MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_011989	GAA	2	6	1222733	1222738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148084
21002	NC_011989	TGA	2	6	1222788	1222793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148084
21003	NC_011989	CGG	2	6	1222803	1222808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148084
21004	NC_011989	CTG	2	6	1222835	1222840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148084
21005	NC_011989	GCT	2	6	1222843	1222848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148084
21006	NC_011989	ATT	2	6	1222892	1222897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222148084
21007	NC_011989	CGC	2	6	1223065	1223070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148084
21008	NC_011989	CTT	2	6	1223093	1223098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148084
21009	NC_011989	CG	3	6	1223220	1223225	0 %	0 %	50 %	50 %	222148084
21010	NC_011989	CG	4	8	1223242	1223249	0 %	0 %	50 %	50 %	222148084
21011	NC_011989	GGC	2	6	1223263	1223268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148084
21012	NC_011989	TGCG	2	8	1223366	1223373	0 %	25 %	50 %	25 %	222148085
21013	NC_011989	TCCA	2	8	1223413	1223420	25 %	25 %	0 %	50 %	222148085
21014	NC_011989	GCA	2	6	1224211	1224216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148086
21015	NC_011989	GCG	2	6	1224218	1224223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148086
21016	NC_011989	TGT	2	6	1224258	1224263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148086
21017	NC_011989	CCG	2	6	1224307	1224312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148086
21018	NC_011989	TCC	2	6	1224337	1224342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148086
21019	NC_011989	CGAG	2	8	1224437	1224444	25 %	0 %	50 %	25 %	222148086
21020	NC_011989	GTG	2	6	1224451	1224456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148086
21021	NC_011989	TGC	2	6	1224686	1224691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148086
21022	NC_011989	ATC	2	6	1224693	1224698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148086
21023	NC_011989	CCA	2	6	1224791	1224796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148086
21024	NC_011989	CG	3	6	1224862	1224867	0 %	0 %	50 %	50 %	222148086
21025	NC_011989	GA	3	6	1224895	1224900	50 %	0 %	50 %	0 %	222148086
21026	NC_011989	GTC	2	6	1225051	1225056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148087
21027	NC_011989	GAGCC	2	10	1225103	1225112	20 %	0 %	40 %	40 %	222148087
21028	NC_011989	GC	3	6	1225132	1225137	0 %	0 %	50 %	50 %	222148087
21029	NC_011989	ACC	2	6	1225145	1225150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148087
21030	NC_011989	TGC	2	6	1225260	1225265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148087
21031	NC_011989	TGTC	2	8	1225277	1225284	0 %	50 %	25 %	25 %	222148087
21032	NC_011989	CTTT	2	8	1225305	1225312	0 %	75 %	0 %	25 %	222148087
21033	NC_011989	GCA	3	9	1225374	1225382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148087
21034	NC_011989	CGC	2	6	1225407	1225412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148087
21035	NC_011989	ATC	2	6	1225550	1225555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148087
21036	NC_011989	TCT	2	6	1225562	1225567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148087
21037	NC_011989	CTG	2	6	1225587	1225592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148087
21038	NC_011989	TTC	2	6	1225926	1225931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148088
21039	NC_011989	TCG	2	6	1225942	1225947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148088
21040	NC_011989	GTC	2	6	1225950	1225955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148088
21041	NC_011989	GAA	2	6	1226014	1226019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148088
21042	NC_011989	GCC	2	6	1226071	1226076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148088
21043	NC_011989	ATG	2	6	1226107	1226112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148088
21044	NC_011989	GAA	2	6	1226203	1226208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148088
21045	NC_011989	GAA	2	6	1226239	1226244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148088
21046	NC_011989	GAT	2	6	1226278	1226283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148088
21047	NC_011989	CCT	2	6	1226329	1226334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148088
21048	NC_011989	GAT	3	9	1226337	1226345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148088
21049	NC_011989	GGT	2	6	1226356	1226361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148088
21050	NC_011989	ATG	2	6	1226389	1226394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148088
21051	NC_011989	CAG	2	6	1226403	1226408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148088
21052	NC_011989	GAT	2	6	1226434	1226439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148088
21053	NC_011989	GGC	2	6	1226485	1226490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148088
21054	NC_011989	CGA	2	6	1226496	1226501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148088
21055	NC_011989	CCG	2	6	1226522	1226527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148088
21056	NC_011989	TC	3	6	1226758	1226763	0 %	50 %	0 %	50 %	222148089
21057	NC_011989	GCA	2	6	1226783	1226788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148089
21058	NC_011989	T	6	6	1226829	1226834	0 %	100 %	0 %	0 %	222148089
21059	NC_011989	CGC	2	6	1226838	1226843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148089
21060	NC_011989	C	6	6	1226853	1226858	0 %	0 %	0 %	100 %	222148089
21061	NC_011989	CCA	2	6	1226885	1226890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148089
21062	NC_011989	CAG	2	6	1227030	1227035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148089
21063	NC_011989	ATGA	2	8	1227066	1227073	50 %	25 %	25 %	0 %	222148089
21064	NC_011989	CAG	2	6	1227204	1227209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148089
21065	NC_011989	ATC	2	6	1227214	1227219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148089
21066	NC_011989	GAC	2	6	1227270	1227275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148089
21067	NC_011989	T	6	6	1227305	1227310	0 %	100 %	0 %	0 %	222148090
21068	NC_011989	TGGC	2	8	1227379	1227386	0 %	25 %	50 %	25 %	222148090
21069	NC_011989	GCA	2	6	1227400	1227405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148090
21070	NC_011989	CGG	2	6	1227409	1227414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148090
21071	NC_011989	GGC	2	6	1227491	1227496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148090
21072	NC_011989	GATG	2	8	1227565	1227572	25 %	25 %	50 %	0 %	222148090
21073	NC_011989	GCC	2	6	1227573	1227578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148090
21074	NC_011989	GCC	3	9	1227605	1227613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148090
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21076	NC_011989	GCA	2	6	1227670	1227675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148090
21077	NC_011989	GCG	2	6	1227716	1227721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148090
21078	NC_011989	GGCCA	2	10	1227806	1227815	20 %	0 %	40 %	40 %	222148090
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21081	NC_011989	CATCG	2	10	1228032	1228041	20 %	20 %	20 %	40 %	222148091
21082	NC_011989	CAG	2	6	1228157	1228162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148091
21083	NC_011989	CGG	3	9	1228177	1228185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148091
21084	NC_011989	AGC	2	6	1228232	1228237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148091
21085	NC_011989	CTT	2	6	1228239	1228244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148091
21086	NC_011989	AAACG	2	10	1228245	1228254	60 %	0 %	20 %	20 %	222148091
21087	NC_011989	AGC	2	6	1228270	1228275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148091
21088	NC_011989	CGT	2	6	1228277	1228282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148091
21089	NC_011989	ATC	2	6	1228365	1228370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148091
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21097	NC_011989	G	6	6	1228631	1228636	0 %	0 %	100 %	0 %	222148091
21098	NC_011989	GGC	2	6	1228653	1228658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148091
21099	NC_011989	TTG	2	6	1228699	1228704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148091
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21102	NC_011989	GCA	2	6	1229063	1229068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148092
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21104	NC_011989	ATG	2	6	1229191	1229196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148092
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21106	NC_011989	GC	4	8	1229309	1229316	0 %	0 %	50 %	50 %	222148092
21107	NC_011989	CCA	2	6	1229348	1229353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148092
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21109	NC_011989	CGG	2	6	1229459	1229464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148092
21110	NC_011989	CTG	2	6	1229472	1229477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148092
21111	NC_011989	GC	3	6	1229492	1229497	0 %	0 %	50 %	50 %	222148092
21112	NC_011989	TCGGA	2	10	1229501	1229510	20 %	20 %	40 %	20 %	222148092
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21115	NC_011989	CTG	2	6	1229562	1229567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148092
21116	NC_011989	CGC	2	6	1229568	1229573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148092
21117	NC_011989	GCC	2	6	1229583	1229588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148092
21118	NC_011989	CTG	2	6	1229611	1229616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148092
21119	NC_011989	GCCAT	2	10	1229904	1229913	20 %	20 %	20 %	40 %	222148093
21120	NC_011989	GTC	2	6	1229972	1229977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148093
21121	NC_011989	GCG	2	6	1229987	1229992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148093
21122	NC_011989	GC	3	6	1230113	1230118	0 %	0 %	50 %	50 %	222148094
21123	NC_011989	GCG	2	6	1230177	1230182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148094
21124	NC_011989	TGC	2	6	1230312	1230317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148094
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21127	NC_011989	GCT	2	6	1230609	1230614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148095
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21130	NC_011989	CCAGC	2	10	1230695	1230704	20 %	0 %	20 %	60 %	222148095
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21135	NC_011989	CGG	3	9	1230940	1230948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148095
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21142	NC_011989	CTG	2	6	1231310	1231315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148096
21143	NC_011989	CTG	2	6	1231367	1231372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148096
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21146	NC_011989	CCCA	2	8	1231523	1231530	25 %	0 %	0 %	75 %	222148096
21147	NC_011989	GGT	2	6	1231550	1231555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148096
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21154	NC_011989	CTT	2	6	1232028	1232033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148097
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21225	NC_011989	ATA	2	6	1235811	1235816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222148100
21226	NC_011989	ACC	2	6	1235869	1235874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148100
21227	NC_011989	ATGC	2	8	1235979	1235986	25 %	25 %	25 %	25 %	222148100
21228	NC_011989	T	6	6	1236198	1236203	0 %	100 %	0 %	0 %	222148101
21229	NC_011989	TCG	2	6	1236303	1236308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148101
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21232	NC_011989	GCG	2	6	1236399	1236404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148101
21233	NC_011989	CGG	2	6	1236418	1236423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148101
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21342	NC_011989	CTCG	2	8	1242813	1242820	0 %	25 %	25 %	50 %	222148106
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21345	NC_011989	ATC	2	6	1242975	1242980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148106
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21347	NC_011989	GGC	2	6	1243047	1243052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148106
21348	NC_011989	CCGAG	2	10	1243133	1243142	20 %	0 %	40 %	40 %	222148106
21349	NC_011989	AAT	2	6	1243151	1243156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222148106
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21352	NC_011989	TGC	2	6	1243317	1243322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148107
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21360	NC_011989	A	6	6	1243723	1243728	100 %	0 %	0 %	0 %	222148107
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21363	NC_011989	CGA	2	6	1243872	1243877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148108
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21402	NC_011989	GCTT	2	8	1245778	1245785	0 %	50 %	25 %	25 %	222148112
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21432	NC_011989	GCG	2	6	1247848	1247853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148113
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21452	NC_011989	CG	3	6	1249370	1249375	0 %	0 %	50 %	50 %	222148114
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21462	NC_011989	CGG	2	6	1249943	1249948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148115
21463	NC_011989	ATCGG	2	10	1249959	1249968	20 %	20 %	40 %	20 %	222148115
21464	NC_011989	GTT	2	6	1249971	1249976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148115
21465	NC_011989	GCC	2	6	1250166	1250171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148115
21466	NC_011989	TCG	2	6	1250212	1250217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148115
21467	NC_011989	CGAC	2	8	1250320	1250327	25 %	0 %	25 %	50 %	222148115
21468	NC_011989	ACC	2	6	1250370	1250375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148115
21469	NC_011989	GC	3	6	1250442	1250447	0 %	0 %	50 %	50 %	222148115
21470	NC_011989	GGT	3	9	1250462	1250470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148115
21471	NC_011989	CAA	2	6	1250483	1250488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148115
21472	NC_011989	TGA	2	6	1250527	1250532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148115
21473	NC_011989	TCA	2	6	1250533	1250538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148115
21474	NC_011989	ATC	2	6	1250631	1250636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148115
21475	NC_011989	CGG	2	6	1250672	1250677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148115
21476	NC_011989	CGT	2	6	1250702	1250707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148115
21477	NC_011989	GC	3	6	1250719	1250724	0 %	0 %	50 %	50 %	222148115
21478	NC_011989	GATG	2	8	1250726	1250733	25 %	25 %	50 %	0 %	222148115
21479	NC_011989	GACC	2	8	1250780	1250787	25 %	0 %	25 %	50 %	222148115
21480	NC_011989	ACG	2	6	1250797	1250802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148115
21481	NC_011989	CGACG	2	10	1250816	1250825	20 %	0 %	40 %	40 %	222148115
21482	NC_011989	TGG	3	9	1250913	1250921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148115
21483	NC_011989	CTG	2	6	1250961	1250966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148115
21484	NC_011989	GCG	2	6	1250985	1250990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148116
21485	NC_011989	GCT	2	6	1251037	1251042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148116
21486	NC_011989	CGA	2	6	1251117	1251122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148116
21487	NC_011989	ATT	2	6	1251158	1251163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222148116
21488	NC_011989	CGA	2	6	1251202	1251207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148116
21489	NC_011989	ATC	2	6	1251281	1251286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148116
21490	NC_011989	GCA	2	6	1251315	1251320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148116
21491	NC_011989	GCA	2	6	1251375	1251380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148116
21492	NC_011989	GGC	2	6	1251403	1251408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148116
21493	NC_011989	CTG	2	6	1251473	1251478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148116
21494	NC_011989	GGCT	2	8	1251489	1251496	0 %	25 %	50 %	25 %	222148116
21495	NC_011989	GTG	2	6	1251518	1251523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148116
21496	NC_011989	CTG	2	6	1251593	1251598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148116
21497	NC_011989	GCC	2	6	1251608	1251613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148116
21498	NC_011989	ACGGGA	2	12	1251638	1251649	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222148116
21499	NC_011989	CAATC	2	10	1251724	1251733	40 %	20 %	0 %	40 %	222148116
21500	NC_011989	CGCC	2	8	1251753	1251760	0 %	0 %	25 %	75 %	222148116

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