MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011988	TCG	2	6	1120906	1120911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107029
19502	NC_011988	TGC	2	6	1120942	1120947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107029
19503	NC_011988	CAA	2	6	1121012	1121017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107029
19504	NC_011988	TCT	2	6	1121063	1121068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107029
19505	NC_011988	CCG	2	6	1121077	1121082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107029
19506	NC_011988	GGA	2	6	1121163	1121168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107029
19507	NC_011988	TTC	2	6	1121200	1121205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107029
19508	NC_011988	GCG	2	6	1121262	1121267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107029
19509	NC_011988	CGC	2	6	1121438	1121443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107029
19510	NC_011988	AGGCC	2	10	1121473	1121482	20 %	0 %	40 %	40 %	222107029
19511	NC_011988	GCG	2	6	1121518	1121523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107029
19512	NC_011988	GGA	2	6	1121536	1121541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107029
19513	NC_011988	CG	3	6	1121597	1121602	0 %	0 %	50 %	50 %	222107029
19514	NC_011988	GGTG	2	8	1121687	1121694	0 %	25 %	75 %	0 %	222107029
19515	NC_011988	TGCC	2	8	1121711	1121718	0 %	25 %	25 %	50 %	222107029
19516	NC_011988	CAA	2	6	1121837	1121842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107029
19517	NC_011988	CGG	2	6	1121855	1121860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107029
19518	NC_011988	CAG	2	6	1121910	1121915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107029
19519	NC_011988	GGC	2	6	1121954	1121959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107029
19520	NC_011988	TGC	3	9	1122034	1122042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107029
19521	NC_011988	GGCGAT	2	12	1122102	1122113	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222107029
19522	NC_011988	GAC	2	6	1122243	1122248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107029
19523	NC_011988	GC	5	10	1122370	1122379	0 %	0 %	50 %	50 %	222107030
19524	NC_011988	TCT	2	6	1122450	1122455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107030
19525	NC_011988	TGA	2	6	1122475	1122480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107030
19526	NC_011988	AT	3	6	1122594	1122599	50 %	50 %	0 %	0 %	222107030
19527	NC_011988	GGC	2	6	1122610	1122615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107030
19528	NC_011988	TGA	2	6	1122631	1122636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107030
19529	NC_011988	GCG	2	6	1122651	1122656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107030
19530	NC_011988	CCA	2	6	1122742	1122747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107030
19531	NC_011988	CGT	3	9	1122758	1122766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107030
19532	NC_011988	GCC	2	6	1122767	1122772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107030
19533	NC_011988	AGGC	2	8	1122869	1122876	25 %	0 %	50 %	25 %	222107030
19534	NC_011988	AT	3	6	1122918	1122923	50 %	50 %	0 %	0 %	222107030
19535	NC_011988	ATT	2	6	1122950	1122955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107030
19536	NC_011988	GTG	2	6	1122978	1122983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107030
19537	NC_011988	CGG	2	6	1123057	1123062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107030
19538	NC_011988	TGA	2	6	1123075	1123080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107030
19539	NC_011988	AGG	2	6	1123108	1123113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107030
19540	NC_011988	TCT	2	6	1123263	1123268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107030
19541	NC_011988	GGC	2	6	1123295	1123300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107030
19542	NC_011988	TGC	2	6	1123313	1123318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107030
19543	NC_011988	ACG	2	6	1123337	1123342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107030
19544	NC_011988	TGG	2	6	1123501	1123506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107031
19545	NC_011988	T	6	6	1123540	1123545	0 %	100 %	0 %	0 %	222107031
19546	NC_011988	CAT	2	6	1123547	1123552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107031
19547	NC_011988	CGTC	2	8	1123555	1123562	0 %	25 %	25 %	50 %	222107031
19548	NC_011988	ATG	2	6	1123641	1123646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107031
19549	NC_011988	CAT	2	6	1123652	1123657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107031
19550	NC_011988	CGG	2	6	1123699	1123704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107031
19551	NC_011988	TCA	3	9	1123828	1123836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107031
19552	NC_011988	ACC	2	6	1123872	1123877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107031
19553	NC_011988	GCC	2	6	1123995	1124000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107031
19554	NC_011988	GGC	2	6	1124010	1124015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107031
19555	NC_011988	GCA	2	6	1124056	1124061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107031
19556	NC_011988	CCTT	2	8	1124091	1124098	0 %	50 %	0 %	50 %	222107031
19557	NC_011988	TGA	3	9	1124101	1124109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107031
19558	NC_011988	GGT	2	6	1124144	1124149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107031
19559	NC_011988	ATC	2	6	1124160	1124165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107031
19560	NC_011988	CCG	2	6	1124206	1124211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107031
19561	NC_011988	GTG	2	6	1124224	1124229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107031
19562	NC_011988	CGC	2	6	1124281	1124286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107031
19563	NC_011988	TCA	2	6	1124394	1124399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107031
19564	NC_011988	ACCAG	2	10	1124421	1124430	40 %	0 %	20 %	40 %	222107031
19565	NC_011988	CAGC	2	8	1124482	1124489	25 %	0 %	25 %	50 %	222107031
19566	NC_011988	ATTG	2	8	1124543	1124550	25 %	50 %	25 %	0 %	222107031
19567	NC_011988	A	6	6	1124858	1124863	100 %	0 %	0 %	0 %	222107032
19568	NC_011988	AT	3	6	1124890	1124895	50 %	50 %	0 %	0 %	222107032
19569	NC_011988	GTT	2	6	1124898	1124903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107032
19570	NC_011988	GT	3	6	1124978	1124983	0 %	50 %	50 %	0 %	222107032
19571	NC_011988	AG	3	6	1124998	1125003	50 %	0 %	50 %	0 %	222107032
19572	NC_011988	TGG	2	6	1125032	1125037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107032
19573	NC_011988	ATC	2	6	1125187	1125192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107032
19574	NC_011988	AGC	2	6	1125386	1125391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107032
19575	NC_011988	TCC	2	6	1125466	1125471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107032
19576	NC_011988	AAGG	2	8	1125523	1125530	50 %	0 %	50 %	0 %	222107032
19577	NC_011988	CGC	2	6	1125556	1125561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107033
19578	NC_011988	GTTGCC	2	12	1125588	1125599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107033
19579	NC_011988	GGC	2	6	1125636	1125641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107033
19580	NC_011988	GC	3	6	1125640	1125645	0 %	0 %	50 %	50 %	222107033
19581	NC_011988	CAT	2	6	1125710	1125715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107033
19582	NC_011988	GA	3	6	1125883	1125888	50 %	0 %	50 %	0 %	222107033
19583	NC_011988	GCA	2	6	1125968	1125973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107033
19584	NC_011988	GGC	2	6	1126041	1126046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107033
19585	NC_011988	TATCTC	2	12	1126074	1126085	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222107033
19586	NC_011988	CCAC	2	8	1126108	1126115	25 %	0 %	0 %	75 %	222107033
19587	NC_011988	CGG	2	6	1126124	1126129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107033
19588	NC_011988	GTG	2	6	1126131	1126136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107033
19589	NC_011988	ACCA	2	8	1126158	1126165	50 %	0 %	0 %	50 %	222107033
19590	NC_011988	TTGC	2	8	1126176	1126183	0 %	50 %	25 %	25 %	222107033
19591	NC_011988	CGG	2	6	1126238	1126243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107033
19592	NC_011988	TCAAT	2	10	1126279	1126288	40 %	40 %	0 %	20 %	222107033
19593	NC_011988	GTC	2	6	1126296	1126301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107033
19594	NC_011988	CGC	2	6	1126318	1126323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107033
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19596	NC_011988	TGC	2	6	1126409	1126414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107033
19597	NC_011988	CTG	2	6	1126419	1126424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107033
19598	NC_011988	TGG	2	6	1126433	1126438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107033
19599	NC_011988	TTG	2	6	1126485	1126490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107033
19600	NC_011988	CGG	2	6	1126494	1126499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107033
19601	NC_011988	GCT	2	6	1126526	1126531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107033
19602	NC_011988	TGG	2	6	1126545	1126550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107033
19603	NC_011988	GCG	2	6	1126560	1126565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107033
19604	NC_011988	AAC	2	6	1126584	1126589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107033
19605	NC_011988	ATCC	2	8	1126591	1126598	25 %	25 %	0 %	50 %	222107033
19606	NC_011988	GGC	2	6	1126662	1126667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107033
19607	NC_011988	GGCG	2	8	1126775	1126782	0 %	0 %	75 %	25 %	222107033
19608	NC_011988	CAC	2	6	1126802	1126807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107033
19609	NC_011988	CCA	2	6	1126858	1126863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107033
19610	NC_011988	AC	3	6	1126864	1126869	50 %	0 %	0 %	50 %	222107033
19611	NC_011988	AGG	2	6	1126888	1126893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107033
19612	NC_011988	TGAG	2	8	1127178	1127185	25 %	25 %	50 %	0 %	222107034
19613	NC_011988	ACG	2	6	1127199	1127204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107034
19614	NC_011988	ATT	2	6	1127210	1127215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107034
19615	NC_011988	CGG	3	9	1127227	1127235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107034
19616	NC_011988	TGA	2	6	1127277	1127282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107034
19617	NC_011988	GAC	2	6	1127312	1127317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107034
19618	NC_011988	A	6	6	1127348	1127353	100 %	0 %	0 %	0 %	222107034
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19621	NC_011988	CGG	2	6	1127422	1127427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107034
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19721	NC_011988	GTC	2	6	1132544	1132549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107038
19722	NC_011988	CG	3	6	1132591	1132596	0 %	0 %	50 %	50 %	222107038
19723	NC_011988	TCAGGA	2	12	1132600	1132611	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222107038
19724	NC_011988	GGCG	2	8	1132627	1132634	0 %	0 %	75 %	25 %	222107038
19725	NC_011988	CGCAG	2	10	1132639	1132648	20 %	0 %	40 %	40 %	222107038
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19732	NC_011988	TGA	2	6	1133144	1133149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107039
19733	NC_011988	ACA	2	6	1133274	1133279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107039
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19956	NC_011988	ACG	2	6	1146534	1146539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107052
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19958	NC_011988	TGC	2	6	1146574	1146579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107052
19959	NC_011988	CAG	2	6	1146586	1146591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107052
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19962	NC_011988	TGC	2	6	1146817	1146822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107052
19963	NC_011988	GCG	2	6	1146984	1146989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107053
19964	NC_011988	GCT	2	6	1147100	1147105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107053
19965	NC_011988	GATG	2	8	1147271	1147278	25 %	25 %	50 %	0 %	222107053
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19996	NC_011988	GGC	2	6	1149077	1149082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107056
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19998	NC_011988	GGC	2	6	1149104	1149109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107056
19999	NC_011988	ATTG	2	8	1149110	1149117	25 %	50 %	25 %	0 %	222107056
20000	NC_011988	CGC	2	6	1149215	1149220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107056

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