MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_011989	CGG	2	6	2449761	2449766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149164
42002	NC_011989	TCT	2	6	2449998	2450003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149164
42003	NC_011989	GCC	2	6	2450263	2450268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
42004	NC_011989	CCG	2	6	2450373	2450378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
42005	NC_011989	CGC	2	6	2450451	2450456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
42006	NC_011989	CCG	2	6	2450471	2450476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
42007	NC_011989	TTG	2	6	2450523	2450528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149165
42008	NC_011989	ATG	2	6	2450576	2450581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149165
42009	NC_011989	CGC	2	6	2450696	2450701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
42010	NC_011989	TGGC	2	8	2450743	2450750	0 %	25 %	50 %	25 %	222149165
42011	NC_011989	CCG	2	6	2450762	2450767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
42012	NC_011989	GTC	2	6	2450842	2450847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149165
42013	NC_011989	GGA	2	6	2450872	2450877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149165
42014	NC_011989	CCG	2	6	2450891	2450896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149165
42015	NC_011989	ATG	2	6	2450926	2450931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149165
42016	NC_011989	CAC	2	6	2451169	2451174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149166
42017	NC_011989	ATCA	2	8	2451208	2451215	50 %	25 %	0 %	25 %	222149166
42018	NC_011989	CGC	2	6	2451235	2451240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149166
42019	NC_011989	CGC	2	6	2451244	2451249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149166
42020	NC_011989	GCC	2	6	2451253	2451258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149166
42021	NC_011989	CCCAGG	2	12	2451317	2451328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222149166
42022	NC_011989	CTG	2	6	2451436	2451441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149166
42023	NC_011989	GGGC	2	8	2451456	2451463	0 %	0 %	75 %	25 %	222149166
42024	NC_011989	CAA	2	6	2451534	2451539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149166
42025	NC_011989	CTG	2	6	2451613	2451618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149166
42026	NC_011989	TTTG	2	8	2451672	2451679	0 %	75 %	25 %	0 %	222149166
42027	NC_011989	ACG	2	6	2451692	2451697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149166
42028	NC_011989	TGGA	2	8	2451760	2451767	25 %	25 %	50 %	0 %	222149166
42029	NC_011989	CGG	3	9	2451846	2451854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149166
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42031	NC_011989	GGT	2	6	2451874	2451879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149166
42032	NC_011989	CG	3	6	2451889	2451894	0 %	0 %	50 %	50 %	222149166
42033	NC_011989	ATC	2	6	2451899	2451904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149166
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42035	NC_011989	GGC	2	6	2451999	2452004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149166
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42038	NC_011989	TCCAC	2	10	2452145	2452154	20 %	20 %	0 %	60 %	222149167
42039	NC_011989	ATG	2	6	2452220	2452225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149167
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42042	NC_011989	CTG	2	6	2452290	2452295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149167
42043	NC_011989	TTTC	2	8	2452318	2452325	0 %	75 %	0 %	25 %	222149167
42044	NC_011989	ATA	2	6	2452352	2452357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149167
42045	NC_011989	CGC	2	6	2452358	2452363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149167
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42050	NC_011989	TGG	2	6	2452599	2452604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149167
42051	NC_011989	GCT	2	6	2452740	2452745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149167
42052	NC_011989	CAT	2	6	2452765	2452770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
42053	NC_011989	GCC	2	6	2452865	2452870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149167
42054	NC_011989	CGG	2	6	2452873	2452878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149167
42055	NC_011989	GT	3	6	2452887	2452892	0 %	50 %	50 %	0 %	222149167
42056	NC_011989	GCA	2	6	2452904	2452909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149167
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42059	NC_011989	CAT	3	9	2453020	2453028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
42060	NC_011989	CAT	2	6	2453044	2453049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149167
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42062	NC_011989	GCC	2	6	2453098	2453103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149167
42063	NC_011989	CGG	2	6	2453155	2453160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149168
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42065	NC_011989	GCC	2	6	2453280	2453285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149168
42066	NC_011989	GGC	2	6	2453291	2453296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149168
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42069	NC_011989	CG	3	6	2453358	2453363	0 %	0 %	50 %	50 %	222149168
42070	NC_011989	CCA	2	6	2453373	2453378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149168
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42087	NC_011989	GCT	2	6	2454456	2454461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149168
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42097	NC_011989	ATC	2	6	2454722	2454727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149168
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42099	NC_011989	GCA	2	6	2454876	2454881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
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42101	NC_011989	TCA	2	6	2454912	2454917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149169
42102	NC_011989	GGC	2	6	2454982	2454987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149169
42103	NC_011989	GTT	2	6	2455012	2455017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149169
42104	NC_011989	CGA	2	6	2455078	2455083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
42105	NC_011989	CAG	2	6	2455106	2455111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
42106	NC_011989	GC	3	6	2455118	2455123	0 %	0 %	50 %	50 %	222149169
42107	NC_011989	CAGC	2	8	2455153	2455160	25 %	0 %	25 %	50 %	222149169
42108	NC_011989	GCA	2	6	2455249	2455254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149169
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42110	NC_011989	GCCT	2	8	2455292	2455299	0 %	25 %	25 %	50 %	222149169
42111	NC_011989	CAGG	2	8	2455300	2455307	25 %	0 %	50 %	25 %	222149169
42112	NC_011989	GCG	2	6	2455459	2455464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149170
42113	NC_011989	CG	3	6	2455599	2455604	0 %	0 %	50 %	50 %	222149170
42114	NC_011989	CTG	2	6	2455636	2455641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149170
42115	NC_011989	AGC	2	6	2455683	2455688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149170
42116	NC_011989	AC	3	6	2455723	2455728	50 %	0 %	0 %	50 %	222149170
42117	NC_011989	CAA	2	6	2455733	2455738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149170
42118	NC_011989	GAT	2	6	2455741	2455746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149170
42119	NC_011989	GAA	2	6	2455777	2455782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149170
42120	NC_011989	TTGCCA	2	12	2455799	2455810	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222149170
42121	NC_011989	AGC	2	6	2455976	2455981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149171
42122	NC_011989	TGG	2	6	2455987	2455992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149171
42123	NC_011989	TGG	2	6	2456000	2456005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149171
42124	NC_011989	GAT	2	6	2456075	2456080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149171
42125	NC_011989	CAG	2	6	2456120	2456125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149171
42126	NC_011989	GCCA	2	8	2456189	2456196	25 %	0 %	25 %	50 %	222149171
42127	NC_011989	ATGGAC	2	12	2456259	2456270	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222149171
42128	NC_011989	ATC	2	6	2456423	2456428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149172
42129	NC_011989	GGC	2	6	2456444	2456449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149172
42130	NC_011989	TTC	2	6	2456510	2456515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149172
42131	NC_011989	GCA	2	6	2456523	2456528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149172
42132	NC_011989	ATC	2	6	2456609	2456614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149172
42133	NC_011989	ATC	2	6	2456618	2456623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149172
42134	NC_011989	TCG	2	6	2456677	2456682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149172
42135	NC_011989	GAA	3	9	2456787	2456795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149173
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42138	NC_011989	CTG	2	6	2456919	2456924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149173
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42141	NC_011989	GCCGA	2	10	2457006	2457015	20 %	0 %	40 %	40 %	222149173
42142	NC_011989	CCG	2	6	2457038	2457043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149173
42143	NC_011989	GGC	2	6	2457054	2457059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149173
42144	NC_011989	CCCG	2	8	2457072	2457079	0 %	0 %	25 %	75 %	222149173
42145	NC_011989	TCG	2	6	2457145	2457150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149173
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42150	NC_011989	GCG	2	6	2457512	2457517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149173
42151	NC_011989	GAT	2	6	2457534	2457539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149173
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42153	NC_011989	TGA	2	6	2458168	2458173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149174
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42160	NC_011989	CGGC	2	8	2458449	2458456	0 %	0 %	50 %	50 %	222149174
42161	NC_011989	GCA	2	6	2458470	2458475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149174
42162	NC_011989	GCA	2	6	2458489	2458494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149174
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42164	NC_011989	GCA	2	6	2458613	2458618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149174
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42170	NC_011989	CGCCAT	2	12	2459038	2459049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222149174
42171	NC_011989	GTGCAG	2	12	2459058	2459069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222149174
42172	NC_011989	CAG	2	6	2459118	2459123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149174
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42175	NC_011989	CAG	2	6	2459513	2459518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149175
42176	NC_011989	ACC	2	6	2459589	2459594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149175
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42179	NC_011989	GTG	2	6	2459698	2459703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149175
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42183	NC_011989	ATC	2	6	2459833	2459838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149175
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42186	NC_011989	CGG	2	6	2459996	2460001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149175
42187	NC_011989	TGA	2	6	2460064	2460069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149175
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42190	NC_011989	GCC	2	6	2460114	2460119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149175
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42192	NC_011989	GGT	2	6	2460350	2460355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149176
42193	NC_011989	GCTC	2	8	2460451	2460458	0 %	25 %	25 %	50 %	222149176
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42200	NC_011989	CGGG	2	8	2461121	2461128	0 %	0 %	75 %	25 %	222149176
42201	NC_011989	ACC	2	6	2461205	2461210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149176
42202	NC_011989	GTCG	2	8	2461436	2461443	0 %	25 %	50 %	25 %	222149176
42203	NC_011989	CGG	2	6	2461857	2461862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149177
42204	NC_011989	GCT	2	6	2461877	2461882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149177
42205	NC_011989	GGC	2	6	2461951	2461956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149177
42206	NC_011989	GAT	2	6	2461965	2461970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149177
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42209	NC_011989	AGGC	3	12	2462276	2462287	25 %	0 %	50 %	25 %	222149177
42210	NC_011989	ATC	2	6	2462311	2462316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149177
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42213	NC_011989	AGA	2	6	2462519	2462524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149177
42214	NC_011989	AAT	2	6	2462532	2462537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149177
42215	NC_011989	TCC	2	6	2462572	2462577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149177
42216	NC_011989	AAT	2	6	2462702	2462707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149177
42217	NC_011989	TGA	2	6	2462783	2462788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149177
42218	NC_011989	GA	3	6	2462803	2462808	50 %	0 %	50 %	0 %	222149177
42219	NC_011989	GCT	2	6	2462860	2462865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149177
42220	NC_011989	CGC	2	6	2462871	2462876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149177
42221	NC_011989	GCC	2	6	2462901	2462906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149177
42222	NC_011989	GTC	2	6	2462911	2462916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149177
42223	NC_011989	GCCC	2	8	2463077	2463084	0 %	0 %	25 %	75 %	222149177
42224	NC_011989	GCCGAT	2	12	2463159	2463170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149177
42225	NC_011989	GCC	2	6	2463172	2463177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149177
42226	NC_011989	GCC	2	6	2463216	2463221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149177
42227	NC_011989	ATGGA	2	10	2463304	2463313	40 %	20 %	40 %	0 %	222149177
42228	NC_011989	ATG	2	6	2463358	2463363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149177
42229	NC_011989	GTC	2	6	2464275	2464280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149178
42230	NC_011989	GCC	2	6	2464287	2464292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149178
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42234	NC_011989	CGA	2	6	2464466	2464471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149178
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42343	NC_011989	CGA	2	6	2471189	2471194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149183
42344	NC_011989	ACG	2	6	2471196	2471201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149183
42345	NC_011989	GATC	2	8	2471216	2471223	25 %	25 %	25 %	25 %	222149183
42346	NC_011989	TC	4	8	2471242	2471249	0 %	50 %	0 %	50 %	222149184
42347	NC_011989	AGC	2	6	2471259	2471264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149184
42348	NC_011989	CAC	2	6	2471377	2471382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149184
42349	NC_011989	CGA	2	6	2471479	2471484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149184
42350	NC_011989	AGG	2	6	2471524	2471529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149184
42351	NC_011989	AACC	2	8	2471629	2471636	50 %	0 %	0 %	50 %	222149184
42352	NC_011989	ACC	2	6	2471676	2471681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149184
42353	NC_011989	TCA	2	6	2471745	2471750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149184
42354	NC_011989	ATTGGG	2	12	2471828	2471839	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222149184
42355	NC_011989	GAT	2	6	2471843	2471848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149184
42356	NC_011989	CAC	2	6	2471851	2471856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149184
42357	NC_011989	CAG	2	6	2471975	2471980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149184
42358	NC_011989	GGTCG	2	10	2472107	2472116	0 %	20 %	60 %	20 %	222149184
42359	NC_011989	GCG	2	6	2472169	2472174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149184
42360	NC_011989	GTT	2	6	2472229	2472234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149184
42361	NC_011989	CGCC	2	8	2472235	2472242	0 %	0 %	25 %	75 %	222149184
42362	NC_011989	GACAT	2	10	2472609	2472618	40 %	20 %	20 %	20 %	222149185
42363	NC_011989	CCA	2	6	2472747	2472752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149185
42364	NC_011989	CAGC	2	8	2472770	2472777	25 %	0 %	25 %	50 %	222149185
42365	NC_011989	CCT	2	6	2472889	2472894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149185
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42367	NC_011989	ATCCT	2	10	2472999	2473008	20 %	40 %	0 %	40 %	222149185
42368	NC_011989	TGGA	2	8	2473009	2473016	25 %	25 %	50 %	0 %	222149185
42369	NC_011989	CGC	2	6	2473017	2473022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149185
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42371	NC_011989	CG	3	6	2473110	2473115	0 %	0 %	50 %	50 %	222149185
42372	NC_011989	ATG	2	6	2473272	2473277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149185
42373	NC_011989	CAG	2	6	2473292	2473297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149185
42374	NC_011989	A	7	7	2473670	2473676	100 %	0 %	0 %	0 %	222149186
42375	NC_011989	CAG	2	6	2473831	2473836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149186
42376	NC_011989	CT	3	6	2473854	2473859	0 %	50 %	0 %	50 %	222149186
42377	NC_011989	T	6	6	2473876	2473881	0 %	100 %	0 %	0 %	222149186
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42382	NC_011989	TGC	2	6	2474699	2474704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149187
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42384	NC_011989	CAT	2	6	2474897	2474902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149187
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42402	NC_011989	AG	3	6	2476074	2476079	50 %	0 %	50 %	0 %	222149188
42403	NC_011989	ATCAA	2	10	2476180	2476189	60 %	20 %	0 %	20 %	222149189
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42411	NC_011989	TTCC	2	8	2476658	2476665	0 %	50 %	0 %	50 %	222149190
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42414	NC_011989	CTG	2	6	2476943	2476948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149190
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42443	NC_011989	GCG	2	6	2478314	2478319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149192
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42445	NC_011989	GTG	2	6	2478446	2478451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149192
42446	NC_011989	CAG	2	6	2478463	2478468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149192
42447	NC_011989	CTGG	2	8	2478498	2478505	0 %	25 %	50 %	25 %	222149192
42448	NC_011989	ATG	2	6	2478668	2478673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149192
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42450	NC_011989	ATC	2	6	2478682	2478687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149192
42451	NC_011989	GC	3	6	2478692	2478697	0 %	0 %	50 %	50 %	222149192
42452	NC_011989	CTT	2	6	2478720	2478725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149192
42453	NC_011989	CAC	2	6	2478739	2478744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149192
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