MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_011989	TCT	2	6	1281064	1281069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148143
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22115	NC_011989	CCGA	2	8	1287356	1287363	25 %	0 %	25 %	50 %	222148150
22116	NC_011989	GTC	2	6	1287528	1287533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148150
22117	NC_011989	TGTT	2	8	1287543	1287550	0 %	75 %	25 %	0 %	222148150
22118	NC_011989	GCGT	2	8	1287605	1287612	0 %	25 %	50 %	25 %	222148150
22119	NC_011989	CTG	2	6	1287701	1287706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148150
22120	NC_011989	GCG	2	6	1287726	1287731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148150
22121	NC_011989	TCG	2	6	1287810	1287815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148150
22122	NC_011989	CCG	2	6	1287881	1287886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148150
22123	NC_011989	GAC	3	9	1287920	1287928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148150
22124	NC_011989	CAA	2	6	1288006	1288011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148150
22125	NC_011989	GCG	2	6	1288014	1288019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148150
22126	NC_011989	TCA	2	6	1288042	1288047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148150
22127	NC_011989	TCG	2	6	1288737	1288742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148151
22128	NC_011989	CTT	2	6	1288781	1288786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148151
22129	NC_011989	GACC	2	8	1288811	1288818	25 %	0 %	25 %	50 %	222148151
22130	NC_011989	TCCG	2	8	1288956	1288963	0 %	25 %	25 %	50 %	222148151
22131	NC_011989	CG	3	6	1288962	1288967	0 %	0 %	50 %	50 %	222148151
22132	NC_011989	CTG	2	6	1289059	1289064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148151
22133	NC_011989	GAG	2	6	1289103	1289108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222148151
22134	NC_011989	GCC	2	6	1289216	1289221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148151
22135	NC_011989	CGGC	2	8	1289310	1289317	0 %	0 %	50 %	50 %	222148151
22136	NC_011989	TCG	2	6	1289325	1289330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148151
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22138	NC_011989	GC	3	6	1289380	1289385	0 %	0 %	50 %	50 %	222148151
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22140	NC_011989	ATCG	2	8	1289427	1289434	25 %	25 %	25 %	25 %	222148151
22141	NC_011989	CG	3	6	1289514	1289519	0 %	0 %	50 %	50 %	222148151
22142	NC_011989	TTCCA	2	10	1289568	1289577	20 %	40 %	0 %	40 %	222148151
22143	NC_011989	CGTT	2	8	1289622	1289629	0 %	50 %	25 %	25 %	222148151
22144	NC_011989	ATA	2	6	1289726	1289731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222148151
22145	NC_011989	GCT	2	6	1289761	1289766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148151
22146	NC_011989	GC	3	6	1289817	1289822	0 %	0 %	50 %	50 %	222148151
22147	NC_011989	GTGC	2	8	1289907	1289914	0 %	25 %	50 %	25 %	222148151
22148	NC_011989	GTT	2	6	1289918	1289923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148151
22149	NC_011989	GTG	2	6	1290024	1290029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148151
22150	NC_011989	ATCC	2	8	1290088	1290095	25 %	25 %	0 %	50 %	222148151
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22152	NC_011989	CTGG	2	8	1290134	1290141	0 %	25 %	50 %	25 %	222148151
22153	NC_011989	ACCC	2	8	1290145	1290152	25 %	0 %	0 %	75 %	222148151
22154	NC_011989	GC	3	6	1290332	1290337	0 %	0 %	50 %	50 %	222148151
22155	NC_011989	ATC	2	6	1290462	1290467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148151
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22158	NC_011989	CGT	2	6	1290518	1290523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148151
22159	NC_011989	GTC	2	6	1290560	1290565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148151
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22194	NC_011989	GC	3	6	1292310	1292315	0 %	0 %	50 %	50 %	222148153
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22200	NC_011989	T	6	6	1292756	1292761	0 %	100 %	0 %	0 %	222148153
22201	NC_011989	GA	3	6	1292776	1292781	50 %	0 %	50 %	0 %	222148153
22202	NC_011989	ATC	2	6	1292803	1292808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148153
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22213	NC_011989	AAG	2	6	1293189	1293194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148153
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22217	NC_011989	GAT	2	6	1293546	1293551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148154
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22219	NC_011989	CCG	2	6	1293643	1293648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148154
22220	NC_011989	GGCC	2	8	1293673	1293680	0 %	0 %	50 %	50 %	222148154
22221	NC_011989	CAG	2	6	1293708	1293713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148154
22222	NC_011989	CAG	2	6	1293735	1293740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148154
22223	NC_011989	CTG	2	6	1293768	1293773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148154
22224	NC_011989	GGC	2	6	1293777	1293782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148154
22225	NC_011989	GC	3	6	1293781	1293786	0 %	0 %	50 %	50 %	222148154
22226	NC_011989	CCA	2	6	1293812	1293817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148154
22227	NC_011989	CAC	2	6	1293831	1293836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148154
22228	NC_011989	CG	3	6	1293884	1293889	0 %	0 %	50 %	50 %	222148154
22229	NC_011989	GCC	2	6	1293900	1293905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148154
22230	NC_011989	ACC	2	6	1293997	1294002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148154
22231	NC_011989	AGC	2	6	1294003	1294008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148154
22232	NC_011989	GGC	2	6	1294032	1294037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148154
22233	NC_011989	AGG	2	6	1294046	1294051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222148154
22234	NC_011989	AT	3	6	1294088	1294093	50 %	50 %	0 %	0 %	222148154
22235	NC_011989	TTCG	2	8	1294178	1294185	0 %	50 %	25 %	25 %	222148154
22236	NC_011989	CAT	2	6	1294202	1294207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148154
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22239	NC_011989	GGC	2	6	1294601	1294606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148155
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22244	NC_011989	GGC	3	9	1294787	1294795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148155
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22246	NC_011989	GC	3	6	1294895	1294900	0 %	0 %	50 %	50 %	222148155
22247	NC_011989	GAT	2	6	1294911	1294916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148155
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22252	NC_011989	TGT	2	6	1295030	1295035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148155
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22258	NC_011989	CCGC	2	8	1295216	1295223	0 %	0 %	25 %	75 %	222148155
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22261	NC_011989	CGG	2	6	1295309	1295314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148155
22262	NC_011989	CTG	2	6	1295329	1295334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148155
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22333	NC_011989	TGGT	2	8	1299635	1299642	0 %	50 %	50 %	0 %	222148158
22334	NC_011989	TCG	2	6	1299647	1299652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148158
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22346	NC_011989	GCTT	2	8	1300193	1300200	0 %	50 %	25 %	25 %	222148158
22347	NC_011989	GGCCTT	2	12	1300210	1300221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148158
22348	NC_011989	GC	3	6	1300252	1300257	0 %	0 %	50 %	50 %	222148158
22349	NC_011989	TCG	2	6	1300292	1300297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148158
22350	NC_011989	GCC	2	6	1300330	1300335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148158
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22352	NC_011989	TGA	4	12	1300413	1300424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148158
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22458	NC_011989	CCG	2	6	1305478	1305483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148164
22459	NC_011989	GC	4	8	1305516	1305523	0 %	0 %	50 %	50 %	222148164
22460	NC_011989	GTC	2	6	1305590	1305595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148164
22461	NC_011989	TGA	2	6	1305631	1305636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148164
22462	NC_011989	AGC	3	9	1305648	1305656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148164
22463	NC_011989	GGC	2	6	1305736	1305741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148164
22464	NC_011989	CTT	2	6	1305764	1305769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148164
22465	NC_011989	CGTCGC	2	12	1305799	1305810	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222148164
22466	NC_011989	TCA	2	6	1305814	1305819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148164
22467	NC_011989	TTG	2	6	1305837	1305842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148164
22468	NC_011989	CGG	2	6	1305923	1305928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148164
22469	NC_011989	TCT	2	6	1305987	1305992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148164
22470	NC_011989	GCC	2	6	1306010	1306015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148164
22471	NC_011989	GCT	2	6	1306021	1306026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148164
22472	NC_011989	CAAAT	2	10	1306070	1306079	60 %	20 %	0 %	20 %	222148165
22473	NC_011989	AAAG	2	8	1306131	1306138	75 %	0 %	25 %	0 %	222148165
22474	NC_011989	TTC	2	6	1306156	1306161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148165
22475	NC_011989	CGCT	2	8	1306226	1306233	0 %	25 %	25 %	50 %	222148165
22476	NC_011989	GGGCCG	2	12	1306244	1306255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148165
22477	NC_011989	TCG	2	6	1306302	1306307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148165
22478	NC_011989	GAT	2	6	1306378	1306383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148165
22479	NC_011989	GCG	2	6	1306475	1306480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148165
22480	NC_011989	GTC	2	6	1306510	1306515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148165
22481	NC_011989	TTG	2	6	1306532	1306537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148165
22482	NC_011989	CAG	2	6	1306540	1306545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148165
22483	NC_011989	GCC	2	6	1306636	1306641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148165
22484	NC_011989	CTG	2	6	1306654	1306659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148165
22485	NC_011989	ATGG	2	8	1306696	1306703	25 %	25 %	50 %	0 %	222148165
22486	NC_011989	TGGCC	2	10	1306740	1306749	0 %	20 %	40 %	40 %	222148165
22487	NC_011989	TGC	2	6	1306777	1306782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148165
22488	NC_011989	GGGC	2	8	1306806	1306813	0 %	0 %	75 %	25 %	222148165
22489	NC_011989	CTG	2	6	1307262	1307267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148166
22490	NC_011989	CGG	2	6	1307380	1307385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148166
22491	NC_011989	GCA	2	6	1307418	1307423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148166
22492	NC_011989	CGG	2	6	1307443	1307448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148166
22493	NC_011989	GGC	2	6	1307459	1307464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148166
22494	NC_011989	ACA	2	6	1307466	1307471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148166
22495	NC_011989	GGT	2	6	1307495	1307500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148166
22496	NC_011989	CGGT	2	8	1307703	1307710	0 %	25 %	50 %	25 %	222148166
22497	NC_011989	CAA	2	6	1307734	1307739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148166
22498	NC_011989	CAC	2	6	1307743	1307748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148166
22499	NC_011989	ACA	2	6	1307790	1307795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148166
22500	NC_011989	GGT	2	6	1307798	1307803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148166

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