MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_011989	GCCGT	2	10	2508338	2508347	0 %	20 %	40 %	40 %	222149216
43003	NC_011989	TGGT	2	8	2508353	2508360	0 %	50 %	50 %	0 %	222149216
43004	NC_011989	GCC	2	6	2508361	2508366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149216
43005	NC_011989	CGA	2	6	2508387	2508392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43006	NC_011989	GCC	2	6	2508401	2508406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149216
43007	NC_011989	CGG	2	6	2508418	2508423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149216
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43009	NC_011989	AACC	2	8	2508561	2508568	50 %	0 %	0 %	50 %	222149216
43010	NC_011989	CTT	2	6	2508601	2508606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149216
43011	NC_011989	GAA	2	6	2508607	2508612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149216
43012	NC_011989	GTC	2	6	2508619	2508624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43013	NC_011989	GCT	2	6	2508666	2508671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43014	NC_011989	CAG	2	6	2508765	2508770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43015	NC_011989	GAA	2	6	2508796	2508801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149216
43016	NC_011989	TGG	2	6	2508822	2508827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149216
43017	NC_011989	GTC	2	6	2508925	2508930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43018	NC_011989	TCG	2	6	2508957	2508962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43019	NC_011989	GAC	2	6	2509012	2509017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43020	NC_011989	AGCC	2	8	2509058	2509065	25 %	0 %	25 %	50 %	222149216
43021	NC_011989	TGG	2	6	2509080	2509085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149216
43022	NC_011989	GCG	2	6	2509119	2509124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149216
43023	NC_011989	CGA	2	6	2509164	2509169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149216
43024	NC_011989	GA	3	6	2509180	2509185	50 %	0 %	50 %	0 %	222149216
43025	NC_011989	CATCGA	2	12	2509245	2509256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222149217
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43027	NC_011989	TCG	2	6	2509313	2509318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149217
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43031	NC_011989	CCGG	2	8	2509487	2509494	0 %	0 %	50 %	50 %	222149217
43032	NC_011989	ATCG	2	8	2509513	2509520	25 %	25 %	25 %	25 %	222149217
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43038	NC_011989	GCCT	2	8	2509850	2509857	0 %	25 %	25 %	50 %	222149218
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43052	NC_011989	TGA	2	6	2510449	2510454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149218
43053	NC_011989	TGC	2	6	2510477	2510482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149218
43054	NC_011989	GC	3	6	2510485	2510490	0 %	0 %	50 %	50 %	222149218
43055	NC_011989	CGATC	2	10	2510571	2510580	20 %	20 %	20 %	40 %	222149218
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43088	NC_011989	GC	3	6	2512304	2512309	0 %	0 %	50 %	50 %	222149219
43089	NC_011989	TCG	2	6	2512351	2512356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149219
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43112	NC_011989	GCC	2	6	2513308	2513313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149220
43113	NC_011989	TGGC	2	8	2513361	2513368	0 %	25 %	50 %	25 %	222149220
43114	NC_011989	CCGG	2	8	2513384	2513391	0 %	0 %	50 %	50 %	222149220
43115	NC_011989	TC	3	6	2513409	2513414	0 %	50 %	0 %	50 %	222149220
43116	NC_011989	CAT	2	6	2513415	2513420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149220
43117	NC_011989	GAT	2	6	2513497	2513502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149220
43118	NC_011989	CAT	2	6	2513607	2513612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149220
43119	NC_011989	GCTG	2	8	2513623	2513630	0 %	25 %	50 %	25 %	222149220
43120	NC_011989	TCC	2	6	2513705	2513710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149220
43121	NC_011989	TCC	2	6	2513714	2513719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149220
43122	NC_011989	TGA	2	6	2513804	2513809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149220
43123	NC_011989	GTC	3	9	2513834	2513842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149220
43124	NC_011989	GTTT	2	8	2513927	2513934	0 %	75 %	25 %	0 %	222149221
43125	NC_011989	CGA	2	6	2513940	2513945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149221
43126	NC_011989	CGG	2	6	2514003	2514008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149221
43127	NC_011989	TGGT	2	8	2514012	2514019	0 %	50 %	50 %	0 %	222149221
43128	NC_011989	CAC	2	6	2514031	2514036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149221
43129	NC_011989	TGGAAA	2	12	2514188	2514199	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222149221
43130	NC_011989	GCG	2	6	2514227	2514232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149221
43131	NC_011989	GATAC	2	10	2514240	2514249	40 %	20 %	20 %	20 %	222149221
43132	NC_011989	ACC	2	6	2514282	2514287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149221
43133	NC_011989	GCC	2	6	2514317	2514322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149221
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43135	NC_011989	TTTGTT	2	12	2514413	2514424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	222149221
43136	NC_011989	CTT	2	6	2514477	2514482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149221
43137	NC_011989	CCGA	2	8	2514502	2514509	25 %	0 %	25 %	50 %	222149221
43138	NC_011989	CG	3	6	2514521	2514526	0 %	0 %	50 %	50 %	222149221
43139	NC_011989	GCAT	2	8	2514544	2514551	25 %	25 %	25 %	25 %	222149221
43140	NC_011989	CTC	2	6	2514588	2514593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149221
43141	NC_011989	GC	3	6	2514690	2514695	0 %	0 %	50 %	50 %	222149221
43142	NC_011989	AAC	2	6	2514748	2514753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149221
43143	NC_011989	GAT	2	6	2514783	2514788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149221
43144	NC_011989	CGT	2	6	2514875	2514880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149221
43145	NC_011989	CCG	2	6	2514916	2514921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149221
43146	NC_011989	GCC	2	6	2514990	2514995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149221
43147	NC_011989	CAG	2	6	2515023	2515028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149221
43148	NC_011989	CGA	2	6	2515043	2515048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149221
43149	NC_011989	CGC	2	6	2515050	2515055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149221
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43152	NC_011989	TTCCAT	2	12	2515203	2515214	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222149221
43153	NC_011989	GGC	2	6	2515215	2515220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149221
43154	NC_011989	GGC	2	6	2515329	2515334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149221
43155	NC_011989	GC	3	6	2515333	2515338	0 %	0 %	50 %	50 %	222149221
43156	NC_011989	AGG	2	6	2515349	2515354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149221
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43159	NC_011989	TTC	2	6	2515530	2515535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149221
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43164	NC_011989	GCG	2	6	2515737	2515742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149222
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43173	NC_011989	TCA	2	6	2516240	2516245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149223
43174	NC_011989	CTG	2	6	2516290	2516295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149223
43175	NC_011989	GAC	2	6	2516357	2516362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149223
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43178	NC_011989	GCTC	2	8	2516641	2516648	0 %	25 %	25 %	50 %	222149224
43179	NC_011989	CTT	2	6	2516717	2516722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149224
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43182	NC_011989	TCGA	2	8	2516840	2516847	25 %	25 %	25 %	25 %	222149225
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43187	NC_011989	AATG	2	8	2517018	2517025	50 %	25 %	25 %	0 %	222149225
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43194	NC_011989	CG	3	6	2517435	2517440	0 %	0 %	50 %	50 %	222149226
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43202	NC_011989	CG	3	6	2518121	2518126	0 %	0 %	50 %	50 %	222149227
43203	NC_011989	GCAT	2	8	2518195	2518202	25 %	25 %	25 %	25 %	222149227
43204	NC_011989	GCC	2	6	2518229	2518234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149227
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43209	NC_011989	TCGT	2	8	2518725	2518732	0 %	50 %	25 %	25 %	222149228
43210	NC_011989	TTA	2	6	2518743	2518748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222149228
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43217	NC_011989	ACG	2	6	2519217	2519222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149229
43218	NC_011989	CCGAA	2	10	2519274	2519283	40 %	0 %	20 %	40 %	222149229
43219	NC_011989	TGC	2	6	2519290	2519295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149229
43220	NC_011989	ATG	2	6	2519298	2519303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149229
43221	NC_011989	TGCCG	2	10	2519335	2519344	0 %	20 %	40 %	40 %	222149229
43222	NC_011989	GGTC	2	8	2519371	2519378	0 %	25 %	50 %	25 %	222149229
43223	NC_011989	ACG	2	6	2519379	2519384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149229
43224	NC_011989	TGGC	2	8	2519416	2519423	0 %	25 %	50 %	25 %	222149229
43225	NC_011989	GC	3	6	2519438	2519443	0 %	0 %	50 %	50 %	222149229
43226	NC_011989	CGGAT	2	10	2519564	2519573	20 %	20 %	40 %	20 %	222149230
43227	NC_011989	TCA	2	6	2519606	2519611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149230
43228	NC_011989	ATG	2	6	2519675	2519680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149230
43229	NC_011989	GATCG	2	10	2519704	2519713	20 %	20 %	40 %	20 %	222149230
43230	NC_011989	GAT	2	6	2519716	2519721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149230
43231	NC_011989	GGC	3	9	2519784	2519792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149230
43232	NC_011989	GAA	2	6	2519842	2519847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149230
43233	NC_011989	T	6	6	2519848	2519853	0 %	100 %	0 %	0 %	222149230
43234	NC_011989	T	8	8	2520025	2520032	0 %	100 %	0 %	0 %	222149230
43235	NC_011989	CAGC	2	8	2520118	2520125	25 %	0 %	25 %	50 %	222149231
43236	NC_011989	GCCA	2	8	2520297	2520304	25 %	0 %	25 %	50 %	222149231
43237	NC_011989	CAT	2	6	2520334	2520339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149231
43238	NC_011989	GTG	2	6	2520344	2520349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149231
43239	NC_011989	CAA	2	6	2520395	2520400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149231
43240	NC_011989	CTT	2	6	2520464	2520469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149231
43241	NC_011989	GCTTGC	2	12	2520490	2520501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149231
43242	NC_011989	GCCGGA	2	12	2520510	2520521	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222149231
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43257	NC_011989	TTC	2	6	2523455	2523460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149234
43258	NC_011989	GGC	2	6	2523463	2523468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149234
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43349	NC_011989	GCC	2	6	2528946	2528951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149239
43350	NC_011989	CG	3	6	2529013	2529018	0 %	0 %	50 %	50 %	222149239
43351	NC_011989	CGCC	2	8	2529021	2529028	0 %	0 %	25 %	75 %	222149239
43352	NC_011989	CGA	2	6	2529111	2529116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149239
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43359	NC_011989	GTG	2	6	2531708	2531713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149241
43360	NC_011989	TAA	2	6	2531866	2531871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149241
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43463	NC_011989	GCTG	2	8	2538495	2538502	0 %	25 %	50 %	25 %	222149246
43464	NC_011989	GCA	2	6	2538531	2538536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149246
43465	NC_011989	GC	3	6	2538604	2538609	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
43466	NC_011989	GC	3	6	2538648	2538653	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
43467	NC_011989	CG	3	6	2538709	2538714	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
43468	NC_011989	ACA	2	6	2538745	2538750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149246
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43470	NC_011989	GC	3	6	2538891	2538896	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
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43472	NC_011989	CGA	2	6	2538991	2538996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149246
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43474	NC_011989	CG	3	6	2539162	2539167	0 %	0 %	50 %	50 %	222149246
43475	NC_011989	GATA	2	8	2539189	2539196	50 %	25 %	25 %	0 %	222149246
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43485	NC_011989	GCGA	2	8	2539702	2539709	25 %	0 %	50 %	25 %	222149246
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43487	NC_011989	GCT	2	6	2539723	2539728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149246
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43489	NC_011989	GC	3	6	2539940	2539945	0 %	0 %	50 %	50 %	222149247
43490	NC_011989	TCG	2	6	2540057	2540062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149247
43491	NC_011989	CGC	2	6	2540196	2540201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149247
43492	NC_011989	TTC	2	6	2540314	2540319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149247
43493	NC_011989	GCGCCC	2	12	2540344	2540355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149247
43494	NC_011989	TGC	2	6	2540669	2540674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149248
43495	NC_011989	TGCT	2	8	2540683	2540690	0 %	50 %	25 %	25 %	222149248
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