GC	3	6	2579077	2579082	0 %	0 %	50 %	50 %	222149282
44123	NC_011989	CTG	2	6	2579089	2579094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44124	NC_011989	GGC	2	6	2579179	2579184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149282
44125	NC_011989	TCCTCT	2	12	2579210	2579221	0 %	50 %	0 %	50 %	222149282
44126	NC_011989	CGC	2	6	2579241	2579246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149282
44127	NC_011989	GTC	2	6	2579260	2579265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44128	NC_011989	CGG	2	6	2579282	2579287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149282
44129	NC_011989	CTTTTC	2	12	2579290	2579301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149282
44130	NC_011989	T	6	6	2579328	2579333	0 %	100 %	0 %	0 %	222149282
44131	NC_011989	GGT	2	6	2579380	2579385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149282
44132	NC_011989	GAT	2	6	2579395	2579400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149282
44133	NC_011989	GCA	2	6	2579406	2579411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44134	NC_011989	CGT	2	6	2579413	2579418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44135	NC_011989	TCG	2	6	2579432	2579437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44136	NC_011989	ATC	2	6	2579489	2579494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149282
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44139	NC_011989	GTC	2	6	2579593	2579598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44140	NC_011989	CGGT	2	8	2579603	2579610	0 %	25 %	50 %	25 %	222149282
44141	NC_011989	TCT	2	6	2579619	2579624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149282
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44143	NC_011989	CGC	2	6	2579664	2579669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149282
44144	NC_011989	CTT	2	6	2579682	2579687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149282
44145	NC_011989	CGT	2	6	2579688	2579693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149282
44146	NC_011989	TTC	2	6	2579701	2579706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149282
44147	NC_011989	CGTCCT	2	12	2579724	2579735	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222149282
44148	NC_011989	CGA	2	6	2579736	2579741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149282
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44150	NC_011989	GGC	2	6	2579857	2579862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149282
44151	NC_011989	GTCG	2	8	2579911	2579918	0 %	25 %	50 %	25 %	222149282
44152	NC_011989	CTT	2	6	2579940	2579945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149282
44153	NC_011989	GAT	2	6	2580717	2580722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149283
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44155	NC_011989	GGC	2	6	2580851	2580856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149283
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44157	NC_011989	GCC	2	6	2580922	2580927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149283
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44166	NC_011989	CCA	4	12	2581339	2581350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149283
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44169	NC_011989	CTG	2	6	2581437	2581442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149283
44170	NC_011989	GGC	2	6	2581448	2581453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149283
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44173	NC_011989	GC	3	6	2581607	2581612	0 %	0 %	50 %	50 %	222149283
44174	NC_011989	ATC	2	6	2581632	2581637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149283
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44177	NC_011989	GCCATC	2	12	2581740	2581751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222149283
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44182	NC_011989	CCG	2	6	2581926	2581931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149283
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44185	NC_011989	GCGCTC	2	12	2582352	2582363	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222149283
44186	NC_011989	CG	3	6	2582375	2582380	0 %	0 %	50 %	50 %	222149283
44187	NC_011989	AC	3	6	2582486	2582491	50 %	0 %	0 %	50 %	222149283
44188	NC_011989	T	6	6	2582546	2582551	0 %	100 %	0 %	0 %	222149283
44189	NC_011989	GCA	2	6	2582565	2582570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149283
44190	NC_011989	CG	3	6	2582585	2582590	0 %	0 %	50 %	50 %	222149283
44191	NC_011989	CG	4	8	2582621	2582628	0 %	0 %	50 %	50 %	222149283
44192	NC_011989	TCG	2	6	2582665	2582670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149283
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44197	NC_011989	TGC	2	6	2583078	2583083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149284
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44200	NC_011989	TGG	2	6	2583282	2583287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149284
44201	NC_011989	GCG	2	6	2583323	2583328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149284
44202	NC_011989	TTG	2	6	2583375	2583380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149284
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44204	NC_011989	CTG	2	6	2583455	2583460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149284
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44211	NC_011989	CTG	2	6	2583718	2583723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149285
44212	NC_011989	CGG	2	6	2583735	2583740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149285
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44215	NC_011989	ATC	2	6	2584081	2584086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149285
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44220	NC_011989	GATC	2	8	2584302	2584309	25 %	25 %	25 %	25 %	222149285
44221	NC_011989	TGG	2	6	2584328	2584333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149285
44222	NC_011989	TCT	2	6	2584442	2584447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149285
44223	NC_011989	GCT	2	6	2584458	2584463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149285
44224	NC_011989	GCC	2	6	2584507	2584512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149285
44225	NC_011989	CGC	2	6	2584545	2584550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149285
44226	NC_011989	CATC	2	8	2584811	2584818	25 %	25 %	0 %	50 %	222149286
44227	NC_011989	TGA	2	6	2584838	2584843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149286
44228	NC_011989	GGC	2	6	2584866	2584871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149286
44229	NC_011989	GGGC	2	8	2584879	2584886	0 %	0 %	75 %	25 %	222149286
44230	NC_011989	GCT	2	6	2584919	2584924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149286
44231	NC_011989	GGA	2	6	2584946	2584951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149286
44232	NC_011989	GTC	2	6	2584953	2584958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149286
44233	NC_011989	TGG	2	6	2585033	2585038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149286
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44335	NC_011989	GGCC	2	8	2591532	2591539	0 %	0 %	50 %	50 %	222149292
44336	NC_011989	CGG	3	9	2591639	2591647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149292
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44340	NC_011989	CAA	2	6	2591775	2591780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149292
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44342	NC_011989	CAG	2	6	2591826	2591831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149292
44343	NC_011989	GCC	2	6	2592040	2592045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149292
44344	NC_011989	TGCA	2	8	2592048	2592055	25 %	25 %	25 %	25 %	222149292
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44346	NC_011989	T	7	7	2592712	2592718	0 %	100 %	0 %	0 %	222149293
44347	NC_011989	TTC	2	6	2592747	2592752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149293
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