MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011989	CTG	2	6	1138014	1138019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148020
19502	NC_011989	CCT	2	6	1138039	1138044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148020
19503	NC_011989	GAC	2	6	1138049	1138054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148020
19504	NC_011989	GCA	2	6	1138060	1138065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148020
19505	NC_011989	GCTT	2	8	1138069	1138076	0 %	50 %	25 %	25 %	222148020
19506	NC_011989	CCA	2	6	1138084	1138089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148020
19507	NC_011989	GCTC	2	8	1138096	1138103	0 %	25 %	25 %	50 %	222148020
19508	NC_011989	GGC	2	6	1138122	1138127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148020
19509	NC_011989	ACA	2	6	1138156	1138161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148020
19510	NC_011989	GGC	2	6	1138181	1138186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148020
19511	NC_011989	CGG	2	6	1138214	1138219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148020
19512	NC_011989	GTG	2	6	1138260	1138265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148020
19513	NC_011989	GCC	2	6	1138300	1138305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148020
19514	NC_011989	TGC	2	6	1138679	1138684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19515	NC_011989	GCA	2	6	1138712	1138717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19516	NC_011989	CGGG	3	12	1138791	1138802	0 %	0 %	75 %	25 %	222148021
19517	NC_011989	CCG	2	6	1138810	1138815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148021
19518	NC_011989	CGC	2	6	1138848	1138853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148021
19519	NC_011989	GCC	2	6	1138860	1138865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148021
19520	NC_011989	TGA	2	6	1138874	1138879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148021
19521	NC_011989	GTT	2	6	1138941	1138946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148021
19522	NC_011989	CTG	2	6	1138947	1138952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19523	NC_011989	CAG	2	6	1138957	1138962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19524	NC_011989	TGA	2	6	1139096	1139101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148021
19525	NC_011989	ATCT	2	8	1139130	1139137	25 %	50 %	0 %	25 %	222148021
19526	NC_011989	CAA	2	6	1139139	1139144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148021
19527	NC_011989	GTG	2	6	1139256	1139261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148021
19528	NC_011989	GCC	2	6	1139268	1139273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148021
19529	NC_011989	GCC	2	6	1139322	1139327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148021
19530	NC_011989	TAT	2	6	1139328	1139333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222148021
19531	NC_011989	CTGGCG	2	12	1139334	1139345	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222148021
19532	NC_011989	CGA	2	6	1139366	1139371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19533	NC_011989	CGCC	2	8	1139438	1139445	0 %	0 %	25 %	75 %	222148021
19534	NC_011989	TGC	3	9	1139468	1139476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19535	NC_011989	TGC	2	6	1139504	1139509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19536	NC_011989	GAT	2	6	1139555	1139560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148021
19537	NC_011989	AAT	2	6	1139607	1139612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222148021
19538	NC_011989	GCAAG	2	10	1139720	1139729	40 %	0 %	40 %	20 %	222148021
19539	NC_011989	GCA	2	6	1139747	1139752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148021
19540	NC_011989	GAG	2	6	1139769	1139774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222148021
19541	NC_011989	TCA	2	6	1139832	1139837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148022
19542	NC_011989	TGG	2	6	1139838	1139843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148022
19543	NC_011989	TGG	2	6	1139955	1139960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148022
19544	NC_011989	AGGGC	2	10	1140073	1140082	20 %	0 %	60 %	20 %	222148022
19545	NC_011989	GTG	2	6	1140083	1140088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148022
19546	NC_011989	GT	3	6	1140096	1140101	0 %	50 %	50 %	0 %	222148022
19547	NC_011989	GGC	2	6	1140110	1140115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148022
19548	NC_011989	ACG	2	6	1140150	1140155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148022
19549	NC_011989	GAAG	2	8	1140169	1140176	50 %	0 %	50 %	0 %	222148022
19550	NC_011989	GAA	2	6	1140190	1140195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148022
19551	NC_011989	GCTGGC	2	12	1140261	1140272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222148023
19552	NC_011989	CGC	2	6	1140273	1140278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148023
19553	NC_011989	GC	3	6	1140310	1140315	0 %	0 %	50 %	50 %	222148023
19554	NC_011989	ATG	2	6	1140331	1140336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148023
19555	NC_011989	GCT	2	6	1140429	1140434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19556	NC_011989	CACT	2	8	1140454	1140461	25 %	25 %	0 %	50 %	222148023
19557	NC_011989	CGG	2	6	1140485	1140490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19558	NC_011989	GAT	2	6	1140513	1140518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148023
19559	NC_011989	TGG	2	6	1140554	1140559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148023
19560	NC_011989	GCA	2	6	1140569	1140574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19561	NC_011989	CCG	2	6	1140745	1140750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148023
19562	NC_011989	CTG	2	6	1140751	1140756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19563	NC_011989	GCC	2	6	1140802	1140807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148023
19564	NC_011989	GC	3	6	1140838	1140843	0 %	0 %	50 %	50 %	222148023
19565	NC_011989	GGC	2	6	1140864	1140869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19566	NC_011989	CGG	2	6	1140884	1140889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19567	NC_011989	GCTGG	2	10	1140924	1140933	0 %	20 %	60 %	20 %	222148023
19568	NC_011989	GGC	2	6	1140934	1140939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19569	NC_011989	TGG	2	6	1140940	1140945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148023
19570	NC_011989	CCT	2	6	1140968	1140973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148023
19571	NC_011989	CTGG	2	8	1140981	1140988	0 %	25 %	50 %	25 %	222148023
19572	NC_011989	TGC	2	6	1141055	1141060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19573	NC_011989	TCGCTG	2	12	1141078	1141089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19574	NC_011989	CATCCT	2	12	1141176	1141187	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222148023
19575	NC_011989	CGG	2	6	1141194	1141199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19576	NC_011989	TGC	2	6	1141217	1141222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19577	NC_011989	GC	4	8	1141221	1141228	0 %	0 %	50 %	50 %	222148023
19578	NC_011989	GGCG	2	8	1141239	1141246	0 %	0 %	75 %	25 %	222148023
19579	NC_011989	CG	3	6	1141265	1141270	0 %	0 %	50 %	50 %	222148023
19580	NC_011989	GCT	3	9	1141344	1141352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19581	NC_011989	CTT	2	6	1141392	1141397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148023
19582	NC_011989	TGA	2	6	1141418	1141423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148023
19583	NC_011989	CTC	2	6	1141429	1141434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148023
19584	NC_011989	CCGTT	2	10	1141439	1141448	0 %	40 %	20 %	40 %	222148023
19585	NC_011989	GCG	2	6	1141472	1141477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19586	NC_011989	CTG	2	6	1141480	1141485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19587	NC_011989	TGG	2	6	1141508	1141513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148023
19588	NC_011989	TAT	2	6	1141546	1141551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222148023
19589	NC_011989	GGC	2	6	1141561	1141566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19590	NC_011989	CCG	2	6	1141677	1141682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148023
19591	NC_011989	TTG	2	6	1141757	1141762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148023
19592	NC_011989	CAC	2	6	1141767	1141772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148023
19593	NC_011989	TGG	3	9	1141787	1141795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148023
19594	NC_011989	CGGCG	2	10	1141906	1141915	0 %	0 %	60 %	40 %	222148023
19595	NC_011989	TG	3	6	1141932	1141937	0 %	50 %	50 %	0 %	222148023
19596	NC_011989	GTC	2	6	1141938	1141943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148023
19597	NC_011989	ACC	2	6	1141975	1141980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148023
19598	NC_011989	CAGC	2	8	1142007	1142014	25 %	0 %	25 %	50 %	222148023
19599	NC_011989	CGG	2	6	1142046	1142051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19600	NC_011989	TGG	2	6	1142054	1142059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148023
19601	NC_011989	TGG	2	6	1142068	1142073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148023
19602	NC_011989	GGGGC	2	10	1142096	1142105	0 %	0 %	80 %	20 %	222148023
19603	NC_011989	TGA	3	9	1142111	1142119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148023
19604	NC_011989	CGG	2	6	1142121	1142126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
19605	NC_011989	AAGGCA	2	12	1142176	1142187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222148023
19606	NC_011989	GGC	2	6	1142190	1142195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148023
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19608	NC_011989	TGC	2	6	1142509	1142514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148024
19609	NC_011989	TGC	2	6	1142542	1142547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148024
19610	NC_011989	GC	3	6	1142554	1142559	0 %	0 %	50 %	50 %	222148024
19611	NC_011989	TTG	2	6	1142572	1142577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148024
19612	NC_011989	GCC	2	6	1142605	1142610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148024
19613	NC_011989	GCG	2	6	1142628	1142633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148024
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19615	NC_011989	CGCC	2	8	1143452	1143459	0 %	0 %	25 %	75 %	222148025
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19617	NC_011989	GCA	2	6	1143489	1143494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148025
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19731	NC_011989	GCC	2	6	1148950	1148955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148028
19732	NC_011989	GCC	2	6	1148966	1148971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148028
19733	NC_011989	GCC	2	6	1149109	1149114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148028
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19846	NC_011989	GCG	2	6	1155078	1155083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148030
19847	NC_011989	GCA	2	6	1155199	1155204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148030
19848	NC_011989	GC	3	6	1155228	1155233	0 %	0 %	50 %	50 %	222148030
19849	NC_011989	GA	3	6	1155286	1155291	50 %	0 %	50 %	0 %	222148030
19850	NC_011989	TCG	2	6	1155298	1155303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148030
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19856	NC_011989	GAT	2	6	1155921	1155926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148031
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19864	NC_011989	T	7	7	1156229	1156235	0 %	100 %	0 %	0 %	222148031
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19882	NC_011989	TGC	2	6	1157700	1157705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148032
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19947	NC_011989	TC	3	6	1161945	1161950	0 %	50 %	0 %	50 %	222148035
19948	NC_011989	GGC	2	6	1161969	1161974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148035
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19952	NC_011989	GCA	2	6	1162060	1162065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
19953	NC_011989	GC	3	6	1162082	1162087	0 %	0 %	50 %	50 %	222148035
19954	NC_011989	CCGG	2	8	1162092	1162099	0 %	0 %	50 %	50 %	222148035
19955	NC_011989	ATG	2	6	1162153	1162158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148035
19956	NC_011989	TGG	2	6	1162187	1162192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148035
19957	NC_011989	CAGC	2	8	1162250	1162257	25 %	0 %	25 %	50 %	222148035
19958	NC_011989	CGG	2	6	1162271	1162276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148035
19959	NC_011989	CGT	2	6	1162286	1162291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148035
19960	NC_011989	GCA	2	6	1162330	1162335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
19961	NC_011989	AGGGC	2	10	1162363	1162372	20 %	0 %	60 %	20 %	222148035
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19963	NC_011989	GGC	2	6	1162575	1162580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148035
19964	NC_011989	CGG	2	6	1162586	1162591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148035
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19996	NC_011989	GCC	2	6	1164582	1164587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148038
19997	NC_011989	GC	3	6	1164665	1164670	0 %	0 %	50 %	50 %	222148038
19998	NC_011989	GGT	2	6	1164675	1164680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148038
19999	NC_011989	CAT	2	6	1164681	1164686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148038
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