MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011989	GCA	2	6	1055547	1055552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147942
18002	NC_011989	CTG	2	6	1055602	1055607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147942
18003	NC_011989	CGCA	2	8	1055677	1055684	25 %	0 %	25 %	50 %	222147942
18004	NC_011989	GC	3	6	1055732	1055737	0 %	0 %	50 %	50 %	222147942
18005	NC_011989	CGCCAA	2	12	1055781	1055792	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222147942
18006	NC_011989	GGT	2	6	1055823	1055828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147942
18007	NC_011989	AGCTGA	2	12	1055846	1055857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222147942
18008	NC_011989	ATTC	2	8	1055862	1055869	25 %	50 %	0 %	25 %	222147942
18009	NC_011989	CGA	2	6	1055886	1055891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147942
18010	NC_011989	GCCA	2	8	1055899	1055906	25 %	0 %	25 %	50 %	222147942
18011	NC_011989	TTC	2	6	1055926	1055931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147942
18012	NC_011989	GCGG	2	8	1055944	1055951	0 %	0 %	75 %	25 %	222147942
18013	NC_011989	AAT	2	6	1055980	1055985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147942
18014	NC_011989	GTCA	2	8	1056112	1056119	25 %	25 %	25 %	25 %	222147942
18015	NC_011989	CTG	2	6	1056170	1056175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147942
18016	NC_011989	GT	3	6	1056245	1056250	0 %	50 %	50 %	0 %	222147942
18017	NC_011989	CAA	2	6	1056282	1056287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147942
18018	NC_011989	GCC	2	6	1056307	1056312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147942
18019	NC_011989	CAG	2	6	1056330	1056335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147942
18020	NC_011989	GCC	2	6	1056361	1056366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147942
18021	NC_011989	ATG	2	6	1056469	1056474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147942
18022	NC_011989	GGA	2	6	1056508	1056513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147942
18023	NC_011989	CAT	3	9	1056526	1056534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147942
18024	NC_011989	GA	3	6	1056978	1056983	50 %	0 %	50 %	0 %	222147943
18025	NC_011989	CGAC	2	8	1057020	1057027	25 %	0 %	25 %	50 %	222147943
18026	NC_011989	ATG	2	6	1057046	1057051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147943
18027	NC_011989	ACG	2	6	1057130	1057135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147943
18028	NC_011989	TAT	2	6	1057487	1057492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147944
18029	NC_011989	TGGA	2	8	1057543	1057550	25 %	25 %	50 %	0 %	222147944
18030	NC_011989	CGG	3	9	1057733	1057741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147944
18031	NC_011989	C	6	6	1057763	1057768	0 %	0 %	0 %	100 %	222147944
18032	NC_011989	TCC	2	6	1057786	1057791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147944
18033	NC_011989	CCTC	2	8	1058065	1058072	0 %	25 %	0 %	75 %	222147945
18034	NC_011989	GCC	2	6	1058149	1058154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147945
18035	NC_011989	CGG	2	6	1058160	1058165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147945
18036	NC_011989	CAG	2	6	1058179	1058184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147945
18037	NC_011989	TGG	2	6	1058232	1058237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147945
18038	NC_011989	T	6	6	1058299	1058304	0 %	100 %	0 %	0 %	222147945
18039	NC_011989	GGC	2	6	1058329	1058334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147945
18040	NC_011989	TTC	3	9	1058347	1058355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147945
18041	NC_011989	CGGG	2	8	1058388	1058395	0 %	0 %	75 %	25 %	222147945
18042	NC_011989	ATC	2	6	1058410	1058415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147945
18043	NC_011989	CGG	2	6	1058448	1058453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147945
18044	NC_011989	GAT	2	6	1058455	1058460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147945
18045	NC_011989	GCC	2	6	1058509	1058514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147945
18046	NC_011989	AGCCG	2	10	1058515	1058524	20 %	0 %	40 %	40 %	222147945
18047	NC_011989	GAT	2	6	1058533	1058538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147945
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18049	NC_011989	GAT	2	6	1058571	1058576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147945
18050	NC_011989	CGG	3	9	1058577	1058585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147945
18051	NC_011989	GCC	2	6	1058659	1058664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147945
18052	NC_011989	GCCGTA	2	12	1058755	1058766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147945
18053	NC_011989	GCAG	2	8	1058769	1058776	25 %	0 %	50 %	25 %	222147945
18054	NC_011989	AGC	2	6	1058813	1058818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147945
18055	NC_011989	CAT	2	6	1058838	1058843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147945
18056	NC_011989	CGG	2	6	1058861	1058866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147945
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18058	NC_011989	CG	3	6	1058928	1058933	0 %	0 %	50 %	50 %	222147945
18059	NC_011989	GCTG	2	8	1058955	1058962	0 %	25 %	50 %	25 %	222147945
18060	NC_011989	CGT	2	6	1058965	1058970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147945
18061	NC_011989	CGA	2	6	1058974	1058979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147945
18062	NC_011989	CAT	2	6	1059003	1059008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147945
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18065	NC_011989	CAG	2	6	1059130	1059135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147945
18066	NC_011989	GC	3	6	1059216	1059221	0 %	0 %	50 %	50 %	222147945
18067	NC_011989	CGC	2	6	1059288	1059293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147945
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18083	NC_011989	GCT	2	6	1059843	1059848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147945
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18085	NC_011989	GCT	2	6	1059948	1059953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147945
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18087	NC_011989	GTC	2	6	1060090	1060095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147945
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18089	NC_011989	TGA	2	6	1060430	1060435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147946
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18099	NC_011989	GAA	2	6	1061074	1061079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147947
18100	NC_011989	AAGC	2	8	1061092	1061099	50 %	0 %	25 %	25 %	222147947
18101	NC_011989	GCT	2	6	1061110	1061115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147947
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18104	NC_011989	CAG	2	6	1061245	1061250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147947
18105	NC_011989	GCA	2	6	1061254	1061259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147947
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18107	NC_011989	GGCG	2	8	1061452	1061459	0 %	0 %	75 %	25 %	222147947
18108	NC_011989	GA	3	6	1061480	1061485	50 %	0 %	50 %	0 %	222147947
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18115	NC_011989	CCG	2	6	1061916	1061921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147947
18116	NC_011989	CCG	2	6	1061932	1061937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147947
18117	NC_011989	CATC	2	8	1061949	1061956	25 %	25 %	0 %	50 %	222147947
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18215	NC_011989	GC	3	6	1067577	1067582	0 %	0 %	50 %	50 %	222147953
18216	NC_011989	TGA	2	6	1067594	1067599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147953
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18218	NC_011989	TGGT	2	8	1068114	1068121	0 %	50 %	50 %	0 %	222147954
18219	NC_011989	GCC	2	6	1068173	1068178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147954
18220	NC_011989	TGGCCT	2	12	1068190	1068201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147954
18221	NC_011989	GCG	2	6	1068268	1068273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147954
18222	NC_011989	CGC	2	6	1068304	1068309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147954
18223	NC_011989	CTG	2	6	1068446	1068451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147954
18224	NC_011989	CGG	2	6	1068538	1068543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147954
18225	NC_011989	GA	3	6	1068581	1068586	50 %	0 %	50 %	0 %	222147954
18226	NC_011989	GTG	2	6	1068620	1068625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147954
18227	NC_011989	GCG	2	6	1068626	1068631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147954
18228	NC_011989	ATT	2	6	1068642	1068647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147954
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18460	NC_011989	GGA	2	6	1080989	1080994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147968
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18491	NC_011989	GGC	2	6	1082473	1082478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147970
18492	NC_011989	GCTG	2	8	1082494	1082501	0 %	25 %	50 %	25 %	222147970
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18495	NC_011989	TGC	2	6	1082580	1082585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147970
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