MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011989	TGGGA	2	10	594104	594113	20 %	20 %	60 %	0 %	222147539
10002	NC_011989	TGA	2	6	594183	594188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147539
10003	NC_011989	GGC	2	6	594234	594239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147539
10004	NC_011989	GAT	2	6	594377	594382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147540
10005	NC_011989	GCA	2	6	594410	594415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147540
10006	NC_011989	GC	3	6	594419	594424	0 %	0 %	50 %	50 %	222147540
10007	NC_011989	CAGA	2	8	594451	594458	50 %	0 %	25 %	25 %	222147540
10008	NC_011989	GCAG	2	8	594544	594551	25 %	0 %	50 %	25 %	222147540
10009	NC_011989	CCGATC	2	12	594576	594587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222147540
10010	NC_011989	CTG	2	6	594660	594665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
10011	NC_011989	ACC	2	6	594674	594679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147540
10012	NC_011989	CG	3	6	594686	594691	0 %	0 %	50 %	50 %	222147540
10013	NC_011989	GCG	2	6	594768	594773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147540
10014	NC_011989	TGCAT	2	10	594780	594789	20 %	40 %	20 %	20 %	222147540
10015	NC_011989	CGT	2	6	594851	594856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
10016	NC_011989	CGT	2	6	594889	594894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
10017	NC_011989	CAGG	2	8	594923	594930	25 %	0 %	50 %	25 %	222147540
10018	NC_011989	ATC	2	6	594981	594986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147540
10019	NC_011989	GTT	2	6	595132	595137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147540
10020	NC_011989	GAT	2	6	595217	595222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147540
10021	NC_011989	GGA	2	6	595280	595285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147540
10022	NC_011989	ACA	2	6	595350	595355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147540
10023	NC_011989	GCG	2	6	595417	595422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147540
10024	NC_011989	TGG	2	6	595428	595433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147540
10025	NC_011989	CGCAA	2	10	595442	595451	40 %	0 %	20 %	40 %	222147540
10026	NC_011989	TCG	2	6	595572	595577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
10027	NC_011989	CGC	2	6	595629	595634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147540
10028	NC_011989	CTGA	2	8	595688	595695	25 %	25 %	25 %	25 %	222147540
10029	NC_011989	ACA	3	9	595713	595721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147540
10030	NC_011989	AGC	2	6	595868	595873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147540
10031	NC_011989	CTG	2	6	595922	595927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147540
10032	NC_011989	CGC	2	6	595957	595962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147540
10033	NC_011989	TCG	3	9	595990	595998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147541
10034	NC_011989	GAC	2	6	596032	596037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147541
10035	NC_011989	TCG	3	9	596075	596083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147541
10036	NC_011989	ACC	2	6	596153	596158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147541
10037	NC_011989	CAA	2	6	596265	596270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147541
10038	NC_011989	CATTC	2	10	596274	596283	20 %	40 %	0 %	40 %	222147541
10039	NC_011989	GCT	2	6	596622	596627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147542
10040	NC_011989	CAC	2	6	596654	596659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147542
10041	NC_011989	TGA	2	6	596685	596690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147542
10042	NC_011989	GCGTG	2	10	596695	596704	0 %	20 %	60 %	20 %	222147542
10043	NC_011989	GCT	3	9	596800	596808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147543
10044	NC_011989	CCA	2	6	596977	596982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147543
10045	NC_011989	GATC	2	8	597006	597013	25 %	25 %	25 %	25 %	222147543
10046	NC_011989	ACTT	2	8	597069	597076	25 %	50 %	0 %	25 %	222147543
10047	NC_011989	CAT	2	6	597195	597200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
10048	NC_011989	GAC	2	6	597226	597231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147543
10049	NC_011989	AAG	2	6	597284	597289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147543
10050	NC_011989	CTA	2	6	597316	597321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
10051	NC_011989	CCA	2	6	597451	597456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147543
10052	NC_011989	TTCA	2	8	597630	597637	25 %	50 %	0 %	25 %	222147543
10053	NC_011989	CAT	2	6	597854	597859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
10054	NC_011989	ATC	3	9	597876	597884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147543
10055	NC_011989	CTT	2	6	597902	597907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147543
10056	NC_011989	ATCC	2	8	597944	597951	25 %	25 %	0 %	50 %	222147543
10057	NC_011989	ACA	2	6	597973	597978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147543
10058	NC_011989	GCG	2	6	598048	598053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147543
10059	NC_011989	ACC	2	6	598068	598073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147543
10060	NC_011989	GATC	2	8	598142	598149	25 %	25 %	25 %	25 %	222147543
10061	NC_011989	CTG	2	6	598157	598162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147543
10062	NC_011989	ATA	2	6	598174	598179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147543
10063	NC_011989	GTT	2	6	598197	598202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147543
10064	NC_011989	GGT	2	6	598293	598298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147543
10065	NC_011989	CCG	2	6	598348	598353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147543
10066	NC_011989	CAA	2	6	598379	598384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147543
10067	NC_011989	TTG	2	6	598399	598404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147543
10068	NC_011989	CGG	2	6	598421	598426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147543
10069	NC_011989	GGC	2	6	598457	598462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147543
10070	NC_011989	GAGC	2	8	598577	598584	25 %	0 %	50 %	25 %	222147543
10071	NC_011989	AAG	2	6	598657	598662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147543
10072	NC_011989	GCTG	2	8	598693	598700	0 %	25 %	50 %	25 %	222147543
10073	NC_011989	CTG	2	6	598745	598750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147543
10074	NC_011989	CG	3	6	598785	598790	0 %	0 %	50 %	50 %	222147543
10075	NC_011989	TGG	2	6	598795	598800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147543
10076	NC_011989	A	6	6	598932	598937	100 %	0 %	0 %	0 %	222147544
10077	NC_011989	GATA	2	8	598965	598972	50 %	25 %	25 %	0 %	222147544
10078	NC_011989	CG	3	6	598996	599001	0 %	0 %	50 %	50 %	222147544
10079	NC_011989	CTC	2	6	599059	599064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147544
10080	NC_011989	AGC	2	6	599087	599092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147544
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10082	NC_011989	GTC	2	6	599327	599332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147544
10083	NC_011989	CCAT	2	8	599348	599355	25 %	25 %	0 %	50 %	222147544
10084	NC_011989	CGTGG	2	10	599369	599378	0 %	20 %	60 %	20 %	222147544
10085	NC_011989	CAA	2	6	599458	599463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147544
10086	NC_011989	GCAGT	2	10	599469	599478	20 %	20 %	40 %	20 %	222147544
10087	NC_011989	TCG	2	6	599487	599492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147544
10088	NC_011989	GTC	2	6	599523	599528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147544
10089	NC_011989	TCT	2	6	599607	599612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147544
10090	NC_011989	TCG	2	6	600389	600394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
10091	NC_011989	GTC	2	6	600475	600480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
10092	NC_011989	GCT	2	6	600501	600506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
10093	NC_011989	GTC	2	6	600520	600525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147545
10094	NC_011989	CAG	2	6	600538	600543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147545
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10098	NC_011989	GCC	2	6	601417	601422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147546
10099	NC_011989	T	6	6	601470	601475	0 %	100 %	0 %	0 %	222147546
10100	NC_011989	CGG	2	6	601514	601519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147546
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10102	NC_011989	CGA	2	6	601541	601546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147546
10103	NC_011989	CGC	2	6	601572	601577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147546
10104	NC_011989	GC	3	6	601620	601625	0 %	0 %	50 %	50 %	222147546
10105	NC_011989	CGA	2	6	601728	601733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147546
10106	NC_011989	ACG	2	6	601763	601768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147546
10107	NC_011989	CTG	2	6	601828	601833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147546
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10109	NC_011989	GGC	2	6	601903	601908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147546
10110	NC_011989	GCT	2	6	602278	602283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147547
10111	NC_011989	TC	3	6	602293	602298	0 %	50 %	0 %	50 %	222147547
10112	NC_011989	GCT	2	6	602425	602430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147547
10113	NC_011989	TC	3	6	602470	602475	0 %	50 %	0 %	50 %	222147547
10114	NC_011989	ATC	2	6	602526	602531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147547
10115	NC_011989	GAT	2	6	602535	602540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147547
10116	NC_011989	GATC	2	8	602573	602580	25 %	25 %	25 %	25 %	222147547
10117	NC_011989	CGG	2	6	602622	602627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147548
10118	NC_011989	AGC	2	6	602726	602731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147548
10119	NC_011989	GTC	2	6	602777	602782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147548
10120	NC_011989	CGT	2	6	604216	604221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147549
10121	NC_011989	TCG	2	6	604296	604301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147549
10122	NC_011989	CCG	2	6	604302	604307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147549
10123	NC_011989	ATG	2	6	604355	604360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147549
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10157	NC_011989	CGT	2	6	606224	606229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147549
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10221	NC_011989	CGG	3	9	611506	611514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147551
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10225	NC_011989	GAT	2	6	611699	611704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147551
10226	NC_011989	TGA	2	6	611789	611794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147551
10227	NC_011989	CTT	2	6	612102	612107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147552
10228	NC_011989	AGC	2	6	612115	612120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147552
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10230	NC_011989	AG	3	6	612253	612258	50 %	0 %	50 %	0 %	222147552
10231	NC_011989	TTG	2	6	612337	612342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147552
10232	NC_011989	AAT	2	6	612353	612358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147552
10233	NC_011989	TGC	2	6	612432	612437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147552
10234	NC_011989	GCG	2	6	612501	612506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147552
10235	NC_011989	TCGAT	2	10	612527	612536	20 %	40 %	20 %	20 %	222147552
10236	NC_011989	ATG	2	6	612553	612558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147552
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10238	NC_011989	CTTC	2	8	612635	612642	0 %	50 %	0 %	50 %	222147552
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10477	NC_011989	GCA	2	6	628293	628298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147563
10478	NC_011989	GCC	2	6	628390	628395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147563
10479	NC_011989	TGA	2	6	628416	628421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147563
10480	NC_011989	AG	3	6	628469	628474	50 %	0 %	50 %	0 %	222147563
10481	NC_011989	GATCA	2	10	628510	628519	40 %	20 %	20 %	20 %	222147563
10482	NC_011989	GGTT	2	8	628566	628573	0 %	50 %	50 %	0 %	222147563
10483	NC_011989	CAGG	2	8	628590	628597	25 %	0 %	50 %	25 %	222147563
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10485	NC_011989	AGCA	2	8	628675	628682	50 %	0 %	25 %	25 %	222147563
10486	NC_011989	CCG	2	6	628756	628761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147564
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10489	NC_011989	AGG	2	6	628811	628816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147564
10490	NC_011989	GAACC	2	10	628853	628862	40 %	0 %	20 %	40 %	222147564
10491	NC_011989	GAT	2	6	628893	628898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147564
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10497	NC_011989	GAT	3	9	629208	629216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147564
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10499	NC_011989	GCC	2	6	629496	629501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147564
10500	NC_011989	GAT	2	6	629502	629507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147564

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