MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_011989	CAT	2	6	3207267	3207272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149834
55003	NC_011989	TGA	2	6	3207296	3207301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149834
55004	NC_011989	GC	3	6	3207346	3207351	0 %	0 %	50 %	50 %	222149834
55005	NC_011989	GAA	2	6	3207369	3207374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149834
55006	NC_011989	GGC	2	6	3207384	3207389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149834
55007	NC_011989	GACCG	2	10	3207398	3207407	20 %	0 %	40 %	40 %	222149834
55008	NC_011989	ACC	2	6	3207424	3207429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149834
55009	NC_011989	CGA	2	6	3207440	3207445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149834
55010	NC_011989	GCC	2	6	3207511	3207516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149834
55011	NC_011989	CCA	2	6	3207533	3207538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149834
55012	NC_011989	CAT	2	6	3207573	3207578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149834
55013	NC_011989	GTC	2	6	3207613	3207618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149834
55014	NC_011989	TTC	2	6	3207839	3207844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149835
55015	NC_011989	TCT	2	6	3207876	3207881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149835
55016	NC_011989	GCC	2	6	3207972	3207977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149835
55017	NC_011989	GC	3	6	3208015	3208020	0 %	0 %	50 %	50 %	222149835
55018	NC_011989	CCA	2	6	3208038	3208043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149835
55019	NC_011989	GCC	2	6	3208101	3208106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149835
55020	NC_011989	ACC	2	6	3208170	3208175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149835
55021	NC_011989	GCG	2	6	3208191	3208196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149835
55022	NC_011989	CGC	2	6	3208278	3208283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149835
55023	NC_011989	GC	3	6	3208299	3208304	0 %	0 %	50 %	50 %	222149835
55024	NC_011989	CAGC	2	8	3208331	3208338	25 %	0 %	25 %	50 %	222149835
55025	NC_011989	ATA	2	6	3208382	3208387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149835
55026	NC_011989	GGC	2	6	3208424	3208429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149835
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55028	NC_011989	TCG	2	6	3208461	3208466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149835
55029	NC_011989	GGTGC	2	10	3208467	3208476	0 %	20 %	60 %	20 %	222149835
55030	NC_011989	GC	3	6	3208511	3208516	0 %	0 %	50 %	50 %	222149835
55031	NC_011989	CAG	2	6	3208598	3208603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149835
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55033	NC_011989	CGC	2	6	3208687	3208692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149835
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55035	NC_011989	GCC	2	6	3208827	3208832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149835
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55041	NC_011989	GCCC	2	8	3209060	3209067	0 %	0 %	25 %	75 %	222149835
55042	NC_011989	CTT	2	6	3209072	3209077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149835
55043	NC_011989	A	6	6	3209120	3209125	100 %	0 %	0 %	0 %	222149835
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55054	NC_011989	CTG	2	6	3209953	3209958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149836
55055	NC_011989	CGG	2	6	3210032	3210037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149836
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55085	NC_011989	CCGG	2	8	3211259	3211266	0 %	0 %	50 %	50 %	222149837
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55088	NC_011989	CTG	2	6	3211361	3211366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149837
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55104	NC_011989	TCAGCG	2	12	3212086	3212097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149837
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55115	NC_011989	GCA	2	6	3212643	3212648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149837
55116	NC_011989	TCG	3	9	3213132	3213140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149838
55117	NC_011989	GC	3	6	3213154	3213159	0 %	0 %	50 %	50 %	222149838
55118	NC_011989	CGC	2	6	3213205	3213210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149838
55119	NC_011989	GTG	2	6	3213326	3213331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149838
55120	NC_011989	TTC	2	6	3213332	3213337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149838
55121	NC_011989	GC	3	6	3213427	3213432	0 %	0 %	50 %	50 %	222149838
55122	NC_011989	CAA	2	6	3213442	3213447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149838
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55138	NC_011989	TTC	2	6	3214315	3214320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149839
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55143	NC_011989	CTG	2	6	3214817	3214822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149839
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55218	NC_011989	CGGCC	2	10	3218917	3218926	0 %	0 %	40 %	60 %	222149840
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55222	NC_011989	CCAT	2	8	3219120	3219127	25 %	25 %	0 %	50 %	222149840
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55230	NC_011989	GCAG	2	8	3219967	3219974	25 %	0 %	50 %	25 %	222149840
55231	NC_011989	CAAT	2	8	3220012	3220019	50 %	25 %	0 %	25 %	222149840
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55332	NC_011989	CGTGA	2	10	3225303	3225312	20 %	20 %	40 %	20 %	222149842
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55344	NC_011989	TTA	2	6	3226060	3226065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222149842
55345	NC_011989	CAA	2	6	3226115	3226120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149842
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55355	NC_011989	AGCG	2	8	3226646	3226653	25 %	0 %	50 %	25 %	222149843
55356	NC_011989	CCAGC	2	10	3226684	3226693	20 %	0 %	20 %	60 %	222149843
55357	NC_011989	GCC	2	6	3226703	3226708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149843
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55363	NC_011989	GCG	2	6	3227172	3227177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149844
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55374	NC_011989	TGC	2	6	3227690	3227695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149844
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55457	NC_011989	GGC	2	6	3232518	3232523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
55458	NC_011989	TGA	3	9	3232538	3232546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149847
55459	NC_011989	GC	3	6	3232550	3232555	0 %	0 %	50 %	50 %	222149847
55460	NC_011989	CCA	2	6	3232616	3232621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149847
55461	NC_011989	ATCT	2	8	3232627	3232634	25 %	50 %	0 %	25 %	222149847
55462	NC_011989	CGG	2	6	3232638	3232643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
55463	NC_011989	TCC	2	6	3232663	3232668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149847
55464	NC_011989	CGA	2	6	3232695	3232700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149847
55465	NC_011989	CGG	2	6	3232752	3232757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
55466	NC_011989	CCG	2	6	3232832	3232837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149847
55467	NC_011989	GGC	3	9	3232876	3232884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
55468	NC_011989	CCCTAT	2	12	3232972	3232983	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222149847
55469	NC_011989	ATC	2	6	3233011	3233016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149847
55470	NC_011989	TCAAGG	2	12	3233102	3233113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222149847
55471	NC_011989	ACG	2	6	3233126	3233131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149847
55472	NC_011989	GGC	3	9	3233203	3233211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
55473	NC_011989	CCGTG	2	10	3233229	3233238	0 %	20 %	40 %	40 %	222149847
55474	NC_011989	GCC	2	6	3233308	3233313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149847
55475	NC_011989	ATC	2	6	3233326	3233331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149847
55476	NC_011989	CCA	2	6	3233408	3233413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149847
55477	NC_011989	GGC	2	6	3233419	3233424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
55478	NC_011989	GTGAT	2	10	3233483	3233492	20 %	40 %	40 %	0 %	222149847
55479	NC_011989	CCCGG	2	10	3233542	3233551	0 %	0 %	40 %	60 %	222149847
55480	NC_011989	CCA	3	9	3233564	3233572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149847
55481	NC_011989	CAA	2	6	3233607	3233612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149847
55482	NC_011989	GCT	2	6	3233613	3233618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149847
55483	NC_011989	GCTG	2	8	3233626	3233633	0 %	25 %	50 %	25 %	222149847
55484	NC_011989	TCCG	2	8	3233707	3233714	0 %	25 %	25 %	50 %	222149847
55485	NC_011989	TTC	2	6	3233797	3233802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149847
55486	NC_011989	GGC	2	6	3233803	3233808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149847
55487	NC_011989	CAA	2	6	3233865	3233870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149847
55488	NC_011989	ATG	2	6	3233984	3233989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149847
55489	NC_011989	AAG	2	6	3234046	3234051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149847
55490	NC_011989	GC	3	6	3234077	3234082	0 %	0 %	50 %	50 %	222149847
55491	NC_011989	CGC	2	6	3234120	3234125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149847
55492	NC_011989	CG	3	6	3234188	3234193	0 %	0 %	50 %	50 %	222149847
55493	NC_011989	CTG	2	6	3234373	3234378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149848
55494	NC_011989	ATC	2	6	3234379	3234384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149848
55495	NC_011989	TCA	2	6	3234389	3234394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149848
55496	NC_011989	GCT	2	6	3234402	3234407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149848
55497	NC_011989	CAA	2	6	3234420	3234425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149848
55498	NC_011989	GC	3	6	3234477	3234482	0 %	0 %	50 %	50 %	222149848
55499	NC_011989	GAT	2	6	3234504	3234509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149848
55500	NC_011989	TTC	2	6	3234538	3234543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149848

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