MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_011989	TGA	2	6	1624748	1624753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148457
28002	NC_011989	CGGG	2	8	1624803	1624810	0 %	0 %	75 %	25 %	222148457
28003	NC_011989	GATC	2	8	1624853	1624860	25 %	25 %	25 %	25 %	222148457
28004	NC_011989	GACC	2	8	1624991	1624998	25 %	0 %	25 %	50 %	222148457
28005	NC_011989	CGCCTG	2	12	1625115	1625126	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222148457
28006	NC_011989	GC	3	6	1625237	1625242	0 %	0 %	50 %	50 %	222148458
28007	NC_011989	GAA	2	6	1625375	1625380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148458
28008	NC_011989	GCGCC	2	10	1625413	1625422	0 %	0 %	40 %	60 %	222148458
28009	NC_011989	CGA	2	6	1625461	1625466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148458
28010	NC_011989	GGT	2	6	1625512	1625517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148458
28011	NC_011989	GTCC	2	8	1625529	1625536	0 %	25 %	25 %	50 %	222148458
28012	NC_011989	GC	3	6	1625554	1625559	0 %	0 %	50 %	50 %	222148458
28013	NC_011989	TGC	2	6	1625562	1625567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148458
28014	NC_011989	ATC	2	6	1625660	1625665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148458
28015	NC_011989	CAC	2	6	1625719	1625724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148458
28016	NC_011989	GGC	2	6	1625794	1625799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148458
28017	NC_011989	GCG	2	6	1625820	1625825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148458
28018	NC_011989	TCA	2	6	1625877	1625882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148458
28019	NC_011989	GCT	2	6	1625929	1625934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148458
28020	NC_011989	CGG	2	6	1625935	1625940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148458
28021	NC_011989	TCGG	2	8	1625958	1625965	0 %	25 %	50 %	25 %	222148458
28022	NC_011989	GTG	2	6	1626017	1626022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148458
28023	NC_011989	GCG	2	6	1626026	1626031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148458
28024	NC_011989	CGG	2	6	1626048	1626053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148458
28025	NC_011989	ACA	2	6	1626075	1626080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148458
28026	NC_011989	CTG	2	6	1626158	1626163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148458
28027	NC_011989	GCA	2	6	1626205	1626210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148458
28028	NC_011989	ATCA	2	8	1626263	1626270	50 %	25 %	0 %	25 %	222148458
28029	NC_011989	TAC	2	6	1626329	1626334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148458
28030	NC_011989	GGTCG	2	10	1626343	1626352	0 %	20 %	60 %	20 %	222148458
28031	NC_011989	TGC	2	6	1626366	1626371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148458
28032	NC_011989	CGG	2	6	1626462	1626467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148458
28033	NC_011989	ATG	2	6	1626905	1626910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148459
28034	NC_011989	ATC	2	6	1626928	1626933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148459
28035	NC_011989	TGG	2	6	1626992	1626997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148459
28036	NC_011989	CAT	2	6	1627065	1627070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148459
28037	NC_011989	TGG	2	6	1627089	1627094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148459
28038	NC_011989	TTG	2	6	1627223	1627228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148459
28039	NC_011989	CAT	3	9	1627254	1627262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148459
28040	NC_011989	AGC	2	6	1627294	1627299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148459
28041	NC_011989	GCG	2	6	1627300	1627305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148459
28042	NC_011989	GCT	2	6	1627329	1627334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148459
28043	NC_011989	GGC	2	6	1627343	1627348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148459
28044	NC_011989	GCG	2	6	1627980	1627985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148460
28045	NC_011989	CGT	2	6	1627994	1627999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148460
28046	NC_011989	ATG	2	6	1628004	1628009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148460
28047	NC_011989	TC	3	6	1628126	1628131	0 %	50 %	0 %	50 %	222148460
28048	NC_011989	GCA	2	6	1628149	1628154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148460
28049	NC_011989	TAT	2	6	1628163	1628168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222148460
28050	NC_011989	GGCAC	2	10	1628187	1628196	20 %	0 %	40 %	40 %	222148460
28051	NC_011989	GGC	2	6	1628208	1628213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148460
28052	NC_011989	TTC	2	6	1628256	1628261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148460
28053	NC_011989	AGCG	2	8	1628296	1628303	25 %	0 %	50 %	25 %	222148460
28054	NC_011989	CCTG	2	8	1628391	1628398	0 %	25 %	25 %	50 %	222148461
28055	NC_011989	GCCT	2	8	1628466	1628473	0 %	25 %	25 %	50 %	222148461
28056	NC_011989	TTCA	2	8	1628540	1628547	25 %	50 %	0 %	25 %	222148461
28057	NC_011989	GCG	2	6	1628587	1628592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148461
28058	NC_011989	GCG	2	6	1628612	1628617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148461
28059	NC_011989	CGGA	2	8	1628697	1628704	25 %	0 %	50 %	25 %	222148461
28060	NC_011989	CAT	2	6	1628778	1628783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148462
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28062	NC_011989	CGGT	2	8	1628881	1628888	0 %	25 %	50 %	25 %	222148462
28063	NC_011989	TC	3	6	1628890	1628895	0 %	50 %	0 %	50 %	222148462
28064	NC_011989	GGA	2	6	1628907	1628912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222148462
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28066	NC_011989	GATTG	2	10	1628950	1628959	20 %	40 %	40 %	0 %	222148462
28067	NC_011989	TCG	2	6	1628971	1628976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148462
28068	NC_011989	CT	3	6	1628977	1628982	0 %	50 %	0 %	50 %	222148462
28069	NC_011989	GCAT	2	8	1629116	1629123	25 %	25 %	25 %	25 %	222148462
28070	NC_011989	GC	3	6	1629159	1629164	0 %	0 %	50 %	50 %	222148462
28071	NC_011989	T	6	6	1629974	1629979	0 %	100 %	0 %	0 %	222148463
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28074	NC_011989	CGA	2	6	1630117	1630122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148463
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28076	NC_011989	GGC	2	6	1630344	1630349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148463
28077	NC_011989	TCGA	2	8	1630356	1630363	25 %	25 %	25 %	25 %	222148463
28078	NC_011989	ACG	2	6	1630392	1630397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148463
28079	NC_011989	CGA	2	6	1630537	1630542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148463
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28084	NC_011989	ATA	2	6	1630721	1630726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222148463
28085	NC_011989	ATC	2	6	1630728	1630733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148463
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28087	NC_011989	GGCG	2	8	1631032	1631039	0 %	0 %	75 %	25 %	222148464
28088	NC_011989	GATTG	2	10	1631059	1631068	20 %	40 %	40 %	0 %	222148464
28089	NC_011989	TCCCGT	2	12	1631143	1631154	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222148464
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28098	NC_011989	GAT	2	6	1631506	1631511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148464
28099	NC_011989	TCG	2	6	1631585	1631590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148464
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28101	NC_011989	TCG	2	6	1631670	1631675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148464
28102	NC_011989	AGC	2	6	1631750	1631755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148464
28103	NC_011989	CGC	2	6	1631802	1631807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148464
28104	NC_011989	CAG	2	6	1631826	1631831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148465
28105	NC_011989	CAT	2	6	1631846	1631851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148465
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28107	NC_011989	CGCGT	2	10	1631965	1631974	0 %	20 %	40 %	40 %	222148465
28108	NC_011989	CGT	2	6	1631990	1631995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148465
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28110	NC_011989	GCG	2	6	1632035	1632040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148465
28111	NC_011989	CCAT	2	8	1632058	1632065	25 %	25 %	0 %	50 %	222148465
28112	NC_011989	GC	3	6	1632068	1632073	0 %	0 %	50 %	50 %	222148465
28113	NC_011989	GAC	2	6	1632084	1632089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148465
28114	NC_011989	GAT	2	6	1632156	1632161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148465
28115	NC_011989	TGA	2	6	1632254	1632259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148465
28116	NC_011989	TCA	2	6	1632260	1632265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148465
28117	NC_011989	TTG	2	6	1632304	1632309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148465
28118	NC_011989	ACC	3	9	1632322	1632330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148465
28119	NC_011989	GC	3	6	1632345	1632350	0 %	0 %	50 %	50 %	222148465
28120	NC_011989	GGT	2	6	1632417	1632422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148465
28121	NC_011989	TCG	2	6	1632463	1632468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148465
28122	NC_011989	CGA	2	6	1632575	1632580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148465
28123	NC_011989	CGG	2	6	1632620	1632625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148465
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28127	NC_011989	GCTC	2	8	1632950	1632957	0 %	25 %	25 %	50 %	222148466
28128	NC_011989	GCT	2	6	1632965	1632970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148466
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28134	NC_011989	TTC	2	6	1633470	1633475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148466
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28222	NC_011989	CCAT	2	8	1638405	1638412	25 %	25 %	0 %	50 %	222148471
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