MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_011988	GTT	2	6	1094089	1094094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107005
19003	NC_011988	GCT	2	6	1094100	1094105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107005
19004	NC_011988	GGC	2	6	1094106	1094111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107005
19005	NC_011988	GCTC	2	8	1094138	1094145	0 %	25 %	25 %	50 %	222107005
19006	NC_011988	GCG	2	6	1094151	1094156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107005
19007	NC_011988	ACA	2	6	1094216	1094221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107005
19008	NC_011988	GGC	2	6	1094238	1094243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107005
19009	NC_011988	GAC	2	6	1094304	1094309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107005
19010	NC_011988	CGA	2	6	1094315	1094320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107005
19011	NC_011988	TGG	2	6	1094444	1094449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107005
19012	NC_011988	ATG	2	6	1094464	1094469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107005
19013	NC_011988	TCAA	2	8	1094480	1094487	50 %	25 %	0 %	25 %	222107006
19014	NC_011988	GCCC	2	8	1094558	1094565	0 %	0 %	25 %	75 %	222107006
19015	NC_011988	GAT	4	12	1094568	1094579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107006
19016	NC_011988	CGA	2	6	1094582	1094587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107006
19017	NC_011988	GCG	2	6	1094603	1094608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107006
19018	NC_011988	GA	3	6	1094658	1094663	50 %	0 %	50 %	0 %	222107006
19019	NC_011988	TAT	2	6	1094732	1094737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107006
19020	NC_011988	GCA	2	6	1094872	1094877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107006
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19023	NC_011988	CGA	2	6	1094999	1095004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107006
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19025	NC_011988	CATG	2	8	1095125	1095132	25 %	25 %	25 %	25 %	222107006
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19029	NC_011988	CAT	2	6	1095402	1095407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107006
19030	NC_011988	AAT	2	6	1095422	1095427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107006
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19033	NC_011988	GCT	2	6	1095500	1095505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107006
19034	NC_011988	CTGG	2	8	1095516	1095523	0 %	25 %	50 %	25 %	222107006
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19117	NC_011988	GGC	2	6	1100158	1100163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107008
19118	NC_011988	ACCGG	2	10	1100169	1100178	20 %	0 %	40 %	40 %	222107008
19119	NC_011988	TGC	2	6	1100211	1100216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107008
19120	NC_011988	GCC	2	6	1100330	1100335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107008
19121	NC_011988	CG	4	8	1100389	1100396	0 %	0 %	50 %	50 %	222107008
19122	NC_011988	GGC	2	6	1100455	1100460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107008
19123	NC_011988	CGC	3	9	1100476	1100484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107008
19124	NC_011988	GCG	2	6	1100540	1100545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107008
19125	NC_011988	GCC	2	6	1100575	1100580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107008
19126	NC_011988	TGT	2	6	1100584	1100589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107008
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19128	NC_011988	GCT	2	6	1100647	1100652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107008
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19130	NC_011988	GAG	2	6	1100789	1100794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107009
19131	NC_011988	CTG	3	9	1100852	1100860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107009
19132	NC_011988	GGT	2	6	1100884	1100889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107009
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19134	NC_011988	CTG	2	6	1100972	1100977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107009
19135	NC_011988	TTG	2	6	1100984	1100989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107009
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19137	NC_011988	ACGTG	2	10	1101037	1101046	20 %	20 %	40 %	20 %	222107009
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19147	NC_011988	TGG	2	6	1101626	1101631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107009
19148	NC_011988	CCATG	2	10	1101664	1101673	20 %	20 %	20 %	40 %	222107009
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19156	NC_011988	GCT	2	6	1101943	1101948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107009
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19178	NC_011988	GCA	2	6	1103044	1103049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107010
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19185	NC_011988	TGG	2	6	1103614	1103619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107011
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19211	NC_011988	CTG	2	6	1104881	1104886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107012
19212	NC_011988	GC	3	6	1104959	1104964	0 %	0 %	50 %	50 %	222107012
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19216	NC_011988	GGT	2	6	1105281	1105286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107013
19217	NC_011988	TGC	2	6	1105295	1105300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107013
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19219	NC_011988	TGGATG	2	12	1105364	1105375	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222107013
19220	NC_011988	GGC	2	6	1105419	1105424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107013
19221	NC_011988	TGGC	2	8	1105460	1105467	0 %	25 %	50 %	25 %	222107013
19222	NC_011988	ACG	2	6	1105537	1105542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107013
19223	NC_011988	GTG	2	6	1105594	1105599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107013
19224	NC_011988	GCC	2	6	1105723	1105728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107013
19225	NC_011988	GGC	2	6	1105734	1105739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107013
19226	NC_011988	GC	3	6	1105755	1105760	0 %	0 %	50 %	50 %	222107013
19227	NC_011988	CTC	2	6	1105761	1105766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107013
19228	NC_011988	GCA	2	6	1105788	1105793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107013
19229	NC_011988	ACC	2	6	1105962	1105967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107014
19230	NC_011988	TGG	2	6	1105969	1105974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107014
19231	NC_011988	GGC	2	6	1105977	1105982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107014
19232	NC_011988	TCA	2	6	1106081	1106086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107014
19233	NC_011988	GTT	2	6	1106178	1106183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107014
19234	NC_011988	CGG	2	6	1106254	1106259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107014
19235	NC_011988	CGC	2	6	1106352	1106357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107014
19236	NC_011988	CGA	2	6	1106405	1106410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107014
19237	NC_011988	CGG	2	6	1106438	1106443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107014
19238	NC_011988	AGATGG	2	12	1106538	1106549	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222107015
19239	NC_011988	CGG	2	6	1106583	1106588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107015
19240	NC_011988	TGG	2	6	1106687	1106692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107015
19241	NC_011988	TTGCC	2	10	1106763	1106772	0 %	40 %	20 %	40 %	222107015
19242	NC_011988	TTG	2	6	1106796	1106801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107015
19243	NC_011988	GGA	2	6	1106821	1106826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107015
19244	NC_011988	GGTC	2	8	1106838	1106845	0 %	25 %	50 %	25 %	222107015
19245	NC_011988	GGT	2	6	1106882	1106887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107015
19246	NC_011988	GGC	2	6	1106965	1106970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107015
19247	NC_011988	GCC	2	6	1107062	1107067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107015
19248	NC_011988	ACT	2	6	1107162	1107167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107015
19249	NC_011988	GCA	2	6	1107259	1107264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107015
19250	NC_011988	CAT	2	6	1107334	1107339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107015
19251	NC_011988	GCTT	2	8	1107349	1107356	0 %	50 %	25 %	25 %	222107015
19252	NC_011988	AGCGA	2	10	1107411	1107420	40 %	0 %	40 %	20 %	222107016
19253	NC_011988	CAC	2	6	1107482	1107487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107016
19254	NC_011988	TGC	2	6	1107559	1107564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107016
19255	NC_011988	GTCT	2	8	1107567	1107574	0 %	50 %	25 %	25 %	222107016
19256	NC_011988	TGA	2	6	1107601	1107606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107016
19257	NC_011988	AT	3	6	1107631	1107636	50 %	50 %	0 %	0 %	222107016
19258	NC_011988	TGC	2	6	1107805	1107810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107016
19259	NC_011988	GGT	2	6	1107867	1107872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107016
19260	NC_011988	GCC	2	6	1107909	1107914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107016
19261	NC_011988	TGG	2	6	1107970	1107975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107016
19262	NC_011988	GCG	2	6	1108015	1108020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107016
19263	NC_011988	GC	3	6	1108156	1108161	0 %	0 %	50 %	50 %	222107016
19264	NC_011988	GCG	2	6	1108207	1108212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107016
19265	NC_011988	CGG	2	6	1108219	1108224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107016
19266	NC_011988	CGG	2	6	1108243	1108248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107016
19267	NC_011988	TC	4	8	1108339	1108346	0 %	50 %	0 %	50 %	222107017
19268	NC_011988	GCCA	2	8	1108371	1108378	25 %	0 %	25 %	50 %	222107017
19269	NC_011988	GCAT	2	8	1108438	1108445	25 %	25 %	25 %	25 %	222107017
19270	NC_011988	CATGG	2	10	1108467	1108476	20 %	20 %	40 %	20 %	222107017
19271	NC_011988	AGGCG	2	10	1108595	1108604	20 %	0 %	60 %	20 %	222107017
19272	NC_011988	GACC	2	8	1108610	1108617	25 %	0 %	25 %	50 %	222107017
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19277	NC_011988	TGC	4	12	1109008	1109019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107017
19278	NC_011988	AGG	2	6	1109152	1109157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107017
19279	NC_011988	CGG	2	6	1109218	1109223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107017
19280	NC_011988	GC	3	6	1109479	1109484	0 %	0 %	50 %	50 %	222107018
19281	NC_011988	TGC	2	6	1109520	1109525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107018
19282	NC_011988	ATG	2	6	1109531	1109536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107018
19283	NC_011988	GCC	2	6	1109602	1109607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107018
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19289	NC_011988	GCTG	2	8	1109869	1109876	0 %	25 %	50 %	25 %	222107018
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19301	NC_011988	GGT	2	6	1110531	1110536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107018
19302	NC_011988	GAGGCG	2	12	1110550	1110561	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222107018
19303	NC_011988	CG	3	6	1110625	1110630	0 %	0 %	50 %	50 %	222107018
19304	NC_011988	GAT	2	6	1110636	1110641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107018
19305	NC_011988	TACC	2	8	1110675	1110682	25 %	25 %	0 %	50 %	222107018
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19312	NC_011988	CCGA	2	8	1111093	1111100	25 %	0 %	25 %	50 %	222107019
19313	NC_011988	GTC	2	6	1111150	1111155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107019
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19317	NC_011988	TAT	2	6	1111282	1111287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107019
19318	NC_011988	CAA	2	6	1111305	1111310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107019
19319	NC_011988	CGC	2	6	1111320	1111325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107019
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19321	NC_011988	AAG	2	6	1111483	1111488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107019
19322	NC_011988	ATC	2	6	1111510	1111515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107019
19323	NC_011988	TGG	2	6	1111516	1111521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107019
19324	NC_011988	GCA	2	6	1111539	1111544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107019
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19330	NC_011988	CGA	2	6	1111887	1111892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107019
19331	NC_011988	CTGC	2	8	1112125	1112132	0 %	25 %	25 %	50 %	222107020
19332	NC_011988	TTC	2	6	1112152	1112157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107020
19333	NC_011988	CTG	2	6	1112176	1112181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107020
19334	NC_011988	TCT	2	6	1112258	1112263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107020
19335	NC_011988	TCT	2	6	1112403	1112408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107020
19336	NC_011988	TCA	2	6	1112453	1112458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107020
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19338	NC_011988	CAA	2	6	1112508	1112513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107020
19339	NC_011988	TCG	2	6	1112516	1112521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107020
19340	NC_011988	TGC	2	6	1112549	1112554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107020
19341	NC_011988	TCA	2	6	1112558	1112563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107020
19342	NC_011988	GATC	2	8	1112592	1112599	25 %	25 %	25 %	25 %	222107020
19343	NC_011988	GGC	2	6	1112613	1112618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107020
19344	NC_011988	GCG	2	6	1112627	1112632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107020
19345	NC_011988	TGC	3	9	1112660	1112668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107020
19346	NC_011988	CGGG	2	8	1112693	1112700	0 %	0 %	75 %	25 %	222107020
19347	NC_011988	GCT	2	6	1112745	1112750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107020
19348	NC_011988	CGG	2	6	1112751	1112756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107020
19349	NC_011988	ATG	2	6	1112767	1112772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107020
19350	NC_011988	GCG	3	9	1112830	1112838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107020
19351	NC_011988	CTG	2	6	1112845	1112850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107020
19352	NC_011988	GTG	2	6	1112851	1112856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107020
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19354	NC_011988	TCA	2	6	1112970	1112975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107021
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19386	NC_011988	CATG	2	8	1115103	1115110	25 %	25 %	25 %	25 %	222107023
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19451	NC_011988	GC	3	6	1118479	1118484	0 %	0 %	50 %	50 %	222107026
19452	NC_011988	TCA	2	6	1118492	1118497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107026
19453	NC_011988	TC	3	6	1118546	1118551	0 %	50 %	0 %	50 %	222107026
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19456	NC_011988	AGCAGG	2	12	1118840	1118851	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222107027
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19459	NC_011988	CGG	2	6	1118928	1118933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107027
19460	NC_011988	C	6	6	1118978	1118983	0 %	0 %	0 %	100 %	222107027
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19462	NC_011988	CAG	2	6	1119058	1119063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107027
19463	NC_011988	CGG	2	6	1119147	1119152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107027
19464	NC_011988	CGA	2	6	1119234	1119239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107027
19465	NC_011988	CAG	2	6	1119247	1119252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107027
19466	NC_011988	GAT	2	6	1119256	1119261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107027
19467	NC_011988	AG	4	8	1119279	1119286	50 %	0 %	50 %	0 %	222107027
19468	NC_011988	CGA	2	6	1119288	1119293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107027
19469	NC_011988	GGA	2	6	1119301	1119306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107027
19470	NC_011988	GGC	3	9	1119334	1119342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107027
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19474	NC_011988	GCA	2	6	1119612	1119617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107027
19475	NC_011988	ACC	2	6	1119631	1119636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107027
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19490	NC_011988	GCC	2	6	1120492	1120497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107028
19491	NC_011988	AGC	2	6	1120532	1120537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107028
19492	NC_011988	ACG	2	6	1120598	1120603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107028
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19494	NC_011988	GTT	2	6	1120669	1120674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107028
19495	NC_011988	CAGC	2	8	1120743	1120750	25 %	0 %	25 %	50 %	222107028
19496	NC_011988	GCAAG	2	10	1120752	1120761	40 %	0 %	40 %	20 %	222107028
19497	NC_011988	CAGA	2	8	1120811	1120818	50 %	0 %	25 %	25 %	222107029
19498	NC_011988	CGGCGA	2	12	1120844	1120855	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222107029
19499	NC_011988	GGC	2	6	1120859	1120864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107029
19500	NC_011988	ATC	2	6	1120879	1120884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107029

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